XLOC_025400 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_025400
Unique NameXLOC_025400
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0002864:8053..13805+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_025400 ID=XLOC_025400|Name=XLOC_025400|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=5753bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002864:8053..13805+ (Clytia hemisphaerica)
TATTTCTGAGCGGCtccgttcaaaacttttccTCTAGCCTGCTATTCAGG
TTCAGCCAATCATCTTTCAGAAGAATTTTAAATCAACCAATCACAGCACA
GTAAATAAAAAGTTGTCCAACCGCCGCGAATTTTCAAGATGAGTACATTT
ATTTCGAACTTGATGATTGACTCGTATGGTTGGGACTTTGATCGATGAAG
AACATTGCTTGATTTTCATATTAGTTTTCATAACTTAAAATTATAATTTT
ACAATGAGCTCCAACATTCTGAGGGAAAACAATGCTCTTACGAATAAGGT
ATATCTATCAATCTTTTTGTTTAATGACATTTCGACGATGATTCATTCAT
CCTCGTCCCTCTTAAATCTCAGAAgacttaaaaaaaaatgcaaatgcACT
GGTCGCTTAGGTGACCTCTagggggttatcctgctgtgttgcaacAACAA
GGGCTGtagtatagtggtcattgactttggttgctgcacaggcgactgag
gttcgattcccactcgcagcggttcacttggcaagtgaatgaaccttcgt
cCGGGTCAGCCCATGCCATGTGAGAGGAATTGGGttgtcagttcaaggtg
ctggcTGACAAGGCgctaattgaaagcgtctatcGTTGCGCCCTTTGGAT
AGTAAAGGGGAAACTATAGACTGATTTAAGCCCATAGAACAAAAAATTAC
CACTTTAAAAtggttgaaaactaaaaatatggcaaatttgatgttttgtg
acgtcatttgggccGTAAATAAGGggacccgtccatattcatttgacaac
acaaaacatcaaattgacgttatcctctgaaACCCCCACCCCCACAGATA
ATGTCAAGCAATGTACTGATGTATACCAAAAGTTgtagccatttttcatc
aaagttttcccgttCCGTCACAAAGTCCATACTTGGTTGTACCGGTGcgt
gtatgtgttcttttaactaatgacctttatttaaaaagaaattaaaagct
ccacttGGCGCTAGGTCTGTGCCGTGCTTTAGGCGTACCACCTTCTNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTCGCCAATTTTGGTGCAGTTCAG
CAGAATTAATTTTGgtgatttgataaaatttctagATTTGGCgcgaatta
attttggcgagcaacccattttttatcaatattttagcttaaaaaaaagg
ggaaaagggtttttaggagaaatagagactaaattgaaagaaaattaaat
ttggcaagaGTTTATTTTGGCAAATGACCTATAAATTTCTTTCCGCGAGG
TAAATCCAAACTTTTTGCTATTAGAAGTGGGGAAAgactaacttgaattt
tgagctgtaTAGGGGTAAAAGGACACAACAGAAAGGGTGTCACCTCAAGG
CTTAGTCAGATAAATAAAagctactttaggcgtacaaacttttgcgagga
caaaaaatcgcaaaattcacAACATTTACTAAAGTACTTCTTTACGCTAA
CGATAACTTCCTAGAAAAATAAAAGAGTAAATTTATTACCAAACCCCTTA
AAAGCCTACCATAACACTAAGGGTTGTTGACTGttgtagattttttattt
tcacatatCATGTGTGACCATACAATTAATTCTTCAATAAGGGACATGAA
ATTCTTGCAAGCAACAAGCTTATCTTTTGTATTTGCCAGGCAATTAGCAG
ACAAATTGCTGGCTGACATAACTTAAAAAGTGCCGGCAAAAAACAGAACT
TTTTTACTTTGATGGCAGCTAATTACCAGATTTTTTCTTTGCAGATTGCC
CGCAAAATTCTCCCCTTCGGCCAaatcattttctaaaaaacacAAATGCT
GCTTGACAACTGTCGTCTGGCTTAATGCTGTAAATGATAGATTGCCAGAC
TCTTAAACCTTCTAACCTTAAACACCATTTGATATATGTTTAATGTGATT
CTTTTCAAGGTACCCTGTTCTGCaccattgaaaaaagaaatcaaagatat
TCCTTTGTCATCCAAAGTTTCTACagataaagaaaatgataaaaagtaag
TGTGATGAACCgtggaaaatttgaaatatctgGCCATTTTTCTCATTATT
GTTACTTTTAAATTAGTGCTAAAGTAAAATCTCTTGCATAGAAAATAGGC
AACTCATTTTCTATCCAAAACATGTGACCTGCATGATTTCACACAAACAC
AGAGCCTGAACCGTCAAAAAAAATCTCCCAAAAATCTATTTCCAGATTTT
CTTTAAATGTGTCACATGAAAACAACTGAAGTAATAAGTTCGATCTGCCG
TTCCAAATACAGCACACATCTTATTTTTTAAGGCCTCACTTTATTTGCTT
ATGGAAAATGTTCAAATGTTCAGCTGTTTCATAAAGTTTgccaaataaga
atttttttcaaatcatcaaaacatttcATGTCATCCCCAGCACACATTAG
ACCTGTATCAGCATGTATCATGATGCTTTTTGTACCTTAGGAGTTGGAGT
TTAAAAGACTTTGATGTTGGCAAACCACTTGGAAAAGGTTAGTTTTCGCT
GCTTTTTTTCCTCAAACAGACATGACATCCTACAAGTGGTTGCTGTATTC
TGTAcataaaatgaaataataaacTGATTCaggattattattttttatgc
cATAATTATACTCTAGTTTTAGGGGGCCAACCCTTAGGTCATCTGTGTCA
TCTTTTGTGGGATGTAACCccatttgattgtttgaaagtAGATAGGATCA
Tgg
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00041427TCONS_00041427Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002864supercontigsc0002864:8053..13805 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
27.66	23.54	137.55	145.82	62.89	47.59	14.18	22.08	15.61	18.24	14.71	9.48	4.48	3.64	8.8	11.06	19.51	14.8	0.76	2.05	10.16	9.34	12.07	12.67	21.12	24.22	4.4	3.82	8.32	9.51