XLOC_022678 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_022678
Unique NameXLOC_022678
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001756:8298..32431-

Legend: gene
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TTTTATTCGCACCTACCCAACTTGCAGCACACAACGTTGTTTCAACGTTA ATTTAACGTTATATGGACGTTATGAACATTAGATAAACGTTGAAACAACG TTGTGTGCCAGCTAGGAACCACGAAATCTGCTTCAGTAACTTCTTATCTA AGAAAGATACGAAACATTTGAACACAGATTTGAAATCAGCAAGGTTCAAG TAATTGTCATGATTTTTGAAACAGCGGGAAGATCTTCATTTTTTCATCAT TTTTCTCATTCATTTTTTCAATTTTTCAAAAATCTTGATCCTTTAGATTA TTCTCCTTGGAATTATCTTTCCAACGTTTTATAACTTTTTAACATAGCAT AACTGGGTGGTGAAAAAATGTCAAAAAATTAAAGTGTCTATATACTTTTG ATACAGACTTAAGATGATTTATGATTTTCTTACTAAAAAGCAAAAATCTG TTGTCTGATTTTCAAAATGGATTTGTCAAAAAGACTTTTATTTTAAAAAG GTTTTATTTAGGAGTTTTACTGGGGGGAATAAACCATTGAGTTTCAAGCC CGAAGGCTAGATGTGAAACTTTAACCCTTACCAGGCAAGAGAAATTGAAG CCACTTATATCCCATCCAAAACGCACATAGAACACGCCGTAATCATGACG ATGGATTGTATCTAGCGACTCCTTTGTTTTTTAGGACTACATCATTTGAA ATCTAGCGATAGATTTAAGTTTCAACCCGGCTTTTGTGTAAAACTACGCG CTTGCGTTCTGGATCGGAAATAAGTAGTTTCATTTCCCATCCAAGAGTCT CTCCTCCAACAGTTCGGGCTTGAAACTCAATGGAATAAACTTCAAGTTAT AATAGATACTCCCTTTAAAACACAAACGATTAGAAAAACAATTAGTAAGA AAAATAAAACTTTCCTTTTAGTGCAAAACTATCATCAAAACATTCAACAC GTCATTCACCCAATTGGAAAGCAAGCTAGAGTCACGTGCTAGTTTCTGTT CCGTGATTGGTTATTGTCAAAGTGAAGAAGACAAGTCTACAATGAAAGAA ATGATGAAGCAAGTATTCGGCAACATGGGTATGTCTCCTAACACACCCCC TTCTCACAGACCCGGTGGGATTTTATCAGCCAGTTAGGGTAAAAATGGCC TTTTCCAGAAAAAAAACCGTATACCCCCTTTTGAGGTGGTCCATTTCCGT TCCNTCTGAACATAGTTTCAATGTCGAAAATTAATAATTCGTAAATTACT TTTTCGTCAGTTGAGCTACTGTGACTTTGCTATTCTTTTTACAGTGCATG AAAATGTTGACAACATTTGAAAAAGCTGAACGCCAATTAGGAAGTGTCTT GACACGTGATTTAACTAAACAACCAATCGGTGAAGAAGCTGAGGAACAGG AACCAATCACAAACGAGGAAGTCGAAACCACATGTAAATGCTTCAAAAAA CAACCGATTTTCGTGACAGAAAACTTTGACCGCTGCCAGCTTTGTCAGCA AATGCAAACAGGTAGGAATACAAAAAGAAACAAAGAATGCAATTTCTAAA ATTACTGAATACATCCCCATCTCACAGACCCACTGGGAACCCTTCCCACT GGAAAAACTGGCCAAAATATTGTCCCGTTGGAAAATTGTCCTCCATATTT TGTCGCCATTGAAAATTTTTGTCCCAACTAAAATTAATCAAATAAACCAA TCCTCACTGCAAAACATTATGCTAATTTTCCCATCCCCACTGAATTTTCT GACTTGAAATCAAAAGAATTGAAACCCCCATCAAGTATCAGTCCGTTATT TTTATCCCCACCGAANCTCAATGGAATAAACTTCAAGTTATAATAGATAC TCCCTTTAAAACACAAACGATTAGAAAAACAATTAGTAAGAAAAATAAAA CTTTCCTTTTAGTGCAAAACTATCATCAAAACATTCAACACGTCATTCAG CCAATTGGAAAGCAAGCTAGAGTCACGTGCTAGTTTCTGTTCCGTGATTG GTTATTGTCAAAGTGAAGAAGACAAGTCTACAATGAAAGAAATGATGAAG CAAGTATTCGGCAACATGGGTATGTCTCCTAACACACCCCCTTCTCACAG ACCCGGTGGGATTTTATCAGCCAGTTAGGGTAAAAATGGCCTTTTCCAGA AAAAAAACCGTATACCCCCTTTTGAGGTGGTCCATTTCCGTTCCAAGAGC