XLOC_008880 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008880
Unique NameXLOC_008880
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000222:160881..168768+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_008880 ID=XLOC_008880|Name=XLOC_008880|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7888bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000222:160881..168768+ (Clytia hemisphaerica)
CTGATGGTAGTATTGCAAGTGTTTGTAGGAGTCTCTCTGGTCTCTCTCCT
CTCACATCCTCTTTGAAGCCAAATAGTTAATATATACTCGTATTTCATTG
TTGAGGttaatttattttgtttctaTTTAGATTTTTAATCAAATATGCCT
TATCAGCCACCCCCAATGCAAAGTGGACCATCATGTTTTGATCGCATGAA
AATGGGCTTCATGATCGGATTTGCTGTTGGAATCAGCTCTGCTGGATTAT
TTGGTACATACTCTGCTCTAAGGTAAacatattattttttatctatagCT
AAGGAGGGCAAATTGTAATAGTGGTTGGAAGAGCTTGTTGCCTCTCCTGC
CACACCACGTCTAACAGTCAGGGACAGTCGCCTTATTTATAGGAGACCAG
GCGTACCCAATCGATAACATCGATTGTCGATTTAATCGATGTCAATCGAT
AAAAGTCGTTCGTAATCGATGATCGATCGATTAATAATCGATGGCCAATC
GATAGGaacgtaaaattttattatcgaTTGGtatcgattattatcgatta
gccatcgattgaattcgattgttatcgattaAGATCGATTGTGATCGATT
GAGCTAATTTTCTGTATTTATGATCGCTACTctgtgtaccagagtgtatc
tcacgatgaTATCGTAGCgtactttaagggaagaaattttcgcgggaaga
acttttcacggaatttaatttcgcggtttttcggcaAATCGGGTGAATTG
CCTTCGCACCAAATTTCTGAGCAATCCGAACAACAAAACCAACGACGCAA
GTTTTTTTGTCCTTGCGGTAccgtggtttttctaatttaacgcgtaGTCT
AATTTAACACGTACCCTGCTTTTGGCGAAAAATCGTAATTAATCTTACCA
TAggacggggtgaatcggataNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCCGTTGTTTACGGACATTTTAAAT
GAACACTGTTTTGACGTTTAGCGTCCAttgaatacccctgtctcaagtaT
CATTCGACCGCTACAAATGCCCCGCGNACGTTTTGCCGAAGTTATAATTT
GAATTCATGCAATTCTCACAAAGTAATTAGTCATTAGATGgagcgtcata
aaaatgtaatacCTAAGGGGGATATATTTGGGTAGTACATTTAGTATCat
tgataataaaattttgattagtGTGCGCTATGAAAAGTGTTGGTTGAATG
CACGATAGAAAGTGCAATGTAAGAAAATTAAACCCGAAATGAAACGTCTN
AAAAGAATAGAGAAATTAATCCGATCatcgtatatttttgttttctcctt
aTTTCAGGTACTGAACAATCTCAGATACTTCAGAGACGGGAGAAGATTAT
CAATAACACTCTGGTTGGCTCTAAAATTTGTTGACAAAATGATAAGAGAA
AACGTAcgatacacccctgtttcagtgacccGGTCAAGGATCCGCCCcga
tgaaaaaaatacaaaaagttacCTAATACTGACACGTTCACTGCCAAGCC
ACTTTAAGAATTTTGACCTCATTGAATTTcatcgaaagtttgactttcaa
aGGTCCAGCCGCCTTGGTTCTGCTTTAAGTGCCTACAAATTGCCTACCGA
TCGACGCAGAATTTGAGGACGATTCCAGAAATGCAAAAACGaagcaaaaa
aaagtattttctttaaagGTTATGGCCCTTTAGAGTACTGTCGGTATTTC
GACACCTATACTACAACTAGGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNAAATATCTGGGGCATATTTTCTCACCGGGCCGATTATTTATTGCC
