XLOC_037818 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_037818
Unique Name	XLOC_037818
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_334:371387..381415+

gene from alignment at scaffold_334:371387..381415+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_037818 ID=XLOC_037818|Name=XLOC_037818|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10029bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_334:371387..381415+ (Clytia hemisphaerica)
GTGAGAATCAGTCCCTGCATTCGGAGCTGGAATAACAAAAAGGAGTAAAA
AAACGAGTAACTCATCGGAAACACGGTGTAAAAACTCgggttttctttct
tttgaagtCACATGATCTAGCACGTCAACAAAATGGTAGCCCGAGTAGTG
ATCGAGAAAAAGAGGACACGAAGAAGAGTTTCGCCAAAAGTTCAAACACA
AATCTCAAGCGTCGCCTTTCAAAATGAGTTCTATCAGTGAACTCCCTTGC
TATACGCTCATCAACCATCCATCTGAAAGTGAAAGCTCTTCAGAGAACCA
ACTGAAAGCTGATTTGGGTAAGTGCATTTTTATGCATTTGTATTTTTGGC
AAGTAAtatcattgtcttttctcttcaaagtttttacaattttgacaTAC
TTCATACTGGGAACCTGAATacctttgattacctttgatgtgtttcagca
aattctctgctcacttaacccgtggggtccggtgtttgaccatttcaaca
attgaattcgAGTCAGCCATCCTGTAAAAGGGAGATAGGCAAGGAGCAGT
GGCTTGTCGGGAACATCTTGGCCAGTCTGGAAAGGAGGGAAATGTTACGC
TGGAGCTGCGCCAACTTAACTGGGAAAAGTTGAAGGCAGCAGATCTCAAA
CCTCAAATCTATGCCGGAGATATCCGGCAGACTGGCATCTTGGAGAAATT
AAATTgatcaagttgttttttgaaggaatttttggaacatttggtCATGT
CACGTATTTTTCTTGGTAACACATTGAATAGTCTtgggcagttagtcaca
ctagcgtcccgccaaaacagttagtcacactagcgtcccgccaaaatgca
taccaaagattaatgctgcgaaagtgctatatcgtttacttgactctcga
GCAAAAAtatgcaccgcaaaacttctaaagagattcatgaaaaaataaac
cggcactttttaatgaaattaacattttcaaaaactttgagaaattgcct
aaaatttgagccatagatgaaaaagtttgagccaagccaaccttgaaaac
taatttgaagatcaacttcacaagaaaaagatctacgggggaggcagaac
ccacctagatccgcgcaccgccggataggctatttcccagaaattttgcc
ggacctcaaacaatgacccatttacatgttcgaaattatttttactttag
cgtataaacaaggccttaaaaatcgaagcgctgtctcgggaattgaatga
caaaatttggttggttgataatttggctgctgcacgttttattttgtttc
aaactttcaagttttgattaccataattgtcttgcgaacttgattcaggt
aactctcatccttgttgtgcaaatacatcctgtagatgactgatgttgNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGCAGCTCTTCCAAATGT
TCTTGTTCGTTGTATTCACTGGTTTGAGGTGGCATTTTCTTCCCAGACGT
TGGTTTGTATATGAATAAATACCGCCTTCCCCTTcacacaagtgttacgc
gtaagccaaatcgcgtattacaaacaacctctaaattgccgagtacagga
gagaaaaaaatcgaaattcaaaatggtggCCAAGCCCACGCTCAATAAtt
ttgcagctcaataaatcaatgaaataatttgaaataaaaagtaaacaaac
cttgaacctttcatgaatccaaataaataaaagtattcatctaaagtgaa
gattacatttaaaaataaaacgatttccaaaccaatcTAAAGTCGGTGTC
