XLOC_008336 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008336
Unique NameXLOC_008336
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000200:409112..421017-

Legend: gene
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>XLOC_008336 ID=XLOC_008336|Name=XLOC_008336|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11906bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000200:409112..421017- (Clytia hemisphaerica)
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AATTACCATCATCAAATAACAACATCTAGAATTGAGGAACAGGAGCATAA CGGGGTACAGATGTGGTTGGGTTAGGATTACTCAAGGAAAATAGAAAGAA TAATTGAAATTCGTTGTTGAAATTACTCTTAAAATATTCCTGGAGAAGGT TGAATATCTTTGAGAATTTCCAAACAATGTAATTGTGTACATGATTTTGT GAGAAAGTTACAATCACTGATTTAAAAGCGATAATGTGAAAAACATCACA CACCAAACCATGGGAGATTTGTTGACTGTGAGTTTGATTGTATTCTTGCT CTGAAGCAGAGATCATGGACTGTTGTAACACCAGTATTGGCGTTTCATTT GATTCATTTTACTTGGCTCTTATCAATTGGTGGTTAATATGGCTATCATT AATAATTGATAAGCTTTTAAGATGAATCAAGGTTATTGAGAAATTCTTCT CATAAGGTGTGAATTAATTACTCTGGTGTCATTAGCTGTATGATATTTGG ATTGCATTTAATGAGATAATTATGGATTCTGATTCCCCTTCATGTTTAAC TGGATCACTTCAATGATTTTGTCCAAACAGCCAACAGACACACAATTACA AACATAAAAAGCAGTTGTCTGAAGAGAATGATATCATGCTGATGAATGCA GATCACGGCACTTGGGTGAGGCCGAAACGTTGTTTTTTTACAAAAAATAA AATGATGCTTTTGTGTTTCAAATTTATCTCACAAACCTTTGGTGAGATCA ACTCATACTGCATGATGAAGAGAAAATATTTTCGGCAAATTTCCTCCTGG CAGATGTCAGACACATTGTCAAACACTGTTACTGCTTCTTTGTTAGTATC AGATTGAGTGAAACTTTCCTTCAAAGGTTTGGTGGGAACAGGGTCCAGGG TATAGAGATATTAGGGGAGGATAAATAGTTATAAAAATAAGGACTGAATC TAANGTCCAGGGTAGACAGGTATCATGGAGAGGGTACATAGTTGCAAAAA TAAGGACTAGATATACAAGATGTTGTTAAATTGATGATGGTCTTTCTCAA GTTTCCAATCTTATAATTCACTTTTCATGTGATCTTTGGGTCATCTGATT AACCTTCTTTGAGCATCTTTTTTATATTTTGCTTTTATGAATAATCTTGA TTGGATTTTTCTTGTGTCTTTGTTTATTTTGGTAACATTTATTATATTTT TCTCTTTTAAGCAATTTTGCGTTTTTTATTTTTAGATAAAATTTCTATAT AAATATATTATTTTGGCTGTTGAATGTTTCGTTTCCTTGTTGTATATTTC TGTTTGTTGAAGTCTATTAAAAAGATTTGATTTATTTTCCTGTTTCAAAC ACTTTGAAGTCAATTTCATTTTTTGTTCATTTTTCAGTGTAAAGTACATA TATAAAAAAGTAAAAACACAAAATGAATCGTGGAAGTGGCAGAGGAAATA GAGGTGGAAGGGGAGGCGCAAGAGGAAGAGGAGCTGGCGGCTCACGTGGT GGTTTTGGTGGCTCAGGAGGTGGTTTTGGTGGCGCATCCAGAGGCGGTAG AGGAGCTCCAAGAGGTGGACAAGGAGGTGCATCCAGAGGTGGCAGAGGAG CCCCTAGAGGGGGATCCGCTGGTAGAGGGCGAGGAGGTGGTTTTCGAGCA CCCTCAATGCTTGGCGGTTCAATGCTAGGTCGTTTATGGAGATATGAGAA CTTCACCCAGGAATTTGAATCGTTTTTCATCCCATCAGATTTTCTAATTC CTTTGAAAAAGAGGGTAAGAATTATCAATTTCACCAACTTTAAATAAAGT TCTATACAGATCTTCAAAGATATCTAAGTGATATTTAAAAGATTTCAAAC TTTTGTCCTTTCAATTAACGAAAATCACTCGACATCATTATTTTAAACCA TACAAAAAACATAAAAACAAATAGATTTTATGAATTTCTTTCTGAAAAAA