XLOC_012735 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012735
Unique NameXLOC_012735
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000430:262496..273019-

Legend: gene
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>XLOC_012735 ID=XLOC_012735|Name=XLOC_012735|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10524bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000430:262496..273019- (Clytia hemisphaerica)
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CACAAACATCCCCAAGTATAGAAATTGTACGTAAAAATGCTATTACTATT CGCAATGTTATCTTTTTTGCATTTCTGATTGAGATTTCACAGTTCCCGCC ATCATTATAAGATCTTTGATGATTCGTTTGTAACTTTTGCTTTCATTTGA TTACCCCGCTAAACCAAATGGTGTATCTTCACTGGTCGAATTTCGCACCT CTGTTTGACAAGTTATTTACAAGTTAAAATTATGCCTTATATATATGTTT TCTTTGCCCCAACATTTGTAGAATACACTGGAAGACTGCGTTGTTTGCGA CCAGAAAATTACGGAACGTATTTTGAAAGCTGTCGGCAAATCATACCATC CTCAATGTTTTAAATGTACGAATTGTAGTAAGAAGTTAGACGGGGTGCCA TTCACATTGGACAGCGCAAACAGAGTTCACTGCGTGGAATGTTATCAAGT GTAAGTCATAAATGTTTTTATTTTTTTTCGACTTTACTCGGTCATTCTTC CAATGGAAAGTTTTCTTTAGGCCTTTGATTGTTTGATTGCCAATGTCGGC TAAATCCTCCATTATTAATTCATATAGATTTTAAAACTGTCACCTGTCCC TAATTTGGGTTTTACGCTAAAAATCTTTACTGCAAGTGTTTATACCTAAA ATTTGGGCACCATCTTTTAAGGTCTTTTTCTAGTAATAAGTTTGATGAAT TTCGAAAATTTTTAAAATTCTTGTCATTATTATAATTTTTGTGACGTCAT TAAGCCTTTTTACTTTGAGATCCCTATGAGATCCCTTTGCACAAACTGCT TCAAACCACTAAAGCCTCACTCTAAGTACTTTGTTTTCAATCATCCGATT ATATGTTTTTCTTCGTTAGTTTTTGAAATTTAGTTTTACATAATTTATTT TACATTTATTTGCAGAAAATTCTCACCGAAATGTGCGGCGTGCAGCGAAC TCATCATGCCGACAAACGTAAGTTTATATGAATACCTGCTAGATATTAAA CTTATCAATACTTATTCGCTCTTGAATAAAACATTCACGTTATCTTGAAA TAAACTTTCATCATGGACCTAAAATCAAATGAAGACGCCTAGATAACTTG GATTCTAAATCCAAACTGAAAAGCTACCCTTTCGGCAATTAATTGTCAAC TTTTAAAGTTTAATCCTTTTTTAATAAGAACAAACAAAGTATTAAGTTCA GGCATTTCAGGTTAAACCAAAGTTATGCATTAACACTTAATCTGCCATTG TGGAATCAAACGTTCGAATTTGTAGAAGCAACACTCCTCACGCAAATCGA ATGTTTGATTCCATAACGGTGGAATTTAAGTTTATATACAGGGACCAGGT TGGGATCTTTTTTTATGTTTTACATAGAATGACCAGAATTATCCATTTTA TTTTAGGATCGAGGAGAGACAGTACACATTGTTTCCATGCAAAAGAATTT TCACGTACATTGCTATAAATGCGAGGTTAGTAAATGTTTCTTCATAGTAA TCATCGCCTACTAATCTCAGACTGTAGTGGACATATTTTATTTATTACCG TTCCAGCCCGACTGGCGTGCCAGTATAGATAACCCATCGTTTCAAATGGA CGTGTTTGATATTTTTGTTATATCATAACTAGACGAAGAGAATATTTTTT AAAAAGCAAAGCGTCCAACACGGAAACCCCTTATAAAACAAAAGATTTTT TTTGTACAAGGCTATAACCACGAAACTTAAAATAAATTTTTGTTCTCTCT TAGGATTGTGGTATCTTACTATCGAACGAAGAAGGGCGTGGTTGTTTCCC TATTGGTGATCATCTACTTTGTCAAAGGTGTAATGGAAAGCGAATGGCTA ATACTACTGAATTATAGATCGTACATACAAGCTGTAAATCTGAAAGAAAT AATTATGTCGATCTTTAATTGTCACATATACGGGTTTCGAATTCAAATTA GTTTCGGTTTTGATCATGTACAATATGCACGGAAATATATCAAGTAGAGA ATCTCCAACCTCCTTCCCTGCGTATTAACAACTTTTTTATTCTTACTGAT AACGCCTGATATTCTCTATGGCGTACATCAGTATCGTAAAAAAAGCCTGG AATACACGAGGACGAGGTTGAACAATCTCCGATTAGCTAAAATGTGCACA TTGGTATATTATCTAACCAATGAGTTTATTTGCTAGGTATTTTTCGTGTA AATTACACGGAGAATCAAGACAGGCTAATTTGAAATCCTCAAATTCAGTT GGTCACATCGAAACTTCCATAAAAAATTCCCTTTTGTCTTTTCTATAGTA TGTTTGTAGGTGTTTGTAGCACTTTTATTTTTTTCTCGCATATATTGTAC ATACAATTATAATTTTTACATTAAACTTTTTTGTACCTAAAATCTTTATT TCTTTTAAATATTGTGTCACTTCATCTATGCCCATACATGGCCTCTTATA GTATAGTTTATACTTAGCGTGTTCTCAATTTTATTTATTCTAGAACCCCG GATTCATCATAGTTTTCAGACTTTCAACTCCCCTGGATCTTAGGATATTA AGGAGGTCAATTGGTTTACTTTTTTTGAATGGCTAAGGATTCCAATAGGA TTCTAGCTCGTTGGACTTCTTTCTTTGTTATGCACCAAATTTCTGTTTCT ACATTACTGTTTGTTGTTTTATTGTTTCAAAAATCTTTATTTTTAATGTA TTTTATTAACTAAACTTAAATATTGATATTCTAAAAAGATATGATTTAAC TTTTTTTATAACTTTGTAAAAGTGACTGACTCCGCTCTTTTAGTTTTTGA CTGACTCAAAATACTCCAACCAAACTCGTGATCTTTTACACAATACTTAA GGGCTCTGACCATAGTGAATTTTTAACATTTGCCACTTACAAAATATAAA TTTCTACTTGATGTAGCACACAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022670TCONS_00022670Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022669TCONS_00022669Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022668TCONS_00022668Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022667TCONS_00022667Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022670-proteinTCONS_00022670-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000430supercontigsc0000430:262496..273019 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
FBLIM1PREDICTED: filamin-binding LIM protein 1 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.29 8.2 3.82 3.29 42.71 36.13 87.65 95.96 52.66 55.82 34.8 33.4 65.88 50.72 35.5 47.33 91.89 69.98 79.88 67.73 150.93 160.69 27.25 28.22 29.87 30.44 19.98 17.23 69.83 97.65