XLOC_012376 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_012376
Unique Name	XLOC_012376
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000403:59333..67902-

gene from alignment at sc0000403:59333..67902-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_012376 ID=XLOC_012376|Name=XLOC_012376|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8570bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000403:59333..67902- (Clytia hemisphaerica)
GTTTCAGATAAAAAAAGAACACAAATTTTTGAAAACACACAACTAAAAAA
TGGCACCAACTCAATCAGAACCGATGTACTGTTCCCAACAAATCAATATC
CCACCAGAGTTACCAAATATTTTGAAACAATTCACCAAAGCAGCAATTCG
AACACAACCTACTGATATTTTACAGGTAATATCATTTTCATCTGATAATC
ATCTACATGTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGTCTTTACGTTGA
ATTGCTATTATTTTCAAGTAAAAATTTGAAAATTCAAAATCAGATATCTC
AACTTTGGAAAATAGTTGGGGCAAAAACTTTGGAGGTGTTTCTTAAGACC
ATAAAAGGTACCTCTAAGCCAAGTATAAAAAAAATCATAATCTGATAATC
CTTTTAAGCAACAGTGAAGGATAATTTAGATAATTTCTAATATCGATAAT
ATCGATGATCTGGATTTTGATCTTTTCCATGGAATTTCTTATTGTTTCTA
TGTTCGCGGAAACATTCTTAATATTTTAAGCTTAAGTTCCCATGAATATT
CAAATAATATATATTTTAATTAATTTCCCTGATATTTTGTTGTTTTAAGT
TGCGAAAGAGAAAATTAGATGAGCCTCTTCAAGCGAAAAACAAGATGTTA
ATATTTTCATTTCATCTTTTAATTTACTTTTGTAGTGGTCGGCCGCTTAC
TTTGATGCACTATCTAAAGGAGAAAGACCTCCTGTCAAAGAGAGACTAGA
TTTCCAGCTAGGCCAAGCAAAAGATCAAAATTTAACCAAAGAAGCTATTG
CAGTGTTACATCGTCAAGTCGGTGACAAGCCTGTGGTTGAGTACTCGCGT
GTTGAAGACAAATGGCATGCATTGTGTTTGTCTAGCCTGGATCTGGATGC
TGTCATGAGGATCGGTTCGTTCCCTGAGGAATTTGAATGGCTGAAATTTT
TGGCTATTGTTTGTACCCACATCAGTGAAGATATAGGAGGTGCTTTGAAA
ATGATATGTGAAATCTTAACCAAAGATCTACATGGAGGTCAAGCTCGTAT
CGAATTCGAGTTATTCCGCACCTTGTACAAGTACCTTGCGACAATCGACG
GCGATATTCCATTACGTCACGTCAACGCCGTCTTGGAGCATCTGTCATAC
GACGTTGAACGTCAAAATGGAATGATTTCACCCATGAATTTCCTCAGTGA
AACATGCCCAAGTCTAAGCAAGGAAGATGAGTAATATTGGTGGAAAATTG
GTTGCTTGTGTGTGTTATGTTGATGAGAGGTTTGCTCGTTCTTTTTTATG
TCTTTTGTCTCCCTGTACATAATGTGTGATAATTCTTGTGTGCAAGTATC
TCTTTTGAAGCTTTTGACCATGTTCGCAGGTAACTGGTGAAACGAAAAAT
GAAGTCATTCTATTGGCTAGAAGTGACGTAAAAGTTCGGAGGGAAACTGA
ACCGTAGTGTGTGAACGTGGTGTTTGCATATTCCTATACGACTAATTGAA
GGTGATTTGTTTATAATTTATCCTAAAAATGAAAATCCTGATAATAAAAT
GCAAAAGTTTTTTTAATCACATTTAATGTAGCCGTTGTCAGGCCTCAAGT
AGTAATTTCAGATGTACTATATTTCAAAATAGATTACAATAAATACAGAC
ATGGAATGTATATGGGAAGTCTCAAAACATAATGTCCCAGTTAATAGCTG
GTTAAAATGCCAATAACTACCTTTTCAGAGCTTATCAAAATAACAGTGAA
AGGCAGTAATGTATTTAATTTAGTTGCTGATTTTCCTGAATCTAAAGTGC
CATTAGAAGCTAGAGACATAATGTGGACGATTTTCTTTTTAGTTATGTCT
TGCCTTATGTCTGATAACCTGTGCATAGAAAAGATAAAGCTCGCGTACCA
AAATGAAGCCAGCGTCAGTTTCGAGCGTCAGCGTCAGCGTCAGCGTCAGC
GTCAACGCGAATCAGATTCAAATCGAAAGTGGTTATAAAAAGTGTTCTAG
CCAGCTTGGATCGAACGGTATGGCTCCCATTTATAGAAAGGACGCAACCT
ATACCCATTAGTGACCTTTTACAAAAAAAATGAAGTTCATAGCTGCTTCC
AATTTTTCAGTTAGTCGAGGAACGTGTCCCTAACTGACTTTAACCAAAAT
GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
CTTTATTTTTTTTGTAAAAGGTCACTAATAGGTGTAAGTTGCGTCCTTTC
TATAAATGGGAGCAATACCGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAAAGCCCGAAT
