XLOC_034717 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034717
Unique NameXLOC_034717
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_250:217053..221360-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034717 ID=XLOC_034717|Name=XLOC_034717|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=4308bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_250:217053..221360- (Clytia hemisphaerica)
ATTAAAAAATTCTTAAGATTCAGAAAGACCAATCTTGGATTTACAAATCA
AGGTAACTGTATTATTTTCTTTGGTTTTCTCAACATATATAACTTTTTGT
TTCTTAGCAAATCGAATTTGAATTATTAGCTATCTTTAAGAAGTGGAGTT
TCAGAATTATGCTTCATGATTCAAATGATTTGATGACCACTGAACTTAAT
CAAATTCAATCGATTTGAATTAAAGATGTGATATAATTGTTCTACAGGGA
CATGGGAGGAGTGTACCACAAAAACAAACGAAAGCATACGTGGTGAGTGG
TGACAGGGAGGGGGAGGTCAAGTAGAAATGCACCAAGCAGTGGCGTGGTG
GGAAAATTTCTTTGGGGTGGCCAAGGCAAATATGGCGACGTTTTTAAAGA
TTTTTTGTGTGCGAGCGAAGCGAGCCAGAAAATTTTGAGTTTTTGAGGTG
ATGAGGGGCGCCATTTTTATTTTTTCATTTGTCAATCTTNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTAAATTAGTGTGTGGTGATTAGTAAAAG
CTTGATTACAGGCTATTACTATTTCGTCCACGTAACTATTGGTGGTTGTC
TTCATGCTTTGAATTATTGCTAGACCAGTCAGTTTTCAAAGACAGTATTT
TTATATGAAACTGACTTTTGGTAAATTTTGAATTAAAGTGTGGTCAATCA
GGCGTCTTATATGAAACAAAAACTTATGTAAAAATGTCTATTTCAAGTTG
ATTACAATTATGGTCAGAATTGTCTTGACATTTTCAGGGCATTTTTGTGT
TTTTCAGAATTTATTGATTGTGTGAAAATGGTAACTTCAAGCTTTCTACT
TTTATAATTGGACATTTTAATTTGGAAAGGGTTAAATGGCTGTCAGGTTA
TATTTGAATTGGATAACTATTTTGTGCTTATTGTTAAGATATTATGGAGT
GGAAATTTATCAATTAAAAAACTATAAGCAATTTTCAAAAATGAAAATAA
TAGTAAGATGAGTGTTTTTCTTTTCTGGTGGTTCTTGAGGTAATAAGAGA
CTTGGATGCTGAATTTCAGCCTCAAAATATATTTCAGGATATATTTTCTT
ATATTTTGTGCAGTGTGTAGGCCTGTCGTCATGCAAAAAGAACCAATTCC
ATTGCGCAAAAGGATGTGTAAATGTTTTTCTTGAACTTTTGCACACTGAT
GCAAAATAGGGATATCTAAAATGTGACTGAGCTCGATTTTCGAAAACATA
TTGTTGTGGCCAAAAATGCGGGAAATATGCCGGAAAAAACCGTGTTCTCN
GAAAACATATTGTTGTGGTCGAAAATGCGGGAAATATGCCAGAAAAACCG
GTGTTCTGGCATTTTTCTGGAGATTTCATCAATAGCTTTTTCTAATTTTT
TTTTGCACAAAAAAGATGCTTATTAGGAATGGCAACAACATGGTCCAGTC
CGATTCTTGAGAAAAGCTTTTGCTTATTTTTATCAGACTTTTTCTCAATA
TTTCGTTGTTTTTTTCACACAAAAACATTATTGATAACAATGCCCACCAT
CAACCATGGTTCAATTGTTCTCCTTATTGCTATCTAACTTTCATCATCAG
GTAATCAGCATGTGGCTTGTTAGCACTAAAATAGCTGGCACTTCCTTTTT
TTAGATTCCCTTTTAATTCTTAGCCTGTGTCATATTTTTCCTTGCATTGC
TGACCATTCTTTGAATCCAAAACTGCTTGTCTTTGGTTCTTTTTCTTTTG
TTTTATTTTCAGGAGAATTCACGCAGAACAACTCTTGGTGGAGTATGTTA
CTCGACGCGATGTCTCTCTTGGTCAAGTTTTACTGAATACAAAACAACCA
TGTAAGTA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055109TCONS_00055109Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_250supercontigscaffold_250:217053..221360 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.06	0.89	1.39	2.05	1.72	0.84	2.06	3.25	1.19	0.95	1.24	1.35	0.7	0.86	2.2	2.83	3.56	3.55	2.12	1.52	6.91	7.26	3.68	6.17	0.39	0.43	1.16	2.18	3.71	2.62