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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_102:309324..328514+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_029300 ID=XLOC_029300|Name=XLOC_029300|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=19191bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_102:309324..328514+ (Clytia hemisphaerica)
aaagaatcccTTGAAAACCTTCTCAATGATCCCCttgaaaagtatgaaaa
atgaacaaaaacctCTTGGAAAATTCAAGCACCGAGCCCAGCCAGGCCCT
TCCCCCTGGAAAAATTTGTAGATAGATACTGTACCCCCGTCTTTTAAAAA
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gttttctgattgtctttttaatctgccatgaagtgttataaaattcctta
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TTCCACTAACTGTCCTTTCCCTTAGCCAATAGAAACGtaataaattatct
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aaacaatcaaacaaatacaacagttagtttagcttattgctaaatagaat
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ATTTTATTCTGTTCTGTTCTCCTCTAACCCGTCGAAGCCATTAGTTGGAG
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TATTATTCTTAGAAAAAGAAGATATATATTTAGCTTTGTGCCGTTTTATG
TTTTATGTAGTACTCTCAGTAATTGATGTTGATTGTTGAGAAACTTTTTC
ATGCGCACTGTTTACATCTATAGTGAAGATGTGCTATTTCACAAATCTTT
AGAAAACAATATGAAGATGTGCTATTGCACAAATTTTTAGGAATAGCTCA
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AGTAAAGTTTATGAtggaaagaaaaacaagttcagaaaaaaatcaacaaa
tccaTGGCTGCTGGGCGTGTAACCTCAAATTTAATAATGATATTTAAAAC
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ACccacaatttttttgtaaatcaagtttgttctgactttgtattttaatg
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AACAGCAGCCTTTTCAGTGGAAAAAAAAcactgccctgcctttctaaaat
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TTTTCAACATGAAGTTCAAGCaagtgttttcattttatttgaataaaatt
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tatcgcacgcctcaaatgatgcagcctgcaaaacgtttcactttttttca
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taatttgcgattttttgcgtNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ccctcaaattgaccaaaaaagatatcaaaagtttattcaccgacattttg
aattttttatttatttttgaaacaataacaatccaCTGGCCACGGCCTAA
ACTGCTCAAAAATTGAGTGCATAATAATAGGAGATGATTGCTTGATCAAT
AATTGCTTAATCGATAATTGCTTAATAAAATTTGCGTAAAAAAGCAGTTA
CAATAAATTAACAATGAAATAGTTAAAAGAAGAAAGCTCTCAAGTAATAT
AACTTGAGAGTTTTCTACAGGTCAAATGGGTCACTAAAAAGTACTAATCA
ATTGACTAATAAAAtcagttttgaaagtctttgtATATTTATCGTTGGCT
TGTGTCTTCATATGAAGAATGACTCACTTATACTTATTATTGTTACCTAC
TATGgtaaaatctttcattttgaCCTCAGCATTTCCTCAAGTGTTTGAGT
GTTTTAAAACATGAATTTTTTATCTCTACCACCATGATCATCCACCCTTT
CTTGCAATTTTCTTTTCTACTTCACACACATAGGACGTCGGACAGTCAGG
GCATTTTAAGCGATATACAACGTTGTGTTTGTGTTCAGTTTTGGTTTTGT
CTTTTACGCTAAATAATGATCTCaaccttttttctttaaatgcCACTtta
acaatggctctattggtCTAAAGATACTTCTCACCCATTTCGTCTCTTAG
