XLOC_023262 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_023262
Unique NameXLOC_023262
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001921:1..9059-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_023262 ID=XLOC_023262|Name=XLOC_023262|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9059bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001921:1..9059- (Clytia hemisphaerica)
CTTGTTTCTATGGTTTTTAATGTTTTACTGGATGCAATCCTGACCAATCA
AAATCAAGGGAGTGATCTTCCTTAAAAGCCGCGGCGAGACACTTTTGAAA
GTCATTTGCTTCTCGTCGCACTGAAAGTATGCTGGTTCGTGAGGAACCTT
ACACGGAAATGGACTTTTTAAACTGCATTTTTGAAAACTTTGAATTGAAC
CGAAAGAAAGAAACGATGCAAGGATCACTAAAGATGCTGCTGGTTTGCTT
TGGTAAGAATCTTTATTTTTTTCTGATTCTGTCTGAGTTTATGATTCCTT
TCCATAGTCTGAATATTAATAGTTTAGGTTTGAAGGGTTAATTATACAGA
TATTGAGACTAGTTTTCTCGGAGAAAGGGTGTTTCTTAGAAGCTAAAAAA
ATCAAATTTGAAGATTTCAATCTTTTTGAACATTTTTATCTATGGTGCGT
TTGAAAAAATAGCAGGCAGTGAAAATTTCAAGTACTTTATTTTGGCCGTT
AAACAGCCAAAATACTCAATTTTGAATTCAGTTTTAAAACTCAATATCTA
AAAAAAATTTACTGTGTCAGCAAAATGCCAAGAATATGTAAGGAGTTGGG
CAGAATCCAAATTTTCCTAGCTTTATGATAAGCAAGGGGTCAACCTTTTT
TGAGAAACCTTGATTTTTTAAGTCAATTCAGTGCTGATTGTTAAAATGTG
GAAATTCAGTGTCTTGGAAAAGTAGCAGAGAGTAATTAGAAAGTAATGTT
CATGTTCTACAAAATGAAATTTCCCCAGCCATAAGTCAAAAAGGCAAGTT
TACTTTAATTAGTGATTAAAGTCTATTCACGATAAGTGTGCACTCTTTTT
TCTTTTACCTATAACTTTTGAAGGAATTCTTCAATCTTTATACATTTGGT
ATCGTTGGAGAGATATTTGTGAGTGGAACAATTTGAAATAAAAATATCTT
TAAAATAATTCTAAAAATGAAGATGAAAATGAAGAAGAAAAAAATGAAGA
TCTTGTAGATAAGTGCTATAACTATCATTTTCACTGGAGAGATTCTTTGA
TTTTTGGAGGTCATCACTGTGAAGAAATTTCACTAAAATATTTATTCAAT
ACAAAGTTATGATACAAAGTTAATAAGTGATTGACCCCAAAAAACAGCAG
AAAACAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGTTTTTAG
ACGTCAATTAGCTTATAACTTTGTTTGATATCTTTTGACTGAATGATTAT
TTTTGAGAAATTTTTTCACAGTAATGACGTTCGATAATCAAGGTTTCAAT
TCAGTGAAAATGATAGTTATAGCACTTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTT
CTTCTTCATTTTCATCTTCATTTTTATAATTATTTTAAAGATATTTTTAT
TTCAAATTGTTCCACTCACAAATATCTCTCCAACGATACCAAATGTATGA
AGATTGAAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCAC
ACTTATCGTGAATAGACTTTAGTTAGTGCTTCAATTATGGCTTTAACACT
TTTGATGCTTTCTCTTTCACAAAATTTATTAGCTCTTATCTGTTTCATTT
TAAGCCCTAATCAGATAGGTGACTCGACAATTTTCTAATTAGAGTAAAAA