TGGGGtgactggcaaggagttacgacttcagactttagattccaattctt
gtataggctgcaactacactacCAAATAATCTGTATTACAAATatttcca
aatgggtccataagttaagaaaatgaaattatcatctagcacgggggttt
tgtttttaaaaacaaacttcaaaataaaattgttaatgaacttatatatt
acttaaaatatcacttacttacataatttatttatgatataacacccctt
tcttaaataaatgggctcttaaagtcttttatgtttgcaaAAAGAAGGGA
GAaacatttaatttgacccccggttttttctctctttttctagctagTTC
CCGCGTGtcagtgtagacacaactttaatccggggaaataaagcgttttc
attggtctaaaatcacggatggtcacgtgaccagaatttttatccaggga
aatgccgtggcggCAATGATTTGCTTTAGTGAGTTTGaccattttattgt
tttgatttgagcgggcgaaatttctgtacaaaccacaatatggcttcgtt
ggaaacACTTGTGTTCaccatagttaaaatttggcacCAGTTGTTCGATT
ATACACCATGTATATATAATTTGGTATCTTTCGCGTCTTCTCTCGAGACT
GTACATATTGAGGTGTTTGAGGTTCTCCCAATAATTCAAATTGGGTGGAA
GTTGGATCCCTTTTATAAAGGATTTTTGCAGATACTCCAGTTCTTGCATT
AGGGATCGCTTTGTAGGAGACCATAGCTGGGAGCAGTATTCCAGATGTTG
AAGTACCAATGTCTTCCAAAGAGTGATCATTACTGATTTATCTCTGGACT
TGAAGGTTCTGTATATCTAGGCACTTATACCCTTGACCCTGTCAGTGATC
GTTTGAATGTGCATTTTATATGACAGGTTGTTTGAGAGTAGGATACCCAG
GTCTTTCACTgcactttttatttcgattggcTGCTGTACATCTGATTTGT
AGACTGAGTGTACTTTCAgttgttcattttttccgtatgcaatgtgttca
aacttttttccattgagCTCCATATTGTTGATAGATGTCCAGTCATAGAC
AATGTCTATAGATCATCTTGAAGCAGACTCACATCTGCAGCACAAGATAT
TGCCTTCATAAGTCTTGTGTCGTCAGTAAAAGATGAGAGGACGGAATGTT
TAATCTTTTCGTTTATGTCACTAATCATTACCAGAAACAAGAGGGGNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNGGTCCACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCAAGGTAGATt
acatcaacattttcattgttttgtagGTGAGATATCAGTCTTTCTACATG
AGCCAATAGTTGACTCGCCCTGGTCTGAAACCGTGTTGTGTTGGATTGTA
TAGGTTATTTTCTTCAAGGTGGGTTTGCAATTTCTCTCTgactattttct
caaatattttagtGGTAATTGATGTCAGGGCAACAGGTCGATAATTCTCT
GGTAAACCTTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNcaaatgacaagatttttcgatcaatgtttt
ctttaaggtgaactctattgcttgatactttcctccaaaattctccagcg
actttttgtctacaaattggatctgaaattgtgtgtgcttatatataaag
aactttttattttctggctggagaaaatatctttttcaaaaaaaaattta
attgatgCAGattgatgacaaaattgaacgcaaaatcatttcgtggagct
aaattttattttattctcgtatattagaaggctagaaatcctcgatgctg
atagtaagaatatTCAGAGCAAatttgagttctactaaaaagtcgtattt
catcgggcgagcctagaatttcttttgatttattacataaNagaatgttc
agagcaaacttgagttctactaaaaagtcgtatttcttcgggcgagccta
gaatttcttttgatttattacataaaagaaatcaaaagaatttaacgacc
aattaccgacaaattcatctcctgtctttctttatacctctatgctgGAA
TAGTGTCAATTTGTTGGATGAAATCATCTTCTGTGAAAGTAATGTTCTCA
AGGGTCGAGGAGTCTTTTGTCTCATTTGAATTCAGAAAACTGTTTTGGAG
TGGTAAATACTGAACAGTAGTGCCTTTGTAAGATGTTTGCCATCTCTTGC