GAGGTTATTGGTATGGACCGTATGAAAGCCATCGTAGATGAACGACCTCT
TTCCTTATACTGGGGAACAGCAACCACGGGAAAACCACATATTGCATACT
TTGTTCCAATGACCAAAATTGCCGATTTTCTTAAAGCTGGCTGTGAGGTA
AAAAAATCATGTCAGAAAAtcgtataattttttttgtatcaaatattttt
ctgattttgtatTTATATCATCATAAAACAGACAATTTGCACATTCTTTA
CACTGTAAGAAAATAGAACTGATAATAACATGTTTTTTGTTCACAATCAT
TCAGGTGACAATTTTATTTGCTGACCTCCATGCTTATTTGGATAACATGA
AAGCACCATGGGAGTTGTTGGAGAAAAGAGTGGTCTACTACCAAGAAATC
ATCAAGGTGCCCTCATTAGTTTGATAGTTTGATGtgttatcattattatt
aatCCTCTAATTTATCAAAGGGAAGAAACTTCATAGCCTGAACAAAATTT
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ttgataaatcTCTAATTCTCTTCATACATAGGCTATGTTGGAGGCATTAG
ATGTTCCTTTGGAAAAATTGAAGTTTGTAAAGGGAACAGATTATCAACTT
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AGAGGTTGTACCTGGTTGTACAGAGTTTTGTTTATTATAATTACTAAAGC
AACAATCAATCAATTTGTCCTTTTTTATTTCAGGGAGTATACTCTGGATG
TTTTCAAACTGACAACAGTTGCCACAGAGGTAATTAACTTATATGATTTG
ACAGGTagctttctttttataaataaatatatgtgtaaacttttatttat
acttAAAATGGCATGAGATTATGCAGGATTATGTTATGATTatgatgttt
ttctatttcagCATGACTGTAAGAAAGCTGGATCAGAAGTTGTCAAGCAA
GTCCAATATCCATTATTGAGTGGTCTTTTGTACCCAGGACTTCAGGTAGG
CTAGTTTTAATTGTATAGGAAAagtaatttcaagattttttagaaaatta
ccAAGTTGACCAAGGTTTCCAGTGATTTATCTATACAATAGAACAATAGT
TTTTTCCTGTAGCTGACCAAAATCATTTGTATAGTTAAAAAACCTATAAG
AtactttttttgtaattcttaAAAAACTTTTGCTACCCTTTCAGGCACTT
GATGAAGAATACTTGAAGGTTGATGCACAGTTTGGTGGTGTTGATCAAAG
AAAGATCTtcacttttgctgaaaaggtttGTTACTTTCTCCTTTCTTAAG
ATTTTATCTTCAAAGCTCATTTTTCAATCAACGAAAAAAGGCAATTAAAG
TCTGTTTCAAAGAAggcaaatcaaatcaaatagtggtattgtgcttgttg
aaaagataatatgGAGTGGAATGTCTgtagaagtttttttttcttttact
ttagtACTTACCTGCATTGGGGTACAAGAAGAGGATCCACCTGATGAATC
CAATGGGTAATAAGAAAGACCAAGCGTTTTCTACCTATCACCATTACTGA
ATATCTTATTTATGAAAAGGGCCGATAATGATTATCTAAGATAGATTCAA
TTTGCTGAGACAAATTTTTCCATTAAGTCTgctctttttctgaaaaagat
gTAATATAAAATTTCAATCCAATTTGTTTTACGAAATTTAACTGTAGTTT
AATGATATTACCTTTCTTCGTTAAATCTTTAGTACCTGGATTGACTGGTG
CTAAAATGAGCTCATCAGAAGCTGTAAGTTTTGAGTTTGTTTTAAGTTTC
TGTATTTTGtcttttaaattctttaaatttcCCCTTGATTAACCAAGaat
tcattttatttcaaatgcTAGTTTAACCCCAAAGAAATGCATCTTTCTAG
TACAAACTACAATGAAACTTTTACTCTAATTATAACCtgctttaattttc
tttcttttttcaggaTTCCAAAATTGATTTACTGGACGAGCCCAAAGCct
taaagaaaaagatttcTAAGGTTTGTTTATACATACTTGGTAGATTCCAT
AATATTAGGATAttgaatttgcaaaaaaaaaatacttctggCTCGCAGGT
ATTTTATCATCTGAATTgttccttttcttttttgttcacAAAGTATATCT
CCTTTTTAAGGCATTTTGCGAAGAaggaaacatcaaagaaaatgGAATTC
TTTCTTTCTGTAAATTTGTGCTCTATCCCATCATGGAACTCAAAGGACAA
GAAGGTAAATAGAATTCGTAcatgtgttttttttaaatatttttttattc
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ATCGAAAAAAGCATGACACACTCTGTATTGGGTACGcctttattggacct
accccggtggaggtcctataaattaaccgttgtatgttcgttcgttcgtt
cgttagttaccagcttttctccagattggctcattagttttttctgattt
