|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000100:342978..352684+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_005558 ID=XLOC_005558|Name=XLOC_005558|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9707bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100:342978..352684+ (Clytia hemisphaerica)
gatgatgcccaaaacttagcatcgtttgatttccaaaaaaatcatccttt
gaatccggaactccttaaaaatcgccggaacagccgaaaaccggcgtaaa
acgtttttccttcattttttcaacttatactcgacagattttcatgattt
tttgcacaatgatgtaaaatgacaatgctcaaaatgtgacagagcccaat
tatcgaaaaagaaatttttccggccgctagaaccggaaatgtcccgaaaa
aagcggttttttgagattttctcgagattttctcattagttttttgcgat
tttttgcacatagatgcacattagtactgccgaaaaggtgtttcttaatt
gctttctccgttccaatagatatataaatcgaaatttaaaattatacatt
acttccattaaattctaattattcgttttataaataggtaggtcttGTTT
GTGTAGATTTTTCAATTTGACTACAAATAAAAGAAACGTTGACATCATGG
TAGATGTGATCTATCCTGACAATACACCAATTTCATCACTGACAAATAGA
CCATATAAAGGCCAAATTCCAAAGACATGGCCCAACTTTGTTTGTTCAGA
ATGTAATATGGCACTGCACACTCCTATAGTTGCAATCCAACATTTCAATG
GCAGATGTATCAAGGTATGCTTTTTTAGtttcttatttttacaaaaatgg
gcttttccagaataaaatttgaatattgggggtggaggatataacatttt
tttggaaatcacaCCAGTATTATTTAATTTGAAGATTCtaattttttctt
cataaacAGTCAAACAAGAAACATGTGAAGCGTGATTTATCAAAGACTTC
AACACCCACTCAGCAATTCAATATAGAGCAAAACAAAACACACCAGACCA
CAGTCAAGTCCAAAAACATAGATGACAGTAATCTGGATTGCAAAGTTTGT
AATGCAGCCTTAAATGGGCCATCGTCTGCCAAAGAGCACTATGCAGGAAA
GAAGCATGCAATGGCAGTTCAAGCTATTCTCGATGAAGGAGGTCATGTGC
CCGATGTGCCGCCAGAAGTCAAGTCAATACCTTATGATAAAAGTAAATTT
CATTGTGATGTATGTAATATCAACCTAACATCTCAAGCGCAGTATGAACA
ACATATTGGAGGCACGAAACATAAGATGATTGCCGATGGTTCTCATCCGT
CAGATTTTTCCAATTATAAAGGTATTTCTCTTGAACATTTTGACCTCTTT
TTTAAATAacctcaaaactttacaaaaaattCCTTTCAGACATAAAGATT
TTCAGGAGTGCTCTGAATTAAGTCGAAATTAGCCAGACAAAACTTGAAGT
TGATAGCACAACTAGAGCAGtctacgtcaaaatttgaaacttatggaaac
tttttttgaacCACCCGATAATACTTCTTTATAGTGTACACCATTCCTTT
GCCTCAGCAAGGTATAAAAAATAGGCTCTCTGTCTCCAAATTTAACACAA
AATctgtaaagtttaaaaaagtctTGTCTAATTTGTTGTGTTTTCAAAGT
CTATCGATCTGATTTTtgcactaaaatagttttaaattaatttaattATC
AAAGGTAAGCAAACACCTTCTAAAATGGACCCGCCTCCTTTAAAACCACC
ACCTAGTTCCCTCCACTGTAATGATTGCAACATGACAATGAATTCTGAAG
ATCAATACGTCCAACACATGAACAGTAAAAGACACAGAGAAAATACAGGT
ACCGTATGACTTTGAATACAGTATCATTTAGTTGAGACTTTTAAAGTTTG
CTGTTTCATATCATTTACATTATATTGCTCTTTGTTTATTCTTCGAAAAC
