XLOC_008581 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008581
Unique NameXLOC_008581
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000210:125415..150530-

Legend: gene
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>XLOC_008581 ID=XLOC_008581|Name=XLOC_008581|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25116bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000210:125415..150530- (Clytia hemisphaerica)
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GTAAAGAACGCAAATTCAGGATGATAAAGTTGAAGTATTTAGTCCTTGAC AAAATTACAATATGTCGAGTTTTCATTACGTATATGTTTTTGTGTGCGTT ATTTGTTAACTTCACTGACCTTTATATATCCCTGGACCAAGCTATATCTG CCATCTTTGATCGAAGTTGTTATTTTGATTGGTACCCGAAAAGAACCCAT TATTGCAGTGTTAAAAATTAACGTCTAACGGCTCTACATCATCAAAAGTT TTCGAGGGAAAGTAGATCTAGCGCTCTCGATGCATTTACACCGCTATTGA GTAGTGCCGCCATTAGGGTACCACTTTTCAAAAAACTCCGATCAAAGATT TTGGTTGGCCGTGGTTGAGAAACTTGGTCCAGGTTATATAAAGGTCAGTG TTAACCAAACCAAAACTCTCTCTCCTTTTAAATAAATTCACAGATGGTTT GTCTATTGGACCCTACGGAGAATGATGACATGAACGTTTTACGTGTCAAC CGGTCACGCGAAAAGATGTACGTCTTCGATAATGCGTTCGGACCTTTCTC TACGCAGGTACGCAATATTAACGTTAGTAACAGCCTATCTGTTAAGCTTT TTCACATGCACGTAAATTTTACTTAGGTAAATCGTTCGTAAGGCTGTCTT TAGGGAATTTCCCCGACCTTATGTAGAGTTTTTGTTGATTAAGAGGGTCT TACGTTGATTTTCCTTCCCTTCAAAACTGTTTGAACGTAAGCAAACTCTA CTTAAGTCCTTATTAAAAGACTACGTAAGCTTAGGGGAATTCCTACCCTT CAAGGTCTTAAGTAAAATTTAACTAACATGTGAAAAAAGCTTTAGCGAGT ACCTCACTAAAAACTCTTCATGATTTACACTTTGATTAGAGCCTTTTAAG TGCTCTGACGCAAATTCGTAATAAACAGCCGTGGCGTCTAGTTACAGGCT ACGTATCAATACGCCTTTCAACCCTTAGCGGTGCAGTTAGCTTTTGAGTA GACTGTTAACAAAGAAATAAAAGGAAAATTCTTTTGGACGACGGTATCGA AAACGCAAGCACAGCTCATGTGGAAAATGTAAGATGCCCTTGCATTGAAG TGATAAAGTAACACCTAAGAATCAGAGATAGAATCAAATGGTTGGAGATA TTTTGCCTGTGGTCCAAAACTAAACCTCCAAATCATTTTGTTGAACTTTT TTCCAGAAATTCAAGATATCAATATAATTCTATCGAAAGAACCTTAAAAG GACCGATTATAAATTATTTTCATTTTTCGATTTTGGACAATATTTAGACA AACAGATTTGAAGGTTTAGCTCCATATTTATAAATTTTATTTTACCGTTA TAGACGGAAGTATACAACCAAACAACAAGAACACTGGTGGAATCAGTTCT CGAGGGCTACAATGCTACCATATTTGCTTACGGACCCACCGGTAAGTTTC ACTGACCGGAATACGGAAACAAGTTCCATATATCTTATAAAAGGCACATT AGTAGACCTCACTAGTTAACTTTGACATCATAGAAAAAGGCTTTTTCGTC TCAAAATTCTGCATAATTCGCCTATATCTAAAAAATATATGTTTATTTGC