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tttcggaaaacatattttttggccaaatttgagccaaaaaaaggctaaaa
aacgggttttttggactttttgaaaaattggatcattaattttttctgat
tttttgtatgaaagtaaaaaatggctcaagcagatttttgcaaaaaaatt
tttttggctcaaaaacgcatgtttatctataagaatcactattaataagc
atacatcaatgttcttagtcaaatgctcattttttttatgagatagatgt
tttttttgctcacgagggcttacttttgaagaatatgtgtgtttagacat
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caaatttgggtcaaaaaacggttttttttagactttgtgaaaaattggat
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TGGCGGTGATATTGTCTTCCAGAAATATGAAGACTTGGAACAAATATTTG
CCGATAAGGTATCGTCACTACGATTTTCACACCATTTTAAAAGGAAAGAG
ATTTGGTTTCTTCAACCATGGAAACAAAGCgagtttttaaaaactttaag
aaTGACTCTTTTTGACGATCAAAATCAAAAGTCCAATTCATCAAAAGCTC
CaagacgcgaaaaaaaaaacaagaaaaaagtcTCTATCTCAGCTAAAGCA
TTTGCGAGTTTTTGTGAAAGTGCTTTATTTCTTTGACGCGTTCTCTATTT
CTATTCAGTTATATTTGgataattttgatttcagaaattacatccaggag
atttcaaaaatggaGTCAGTGATTATTTAAACCAGGTatttatttgattg
acattAATATCGGTATTGAGCATATGCAGACCCAGTTTtagtacctaaac
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ATTTTCGATTAAATCTCGATTAGCGCCGATTAACGCAGAACCGCCGGTTG
TTCGAAAAAAATTACGCTTTAATCTGGATTAAATCCCGATTAAATTGGCC
AAATTTTAATCCTGCTCTGACCCAGGATTAACGAGGATTAAGAAgctttt
ttctgcaaaaaaagtgaagtcgctgcattgaagtgataaattcgaacgaa
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AAGATCTTTAAAAACACAGGCAAAAAGTCCACGATTAGTTAAAATCTGAC
GTTCGAACAACGGAAGTTAATCGCCGGGATTAACTAATCGAAATCTAATC
GCGATTAGCGGTAATCGGGACTTAATCTAAtcgacttttgaacaaccggg
caaCTGATTATTAAAAGGTTTTGCTTGCAAGCTTTCTGGCTGATTTCTTT
GGTAATAGTGATTTGAGCTATAGCTATAGCTCTTTTCTTACGAATGCTAA
CTgcatgaaaatttatttattactTTAAAATATTCCCCATCTGTGTTCTT
CCTAAGCTATTGCAACCAATCcgaacaaaatttcaaagtgcaGAATTGAA
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ACAATTCGTAAATATTTCTGCACTAAATCTTGCCAAGACAAAATGGTTCC
ATACTACTGACATTTTCACCATCATTGATATGGGAGCATTCTCATCAAAT
ATTACCATAAATCCCATTGCGTTCCGCGTCTCATACGTCATGATTATTTC
AACTAGAAATTTGTACTAGTTCCAATCCCCTAGTTCACTTCGAAATGATT
GGAAAACCGTGAAAGTTATTACCTTTCTTTTGATTCTGTAATTAAATTAA
CTTGGGATCGCAAGTCGTACAAACGAATAAATTTGTGCAGATTTGTTATT
ATTAGATTCGGTGTGACGCTGTCAAAAAGTGATATGACACTTGTACAAAT
TTTCAACCAGTGTAATCATTGAAATGATGTTTTATGATTAATTTTCTTAA
TGTTTTAGAGCAACCGAAAGGAGGTGCTACACCACAACGAGAAGTCACAC
CTGCACGACTTGACTTGAGAATCGGCAAAATCGTTTCCGTTTCCAACGTA
AGTTTCTAAActcagtgttaaaagttcttccgtctcagacagCTTTGACC
ACCATAACCTCTCCTTAAAACTCGACAACAGGGTACTGCTTTTTAAATCA
CTGACTGATTTCTTCATCTTTTTACTATCCAAATTTCTACCAAAAAATCA
ATATTCTCCCCCTTTTCCCATGTAGCACCCAGACGCCGAATCACTTTACG
TCGAACAAATTGACGTTGGAGAGGAGAAACCACGTACTGTTGTTAGTGGT
TTACGTCAATACGTTACGTTAGATGACCTAAATAATCGTCTTGTTGTTTT
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aaagttttctttttaatttggcTGACTTTGGAGAATGAAGCTGACATCTA