GGGCAAAGTGGACTTGTGAATTCTTTCAATTTATTTTTGGTAGCCTATGG
CAGCCCAAGTATAGCCCTGACATAGCCCTAGGTTTTTAGCTTGGCTTTGC
TTATATAGCCCTGTAGCCCTGAATTTAGACATGTCAAAAGTGGTAACTTT
CTTTGAAAATGAATTGAATTACAATATTCTTATGGACTTTATACCAAAGT
CTTTTTAATGCAGCATTGAATTTTTTGAATAGAGTGTCTTCGTATTTCTT
GAGCTCTATCAAGTAATTTTGTGTTTATTGTTGCTATGGATTATTCATGC
ACACTTTGAAATTTAAAAGATTATCACTTTTTCAGCACTCATTTACTTTG
GATTCATAATTTGTTAAGAACTCTGAGAAATTCCCAAATTTCTTTGCCAA
GAGCATCAAAAATTCAACCCTAATTTGATTTGATTTCTCAAACTCCAACT
ACATAGTTTAAGTTTGGAAAAATTCTAAACCAAAACCCAAGACAAAGTTT
AAGAATTTGAAATTATGATTAGACAAGGCTGGTAAAGGCAAATTGGTTTC
TTTCAATTTTAGTGAGACTTGGATATTTACTTTTTAATTTTAAGGTTAAG
ATTGTTTAGTTTTTTTTACTGTACATTTACACTCAAGTGTAACTCAACAA
AGTCAAGCATTCGTATTTTAGGCAAGTTTCCAACTTAGATAAATTTAAAT
TTTTGGGATCAATTCTGAATTTTATGAAATACCTCTTTAGAAAAAATATA
TTTCGATAAGCATTTTATGGAGCATTCGAGTTTTAGGCAAGTTTTCAATT
TAAATTTCAAATTATTTGGGTCAATTTTAAATTTCATGAAAGACCTGTTT
AGAAAAAATTATGTTTAGATTTACTTGAATTGTATTTACAGCTTGAAACC
GTTACAATTTTGAATTGGAAGCACGTGAAGAAAACTACTTTAATCTGGTT
TAGGCTTAATTTACTTCATAGAACCAAATCAAAAATCTTCAAGAAAGAGA
GAGAGCGAGAGTTACAAAGGATCCTATGGCTGAATATCTGTGAAATTTAG
GGTATTTGTATGTGTTCATTTTGATAAAAAGATCATTAAATCCTAAAATA
TTCAATTCAATTATGTAAGTCAGCTGTTTATTATGGTACTGTGATAAGGA
ATTNATTTTTTTTGTCAATTCTACACTCTATTAGGAGCATAATATCAAAA
ATTTGCCCTGATCTAAGGGGTGCCCTACGAAAACCATTTTAAAGGCATTT
TTTGAATCTTGGACGCTGGTCTACTATTACAAATACAGATTTTTCCTTAC
AAATACAAAATACAGAGTTTTCCCTTGCAAATACAGAGTTTTCCCTTGTA
AATACAGAGTTTTCCCTTACAAATACAAGAAATTTTTATAATGGAAAACA
TTATTTTTATTGTAAAAGATAGTAAGATTAAGTGTTTATTGACAAAATAC
AAGGCAGCCTTCACAAAGCAGAAAAAGACTAAACTTGACAAAGACTATAT
TAAGATTTGCCTTGAGCAATTTTCCTTGATTTTACTTGAAAATCATACAG
AGCCACTAGACGGTTCCCGTCGTCGTAAACGCCGGTTAACGGTTTTGCTT
GCGCATCAAAAGCCTTTAAAATACTATAATGTGGGTTAATTCCTGACATC
GTTTTGGCTTAAAATGCCAAATACATTATAAGAAATATACTTCTAAACTT
TCTACATTAGTCAAAATTTTGTGTCTGTAAGCCTCGATGATATGTCTTTT
TAAGATAACGGAAGTTTGTGTTCAATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAGGAAAGAAA
AAGCCTTAGTTGTGAAGGAGAGGCTCGCGCTTTGCGATTGAGCACTGAAG
GTTTTCCCGTTTGTTGGCTTCGCATGCGGACAGCTTAAGATCGGCGCATA
TGCAATGCAACCAACATTGAAACCTTTTTAAATAATGTTAGACGAAGTTT
AATCTTCAAACAACAATGTTGACGTCAGAACTTTTTTCGTTTACAAATAG
CAGTGTAGAGTCTTCTCTAATTCGAGTTTGCTACGCTTGTCAAACTTAGC
