XLOC_015568 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_015568
Unique NameXLOC_015568
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000636:1823..6674+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_015568 ID=XLOC_015568|Name=XLOC_015568|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=4852bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000636:1823..6674+ (Clytia hemisphaerica)
CTTGAGTGTGGGGAAAGAAAACAGTTGATGTTTTAAGGAACATTTAAACA
AGCAGTAAGTGAAACTTCTATATTAATctttaaaaagtcttgaaaaattt
ACATTCCTTTCTAGCTAAAATTGAGCCAATCTTTAAGTCACAACAGACAG
GGATTTCAGAATTCGCTCTTAGAGCATTTCACAGAATATTAGTACAGTTT
GGAGCGTTGTTTTTTAGTTTGGTATATTCATTTATGCCAACATTTCCATG
CTGATTGCTTAgacatttctgaaatctgaggccgagtttgttttttaatt
atttctaaGGTTTTGGCTCAAATCAAACCTCACGTTCTAATAAAATTGCT
CGGTTAAacagattttatttcaaatattaATATACCCTTTTCTATCTTCT
TTGGATAAGTTGAATTTCTAAGTTACTTAAATGTCTTGAAAATAGAAGAT
GTATTGATTAGGTGAGCTTTCAACTTGtattcatatttttcttctttagg
gATTATTCGAACGAGCAAAGGAGAAAGTCGTAAAGATTTCCTACCGTAAT
TTCACACTTGCATAATAAAGACTTATGGGACATTACTTTTTGTGCACAGC
AGCAAAATTGTACAAATGACCTGGAATGTCATGGTACGCACTATGATTTT
ATGATTCACATTTCACCTTTATTACATTTGCTGCATAAGGGACCGGTGTA
GGACATTGCTAACCATTCGAATTTGCaaataatacacccctgtctcacag
ccccggtggtacttttttcctcagtgggaatAAAATTTCCTGTCGAAATT
CaagtgggaataaaaattttattgtttcaagtTCCAAGGTTCAAAACTCC
ATTCggggtggttttggagtgcagcttataaacattgattttcggctggg
gatgaaatcatagtcaatttctcagtgggaGTGAAATTCCCGGTAGTTGt
tctaccggggacgaaatttttgccaaatattcCCGTGGGGCTGggatccc
agcgggtctgtgacacgggtttaataattaatgaaaattaataaaacCTT
GTAAATTTTGAGTTTATTTTAATAATATTGCTAGTAATCTTTGTTGTGAT
AGGATTGCACAACATAAAGCACTTTCTGTAAaagcaattttaaagtgctA
ACTTTGAAcaatatcaataattattttttaacattttttcttcTAAATCA
TAGCTTTAGATTGAAGGATANTTTTTAGTATAGGCGGGTAGCggggtttt
ctcaaaatcttcaagtttcagtggggaccgacagggaaataaaaattttg
aagagctacttagtggggatctagaaaaattaaaagttttcagtggggat
tccCCGGAGGCAAATTAAGCCTGTTTTTCTCACCGGGGACAagattttgg
acttttttttcagcgggtgggggtgcccagcgggtctgtgacacgggggt
gtATTAGAAATAAAcccattttattttttagaaaactgcaaggaaaaaga
gaactttcatttataacaagttaacaactgaaaattgatcaattttatga
attattttatcattttctgaGAAGAACTTTCAACCAGAAGGGAGGGTACA
GATTTGAAACTTGTTGTTAAAGTTATGGACTTTTCCTTTAGAAAATgaga
tttaaaatttcattatcaaagaagaaaacaaatagCCCCAGATAGGAGAG
CTGACCAGACTTCCAAACacaagtaaacaaaacaaaaagaagattAAAAA
GCTAGCTAAGGAATTTTTACTATATAATGTCATTGATTACTAGAACTTGC
TCCTTCGAAATTCTTGATATAATTCTGAAATATAAATACTTCAAATTAGA
TTAGAAAACAGAGAATTAGAAATTTTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGAGTGAAATTCCCGGTAGTTGttctacc
ggggacgaaatttttgccaaatattcCCGTGGGGCTGggatcccagcggg
tctgtgacatagggtttaataattaatgaaaattaattaaacCTTATAAA
TTTTGAGTTTATTTTAATAATATTGCTAGTAATCTTTGTTGTTTTAGGAT
TGCACAACATAAGGCACTTTCTGTAAaagcaattttaaagtgctaacttt
gaacaatttcaataaatattttttaacattttttcgtCTAAATCATAGCT
TTAGATTGGAGGATATCAACAGCATTGGATAACTCACTAATGATTACGAC
TAAAAGGACATTGCGAAGAGGACAACAAACAAGTGAAGATAGTTTTTGTA
GA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00027595TCONS_00027595Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000636supercontigsc0000636:1823..6674 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.12	1.47	0.89	0	3.31	1.98	5.81	5.33	3.58	5.75	1.4	4.54	0	0	1.69	1.3	1.28	1.44	0	0	0.41	0	0.49	0.65	0	0	0	0	0.94	0.48