TGTGTAATACCCATTTTGCGTCCCTGTTGAAGCGAGAATTGGAATCTTCA ATTTGCTTCTTCGTTTCGTTGAAAGAGAACCCGTCGCAGTCCGTATTTAT ATCTGATGTGTACTTGACGGGTCAGAGTCCATTATCAAAGTCAACAAGAA ATTGCCTTATTTTATCGCTGGACTCGCTAACCGAAAAATAATTTTTATAA CTTAACAAATTTTCTTCGAAAGTGAGTGTGCTAACGGCACGAAGAACTGT TTGATTGGCCAACAGTTTTTTAGTGGGAAATTGGAAACGATTGTCAGCCT TGACACCATGCTATTCATTTTGCCATTTGTATATAAATAAAAAATCATAA CATTCACCTCTTTACAAAATGGCATCAGAAAGTTCACTGACAACGCTTCA GAGTATTTGGTGTAAAACTTTTATCTGTAACTTTGGATAAAGGTAGAATT AGAATGTCCAGTAAAGGGAAATGATTTAAGTAAAGTATGAAGAATAAAAT GTGCATCAAATTAGATTCTTCGCAGTGAGGTTAACTATACTTGAAATTTT TGAGGTCCAGCAACCTGACTTTTTCACAATGTCAACGAATCTCTTCTTCG TCTCATCTTGCAGGTGCTGGTAAGACGTTCACCATGTTGGGAACAGATTC AGAACCTGGTATCATGGCCTTAACATTGAACGATCTGTACAGACAAATGG AAAACTCCAAAGGAAATGAACTTTACACTGTCAGCATGTCTTATCTCGAG GTATGTCCACATATTACCTCATCGGCCCTTTAAGCCCCTTTTACGCCGGC CCCGATACTCAAGGGACATAATCACCCTGGTATCCAGTCTATTTAAAAAG TCTAAGTGGACCCGGGCCACCCATGCTGCAGCTATAGGGTATTGTTCTTA ACTTTTGAGAGGATTGAGGACAAAGATCCTATTGCCTGGCAAATATGGTC ACCTTGACTATTTTAGCATTTTATTGCTTATTATTTTGAGGGAATCTTTC TAAGTTAAGACTCCGACTTAAAAGTTCTATTAATTGGGGCTGTATATGGA CTTTAATAATGTGATCATCATGCCACTGATCTTAAATATTTCCGTTGATA TCCACAGATCTACAACGAGATGATCCGCGACCTTTTAAACCCATCATCGG ACTTCTTGGACCTGCGGGAAGACTACCGGGGAGTGCAAGTGGCCGGACTG ACGTCATATGAAGCACGTGATACAAGTCACGTGATGGAGATGTTATCACG TGGTAACAAAGAGCGCATGTGCGAACCAACAGCTGTCAATAAAACTTCAT CAAGATCACACGCTGTTTTGCAAGTAAGTGCAGATTTTTTTTCTTATTTC TCTTTGCTGTCAATTCTTGAATTGTCATACTTCAGATGAGAATGTTTGAA TCATTTATGTATGTTCAAATGGTCATTCTTGATATAAATTTTATTTTAAA CAATATTTCTCTTTGTTGTGATTTCCCAGTTGGCACTATCTAACGTTCAC AACGTCCATATAACGTTAGATGAACGTTGAAACAACGTTACGTGCCAGCT GGGTTATCAATGAAAGTTTTGTTGAGTATCGTCTGTTCTTATTTTGGTCT CAACATCTTGAGCATGAAATTGTTCTTATGCTGTTCTTATAATATCAGCA CTTTGAGCATAAAACTCTCATTATGCTGTTCTTGTTTCTTTGGAGGTATT TTAGTTACAATTGACTCTTCTTAATTTGATCTTCAAGAGACTAAACATTA TCTTTGAATTATGCGCCTTCCCAGCTTACCATTACTTGAGTTCGAGTGAC AGAATGATTCCAATGATAGATGTTCGAATTGTAAAGAGTTCTCTGCTCTT TGCTTTGCTTTCGAGTGTTAATAAAATTGCCATTCACGGCCGTTAATTTT TTAATCTCCAAACTAGACGCAATATTTCACATTGAATTGACAATGATGTG GTGCAAAATTGGTCAAAAAGAGGAAAAGAAAAACAATTCTTTGTCTATTC AGCACAATATAACAATGGGACACTATCCTGATATGAGTGTATGTGCCTGA TACGAAACGGGAACACTTTAAAACTTTCTGATTGCTTTTTTGTAGGTTAC