AATTGTTCCACTAGGAAGGGGCTCCACCGTGTCATACTTTCTTGCCTCTT
TTAGCTTACCAATTTCCGCTTGCAGAAATAtttgcacccctgtctcagag
aTGATTTTAGCCAGGGGATGCGAGACCTCCGAGAGAATGAACAGCATATG
AACGAACGGGAAATTATGTCTTGTCTCGTACTGTACCCTTATCTTGTTGT
AAAGTGTTTGTAGCCTTACCCTTCCCACTATTTTCTTCTGGAAAATAATA
CATAACATATAAACTCCTAAATTATCACCatacaaaatatacaaagacAT
TGTATTCACATGAACAATGAGTGACTATTAACATTTGAACATTTATTCCT
AGCTACTCTGAACACTTAACAAGCCTCTTGGGATAGTGTGGCagtaatta
aaaatgacatgatgacggcatttgatatttttaattattcaataatTAAC
TCCTTTCCATTTCTCGGTTACGTATCAATTAACAACGCCTTCAACTTGGG
GCGCAAATGGGCGATTCGCGTTTTAACGCGACTTTAGAATGAAAATACGA
AGAATAGACATTGTTTTTCGTTTAGTGAACCAAAGATTGTGTATACAACT
GGCTTTCGTAGAACATAATGCCAAAGGACTCTCCAATCACGGTCGCTTCA
TTATTTCTTATTCGGCATTTCAAAAAAGGGTCCGAAAATCAGaaggtttt
cttcttcaatttccgaAGAACATGCTCCAAATCTTCGAAGCCATATTTTT
CCGATAGCTTGATCAATCAGTGATCGGGATCTGAAAACAAAATGGAAAAA
GACATCGTCAGTGAAGTATGAGAGGCGATTAAACAAattatccgattcac
cccgggtatccgattcaccccgtcNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNgggggggggtcctaattgccagggggttgga
aaatttacttctgaaaaccctaaaataaggtaaatataggctaaaatcag
gttgtttagagcaaaataagtttactttgaaagctgaaaatgttattaaa
aattaataaaaagggGGTCCTTCAGgtctggggggggggttgggaGGGTT
GGAAtactttcgaaaaattaacaagcgggggatccgtttatttggaaccc
aAGATTAGTTGGGCTGCAtttgttacacgcttttttttataagaatggtg
taaatccatttcatcatggatattcctaacttttttgggaaaatcatcct
taaatattcttacagcatattcttaggttagggtcttaattcagactaga
tttaacatttagtacctACGTCTCAACAGgtctcaaaattccatgatggt
gatattcttagcatattcttaattttttggccattttcatcatggacatt
cttattaagtgtattcttataaaagaaaagtgtGTATTTTTACTCATTCT
GTCAACAAGATTTctgcttaaaattttcttaaaacttTCTTTGTTACAGA
ATGGGTTTGAGAGGAAGAGAATTGATGTCAAATGTAGGCAAAGTTATGAT
TCAAGGAGGAGGAACTTTTGGGACATTCATGTGTATTGGAACTGCCATTC
GATGCTGATAAAACAAttagaatttattatttttttgttgtacataataa
gcaaattttttagaaaaagaaaatcaattacTAGCACATGAAAGAAACTG
TTCTATTTTTTAATGAGTTTATTATAGACTTTTTGCTAGGGGTTTGCTAG
TTAGGATGTGTCAtgttaaataattaaaaactctagcCACAAAAcaaccc
ggggggggtactagggttgcgagctgacggggagggggttgtacttttac
ggtgtgacgggattggcccttttttagtacggtattac
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015897TCONS_00015897Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000222supercontigsc0000222:160881..168768 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
188.27	185.34	243.23	298.7	43.13	35.82	40.72	52.22	59.33	49.2	46.92	50.71	47.54	56.72	58.22	66.72	91.1	70.05	18.93	17.37	54.06	52.34	88.48	70.71	31.71	32.02	47.17	31.07	61.28	50.92