ATTTTTTATCAACTTGACTTTCCATAGGTTGTAGCAACATGTCAGGAATC AAAGGAATGTGTTCCTATTGCACAAGAACAAGCTCGATACATCTGGATCA CTAGAGCAAGAAACTCAGATTTTGCCCAAACGCATTGTGTCAAAGTAACC ATTGCATTAAATTTGATTTTTTTATCATCCTTTTAAGAAAAATTCCTGCC CCAGACATTCTTATTCTTACATATTCTTATTCTTACATATTTTTATTCCA CGACTCCATTATCAAAAAAGGAGCAACACAATCAAACAAAACCTGAAAAA AATTGTTAAAATCATAAAAATTTTCAAAAAAAACTGAAAATTTGGCAGTC TGTAAGGCAATGAAAATATAAATGTACTACCAAAATCAATTTTATTTTTA ATTCAATTTTTGAAATTTCAGGGTCGGTCGGGCCTGTAAGACAACTAATC GAATTGATTTTATTCAATTTTTATTCAATACATCGATTGGTTTTTTTTAT TTCCAGCAACCAGAAAGTATAAGAGCTGGCAAAGGATACAGCTGTGGGAA TTGTGACATTTACACGGACACACATACAGAATTATTGGAGCACAACAAAT CAACTCCTCACAAAGAAGTATATTTCTGTTTTCCTTATCCTCTTATTCTC AAGGCTCTGAATAAAGATTTCAAGTGGGTCAGACAATATGTCCGATCAGG GTTGCTTTAGCTTGAAAATTATGATTTTCTGGTCGGACAAGAAGCTTTTT GGGTCACACAATGTCCGATGTCCGAGCGTTATTTCAAATCCTGTATTCTT CTGGTTAATACTTATCCTTAAAAATGTTGAATTAAAATCGAATTCCTTAT TTAACATACTTTTTAGTTGTTCTTATGAATTTTATAATCCTTTTCCATTT TTATCTTTTTTTAGATCTTGGGTTTATTTAGAAAATTTGATCCATTGTTT AAAGAATGGTTGAAACAGTTCAATGATCCGGTAAATTTATTTATTTCAAA ATTTTCAAATGTTTCGATGAATAGATGAATCATAATCTCATATTCCTAGA AAGGGTCTTTGGTATATAAAACACAAATTTCACTCCTCCCTTTGACGCAG TACTTCATCTTTTATAGAAAATTTTGAATTCAACCATACAATTAAAAATA GTTTCCCAAATATTTATTTCCAAAATTTGTTGAGCAGATACAGATGACAA TATTTATTTTTCATTCAGTCCTATGCGCTATCTGAGGGTGCAACTGATGC TCAAGTCAATGGTATCAAAATTGAGAAAAGTGATATGGTAAATTTTCAAT ATTTTTTTAATTTGTCTAATCCTGAAAAAAAAACCATGATAAGTAGCTCA GATGAAAATTATGGAAAATTATTAGGTCAAACCAATATAAGTAGTATTTT TTTACCAAACCGTTCATAGCAACGATACACTACCTTTGAATATTCTCATT TTATCAAGGAAAAACTTACTACATCTAAGACTTGTTGGCAGGAATCTCAA AAAGAGAGAAATGAACTGGAGGTATTTACTGATTTTTGTTGGAGAAAAAC ATCAAATGTATTATTTTCATGCTTTAATAATAATTTTGCCTAAAATTGCA AATCATGAGATGCTCTTCAAATACCTTTTGTAAATTATTGCATGCCTCCT ATAAATGTAGAATAAATATTAGCCGCAAAAAGTGATCCATATTTTTTATT TCAAGTTAACAAGAGAATTGAATTGCATGGAAATGTTATCTCTGTTAAAA TGTTAATTTGATGAATTTGGGCATTTGACGTCAATTAACTCTATTAAATT CAAAGCCAAAACTTTCTTGTATTTTCTGGTGGAGGGTTGTTACCATATGT CTCTTTCTCTATCTGCCAAATTTCCTTCTGTAGTTGTTATATCTTTTGAT TGGTTTTTCAGCAACGAACAGCCAATATGACACCGATAAATGAATTGCTT TTCAAAGATTTGGATCACACAACTCTTAATGATGAAGAATATGTCCTTGC TGCTTATGATGTCATTATGGAAGTCCATTGGCCCAAACCTGTGACTGACC ATTATTGCAGGGAATGCAATTACAGGTCTTTTTTGTCTGAAAAAGAATTA GAAATGCACCAAACTTCTCCAGAACACAAGGTTCGAAATATATTGATTTC ACTCAGTCGAAATTTTTTTCCCCTTTTTAACTGATATTTAATTTGACTGA TAACACTTCGCTGCCATTGAGGCAAAAGGTTCTATCTCAATTAGTGTCTG AGGAAACTGAGATTTTTTTTTTGCTTTGCTAACTGGATATTTTGAGAATA GCCCATTTCCTTTGTGGATAGGGTACTTATCATGAAAAGAAGGGCCAATT TCAGTTTTTTAAAGTAAGCAAAGCAAAAAAATTCTCAGTTTGAGATTGAA CCTTTTGCCTCTTAAACCTAAGATTTGAATCACCCAGATTGCTATCTTTG