XLOC_025291 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_025291
Unique NameXLOC_025291
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0002792:3020..12394-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_025291 ID=XLOC_025291|Name=XLOC_025291|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9375bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002792:3020..12394- (Clytia hemisphaerica)
CTTTTATCATCTACAATGAACTACTTACGTGGCTTTCGTGCAGTGTTACA
CTTGACATTGATGACTTTGGTAACATCAGTTTCTCTGCATCCTCCTGCTG
AACCAAATGGCCACCTCCTTGTTGTATATGCTAAAATTGAGCAAAATCAT
GATAAATAATCATTCGGGTAAGTCTTTATTTTTATTAGTCCTCTGTCAAC
TTCTGAAAGTACAAAACCTATATGCTTACTTACCAGGAGAAGAAACTAAA
ATGAATTCTCAGCAAAATTACTATAAATGCTTTTGCTATGAAAAAGGAAT
ATTTTAAGTGATTTGGTATGAAACTAGGAAGAATTGTTCATACTCAAACG
TGTCATGGAAAATGTGATTGGACTTTCTTCAGAGAAAAATAACTCAACGA
AAATGCAAGGTTTGTGCGGGCTATCAAACAAGGGAGCACGATACTTAAAC
TTTGGGCTGTTTTTTAGATTTAAACAACGTAGCAATAAAAAGCCACAAAA
TGAAATGTTCACAGCCTACACTAGCATCCTAAGGCCACAATCGCGAGTAA
CTTGTGTTCACGCTGCCCAGCTGACTGATAATTTTTCCTAATTTTCCAAT
TATTTTGAGTTGGAAACTTACATAATTGTTGAATTTTATCCAGTTTTATC
CTTCCCTTCATCTGCCATATTTGGGCGGTTTAAGTTATAACCCGTTACCT
CCCCCCTGTGGATGGATTTTCCATAGCAGTTTGCTTCTGAAAAAATTCAC
GATTTCCGTAGCATTTATTAAGATTTTTCATGAGAAAATCTTGGCTTTTC
CAATATATGGCAAGAAATTTGATTTCTGCTTAAGTCATAGTTTGAAAGTC
AATTTTTATATTTTTTTTTCACTGACCAACTGGCTCACTTTTTTTTTGCC
TCAAACAATGCGAACACCAGTAATTTGTGATTGTGGCCCTAACTTTCAGT
ACACTATGTGCACCCCCCCCAGCGGTTTGCGTGATTGCGTGAATGGACAT
TTTCGGTTATGTCCAGACGGTGTCAATCGAACAACTTCGAACAAAAATCG
CAATCGAACCAATCGAACGTAATCGAACGCGGTCGAATAATTGCGATTCG
ATTGTCGAACGTAATCGAATCTCAATCGAATGGCCGATTGCTGGGTAATA
TTCGATTGCGTTCGAGTAAGGTTAGATTGGTTCAATTGATTGTTGACTAT
GTTCGATTGGTTCAATCAATTGATTGTCAATTACATTGGATTAATCTTCG
ATATCGTTCGATTACTATTATGTACGATGAGTTTGATTGCGATTGAGCGC
TTAAGTACCATACTAAAGCGAATAAAATCTAATACAATTGAATCAATCGA
ACGTAATCGAATACGATCGAACGTAATCGAAGCAATCGAACAGCAAATCC
TGGGTAATATTCGATTGCGATTCGATTGCGTTCGACAATCGAATTTCAAT
TATTCGATTGCGTTCAATTGCATTCGATTGATTCGACGTTCGATTCGTTC
GATTGACACCGTCTGGTTATGTGAATGCGTGAAAATTGAAAAAAAAATGT
GAGAATTGAGAAAACTTGCGTGAACGTGAAAATGTACTTTTTCGTGAATG