TGTTGAGCAGAAAAGTAGCATCAGAGATGTTTCAGAAGAAATCAAAACAG CCAAATTGTTCATGATTGACCTGGCAGGATCTGAACGTGCAGCTCAAACT CAGGTACATATTTTTTTGTAAGAACATCCTACAATTTTGTAGCCTTTGTC TTCGGATGCTCTGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCACCATTCTGAGAGTT TTTTTGTGCGAATTTAATAAGAAGTCGGATGTTTTAGAGCCCTCAAAGCT CTTAATATTTTATTCATCGAAGCCTTGTTTTTATATAGTTTATTCTTATA AAAAACGTGTACGACGAAATGTTACGAAAAAGGTGAAGGACGGAGTATTT ATCTTATTAGGCACCTTTAAATCATATCCTATTGAGCAATAAAAGCCTAC CTTTCTTAGTCTGAATCACAGATCTCTCAACACCACAAACAAGAGGGAGG GTTGTTCTTATAAAAAACTCCTGTGAACATGTTCACTTTCAAATTTACAG TACAGATATTCTCTCCAAAAACCCACGTGCTCAAAGATGCCCTTTCTTCC TCGATCGATTCATCGTTATTTTTATTTTCACAGAATACGGGGAAGCGTTT CATTGAAGGAGCGCACATAAACCGCTCGCTGCTTGCTCTGGGAAACTGCA TCAATGCTTTAGGTAAGGCTCTTAGTAATCACGATGAAATGTATTTGAAA TGAAACTAACTATTGTTTTAAGCCCCAAACTTCAACATGATATTCTTATA GTAGTTATTCTTATTATAATGCGTAGATGTCAACGCCCGGGAGGTCATCA AGGTAAACGACCTACCGTACGTATGTCCCTTAAGAGGTCCTTTTCCAAGC TTCCCAAAGTGCACTGTAAGGGTCTAAACGGGTCTAAATGAGCAAAGATG AGAAAAAGTGCTCTCTAAGAGTGTAAATTTTGGAAAATTCGACGATATTA TGCCAAAACATGGTCAAAAAGTTTCAAGAAAATACACCGTAAGGGTCATT TTTTCGCCCAAATTTTGGAAAATTTGGCTAAATTTTTACTGCATTGTAAG GGTCCAGTTGTTGACGTCATCGTCGTTTCTCTCATAGATCTACGTAACGA CGTGGAACAGAACAAAAACATCTGTATGATATTTTCCTCTAACCAATTTT CAGATACAAAATTTTATCTCATTTTTCAGCGGAGAAAGGCTCAAAATACA TCAATTATCGAGACAGTAAGCTAACGCGGCTTTTGAAGGTATGATCAACT CTAACCTCTATATCTATTTAACTCGATGACCCAAAACGTCATTTTTCTCG ATGATCCTATACGTCATTTTTCTCGATGATCCTATACGTCATTTTTCTCG ATGACCCTATGCATCATTTTTCTCGATGACCCTATGCATCATTATTCTCG ATGACCCTATGCATCATTATTCTCGATGACCCTATGCATCATTATTCTCG ATGACCCTAAACGTCATTTTCCCCGATGATCCTATACGTCATTTTTCTCG ATGACCCTATACGTCATTTTTCTCGATGATCCTATACGTCATTTTTCTCG ATGACCCTATACGTCATTTTTCTCGATGACCCTATGCTTCATTTTTCTCG ATGACCATATACGTCATTTTTCTCGATAATCCTATGCATCATTTTTCTCG ATGACCCTATGCATCATTATTCTCGATGACCCTATGCATCAGTATTCTCG ATGCCCCTAAATGTCATTTTTCCTGATGACCCTATACGTCATTTTTCTCG ATGACCCTATACGTCATTTTTCTGGTTTGATGCACTTTGACAGGGACAGT GGTAGACTAGACTGGGGAACAGTCTCTCTTAGGGTCAAGGTAGTTCATTC TCCTAAATCCTATAAGAGTGTATTTTTTTCAGGATTCTCTCGGAGGAAAT TGTAAAACAGTCATGATCGCTCACGTCAGCCCAGCGAGCGGGAGTTTTGA AGAATCGCGGAACACTTTAATGTACGCTGACCGTGCCAAGAATATCAAAC TAAAAGCCAAAAGAAACCAACACAGTGTCAATTACCATGTATCTCAGTAT