TCATCTAACTAACTAGTGGCGACATATGTTATTTCCGAAGACATGGACTT AATTGTGTCTGAAGTTAGTAAGTTGAAACTTTATAAACCATATTGAAAAA TCAAAGATTAGCCACATTCCTAAAAAATTCTAATAACAATCTTTTCTGAT GATTTTTAATTTAGAACTTTGCAGCAAATTATTCCATCTCTTGGTGTGTT TCATGTCAATTTCATTTGGGTACAAAAGAAGGCTTAGAAGGTCATCAAAA TTCACCACGTCACACAATGGTATAAAATTAAAAATAACTATTCCCTAAAA TGTTGAAAATTACCAAGAATGTTTTCGTCTTCTTGAATATATCCCCATTT TCCCTTTCAAGTTTTTTATTCTATTTTATTTTCTCAATTTTATTTTCTCA TTGGCTTAGGGCATAGGGTTATAGCTGTACCAGAAACATGCTAATTACAA AGCTCCGTCAAATATTTCAGGGGTCCTATTTTTGTCTAAATTTGACTTAA AATGTTGCAATTTATTAATTGTGTTGTGATAAGTCATTTTGATTTTTTGT GTATAGATTGTGAAAATGTTGGAAGATGTGCGAACGAAAGCCATAGAGAT GTACAACCGAAAGCGAAATGGTGATAAACGAAAGCAGGAGCTAGAGGGTG GGTACTTTTGTTAATTTCTCCAAAAAACTAAACACCCTCAAAAATAAGTC AAGGATATACCACTACCAGTAATAGTTTGATATTCATGTCGTAATGTTTT CTACAGAAAGACCCGGCTTTTGCCAGTAGTGGCAGATTTTATACAACTTT TGTCTAGTTTAAATTTGCCACTACTGGCTAAAACCGGGGTCTTTCCATAG AAAACATTATGTCATGAATATCATGAATAATTTGATAACTGAAGACCTGC AAATTTCCTGTCAAATGCCGAAACTCCATGGTAAAATGTTATGAAATTTC GAGAATATCAGCTAATTTTTCACTCACTCCCAGAATACACCGGAACACCT ATTCTTAATGAAGGCTATCCAGCCACCATGTTAATTTATTAATAAAAACA CAAAAACTCTTGTTAGAAAAAATCTTAAACAATTTCAACAAAAAATGTTC AATTATTCATTTACAGAGAAGAAGCAAGCTGAACAGAAAAACAAATTGTA AGAATTTTTTAATCTGAAGAATTTGCCAAAATATGATTACAGTAATTGGT CAGCCCCAGGTGACCCTTCAGTTCGCTATCGTCGCCATTGCCATAAGATT TATTTTGATTTTTCCGATCGCCCGATTTTCTGATCGCGCCCAATTAATTC CGATATTCGGATTATTTTCGGAAAACAAGTTATCGGGAAAACTTTGGCGC GAAAAATATTTTTTCTTGAAAGAGAAAACTAAAGAAACACATCGATAACT TCATTAAAAGATTTGCGCATGATAATAAAAGAACACTATAATTAAAAATA AGAAAGTGAATTTTTTTTTGTTTATTCAATAAATCGAAAGAAGCTATTGC ATTGTAAATAAATAGAGAGTGTAAAAGAAAGTTTTTCATGATTGGTTTTG AGGCTTTCTTGTCTGGAGAGTTTTGTACTTTTGTGTGTAAGAAAGGAACG TCAAAGTGTGGCGTAACATAAACTTAGAATCGTCATAACTTTTAATTGAG TTATCGAAACTGGACGGAATTTCCTAAGCAGCTTCCTCGATATAAAATGC CCCTATTCATTCACATTATACTAGGTTCAACACTTCATTTAAATCAATCT GAATCAGTTGACTATTCTTTTCAAGTGATTACTAGACAGCAAACCGTGCC CCGGGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014914TCONS_00014914Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014913TCONS_00014913Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014912TCONS_00014912Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014913-proteinTCONS_00014913-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000200supercontigsc0000200:409112..421017 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.08 9.13 4.07 3.63 60.46 47.07 26.53 29.05 18.92 19.5 13.94 12.94 12.28 12.98 16.98 18.91 22.52 22.24 8.76 10.66 20.82 20.88 14.32 16.33 18.01 19.98 12.26 10.01 15.17 14.84