ATTTCTTTTTCGGTATTGTCAACACTGAGGCTGTGAAATGCTTAACGAAA
TACTTCCCACAAATATTGCAAAAGAAACTGAACAGTTTAAGATCGTTCCG
TGTGGATAGCAATAAAAATTAAAGGAGATGTTACGTAAATGCCCGAATGT
GAAGCAAGCTTTTCagtttatcaattttcttttatttttaggtGTGAAAT
CGGAAGGAATGTTGCTGGCTGCTTCTAAAACAAAGTAAGTGTATCTTCGA
GGCGAATGGCGAAACTTGGTTTACTTGCTCTTCAAAACAACAATTGTTGA
TCGAATTAATAAATCGAACTCCGAACATGTTATTAGTCAGAACGTTTTGA
TTAAAGCAATTGATTAAACTTAACCCAAGTAACTGTTTTTGCCGCTTTCC
CATGTTCTAGCGATGTCTGCAGTAATGagattattgttcactctccttgc
ctctttagataattttttgcagcattttaatttcgttttttatcgaaaat
cactcatcgaagatttatgatttttctgtgatagtGAGATTCGTCTATTC
AATTGCctattataagtcgttatgacgttttaagttgtgagaaagatgca
aaagtgctatgtataagaaattgaatgtcgACACCGACAATGTTCACTTC
AACCTTAAAAACCTTTCCTTGCCGCCATGACAGTTTCTCTTTGTGGAGAA
AGCTCTGTTTTTGCTAGAGTCTGTTTTGTAACCTACTGACCGTCTTCTTT
TCTTTTAGTATGGATGGACAGCGAGTGGTAGTACCGTTAGATCCACCCTC
CGACAGCAAACCTGGAGATCGTGTCTACGTTGAAGGATTCTCACACGAAC
AACATGGTGGTAAGTCCTACactcctttttggacctaccccggtggaggt
cctataaattaattcgttcgttcgttcgttcgttcgttagttaccagctt
ttctcgagattggctcattagttttttccgattttttgcacaaagatgca
taactataaaccctcgaatgtgacggagctcgattttcgagaaaaaaaat
gctTAATAATGAAAGAATATtcaaagagcatgaaattttggtttctaaac
ggtttttttataagaaacaaacgactaattttaaaagatcgtcactattt
gtgttctgaatgattgtttaatggtcacgctcacgtagatatcaattata
tatgtgttaaatgcataaccaggtaggtccataaaagtatcacttgtttt
tcatAGTAATGGGGTGATTTTTCCTAAAAAGTAAATTTCCCAGGGGATTT
ATTCACAGGGGCAAATTTCATCTACTTTTTCTAATGAACGTTTAGGAATG
TtcacaaattcaaaaagtttaaggggttgaaaaataaatgcaaaatTTTC
CTTCGAGGCCCCCCCCCCTGACCCTTGAAATAGATTTTAcgtgaaaataa
tttcaaaatattttgcattgacAGAACCTGACGAACAACTTAACCCAAAG
AAGAAAGTCTTCGAAACATTGAAACCCAACCTCTTAGTATCGGACGAACA
ACGAGCTGAATTTAACGGACAACCCATGAAAACATCATTAGGTGAAATCA
CTGCCAAACTGGCGAATGCAGAGATCAGTTAGACTCAGGTGATCTACGTT
TTAaggatttgaattttgattttattttttacactTATTGTTTTGTTGTC
GATTAGAAGCATCTCCAAAGGCCCTTTAATTTAAAGACCAGGCCACGTCA
TATGGACTTTGTATACATTTGTATTGCATTGCATTgcacgcttttcttta
taagaacacgaggctgaaaattggccaaagcATACGAATATATttagaac
aatctgagcctcagatttcaaaaatactaagAAAGAACTGATCTTCAACA
GATTTAACAGACTTTAAACCCTTTTTtaagaatatcgtaagaatatttaa
aacatataGAATTTGGAAATATTAAGAACGGCTCAGCctgagcaaaaatt
tactggtttttataaaagagggatgggatggagtttttataagatacttc
actaattggtcatttgatgacgcgttctttagaaaaagtttcaACAATAT
TGTTACAGGTCaatgaccaaccaaatcaagtaagagcttgtaaaaaacTG
CAACTCGTCCCATAAAAGAAGCGTGTTATTGTACAATCTGATGGATTTCT
CTAGATATTTCCCTTCGTAGCATATCGTTTTTGGTCTCTTTTTTTTATTC
CGTGATgcatttcaaatgttttgagcGGTTTGGGCGTCATTCACTTCAAG
GGTCACTTTGCACGATGCTAAGTTTTTGTTCATAAATTAGGAGgaaaatg
tgatttttataaaatatttatatttattttactgtattgaaatttcttaa
tacaaaaacaaacaaacaaacaaagaatgtTCACTTctttgaacttttta
ttttacaaaacGTTTTTTCGATCAAAATACAATTTAAAACATATTGTGTT
TGTTTATAACCTTCTTAagaatttgaccaattttagGTGAATTTGTGGAC