GCGAGACTTTTTGTATCGAAGGTGGATAGGTTTTCCAGCCGCGGCGTTCA
AATTTTAGAAACCTTAACATATGTTACTGGGCTAGCGTTACAGACATTTT
TCATAAACTCATTTAGTATAGTAAGATAATGTCTTAACATTAAGTTTCCT
TTCTTTGAGAATACAGGATAAATTTTCCTCGAAAATATGCATTGATTTGC
CTTGAAAAATACAGATTACTTAAGATTACAGGATTTCTTTTCCTCTAAAA
ATACGATTTTACCTGAGAATGACAATGAAATTATCCTGCTGTCTTTTTAA
AATACGCATATACGCATGAGATAACAGGCGGAAAGCTGAAAGTAATAACA
TGAAATAGAAATTTGCCTGGACGCACATGGATGACTTGCCTAGAATTTAA
AAAAGAACTATTGTTGAAGGATACATTGATTTTACTGAAAAATATTGAGA
AAAAACATCTTCCTTGAGTCATGAAGGTAATAAAGATATAGATGGAGAGA
AAACGTCTCGGTAATGACCTAAATGATCGTTGAAATCTTTTATAAATCTA
TTCAAAGCGGCTTTTCTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAAAATCTCACTAAAATTTGAA
TTGAAAGAAATCAATTTGGCTCAACCAAATTTTTAAACTGTTCTCTTTGG
TTTTTGCTTAGAAGTGTTACAAACTTTAAAGGAATCAAAAATTAGGGTTT
AATAGACCTTTTCTTAAAGAGGCAGCCATGTTGAATAATTAACTACTCCA
GTATAAAAACAATGATACAGCCATGCATAATTTTAAAAATGTGCATGATA
CAGTAATTATCATATCATTGTTTTTATGCTGGAGTACATAATTATTAAAT
ATGGCTGCCTCTTTAAAAAAAGGTCTATTTGTAAGATTCTTGGCAAAGAA
TTTTGGGAATTTGTCAGATTTTTTAACAAATTATTCCAAAGTAGATGAGC
GGTGAAAAAGTGAATAATCTTCAATTAATAAGTGTACATAATAAATTGCA
TCCAGAGCAATAATCAACACAAAATTGCTTGGTGGAGCNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT
TTAGCTTTAAAATAGTTCTAGATCAATAAAATACCTTTGGAATTATATCA
TTGACATTAACAACTGTTTTTCAAACATTTTCTTTGTGTTTTACAGTAAT
CAACGCTGACCTGTCAACACTGACCTGTGACCTGTGACCTGCGTTTTACA
CTAACCGCACTTCAAATCTAACTTTGCCCTTTTTACTCTTGTTTTTAAGA
AAACAGTCTACTGTATCTAACATAAAATGACATCGATGGAACACATTAAT
TTCTTGAAAAAAGGAGGTAAAAACATCCAAACTAACGGCTAGTTGATTTG
TAGTTGGTTAGTTAGTGGATTTTAATGAACCCAATTTGGCATTTTACTGG
ATAGAATTCTTTTGTATTTACAAAAGTTCTTATTTGTTATCATTTGTTTT
TATTTACAATAACCATGCGGTTGAATGAATTTTGATCGCGGTTAAATGAA
TTTTGATTGTATTTAGTAATGACTATCTCCAATTTTTAGACAACCACCTT
AACTGCACA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038758TCONS_00038758Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038757TCONS_00038757Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038756TCONS_00038756Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001921supercontigsc0001921:1..9059 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.91	2.31	3.88	3.79	2.23	1.76	0.71	4.11	1.27	0.18	0.47	0.77	0.23	0.12	0	0.34	0	0.85	0	0	0.06	0.16	1.26	1.09	0.06	0.53	0	0	0.19	0.2