XLOC_024816 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_024816
Unique NameXLOC_024816
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0002542:22..7289-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_024816 ID=XLOC_024816|Name=XLOC_024816|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7268bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002542:22..7289- (Clytia hemisphaerica)
CAGTGAAAGAAAAAATGGCAAATGCAAAAAAGCCAAACGACAACGAGCAT ATGGAGCAAGAAGTGAGTGTTTTGATTTTTTAAAGTCTCTTCGGTATAAG CTTGTATTTAGTTCCAGTTCCTTCAATTTCTCAACAAATGTTTCAACCTT AAGATACTGACGGAAAGATTATTCAGATCGCTTTATTGAGATAAATTATT CCAAAATCTACTAAAATAAATCTTATCGGAGTTTTTGATTTTTTAAAAAA AAGCGATGCATTGTGGGATTGTTTCAGAAATCTCTTAGGAATTCCTAGCC TGGATATCCAGGCTGTAAACTATTTCACAGTCTAGTTTTTTTGATATTTT ATGTTCTGATTTACAGCTTGGTCTCCCTAGAGCGTTTTGCATTCTCCATA TGAGAATGCAGTCTGCTTGCTTGCGCTCACTTCGCTAAAGCCGTAAGGAC CAATCTACACGGCGCGGAGCAATTCTGAAGCGAAAATAGGATAGTCCTCC ACTTGCTAGTGAAGATAGAACTTTCTGTTACATGAAAACATGAAAAAGAA GAAAACAGAGGCAAGTTCATTTTCCAAGAAAACATGGTCTGATGGTTGGT CATGATAATGCATGTAAACTTGTTCATGGACTCTGGTGTATATATATACC GGGTGACCCACGAAAAAGTTCGGACCTTTCTCGGCGTCTTGAGGCCGAGC AAATGTCCCAAAGTGCTCGGAATTTTGGTATTTAAAAAGTAGATATCCTA ACTTAAAATTTGAGCTATCACTTTTTAAATTTGACCAACTAGTTCTCTAC TTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNGTTGGACAAGAAGCTTGAATATTTGAAAGAGTGCTACTTTGCT CTTTTGCCCGTTTGAAAAGTTTTTGTAGGTTGCGATTAATTGCTAGCTGG TTCAATTTTTCAGCTTCTGTTTTCAGATACTCATTCTTAAGAAAACGTGC TCGTAATCTGATCTTTTTACGAAGTGCCATGGGTGAATTATACGGTTTTT GGTCAGTTTTGGAATATTTGTTTCAGCAGCAGAATTTATTGAGTGGATAA AATGTCGATTTATAGTGTCATTATTTTCATTCTCAAGATTTCTAGTGTTA ATGTTGTCGATTGTAGTTTGTATAAACTGATTTCTGATATTTTCGTTATC TAACATTTTCAAATCGAGTTTTTCGTTTTTTTTCTTTTTGTTCCTTTTTC TGTAGCGTGCAGCTTTGGTGCATGGCGTATTCAAGGTCGTGATAACTAAA CGGTGATCACTGTCAAAATCATAGCTTCGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCTGA TCCTTGAGATAAACGTCTGACTTCCTGTAGGGCACAGATGCTGATATCTG CTTTATCGATTTCGCGAATAATTCGTTCAAGCTTTTGGTCTTCTCGTCCT GTACGTACGTTGATGGTTCCAAGTTTCCATTGATAGGTGTTTTGCATCGA TTAGAATGTTCGAACAGGGTATATAAGGATGTGTTTGGTCAATTCCTCAC CCAGAGACAATAATTCATCACATCACATTTTTGTTTGTTTTTAATAGTTG TTTGTTCACTTATTCACTAATTCTTAATGGAGTGAATTTTTTATCTGTGT AATCTTTTATTAAGTTCTGTTTTGCTGCCCTGGTTAGGCTGGGAATGTTT TGGAAACATGGGTTTGCACTTTCATTCTCTAGGGAGACCAAGCCCTATAA TTTTAGAACCTTTTGTATGTTGAGGAAAATTAGTTTTTTCTAAAATTTTG AGCTTGGATATCCAGGCTAAGGAATTCCTCGAGAAAATTCTATTGTAATA CTCCCGAAACAATCCCACAATGCATTGCTTTTTTAGAAAAAATCAAAAAC TCCGATAAGATCTATTGAAAAGAAAATCAAAGAAGAACTTTTCAACGAAC CTTAAATTTTTGGTACAAACCGACAGAGGTACTTTTTCTGATTAGAACTA TTTGTATAATATCTTATCATAAAGGTGCTGCCTTTAAATGAACACTCAGA ATCATTTTTCTCAACACCTTATCGGCCCTTTTTACGCCGGCCCTCATTCC GCCACAGCCTAATTTTGGGCTTTTAGGACCGTAAATAACGCCAAAACTTG