CGTGAATCTGGGCTATTTTGTTCGTGAATACATGAATTTTCCATTTTTTC
TACCGATTATGTGCAGTTTTCCCGATTTTCCAATGTTTCCCTGATTTTTC
CTAAAAGATTTTCCGATTGCGTGAAACTCGAAGAAAATTTGCGTGAATGT
GTGAATTTCGAAAAATATTGCGTGATTGCGTGAATTGAGGATCCGCTGGG
GGGGGGGCTCCTTTGTAATTGAAGTTATCAAAATTGCAAAATAAATTTTT
GTTTTGAATATTAACAATGGTGATTAAAAATATATATTTTTTTCTTATGC
GTTCAATGACAATTGAGAAAGCTAAGATTAAAAAAACAAATTGCCTTTTC
CTTCCTAGGTGAGACAAAATTATTCATTGTCCTACAGGCCTGGCGAACAC
TGCTATTTCAAATTCAGCAAAGCTAGAGGATGAACTTAATGTCTAAATTA
AATTTAATTCTCTTAAATTAAATTAAATTGGGACAATTAGTTAAATTTGA
CTTATCTTTTCTGTATCAGAAAATCAGCTTGAATAACCTTAAGGGAAGAA
ATTTTCGCGGAATTTAATTTCGCAAATCAGAGTTTCAAAATGGCAAATTT
CGCGGAATTTAATTTCGCGAATGAGCCAATTTTAAAAGTTTCACGGAATT
TAATTTCGCGATGGAGAAGAATTTATCAACTTAGATTAACTTTTAAGCAT
CACGGAGTTGTTTATATTTGTTTATATTTGATAAAAAATTCACGTTGTAA
TGCTTAAAAATCAATTGTGTCCATCTTTTTTGGTAATACCCGGTCAAAAA
CAACAAAATGAAAGAAGAAGAAAAAAATCGAATTTCGCGGAATTTAATTT
CGCGGTTTAACAATTCTGGTGTGTTTCGCGGAATTTAGTTAAATTCCGCG
AAAATTTCTTCCCTTAAGGTAGGATAAAGGTGACATAAAGGAATTATATT
TTCAATTTTCAATTGTCATTGGTAGAGGAAAGTATTTTACTTACTTGATA
ATTCATTAATGATGAATGGATTTAATGCAGGTCTTACTCGTCCGGTCTTT
TTATCTGCTAATCCTAAAGCTGAACTTCTAATAGATGAAAATTAAAAATG
TTATTAAAGTTTGAGTTAAATTTTGCATTTGTCAACTAAGATCTCTAAAT
CCTTGGCTGTTGACAAGCCTGTTGCCCCAGGTTTTACTCTTTTTTTTCAA
TATGGGTTTGACTAGAGATAAACAAATGGCTGTTATTTATCTCCCTAAGA
TGACTCTACTTAAATAAATCAGAAAATAATGATCTGCATATGGGTAGGTT
GGCAATCAATTTTTGAACAATTTAATGCAAATTATTTTTTTGACAAACAT
TATTTACCTCATGTAGAAACATCTAAGAAACATCAAAAATGATTAGGAAA
CCTTTCATTATTTTAGGTGACATTGTAGTTCAGTAGCCTTCTATGAATAC
ACCGTTTAGGAGTCTCGCTATCTTCACGGTACTCCATTGCAGGCGGGTAA
AAATGGTNTAGATATATGGGTGACTCTTCCTAGTGATATTAAGTAAAAAT
TGTTGCTTACTTTTTAAGTTCGTCCTTTGTAAATTTTAAACCCAGGATTA
AATTTACAAATTTGCGCCAAGATGCCATGTTATTTGTTTTCGCTCTAATT
CTTGTCATCTCCATGTCCGTTAAAAAAATGTGTGGTGTGCAATCGCCCAG
CTGTTTTAACTGAATGGAGAAAATTTTGAATCATTTGATTTTTTATGTTT
TGTATCAAGTTTCAGATAGCAATTTATATCTTACAGGGGTGCTTGTCTGA
AAGGTGTGAAAGACAAGTTTAATTAGTGTTTTATGGGAAGTGCCCTCAAA
GAAATATTGGTTCTCGGACAAAATCATAATAAATGTATTTCTTAAAATCT
AGGTTTAGACGGTTGAGATCTAAAAGATTTGAAATGAGGGTGACATTTGA
GATTAGCGTTTAAAAGTAGCGAAAGTTTCTCACCCCGGTTGATGTATCAT
