XLOC_023231 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_023231
Unique NameXLOC_023231
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001912:27580..35156-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_023231 ID=XLOC_023231|Name=XLOC_023231|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7577bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001912:27580..35156- (Clytia hemisphaerica)
GGACGTTGTAGGACAGACTATACTCAACCAGAGGCTAAAAGCTTGGATCG
TCAAGGCCAGTGCTGTAATCAAAATTTTTCAAAATGGCGGAAAAAGCGCG
GAATGTTTTCACTTCTGTTTCTGACACTGTCTTTCCAGGATCAAAGAAAA
TTATCAACAAAGGAAGAACACACCCTTCGTCAGGTATACTTCTTGCTTAC
AAAGTCTAGTAGCTTTATTTTGTTTTGAAATTGTAACCGTGATGAGATCG
GGTAACTTGCAAGTCAAGTGGAGGGAAACTTTGCTGCTGCACGTACAGCA
GCAATCTGCTGCTGCACGTACAGCAGCAATCAAACATGAAACGACCCTGC
CCAGCCTAGACTAATGTTAATTTTTCTTTCAGAAAAAAGACTATAATTTG
TTTACCTTTATCCTGCAGCTTCCCAACATTCAAGCTCTCAAACATCACAA
GCCGAATGAAATTATTTTCGATTTCCCGTAGAAATTATGCGATGAAAAAT
CCAGGAGGGGTCGAAGAATATGAAGACTTTTTATTTCCAAACAAGTTATC
TTTGCTTACAGTATAACGAAATATTACTTTTCAATATATTTGCTAAATAT
AATGTTTGATTACAAAAATACTTTACACTGTATTTAAAGTTTGAAAAAGT
CGATTCTACTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTT
CTGGAAATACTCCAGGGAAATCAAAATTGTTTGGGTTTAGGATTTGGGTA
TATCCGCCATTATGGAATTGAAATATGTGTTAAAACTGGCTAAAATACTA
CGTTTCAAGCAAAAACCTCGTTTTTGAATAAAAATTGCTCTAAAATGACA
ATAGACATGGACCCAAATTTTTTTGAAGTGATAGTATTCTGTGAATATTC
CTGGAAAAACAAAATCATTTCAGTCTGAGATTTGTTTACATCAACCCTTA
TGGAAATGAAATCTCTGTTAAAATGCTACATATTTCCATCCCATATATCA
TAATTGACTAAATATTTTGTATATTATATTAAGCAAAGAATGTGAATTTA
CAATCCTTTAATTTAGAAATACTAGTTGAAATATATTATTTAAAAAATCC
CATTTCACTCAACAATTCTTTATAGCCCACTTACATTTCCATTTTCAAGA
CTTGTTCCGTCAAAAAAAGATTGAATTTTAGCTTGAAATATTGTATACAT
TTTAAAACTAGCTTCAGTTTTAAAAATGCGGTCCCAGAAGCATGTTATAC
CTGAATAGTTTTTACCCCTAGAGTATTTACAGAACACTATCACTGCAAAA
AGATTTTAGGTTCATGTCTATTGCCATATTAGAGCAGTTTTTAAGTCAAT
ATAATATTTTTGCTTGAAATGTTGCAATTTAGCCAGTTTTAAAACATATT
TCAATTCCATAATGGCGGATATACCCAAATCCTAAACCCAAACAATTTTG
ATTTCCCTGGAGTATTTCCAGAAGACTATCAATGCAAAAAAATTTGGGTC
CATGTCTATTGTCATTTTAGAGCAATTTTTATTCAAAAACAGGGTTTTTG
CTTGAAACGTTGTATTTTAGCCAGTTTTAACACATATTTCAATTCCATAA
TGGCGGATATACCTAAATCCTAAACCCAAACAATTTTGATTTCCCTGGAG
TATTTCCAGAAGACTATCACTGCAAAAAGATTTTAGGTTCATGTATATTG
CCATTTTTAAGATTTTTTGAGTGAAAAATTGGATTTTTGATTGAAATATT
GCGTTTTAGCAGGAATTTCAATTCCAAAATGGTGGATATACCAAAATCCC
AAGCCCAGATGACTTTGATTTTCCTGTAGTATTTCCAGAAAACTATCACT
