XLOC_014279 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_014279
Unique NameXLOC_014279
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000535:106572..122952-

Legend: gene
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>XLOC_014279 ID=XLOC_014279|Name=XLOC_014279|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=16381bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000535:106572..122952- (Clytia hemisphaerica)
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GGTTATTAAGTAGTATTTTACATTCACTTCTTTTAGGTACCTGCACATAG CGTCAGCCTGGGTTTAAGTCACAGGCAAAAAATAGGTCCCCCCTGAGATT TAAGTCCCCCCAAAGACTTATGAAATTCTTGTTAGCCCCCAGGACTTTTG ACCCCTAGACACTTTCAAAAAATTGATGCAGTAAAAAATTTTTTTCCCAA TGTAAATTGCGTTGAGATCTAAGTTTAGGATAAAATATTTTGCACACTTT CTATAAAATATTGCGCCACAGGCGAAAAATTTTCAGATTCATGAGCTTCA ATTTGAGTAATTGAAGCCAACTATTAAGCTGAATTATTTTAGCCCCCACG TTAAGTGATGAGATTTTAGCTCCCCCCAACCCAAGTACATATGTCCCCCC CAAAAAAGTGGTATACTTCCAGCCCCCTTCTTTTTTGGGAAAAATTTAGG GTGTAACCCCCCCCCCAACCAGCAGGGGGGGCTGACGCTATGCCTGCACT GTACCACACTTTGTTTATGCATTTTATTTGAGCTTGCCATTATTTTGTCC ATACAGTCTCAACTACACGTTTGTTTTTTTTTTAAGAAACACACTTTTAA GAAACATGAGGCTCAGAATGCCTAAAAACTAAGAAACATCTAAGAAACAT GCTGAGGCTGAGAATGAGAAAATAAGATTTTTTAACTCGGTTTTTTTAAG AACCTTCCAACCCAGCCTTCCATGAGGCTGATTATGTTAAAAAGTTTAGA AACATGTAAGAAACATTTAAGGCTCAAAAGGCCGATTTCTTAAGAAACAT TGAGGCTGCTTGGTGAAACTAGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAACGTGTAGG TCAAGGCCCTAACCTTAAGAAAAACTTATGTGCCTGAAATTTGGCATGTA ACTACCTTTTGAGTCCAAGTACCGTCAAAAAAACCTGCAGTTGATTCTAA 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AAAATGCTCCAAAAAGTACTTGAATATACTTGATTTTCAATGACTAAAAT CGCTGGCCACCCTGTAAAAACTCAGAAATTGAAATTGCGATACAACATAT CTAAAATTTTACATCTCACTGAGTCAGTTTTATTAAAAAAACATTTCTAA GAAGCTTCTTGTTCAGCCTCCAATAAAATAGAACTGTCCATAGAGTGGAA AATGCGTCGTATTTTTATTTAAAAAACGCATCGTGAAAACTAAAAAATTT CGCGCCTGTAGCGCACAGTTTAGCTCGTTTTGCTCGCTTAAAAGTGCCTA CTAATAAATTCACGGTAACTTTGTACAAAAGTATTTTCCAGATTAGTCCT TTCCTTTCCGTGGGGACTTAATTTCCTGGGTGACACTCAAATCCGCAAAA TTTTATCCCATTATACCAAAAACCAAAAAAATCTCAAAGATGTTCATTGG GTCAAAAAATTCAGCTTAACATTGACTGGGTTAATAATAAAAAGAAGCTT GCATTTCTTTCAAGGAGCCGTCCACATAGTACGTGCGCACTAAGGGAGGT CCTTCTCAAAAGCGTATGCTTGGGAGGAGAGGGGTCAAAGGAAAATGTAC GTACGCAGAGAAAAAATTTTCAGAGCCCTTTTTCGCCTGTTTTTTTGTCG ACTTTTACGCGTGTTATATGCATCAAGGAAAAGAAAAAGTTTCTTGATAA ACATTGAGTTTCATGTATGAAATAAAGGTCCGAACCATTTCATTTGAATG