GTAAGGTTTGATATATGGCAGAATTCCATAGGGAGATACAAAAATCTTTC AAAAATAACTGGAATTCCATGGGGTAGCCTTTTAAATCCTACTAAAATTC AGAATTACAGAGGGGTTTAAGCCTGAAATTGCCTGGAATTCCAGGGGGTT GCAGCATTTCCAGCCACAAAATGATGGACTTCCTCAACAGGGGGTATACG GTTTTTTTCTGGAAAAGCCCAATAACGGACCAATATTACCGATATTACCA TGTTTTTTATGACCGAGGATTTTAATTCCATTATTTTCTAGCCCGAAAAT TCAGTGGGGATGGACAAAAAGTACAATATTTTAAAGTGGGGATTTGCTTA TCTGATTAATATCAGCGGGGACAAAAAATAGAGTATAGATTTCCACAGGG GACAATATTTTGGCTTATTTTTCCAGTGGGAAGGGTTCCCAGTGGGTCTG TGAAAAGGGGTGTCGTACTAACCCTTCGACCACGAAGGACGCCTATTTAC ACACAACATTCCCTTCTTAGAACAGCAGTGGGAACCCTTCCACTGAAAGA ATTGGCCAAAATATCGTCCCTAGTAGAAATTATACTCCAATTTTTCCCCG CTCTTGACCACTTAATTAATAAGGCACAAACCAAGCTTTTAAAGACTATG AGAATAAAATAGAAAATTTAGAAAATAATTATGCTTTTGAGAAAAAGCAG AGCGCTCTAAAGGTTATCGAAATTGAGGGAGCTATAACTTTTGGTTTGAA AGACCGAAACAAAAATTATCCTCAGTAATAAAGAAGATATATTCTTTGGC AGAATATTAATCAGTTATTCGATATTCTTTCTATAATTTAAACGAATCCT CAATTTCTATCGAGAGAAACCCTTCCTAAATTTTTCTTATTATTCCAATC TCCCTGTAATTCGAACAAATAAGCCTTCCCATTTCAGTTCCAGTTATCAC AAGAGTAAAATGTATTATGAAACACATTTCTAGCTTCTTTGTTATATTTA TACATTTAACATTCGACAGGTTCCTTCCTACCATCACTCGGCTTGGGAAT TGGTGGTAATCCGTTGGATAAGGAATCTCAATGTTCATTTTGCAGTGACT GCATGAAAAATATCAAAAACACACTTAAAAATGTTACATCTACTGGTAAG ACACTTTCGCTACCTTTGAAAAAAGTTTTTCATTGAATTTTTGAAATCTT CGTAAAGTTAAGTAAAAACTCACTTAAGAGAACATATTTTGACGGGGCAG CAGGCATTTTTGCTCTCATCTGCTTTATAACGACTCGATCAAACATTGCT AACAGGAAAGAGACCTTTTCCAAAGGCAAACGCTTTCGATCAGATCCCTT TCTATGGTGTTCAGTTTTCGCTTCATCGATAATAAAAAAGTGAGGTCAAA ATTCTACATTGCGGCAGCTTCTTTATGGATGATTATAAATTCACCTTCTT TCGCATCATATAAAATTCTGGTGTTCATCCGAAGACTTTTAAACCACGAC GTTCTAAAAATAAAGCTGAAAGCGAGATTGGGCTATTCCAGAAAAAATTT GTACCTCCTATTTTGAGGAGATCTTTTTCCCCCTGGATTTCCAATTTTTC AGGACCCCCTTGGATTTTTTTCTTCAATTTCTTTGGACCACCTTAGATTT TCNAATAAAGCTGAAAGCGAGATTGGGCTATTCCAGAAAAAATTTGTACC TCCTATGTTGAGGAGATCTTTTCCCCCAAGGATTTCCAATTTTTCAGGAC CCCCTTGGATTTTTTTCTTCAATTTCTTTGGACCCTGGACGTCACACCTC CTCAACATAGGGGGTACAGACTATTTATGGAATAGACCATTTCTTTTCAG TATCGGCCACTTTCTAAAACATGTCTCAAAATATGAAAATAAGTTATGAA TAACACTTTAAACAAAAAGACTGAGCTTTTATGATTATTTTTTTAACATT GCTTTACACAGGAATGCCAGAGGAAGACATTACACCAATGTTGAAAGATG GATTTGCCATTTATTGCCGATCCATGAAAAAAGGAGATGTTGTTGAAAAA GTGGTAAGAACAACAAATTCCTTATTTGAACGGTTTTTCTCGGCTACACC TGATAGCCAATCTAGATTCGCTAATCTTAGTACAAAGGGGAAAATACAAA ACTGTTGGGGTACAGAGCCCCCCCTTCCTACAACCGACGGGGACGTACAG CCGGAGTTTGAAAAGTGGACTCTGTCAGATCTGAATAAGTGGTAATTTTT CAGAAGGAAAAATTGAAAAATTTGTAAAGTGGCGAAAATGACCAAAAATC GACCCCGTTGAAAATTAGTAAATTTGGGACCCTGTCAGATATCTCTTAGA GTCTGAAAAAGGGACCCTGGTCAGCGGCACGTCCCCGTGCCAAATTTATT