AATTTCGATAGGAACGTTTAAGAACATTAAttgtagacgatgttatcgtc
cgttacagtgatagtaaaggcgggaaaatatggcggtatggcgttatggt
ggTATACGGGAAAAATCGACGGGAGAGTTtcagactggcaactctaccga
ctgtaaactcttttcggcaaaaaaacccgtttgcgaatttttttccgctt
tgggcttttttcttcgatagtgattcgtcttagactataacatagtctac
aTTAATTGTTGCTGTTGTTTTTACATTACCGAGGTGACCTCAAGAATTTG
TACGAGTTTGATGGCTAGCTTTGTCCGACATTTCTGCACTGAATTTCTCT
CTCCattgtaaagaggaaaggcTTACTTATACTATGGAATATTAATTTAT
AAACATTCAAAGtgaaaatttactttttgaaaaagttcaaaacaTATCAC
AATCGACGCGATTTTACACAGAAAACTATTGCTTCTTACTTCTTACTTAA
TTGATAATCAGCTGTATTTTTATTGACTACTGCAAAAATACCTTTggtaa
ataaatttaaatattaTTTTGCCTCCAAAAATTCGCTAAATtctccaaaa
ttttcattttgaaataatgaaaattgccaaaatccttttcgccaaaattt
cttcgaaAGGGAGGCGGGAGTTAAAAAAAGCGAGTCAgaggaatttctca
aaaataatcctCACTGGAACATATTAAATCTTATCCAGGATATGCTTATA
CTAGCCTTTAGAACCTTGAAGGGCCGAAATCACGTTTGCTGATTTTTATG
ACAGCGATTGGCTAAGAAATCTTAAGAAAGCAATTATTACGCGACGAAAA
TTCTCTATACTCCACGTCAAAAGCCAAAGGATCAAAGAAACGGATGAGCA
CTTTTTAACAAAAACCTTATGAGAATAGGGGTGTGTAGGTGTAATCTGGT
TCTCTCGCTAACAATATAACAGAAGATTTTATATAACAAAGAGTTTGTGC
AAGATCCTCTGAAAACCTGGCCattcaaaattaaaagatttttgaactAC
ACAAGATACACAAGAAGTCTAATTCTTCGAAGATaaagattaaaatttta
atattatttcgaatattattatattttgTCATATCTCAAAATTTGCTAAA
ATGTATAAAAAAACTATAGCCAAAATCTATATAACTCCGCAAGTTCGTCC
ACTTCTTAAAACATTGGTGCGACTtctgaaaaagagaaaagagattGAAT
TTTCCTTTAATCATCTCAACGAAACGGTAAATTTTAGAGGGGAATGAGAT
GGAAGTAAAAGAAAATCTCAGCTTTTTAACTTACAAAGATCTCCTTAACT
CTAGGCTAGATTCAGACCACAGaatatttagaaaatatttaacCAAATCA
AATGTCTTTTCTAACCTTTGCATTGGCAGATTTGGCAACCATTTTTGTCT
TGTTCAAATCCATTTGGACATCGCATTCTGCATTGTCTTTGTGGGCATTC
TGTAGAGAATATTTATAAGTAATTTTGTTGCAGAGAACAAGTTACACCTC
CCAAGGTACCGTAGGACAGCTAAACTCTCTCCAATCCAGAGGAAACATTT
TTGGTGGCATTTCCAAGATCTTTCCGGTGTTTTTAAGGGTATACCTGCTT
TTTTGCTGCGTACAAACACGTAGATAATACACAACACCTAACAAATTTAA
ATCACTTTTACATTCCCCGCGTGTTGGCCTTTTTCCGCTATAGTGGCTAT
AGGAAAACTTCCCTGGGAACGAGAAAGTTTAACTGTCCTACAGTATTTAG
ATTAAGCTTTCATATAAGAGTCGCCTGAGCTTTCAGCATTAGGATTGTCC
TATTCTTGGACAACATGCAAGATATATTCCATTATTCCTGATTTAGCACT
TTCGATTACTCCCTTTTATTTGGTTAGTGATACAGGCAAGTTGAATCAAC
TAAACAGTTCCCTTACCGTTGCATTTGCAGATCTCACAGCCGTTGGCGTT
CTTTTGGAATCCATTTTTGCAGAACATACGACATTGTTGTTGTGGACATT
CTAAAAACATGCAATATAGATATATTAAAACATTGCCCAAGCACTGATAG
TAATAGCCTCTTAGAAACAGTACACTACACCTCCNACATGCAATATAGAT
ATATTAACATTGCCCAAGCACTGATAATAATAGCCTCTTAGAAACAGTAC
ACTACACCCCCtgctcacagacccggtaggattttttcagccagtgggga
taaaaataacagattgaaactcgattgggattgatattcccgtatttttt
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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_102 | supercontig | scaffold_102:309324..328514 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| YARS | tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic | Homo Sapiens |
|