TCGACTTTTTCACATTTTGGTTAAAGTCAGTTAGGGANNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCATAGCTGCTTCCAATTTTTCAGTTAGTC
GAGGAACGTGTCCCTAACTGACTTTAACCAAAATGTGAAAAAGTGAAATT
CGGGCTTTCTGGCCAACTTGGATTAAATGGTATGGCTTCCATTTATAAAA
AGGACGCAACCTACACCCATTAGTGACCTTTTACAAAAAAAATAAAGTTC
ATAGCTGCTTTCAATTTTTCAGTTAGTCGAGGAACGTGTCCCTAACTGAC
TTTAACTGAAATGTGAAAAAGTCGAATTCGGGCTTTCTGGCCAACTTGGA
TCGNTTTTATTTTTTTTGTAAAAGGTCACTAATGGGTGTAGGTTGCGTCC
TTTCTATAAATGGAAGCCATACCATTTAATCCAAGTTGGCCAGAAAGCCC
GAATTTCACTTTTTCACATTTTGGTTANAGTATTGCTCCCATTTATAGAA
AGGACGCAACTTACACCCACTAGTGACCTTTTACAAAAAAAATGAAGTTC
ATGGCTGCTTCCAATTTTTCAGTTAGTCGAGGAACGTGTCCCTAACTGAC
TTTAACTGAAATGTGAAAAAGTCGAATTCGGGCTTTCTGGCCAACTTGGA
TCGAACGGTATTGCTCCCATTTATAGAAAGGACGCAACTTACACCCACTA
GTGACCTTTTACAAAAAAAATGAAGTTCATGGCTGCTTCCAATTTTTCAG
TTAGTCGAGGAACGTGTCCCTAACTGACTTTAACTGAAATGTGAAAAAGT
CGAATTCGGGCTTTCTGGCCAACTTGGATCGAACGGTATGGCTCCCATTT
ATAGAAAGGACGCAACTTACACCCACTAGTGACCTTTTACAAAAAAAATG
AAGTTCATAGCTGCTTCCAATTTTTCAGTTAGTCGAGGAATAGAAAGGAC
GCAACCTACACCCATTAGTGACCTTTTACAAAAAAATTGAAGTTCATAGC
TGCTTCCAATTTTTCAGTTAGTCGAGGAACGTGTCCCTGACTGACTTTAA
CCAAAATGTGAAAAAGTGGAATTCGGGCTTTCTGGCCAACTTAGATCGAA
TAGTATGGCTCTTATTTATAGAAAGGACGCAACCTACACCTATTAGTGAC
CTTTTACAAAAAAATTAAAGTTCATAGCTGCTTCCAATTTTTCAGTTAGT
CGAGGAACGTGTCCCTAACTGACTTTAACCAAAATGTGAAAAAGTGAAAT
TCGGGCTTTCTGGCCAACGACTCATTACTGTTTCATTAGCATTTTATTAG
CTTTTTTTCAGAGGTAAGACAACATGGTTATAGAAGTGGCATATACCAGT
CAGCTCGCCCGCGCACTGGAAGACGACTACATTAAGTTTTAGCATAATCA
TTGTTTAATTTTACAATGTAACAATTATGTAGTGAAGTTGATGAGCACAA
ATAAATAAAACACAAAATATCTTTTTAAGCCTGGTTTTGTGTCATGGGCG
GACGCTCTTGGGGTATTCCCAATAGTTGAATTGGTGCCACACCACGCTGT
CTCTCACTATGAAATCAAAAGCGAAAAATGTCGATCAAAATTTCTCTTTT
GTGCAGTTGGTAAGATTTTTCGATTTATATATTTCATTTTATCTTACTAA
GCAGTCAAACAAGAAAGATCGTTAAAGTTTATCGTCAAAAAACACAGAAA
GAGAAAAAACGAAAAAGGCACAATTGATGGGTTTCCAGAAGAAAAGTTTG
GTCATCTTTTTTAAGTTGACGATAAACCAGTTATCACCCTTTATCAGCAA
TTTGTTAGAAAATGGCAATCAAAACAAAACATCTAATTATCTTTTCAACG
AGCACAGGATTTAGATATTTATAATTCCATCTAATTATTATTGGTTTTAG
CTTCATATCGAACAAACGAAGAAGACCTCTCAAATTTGGCAAAAGGAATT
TTCAACCGAGCAGAGGAGAT

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00022056	TCONS_00022056	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00022055	TCONS_00022055	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00022055-protein	TCONS_00022055-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000403	supercontig	sc0000403:59333..67902 -

Orthologs

The following orthologs are found for this feature:


Ortholog Name	Description	Organism
ROPN1L	PREDICTED: ropporin-1-like protein isoform X1	Homo Sapiens
ROPN1B	PREDICTED: ropporin-1B isoform X1	Homo Sapiens
ROPN1	PREDICTED: ropporin-1A isoform X1	Homo Sapiens

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.49	4.17	6.39	7	222.52	173.14	109	109.62	99.04	90.62	70.33	95.04	60.61	63.73	27.47	29.03	46.84	55.25	116.43	124.97	66.4	63.42	24.37	28.71	94.94	69.43	34.47	28.43	10.51	10.42

You are here

XLOC_012376 (gene) - C. hemisphaerica