AGTCTAAGTGCCTTCCCCAAGGGTAGTACAAGAAAAATATTTCATTGTTG AAACTGAATAAAGGTGGTCCTAAATAACCTACGATTCCCAATGTAGAGAT GAGAGGGGATGGCAATCCATAAAAACAGGACCTAATTTGGACCCCTCTAA TTTTTTATTTACACTCCTCCTCAACATAAGGGATAGAGACTATTTCTGAA AAAGTCCATTTCAGCTTTTCTTTTTTATTTTATTGAATATTTCGATTTTG GAGGGATTCAGTGGCTTCCATGCTTTATTCTTAGCCTTATTATGACATTT TTTAGTTTTCGGAAGTCCGAAGTCTCATGTTTAAAGTCAGGGTTAAAATT CTTAGTTAAAGAAGTAAATTAGAGCACTTCAAAATCAGTTTTAGTTTCAA GATTTTGTAGGAAATTCCCCTTTTTTCTCAAATATAATTATACTTTAATT GTATTACAAGGGAAAATGTTGAGTTAAATTTTGATTCAAATGAGAATACT TTAGAATATAATTATAAATGCAACTTTTATTATGGGCGCACAAAGTAGTC GGTTCCATCCCTGGTAGAGTCATACCAAAGACTCCGGTATGTCCCTGTTA AAAGGTGAGAAATATGTCAGAAGGTCAAAAGGTTAGAAAGATAAGTGAAT AGCGATTCTAGGAAAAAGATTGGCCCCATTCCTTATCTTGGGATAGATAG CTATTTTACACTAAAATTTGTTATCGTTTCAGTGCAAACGCATTTACAAT GGCATGGAGAGCATCCAACGAACCATCATTTCAACTTCATCCACAAGACC AACACCATCAACAACAATTGAAACTCCAACGGAAGAAAATGTTGCTGCTG ATGATGAGTTTGGCCTTTGCAAAGATTTTGATATGTGCTGAATGAACTTA AAAGATCTTTGTCTCTTAGAGACAAGTTTGTGGAGACAAAGACACTTATA TTTGTAAAATCGCTCGATTTAATTTTTGTTTTATAACTATAACTTTTTTA CCTTTTCATTGTCCATTTTATCTTTGCAATATCCAAATAAATAAGCTACT ATTGTATAATGGTAGAGCTATGACGAAAATGCTGATAAATTTGATCCATG CAATAAACTCTGAATATAAATGTTTAACCGGAGAGGTTTTTTTTCCAATT TAAGGACGTACTTGTTTATTTTTTAAATCAATTGAAGGTTACTTATTTTT TACCAAAACGGCTCCTGAAAATATATTAAACGATGTATGATAGATGGAGT TTTTGATATGTGGTATAGTTGTCTTGTAGTTTTGTAGTTTATGAAATATT TCTTAATCTTCCTTTACATGAATGCAACGAAGCAAATGATATTTGTAGAA TTTTTGTATCTTTAAATTTATCGTAATATATTTGAAATCAGCAAAATAAT TCCAAAAGTTTTGATACTTGTGTAAAATGTGGAATATAGATGTGGTAGTA GTACAATGACTCAAAATTGTACGCATAATTAACC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038003TCONS_00038003Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038002TCONS_00038002Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038001TCONS_00038001Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038000TCONS_00038000Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00037999TCONS_00037999Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00037998TCONS_00037998Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00037997TCONS_00037997Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038001-proteinTCONS_00038001-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001756supercontigsc0001756:8298..32431 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.3 0.28 0.84 0.38 14.51 11.45 85.41 94.07 152.95 119.41 168.9 146.41 143.98 160.01 116.82 100.28 57.56 65.15 234.24 302.14 123.47 112.68 155.02 201.47 213.53 210.8 48.77 64.15 954.1 838.93