XLOC_006917 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_006917
Unique Name	XLOC_006917
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000143:481781..488318+

gene from alignment at sc0000143:481781..488318+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_006917 ID=XLOC_006917|Name=XLOC_006917|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000143:481781..488318+ (Clytia hemisphaerica)
TCTAGGTCTGATCGTGATAAATACGTTATAATCCACGAGGAGAATATTAT
GCCAGGATacgaaaagaatttcaaaaaacgtGACAACGTTGATTCGCGAG
GTGTGGCTTATGATCGCCAAAGTATTATGCATTACTCAAGGTAGGTGTTT
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TCCCTGTAAGAGtaggaaaaatcagaaaaattaaatGTCAGTCCCATTTA
AGGTTGGTTTTGCATCTAACAACAtcgaaatttgatcaaattagtcccaa
tagggtcgtaaaattcacaaatgtTCCAACTTCTCCTCCTTTTTAGCCCT
GACAAGGGCCCAAGGGTCGAAAGCCGGGCAGCATCATCCGTCATCCTGTA
AACTCAGTATCCTGGGTGGGCTCAGAGCTATGCTGTTTTTATTGTAGGCC
CATAGCAACCTAGTTATTCATTTTCCTAAATTCTTGaattcaaaaatctt
caaaactttAATGATAGCTTGTACACGCTTTATGCAACAGCAAAGTATCT
TTCAAGGTTGTCCTTTGAAAATGCTCAAACAACCTTTATTTTCTCAAAAC
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GGATCCTAAGAAATCTCTTGGAGGAGCGAAAATGACCCCAAGTGATATTT
TACAACTCAAATTGATGTATGGATGCGCCACTAACCCTACTACAACGACC
ACTACAACAACGACTACTccaacaacaacgacaacaacaacgacTACCCC
TACAACTACCACAACAACGACTACTCCAACAACTACCACAACAACGACTA
CTCCAACAACAACGACTaccccaacaacaacaacgacaacaacaacgacT
ACCCCAACAACTACCACCCCTACAACCACTACCaccccaacaacaacaac
gaaaacaacaacaactaaACCAACAACATCGACCAAGCCTACAACAATAA
CCAAACCAACAAGAAAAACTAAAAGAACTACACCAAAGACGAGGACAAAA
ACTACAAAAGAAGGACAAAAAGGTAACATCTCAAACCccgtttttcagat
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CTGGGGAAGACTTGCATAAAGCtatgtaattttttattttttatttttta
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TATATTATTGAGTGTATTTGtcaactacaatcatggtcgtaatatttgag
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gccagaactttaaatcttgaaaaacgttaaaataaccgcaattctcattc
tatttcgaccatgattgtacaacCCAAATAAGTTATTAATTCGAATTTTG
TTATCTTATTCAGAATGCAAGGATACATCTGACAGATGTGAAGATGCTGA
AAACAATCCAAGTCtgtgtaaaaacaaaaattatgtaTACTATGAACATT
GTAAGAAAACCTGTGGACTTTGTGCGACAAAACCCAAAACAAAGAAAGGT
AAATTTTAGTAAGATTTTATTCATTTCTACTGGATTTTCCAATATATCAT
AAGTTTTTTGAGGCTTGGCTGCTTGGTTGGGTTGAAATTCAAGCTAGTGC
TAATAATAGCTGTTCTTCTTCAAGCCACTGAGAGTTgaagggagaaaatt
ttttttttttacccttTAGTAGGGGGTCTAAAACTCCAAAATATGGCGTG
AGGCTAGAAATCTCGCAAACAGTTTGTAAAATGCTATATATCAGTAAAAC
CTTggtaaaactaattttttcatcGTGGActaataaaaagtttttatttg
agTAAATCTATCAAAGGGCAAAGAAGATTTCTATAACAGTATTCATCTTG
ATTTTTCAGAGTGTAAGGACGTTTCCAGTTATTGCAATGGAGCTACATCA
TCAAGGTGCAGACAAATGAGTCATTATCGCAAATATTGCAAAGCAAGTTG
CGGCTTATGCAATACAAAGCTAAAACCACATGAAGAAA

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00012298	TCONS_00012298	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00012298-protein	TCONS_00012298-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000143	supercontig	sc0000143:481781..488318 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.51	7.39	2.96	0.83	1.87	1.25	0.27	0.19	0.09	0.17	0	0	0.35	0.15	59.83	8.75	10.85	10.22	0.11	0	0	0.08	0.43	0.5	0.06	0	4.32	0.16	0.24	0.3

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