CGAAATTTTCTTCAACCGAGGGGGGGGGGGGGGGAAAGGAAAAAAAAAAA AAAAACCAAGGGGGGAAAAGCCCTTTGGGTTCCTTGGGGCCCGGGGGGGG GGGGGGGGTTAATGAAAAAGTACGTACTTACCAGAGGGGGTATAGCCATT TGCGTCGCTTGCGTACAGGGGTGGGGAGGGGGTACTCGATTTTCGACAAT 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TCTGTTTTCTCAATCTTTTGTCTTTTCAGTTCTTTTAAAATTACTACCGT TGTCTTCCAATTTTTACATTTGAACTATTTTCTTATCACGTGGGTTTAGT TGTGATAGGTTATTACTACTTAGATTTTATGAGAAAAAGTACGTGGATTA AAACTGATTTATTTGATTTGATAAAAACTAAATATTGCGTAATTTTAATA AATTAAACTGAAACCAGCTAAAATATTTTCTCTCTTTTTATCCAAAGACT TTAGGCGTACATACTTTCGCGATTTGTAATTGGGGGGGGGGGACAGTTCT GGTTTCGTGGAGCGTAGTGAGATTTTCTTTCTCTGTCAAGAACCACTGGA ACCTTGGAACCTCTGAATACACTCTCTTTTTATAAGCATACGGGAAAATC GGTCCGAGGCTCAGTTTGCTTGGCAAAATCTCATTTCGGTCTTAATTTAC TCTTAGGTTCCAAATAAACGGGGGGACCTAATTGCCGGGGGGGGTTGGAA ATCGTACTTCTGAAAACCCAAAAATTAAATAAATATAGGCTAAAACCAAG CTATTTAGAGCAAAGTAAGGTGCCTTCCTTCCCTTTGACAGCTGAAATTA TTCTTCAAAAATTAATAAACGGGGGGGGGGCCTAATAAGGTGGAAGGCTA GAAAATTCTGAAAATTAACAAGCAGGGGGGGGGGCGTTTATTTGGAACCT AAGAGTATGCTCATTTATATGCCTTGACTTTTTGTTGATTTTCTTTGGGC TCAATAAGAGCAAAGTGAAAATTTCTGTCTTAGAAAGTTAAAACAGCTTT GAGGGCTTTTTCATAATCATCGTGTATAAAATGTGTTTTTCTGACTGATG TAACCAACAAAACTATGGCATGTTATACATTTTCTGTTATAGACCAGCGG CCGAGTCAGTGGATTGTGTCACTTCGTAGGGCACCGTTTAGATCAGGGCA AATTTTTGATATTATTCTCCTGACAGGGTGTAGAATTGACAAATAAAATT TGCCTTTCGAATCTCCTGCAGTTTTCGAAAATTATCGATATTTTTTGCTG AGTCAGCAGTTTTTCAGCATATTTATCCACCTTAAAAATGAATTATCTCG AGATCTATACATTGAAAGTTGACAAACCATACCATTTTTGGATCCCCTTG ATAAGTTTTATCGATTCACTCGAAAACTGCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025427TCONS_00025427Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00025426TCONS_00025426Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00025425TCONS_00025425Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00025424TCONS_00025424Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00025423TCONS_00025423Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025423-proteinTCONS_00025423-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000535supercontigsc0000535:106572..122952 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3987.67 4194.26 4105.23 4478.03 1603.31 1187.39 1689.48 1731.35 2294.4 1920.55 2241.28 2265.84 2939.33 2764.59 2573.32 2405.86 2055.82 2095.18 3415.74 3068.72 2643.17 2554.58 3453.77 3126.74 1388.49 1443.76 2979.7 2834.39 4225.17 4050.68