TAAAAATCGCTATTCGCGCTTCAAAACAGTAAGTATTAACTAAAATTTAC ATTAAAATGTTATGCTTCAGTATTAAACTGTTGAAAATTCCATTGAAGAT CATTGATTTTCGTGAAGTTTTGGATATAAAGTGAAAAAAATGGATAGTTT TCATCCTTCCTAAATGCCTAAAATCCTTTAAATTGAGAAAAATGGTCAAA AATTAACGCGGCTTTTAGGTAAAAATTGCAAATTTTTGGCCCTTTTTACG CCGGCTCTTTTAACACCAGCCCTTATTACGCCACGAGCCCAAAAATAACG CTGATAAGGGCCGGCGTAAAAAGTGCTGAAAAAGGTAGTCCTCCGATTTT TATAACGTCTTTTCAAAATCAAAAACTTTATGCAACTAAAGCTTCATAGC TAGGTATATAATATGATGATTTTCGCAAGGAAATTACCCCCTCATTAAAA ACTCCCAAAAACAAATTCACTGGAATTATAAAAATCACTTGCTGATACTC AATTCCTTTTTTTTTTCTTACAGCTCAAAAGTCTGTCAGAGCTAGTACAG TTTAGGCAAAGTTTGTATGTTACTGACAAAATAAAACTGACAGAATGCGC TTTGGATGTAGTGGATGATATTAAACTTTTTGCTCAGAATTTCATACTCT CTTTGATGTTTCTTTCTCTGATGGTATCAATAAGCTATATAAGTGTTACC TCAGCCTTTCTAACATATAATATAAACAACCCCTTCTCACAGACCCACTG GGACCCCTTCCCACTGGGAACACATATAATAATTCCTTTAGGTGAACGCG ATGGTATACTCTTAGGTGCCAAATAAACGCCCCCCCCCCGCTTGTTAATT TTTCGATCTTTTTCCAACCCCCCGGACCTTATTAAGACCCCCCGTTTATT AATTTTTGAAAAAATTCCCAGCTACCAAAAGGAAAGTTCCTTGTTTTACT CTAAAAAGCCTAAATTTAGTCTATTTTGACCCNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTT CCCCCCCCCCCCCCCCGTTTATTCGAACCCCACCTAAGCACCTAAGAGTA TTGCATAACAAATTAATATTGCTTAAATTATGCTACCTCCATACTTTAAT AAATTAATAAATGCAAATAAAACTAGCAGGAAATTAGATCTTACCTATAA ATAAGTTTGTGTCTTTTTTACAGCATCTTCGTCGTCATTTGCTCCAACAA AAAGAAAAGTTACTTGCGGAAAAGTTGTACTGGGAGCACGAATGTAGAAA AAGCTACGACCTGTATGAGGTAATGATTTCTTTTTTTTGTTCTGATCATC ATCATCAAGATATAAAATTCGGATTAAGTCCAAAAATATACCCGGTGCGT TTATTCGAAGTGCTTCAGTTCACAAANTTTCTATCATAATGGATTGGATG AGTCAACTGATTGGCAATGGAAAGATCCAATTAGCTGCTTTGAAAACAGT CCACTTTAAAACTGTGTATACATATTTGTGTCAATCCAATCAGGTTCTAG GCCATAGACCACCATCAAAGGACTATGATCGACTTCTAAAGGCTTTATCT AACCAGTTATTTTCGCTACAATTTTCAGACACAGAGGAAGAAGAATGATC TTGAATTTACAAAAAGATTAAGTGGGAATAAGGTAACAATTGTTTTATTA TGAAAATCATTTGGGGTTAAAATTTGAAATCTTTATATCCCTATTTTCAA ATTATTTGCGAAATATTATCAAGTACGTGAAACGTGAAACCATTTTTCTA ATAGGGGTATTAAAGTGTCAAAAAGATGTGCCGTGTTTCTATCTTTACCC ATAACTTTCCAAGGTTGATATCGTTGGAAAGATATTTAAATGCGCTGAAT TTTCCACTCATTTGTTTTTCAAAATTTGTTCAAGAAAGTGAAACAAAGTG AAAAAGAAAAAAACTTCTTGTAGAATAACACCCCTCGGTTTGATTGATAA ATCGGAATATGATTTATTATAAAATAATTTATTCTCATTTATCACTGTGA TTTCAGCAGCACAAACGGTTATTGGTGCCATGCCAATGTGGCAAAGCGCA TGAGTACCTTTACCAGGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00040735TCONS_00040735Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00040734TCONS_00040734Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002542supercontigsc0002542:22..7289 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
18.44 16.2 20.63 24.93 13.77 7.99 13.09 11.61 9.48 12.31 5.43 7.49 9.98 6.29 5.78 9.47 10.16 15.26 1.19 5.36 5.18 7.58 13.52 7.26 6.39 14.94 8.08 4.71 7.73 9.7