TAGATGAATTATTTGAAGTTAGGCTTGATTGGTTGGTTGCTGTCTGGCTT
TCTATTGGTTTTGAATTTTGATTATGATTTGTGGCTATTTGGATGGGCTT
GCATAAAGTGGATGGTGACTTTTTGATTGGCTTACTGACGACTGACGATG
ATGTTTGGATGGGCTTGCTGACGACTGACGATGATGTTCGGATGGGCTTG
CTGACGACTGACGATGATGTTTGGGTGGGCTTGTTGACGACTGACAATGG
TGTTTGGATGGGCTTGTTAACTTGGGATGTTGATGATGCTGTTTTGTTGG
AGTTATTGATGGAGGAGGGTGTTGTCTTGGGTGTGGATGTTGTAGCTTTT
AGCTTGGGTGTCAGGAAGTATGATTTTGTCTTTAGGGAGTTGTGTGATTG
TGGTGAGATGCACCCCATACTCTAAAAAACATTTTTGATAGTACAGACTA
GAAACATTATTTTCAATACCAAATAAAAAACTTTGTGAGGGAACATACTT
AGTGCAAATATTTGAGGATCATGTGTAAGAAAAATCACAATTTGAATCAT
GATCCAAGTTTCTTCCTAATCAAATTTTTAGCTTTATGAAATTAAGGCGC
GTCATTCTCACCTGTTGACTAGTTGACAATAATGGCTCGTCATTTGAGAA
AGATTTTCCCAAGCTTTCATCGACAACCTAATGTAATATGAGATTTGCTA
TTAGGAATCTTGTTAAGTTTACAATGAATTGACTCAAAGTACTGAAAATA
AAGTTTGAAACAGTTTAAAGTAATCTTTGAAAATTCAATTTTTAAGATAA
CAATTATAACACTCAATAAAAAACTCACTTTGTCTCCACCCACAAAGTGA
TTTAATTTCTCAACAGCTGAAACAATGTCAGGAACCAGCATGGTTTGAAT
TTGTCTCAATTGATTTTCTAAGAGAAGATAATCTTATTGTTACATTCTTA
AAGGTGTTACTTATCGCTGATTTCCTAACCAGCCCTGAGATGTTTAAGCA
TTCGGATGATTAACTTTTGTTTTAGTTTTCATTGTTGCAATTTTAAAGTT
CTACATAATTTTAACAATTAAGCAAATCAGAAAAAATGAATGGACATGAT
GCAACTTTTATTGAATAGCAATATCAAAAATTTTATTAAGTGATTAAAGT
GGTGTAAACTGACCTTTTTCTTTCAGTTTTCTTTTGGTCTCCTCCAATTC
AGCCATTACAGTTCTGCAATTGGTACAGGACACTTTAGCTATAAATTTTA
AAGATTTGTTGTCATATGCTTATTCCCTTACTAATGATAATTTATTGTTA
CCTTATTAAAGAAGTTAAAGGTCTTTAAAAGTCGTTTCAAAACTAATTGT
ACATGAATCAAACAAAAACAGTTACAACAAACATATCAGTTTTAGTTTGG
TTTTGAAGTGCTTAAAGATTGAAAAGGAATGCAGCTTGATTTGGTGTCAG
TCGTCAGGAAAAGTCCAAATATCAAACAAAAACAACCCTATTTAGACAGT
TGTAATATTATTATTTTTACAAGCCATGAAATAAGATTGTGTACCTTTTG
GTTCCAGGCGCTGGTAGATTGGGGATTTCTCATTATCTGAAACTAATGAA
CAGGAAAGAGTTTTGGTTTTGTTAAGCTGCTATCAAAATAATATTTCAAA
CTGTTCATAGTGTATCTTAGAAATTGTTCAATTATCTATGCTTAATATTG
GCAATGTACTTCTTCTCCCTCAGAGCATTATATATTTTGGATCCCTAATA
GAACTTCCTTTAGCAATAACTGATATTTGGATTATTTCAACAATTTTGTA
CCATTTTATCATTACCTTTTTCAGAAAATACTGGACTTGGCAGTTTCAAT
GTGTTGGTGCGCTGATCACATAGTCTTTTGGTCGTCTTTGGAGTAAACCA
GATCCCTTAAGGTAATGACATTGTTTATTTGATATCTTCCGAGTTATACT
GCACAAATATTTTTTTTCGATAAGAACGAACTGTATGAGAAAAGACTTTG