GCAAGAAAATTTGGACTCATGTCTATTGACATTTTCAGTCCAAATTTGGG
TTTTTGGCCTGAAAAATGGCTCTTAGCAGGGATTTTATTTCCATAATGGC
GGACATAGATCCATCCCAGACGCAAATGATTTTGATTTCCCTGGAGTATC
TCCAGTATACTATCACTGCAAAAAAAATTTCAGTCAGCATTTAAACTCAG
TTTGTAGAAGCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACACCAG
AAACCGGACGCACTTCGGACTCAAGTCTGATGTTGAGATTGTCCGGTGTT
AAAAAGTATTCTCATCTGATACCGGACTTGGCGTGTCCGGTGTTTGTAAA
ATCCGGTGCGTCGGCAGGGATGAAAATTTTAGGGTGATATAATAATATCA
TGAATAGAAAAAACATGCTAAAATTTGATCAACAGAACAAAAAAGTTTTG
TTTACTTCCTCTCCAGAGATCAAACGGTGGATGATGGAGAGTATCAGCAT
AATGCACATCTGTTTTGTCAATTACAGTAAAGGTGTTTAGAGGCCCAAGA
CATGAGAAACCTACATTCTCGGGGTCAGGTGCTGTAAATGTGTTGGCAGA
CCCCATATATTGTGATTCTCTTATTATTTTTGTCAATTTAAGTTTTTTTG
TCAATAAAATGACAATGAATAATAGTGACCTTCAATGGGAAAAGGATCAC
TTTCGTTTTCTACAGAAAGGTGTATTGATAGTAAAATTATCAATAACTTG
ATCGATTTTATTGATAACTGTAAATTCTTCGTCGATAGGCTGGTTTGCAT
CGACAAGGAAGTTCTATCGATAATTCTATCGCTATAAGGATTATCGATAA
AGTCATCTTTGGAAAGTCTTTATCAATAAAATTTTATTGTTAACAATTTC
TAACGCTAAACATGATAAGTTTACGTTTCTGTTTGATTTGTTCTTTCTAA
AATAAGAAATCACGTAAAAACGAGTTGATGAAATTAAGCATTAAAGTCTG
TCTCAAAATAATTTGCAGCTGGAGACAAAAAAGGCTGTAACTTGTGATAG
AATTCGAATCAAGTTGCGATTTTGTGCTCGTTAAAAAGATATTCGTGAGT
GGAATATTATCAAGTAAAAGATTTGGAAAAAAAAGGTAAATGAAAATGAA
AAATGAAGAAGAAAGAAATCAATTTCTTGTAGAAATGTGGTATAGTTACC
ATTTTCAGAGGAGTGATTCTGCAATCTTAGATCATTATCACTGTTAAAAT
ATTTTTCAAAAATATTCATTCAATCAAAAGATATCAAACAAAGTTTATTG
CTGGTTGACTCTATAAAGTAGTAAAAAACGACAAAAAAACTGTCTATTGT
AAATACTCGTTTTTTACTTGATAATATTCCACTCACGAATATCTTTTTAA
CGAGCACAAAATCGCAACTTGATTCGAATTCTATCAAAAGTTACAGCCAT
TTTTTTCTCCAGCTGCAAATTATTTTGAGACAGACTTCAGAAATACTCGT
GAAAAATACAAGAAAAGCGGGTTGATAAAACTTTTCGTTTATTGTTTATA
TACACATCTTTTTATGTTATGCATTTTTTTCTTTCTTTTCTTCTTATCTT
ATATACAAAAATATTAATTGTTTGGGCAGTAATCCTGATTTATGTCTGAA
TTTATGCTTCCCTGAAAGTCTGAAGACCTAAAAAATTGTCGAACCGATTG
GAAGAGTTGGTTGGTTGGTTACCAATAAGTTCATAATAATTTTTTTAATT
TAATTTGCAAATGCAAGCGTATTGACCTTTAATTCAACCCTATTTTTCTC
TTTTTCTTTTTCTCTCTAGGGAATTATCTTATTTCCAACCTTGGTCTACA
GATGGCGCTGTATTTCAATGTTCATTATTCACCTTTCTGGTTTGTTTCAT
GTATTGTTATGTTAACTGTGAAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038715TCONS_00038715Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001912supercontigsc0001912:27580..35156 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.16	1.68	0.49	3.34	18.6	12.4	6.1	14.53	4	3.6	4.8	4.59	3.15	4.76	2.94	2.1	3.24	5.64	0.92	2.4	2.92	4.27	4.45	3.59	16.2	13.63	0	0.63	0.48	1.95