XLOC_016402 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_016402
Unique NameXLOC_016402
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000714:102795..111086-

Legend: gene
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>XLOC_016402 ID=XLOC_016402|Name=XLOC_016402|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000714:102795..111086- (Clytia hemisphaerica)
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GTAATGGTTTTTCCAGATATCTGAAGGACTTTCGATACTCTACTGTGGAG ATTGATACCTGACCATGCTGCATTCGATTTCTTTCGAGTTTCAATCGAAG AGCATTTGCAATGTCATCAATATCGTTGACATCTGGTTCTTTATCCCAAC CATTGGAAGGTGCCTTGCAACCACATAATGTTCGTATCAAAAGAAAAAGC AAAGTGATATCAAATTGTGTTGAATCTGTTTGCTGAGATTGTGGAAAGAC TTGATCGTACTGGTCGTTTTTCAGTACCCCTTTCTTTTTCAATTTATCCA ACTCTTTCTTGTGTTTTGTCTGTGACAACTCTTGATACAATGTCGTTGGA TTTGTTGAAAACTTTTGATGAAATAAATCAAGTAAGCATTTGGTAGATTT CTCACGTAAGAGTTGCTGTTTGAAACCGTTCTTCTGTTGTTGTGTCGGAT ATTTTGTTTGTAATCCAATATTCGCTGAAGCCATTATCGTTTCAGATTTT ACTTTCAGGTCACCATCTTGCCCTCTTCGACAATGTTCATGTCTGAACTA TTTTCTTTAACTAACGTAATCAGGATATCAGTTCATTATGATTATATAAT ATCTGATGTATTGATCGATCCTTATTAATCGAGCTCATCACAGTACCGCT CATTAAGAAGTTTTTACTAAAGAAGGTATTAAGTTTAGACAAAATATATA ATATCTGATGAATTGATCGATCCTTTTGCTTATCACAATACTGCTCATTA AGAAGTTATTAAGTTCAGACAAAATGTATCACCCACATTTCTCTTACTGC ATCTATTCATTTCTTAATCCGTGTTTATCCCAGCAACCATATAATAAGTT GAATATATTTTGTGTCTTTTGACAAACGTCTTCGTAATTTAATATAAGCA GCTCTAAAGCAGATCCTGACTGTTACGTATACACTCTAAAGGCCATTGCT CCGAAAGAGAATTTGTCCAGGCTGATGGACCGCTTTGACAATTTCATCCA AATTTTAATATTTAATTAATATTATATTTATCGCATTAAAACGCACTTTT TGTCTATTTTTGATAAATGTAGGATTCTTTAGATAAACCCCTCTAAAACG CACTCTCGTTTGCCATCGTTTGTAAGCAATAAACAACACAGTTGCTGCAT CCCTTTAAAGCAAAGCGTGGTGTGTACATAATGGATGATCTCTCATGAGA TTAGATTTAATACCCAACAGCTGAGCATCATCGATTCTTCATGTGGTCCT AAATCTTCTCCTTGAAGTGAATTTCTTAGCGGTATCAATTGAAATTGAAG AGGCTAACAAAAATGTTGTCAAGATATAAATCGTAAAAGTGATTACGTAC GGAGAATGAGGCATGTTCGCAAAGCGAAAGGAATTCTATAGACTAGGATT ATATAGAGACACGGAATGTTGCCTAACTGTAACAAACCGAACTTCGCGTT ATCTTTTCAGTCGGCGAAGAAGATTTGGTACATGATACTTCAAACTCGAG ATATCGCATTTTGAAGTTGTTCCTAAACCCATGACGTCATTAGGTCCCTT TACCCCGTAATGTTGTCAACGGTCAATTCGCAAATTTTGGATTTTTTGAA GTCAAAGGGTACCTTGAGCCCCAAAGGTCCCAAAAAAACAAAAATGTTAA TTATTTTCACGGGAAAGCGGGTTTTGAATTTTGCAAAGATTGATACTGCA ACGANATTTTCACGGGAAAGCGAATTTTGCAAAGATTGATACTGCAACGA CTTCTTCTTAAAAAACGCTAATTTTCACGAAATTCTCAAAGTTGAAATGT TCCAAGGGCAAGAGAAAGGCCTAATTTTGTTTAATACACTGAGCATTATT TTTACAAGATAACAGATAAAGATACTTCTCAACCAATAAGATTATTCCTA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00028893TCONS_00028893Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028892TCONS_00028892Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00028893-proteinTCONS_00028893-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000714supercontigsc0000714:102795..111086 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
POLR3GPREDICTED: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7 isoform X1 Homo Sapiens
POLR3GLDNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7-like Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
24.96 21.94 13.57 11.07 17.54 13.35 16.11 16.76 12.57 10.84 10.85 9.31 8.22 8.27 7.15 6.73 11.27 9.18 4.48 4.57 9.3 9.58 17.43 15.36 12.26 15.02 3.31 3.6 8.36 12.11