CAAGGCATTATTTCTGAATTACGCGAGGAGGTCATCAAACTGAAAGCTCA ACTTGTTGAAGCAGAAACAATAGAGACTAGACCTACAGGTTAGTTTTTCG TATACATACCGTGAAAAAAGAGAATTCAACTGAAAGGCACATTAACTTTA GCCTCTATTACACGTCACGGCTTTCTCACTTTGCGACTTTTTTGATTCTT TGATATTACAGTTGACACTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGGAATTGGATT TTCGTCGAATAAGGGAGNGACACTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGGAATT GGATTTTCATCGAATAAGGGAGCTTATCGAATAGGGGAGCATCGTTTATG AGAGTTTCTTGTTGACTGGGACTTTAAATTTCATCGAATAAGAGAGCCTA TCGAATAGTAGAATGTCGAATTAGAGAGCGTCAACTGTACATTAAACTTT CGTAGCTCTAGTCTATACAGTTTTTTCTACGTAATTAACGTTTATTACAC TTTGTGACTTTTTGAATGTTTTGAGCCCAACTTGACTTCACGTTTTAGCG ATGTCAGCTGACCGGCAAACCATTGAAAAACTGAAAGATAACCTGAAGAA AAAATTCCAAGAGCAACTTGAATTACGGTAAACTTTTCTAATATAATTTC TGTTAAACTAATTAAACTACCACACTAAAATAAGGCTTAGAGTAGAATGG AACAATTGAATAAGGCCCTAATGGAGGCCCTAATGTCAAAAGGTTAAGGG TGTCAGTAGACAAATCACTTTCTATGAACTAAGCCCAAAGCCGAAGAAAA TCCCAAACGGGTTTTTTGCCGAAAAGAAACTCTCCCGCCGATTTTTTAAC CGTATTAAACCCCTATAACGGCTGTAAATTCCGCGAGTATATTATATTCC CGCCTCTACTATCCCTAAACGGACGATAACACCGTCTAGGGTATCAGTAG CGTCTTGGATACACTTTGATTATTTTAGACCACCAGATCAACACCATACG TATACATAACTTCATCCTAAATATATTGTACCTTATCGGGGAAAACTTCG TCGGGGAAAATTTTCATCGGGGAAAATATTCGTCGGGGAAAAATATTCGT CACTTGCTGGTAGTTGGTAAACCATTAAGGCTGGGGAAAATTTTCTCCGG GGAAAAATATTTGTCACTTGGCCAAAATTTCGTCACTTTTCCCCGACGAA GTTTTCCCCGATAAGGTATTTAAATTTGTCTCCCTTTTTCTCATCCACAG GAAAGAACTGATTGATTTGGAAGATTCTTCGCTACAATTTGCTGTCGAAT ATCAACGTTATCTTCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015351TCONS_00015351Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015350TCONS_00015350Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015349TCONS_00015349Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015348TCONS_00015348Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015347TCONS_00015347Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015351-proteinTCONS_00015351-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000210supercontigsc0000210:125415..150530 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.32 3.06 1.2 0.58 21.66 16.87 35.34 38.05 20.44 23.78 14.16 15.95 11.76 12.17 2.75 3.59 4.2 5.64 15.27 22.1 8.32 6.88 6.76 8.57 8.94 14.03 1.28 1 2.09 1.84