GAGTCAGATGTTAATTGGTtggtggttggatttttcagTGGGCCAACTTT
AGGTTTAGTTTTTGAGAATCTTTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTG
CTGTAGCATCAGTTCAATGTCAATTAGTTTctgatttgttttattggttt
tgaaattctttttggagAGTCTTTTACGTTTTCTCATAAGAATACGACCA
TCTCttggaatctttgaaaatttttttggaggtTTTCTCTTTGGCAAATG
CTTTTTCACAATCAGAAGACATTTTTCAAGGAAGTTGGGATATTGACGAT
TTGGGTCATATAGATTTGTGTCCAGCTCTTGAGACCAATTAATGTCTGTT
AATTCTTTGTTAATAATTTCCCAGTCAATTTTATCACTTTGGAAGTTGTA
GAGGTCAAATTTGCTTATTAAGTTACGTTCTTCAGTTTCTCCGAATTGAT
TATCGAAATTCAAATGTGTTGTAACATCTACAACAAGATGATCTGAATAG
ATAGTAGGTGAGCATGTGTAGTTAAATATAGTGTCTGTGTTGTTTGTGAa
taaaaagtctaaaatattaCCATCACTGTGTGTTGATTTGTGTATCATTT
GATTAATGTGCAAGTCtgctttaaaaacatttaaaacgtcCAGAAGCtgt
ttatttcaattttgtgtTGGGGTTGAAGTCTCGTCATTAAGAGGTGTGTG
TGGTATGTTAAAATCCCCAAGGATGTATGTGTCAGGTGTACAATCAGTAA
TACTATCAATTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNCATCCTCGGGTGGAAGCTTTGGCACTTGGTACCTAGGTTG
CAGCCTCTTGGTTGTTTGTTGCcatatttgagcaattttgtacAGGCTTT
AGGATGGATAAATAAAACCTTATAGAATAATTAGATAGCTTAACCATCTG
ATCATCCCTTTACACTGGCTAAGATTATTGTATAAGAGTAGAGAAGTGGC
TTGATTTGCAGGCtgcaagcaaagcaaaattGTGAGACTATTTTTTGTGT
TGCCTTTTTTAGAAGATTTTAttggtgaaattctacttttattttaattt
tttctttgacCGACCCACCTtctttttttgggtagcttggcNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGGTTGGTTGAGTCTTCAAATTAA
TCTTctctattttcattttatatttgcGTCTATCGATAGCTTTCTTTGGT
CTTCAATTTGTTCATCAATTTTGTCGCTTCGAAGTAGCTGGTTCATGCTG
TTTACGCTTAATTGATCTTTGATTTTAGTTGCTTCACAATTTTGCTCACA
GAcagttgcttgtttttttttctaaacttaaaattttcttacaaTTAAAT
ACAAAACCTCACACATCAACCTTGCTTTATAGAGAATGGAGATGTCAAAG
TCCGAACTGTTGCTCTTAAGAAAGTCATGTACCAAATTTTGAATGGTGAA
AAAATGCCTTCACTACTGATGACAATAATTCGGTTCATTCTACCCATGCA
AGACCACCAAATCAAAAAGTTATTACTCATCTTCTGGGAAATTGTCCCAA
AGACTGGAGCTGATGGTAAATTACTGCATGAAATGATTTTGGTGTGTGAT
GCCTATCGTCGTGATTTGGAACATCCCAATGAGTTCATTCGAGGATCAAC
ACTCAGATTCTTGTGCAAACTTAAAGTAA

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00060108	TCONS_00060108	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00060108-protein	TCONS_00060108-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_334	supercontig	scaffold_334:371387..381415 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
75.16	80.21	58.72	65.5	102.3	81.4	191.12	208.24	91.83	127.46	94.34	88.39	84.07	80.83	99.33	110.44	95.68	101.78	54.1	71.23	50.73	47.72	53.74	62.73	71.57	77.56	43.96	39.23	55.32	44.78

You are here

XLOC_037818 (gene) - C. hemisphaerica