GTCATATATAAGGAAGTGGATTTTTAACATACGAGTTGCGAGTTGGTCCT
ACGAGTTGCGAGTTGCTATCAAATATGCGAGTTGCGAGTTACGAGTTGCT
ATTTTAACCAAATAAAAGTGTGAGTTGCAAGTTGAAAATTTCACGTTAAG
ACATCAAAATCACAAGTTGCAGATTAAAATCGCGAGTTGCAGATTAAAAT
CGCGAGTTGAAAAATCAATAGTGTGAGTTGCAAATTAAAATTGCGAGTTG
AAAAATCAAAAGTGCGAGTTACAAATCTAGGAAAGACCTAAAAGAAGAAT
TTACCATTTTCCTCAGGTACTTCAGCTTGACATTTAGGTTTCAACACTGT
ATGGTTTTGTGTTGCTGTGTCAATTGTGTCGATTGTTTGGTTTTCTATTG
ACTGACTTCTGTTTGTTCTTTGAATGTTGAAATCTGCAAAAAATGTTATT
ATAACGATCTAGGTACTAGAATTTAAGTTTCTCCATTTTGAAGATAAGTA
ATAACAAATTAAAATAGAAAAAGTGGTGCAGTTCTTGAAACTTAAAGCAA
TGTGTCAGTATTAATTTTATATTCCATACATACACATTTTGTTACATTAT
CCAATGTGACATATCTCAAATATTGATTACCTAGAGAACTGTCCATATTT
TGGGCTTTTTCTTGAATATCATCAATGTCCACGTATTCAGTCAACAACTT
GTCGTTGATATTAAGATTGATTGCTGCATCTAAAAGAAGAAAGATGACAA
ATATTTAGTCATATTGGCCATATTGATTCAACATCAGTCAAAAAATTCTA
GCTTGGTTCTTATTTCCATTTGCATTGTATAAAGAAAGTCACAGCCTTTT
TTAGTCTTGGAATATTGCTATAATGGCTTTTACCTTTCGCAAGGATTTCC
TGTGCAAGCAAATTTGATGTATTTGCCTTGGCCTTCTTTGATTGGTTTTC
TTTCTCTAAAGAAATTAGGGTCATTCAACTACCTTAAAGGAAGAAATTTT
GGCGGGAAGTTAATTTGGCGGTTGACCGAAAAAACTAAATTTGTCGGGAA
TTTTGGCGTTTGCTGAAAAATGTATCCTTAAGATGGCGTAAAAACAGCAA
AAAATGTAAAAACACCTTAAAAGATTCTATTTTCAAAAAGTTTAATTTGG
CGGGCATTTAATTTGGCAGATGGCAGAAAAACCAAATCCGCCAAATTAAG
TTCCCGCCAAAATTTCTTCCTTTAAGGTAGTAATGAAACTGTTGGTAAAA
ATTGAAACTTAATAAAAAGTTGTCACTAATAACATCAAAATCATTCAAAG
ATGAAATAAATTTTGAAATGTATGCTAATATTTCACAATGAACTTTCACG
GTCAACTAACCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTCATCCTCTTTCTTTTT
TTCCTTTGGAGTTTCTTAAATGGAAAAAGTTGAAAGCTCTGTTAGTGAAT
ATTAGCTCAATGTTCTGCAGATTTCGGACTTTTTTCCTTTGCGAGCTTCA
TATCTTTTTTATTGTTTTAGGTATCATTCTGACAAACCTTTAGTGATTTC
TGTTGGATTGGTCTTGCTTGACTCGGGATTGTCATCGTTTTGTTCTATGG
TTAATGGAGTGATAAAGGTATCTAACAAACTTATCTTTGATAAAATTTAC
TTGTTACAACAAGATTGTCCTGGAGGGAGTGAAAGAAACTGAATACTTTC
ACCTTGATGGGGGGCTAATGTAAATGGGGGATTTCAGGAAATCTTATGGG
AAGAGGGGGAAGAAATTTGTCCATGTTCAACATTAGTGTCTTTATTGCAG
GAAATTGATATGGGGGTAGGTGGGGGTAGAATACCAAATGGGGGTTTTCG
GCCCCAGATGGAGCATAGTTTCTAGAAGGGTCAAGACCGGCCCNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCTTAGAAAATCAGTAT
AAATAAAAAATTGAAATTTTGCATAATTCAAGGAAGATCCCCCCTTATCT
AAGATGACCCCCCCACATCCCCCTTGCTTTTGGTTCATCAAAACCCAAGA
CCCCCCTGAATGTAGATAAAGAAACATGTGGAGGGACCTAAACACCTGGA
AGATATCATGGTCTAGACTTATACTGAACTAGGATTTACCTTGTTGGCGC
TTTTTCTTTGTTTTTGGTCTTCTCACTTCGTCTTTAAAAGAAAAATATAT
ATAGCTACTTTTTAAAGGCTTTTAAATAAGTAATATTGGGTGCAACGAGT
TTGATTTAAAAAGGAAAAGGACTTTTTCTCCAGTTTAATAAACAACTACT
ATGTTGATATTTTATTCTACACTTAATAAGGCTATCATTTTTGAATTAAC
ATGGTTTATTTATTTTTTTAGAACAAACCTTGATTGGAATCGTTTGCATC
CCCACCATCATTTTCCTCCGTGTTCTCTTTGTCTGCTTCTAATGAAAAGA
ATGAGGTAAGGATTAATTTGAAATTTTCTGATTTTTGGACCTTAGAATGG
GAAGGAGCCCGATTTTTGAAAAAAAAATTGCATGTTTATCTATAAAAATC
ACTATTAATAAGCATACAGAAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTT
TATAAGCAAGTGTATGCCCCTTGGTCAGGCTCGTGTATGCTTAAGTTCTC
AAAGCATCCAGGTTTATGCTTATTACATGCTTAAGAATTATGCTTATGAT
TCACCCCGAACCAAGTTTTTAATGAAATTTCAGAAATTTTGTAAAAAATT
TGCTCAGATTTTAGAAGCAGTGGAATGGTAGCTAGCTGTGGAATGTCTTA
TTATTTACTTGACCTCTGCCAAATCAGATAAAAATGAAACATAAACAGAA
AATGACCACTTGAAAAATATTTTAGGCTGACATATATGCTCATGTTATGC
TTAGGTATTCTGCAAATCTGAGTCTTCATATGCTTATAAGCGTTATGCTT
ATAAAAAAACATGTATGTCAAAAAGTATAGACATGTAAGAAACATTGAGA
CTGCTTGGTAAAAATTGTTTCTTAAAAAAAGTGTATTGTCATTGTTTAGC
TTCTATTTGATGGTACACGCTTTTTTTATAAGAATATCTATAAAGCGTGT
ATTTTCTTTTTCTAGCTCGAATTGGATGGGAGCTCACAGATATCTAACGA
CCAGATGATACTTCTTAACAAGATCACTCTCAGATGCACGTTATTGTCTT
AGTGTGTTATTATAATGTATGAAAGAAAAAATACCTTTACTCAGTCTTCG
TTTTTTTCTTCCTTTGATCTCAATGAGGAGTGCTGGATAATATTGCTTAA
GATGGGGGTAGAAGAAATTGTACTTTTCCATCTCCTTAAGGTTTTCGAGC
GGTACTAGTTCCCCAGTATGGTTGGTTGGCTTTAAAGTTGAAAATGGGAG
GGCTAGGTTTAGGCGTTTTCCGTTGGATTCTTCCTCTGTAAAAATAATCT
TTAACACAGGTCCAGTGTCTTCCCC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00041304TCONS_00041304Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00041303TCONS_00041303Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002792supercontigsc0002792:3020..12394 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.36	0.9	0	0.09	9.59	8.6	5.97	7.42	2.11	4.39	2.51	2.04	2.92	3.75	2.25	2.87	2.34	1.98	1.36	2.03	2.86	2.64	1.66	2.92	3.32	4.07	2.97	2.47	4.11	4.01