TTAATGAGGAACGGCTTACGTTCATTTTACTAAAAGTGCCTAGAATTCAA
GAGATTAGAGTATTTGGAATTCCAACATactatgttgaaaaatttcgGTT
TTACTCATCAACTGTATTCTTTTTTCTATAAAAGCCCTCTGCCAGGTACC
AAACCTGTTATTTTATAAGGTGGAgctgatttgtttttttttctacattt
aATTTATCCCTTCAGGACTACCAGTACCTCCAAGACCAAAGCAAAAAGTG
ACACACCCTATACCAGTTCCTGAATCTCTTCATTGTAATGATTGCAACAT
GACAATGAACTCTGAAGACCAATATGTCCAACACATGAACAGTAAAAGGC
ACAGAGAAAATACGTCAGGTATTctatgggccacccagtggcgTGCATGA
ATGCGCAAATGGGCATTTTATGGTTGTTTgaatgtttgaagaaaaaaaag
ccTCAATGTTTTGCTTTGACACAgaaattcactttttgattgctTGGTGA
ATCTGtgcaattttgtgaatttttcctttttccacAGATTATGTGCAAAA
CTCTGTGAAACACgagaaaaatttgaatgaatgcatgaattttgggtccg
ctggacGCCTTTCCTATTGGGTGCACACAGTTACTATTTTGACATTCATC
AGTCTTTTTGGCAGTATTAGTTCAGTCGTATTGTCTGAACTGCAGACTTC
TATAGATATATTtccctataagaaactttttccatGAGAGAATGAGCATT
AGCCTcgtttatgttttaaaatgaaatttaaataaTTCAACGAATATTCC
CTGTTGGTATTTTGAAACTTTGCTTGAACCGGGGAtgctttttccaattt
caaataagaaacttttaaaaaccttttttcatgaattttattcTGAAATT
TCCTATTTTTTGACAGTTCCTATAATCCCAAAAAACTTTCTTGCTAATCC
TACTGTACACGATTTTGCTGTCATTACATTACACAGAATTATTATCAGAC
ACCCCTTTTATATTAAGGTGTATACTATTATCCAAAAAACAAAGTCTGCC
CAATGTCGTAGTCACTGTCACAAAATATCAGATTAACTAGGTACTACCCC
AAGTTCAAATTTCCCAGCATGCTAATGCTATTTGGTGAATTACTAAATGT
ACTCTGTTTGATACACAAGAAGGTTAATTGAgagaaatttcatttaaaat
ttattattttgatagTAAAAATGATTTGCTTTccaactaaagtctattca
cgataagtgtgcactcttttttcatttacttataacttttgaaggaattc
ttcaatctttataaatttggtatcattggaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNTGAagatgaaaacgaagaagaaaaaaatgaagatcttgtaga
aaagtgctataactatcattttcactgaagtgaaaccttgattatcgaac
gtcatcactgtgaaaagatttctcaaaattaatcattcagtcaaaagata
tcaaacaaagctataagctaattgacgtctaaaaacactgttttctgctg
ttttctgctgttttttggggtcaatcacttattgattttgtatcataact
ttttattgaataaatattttagtgaaatttcttcacagtgatgacctcca
aagatcaaagaatctctccagtgaaaatgaaagttatagcacttttttac
aagatcttcatttttttcttcttcattttcatcttcatttttagaattat
tttgaagattttcttacttcaaattgttccactcacaaatatctctccaa
cgatatcaaatttataaagattgaagaattccttcaaaagctatagctaa
aagaaaaaatagtgcacacttatcgtgaatagactttagaatgAGCCTTT
GATGATTTTAGGTGGAAATTACAACCCCAATCAAAACAGAGGTATCAAAC
GACCAGCACCAGGTAGTGATCGTGGTTCTGGGCATGGTGGTGGAGGCAGA
GGTGTACCTCGAGGTTTGAGCAGAGGAGCAACTGGCAGTTTCAGTAGAGG
GCGTGGTGCCACCAGAGGGGGATTCCAAGGTTCAGACAGAGGAGTTCCGC
ATGGTAGAGGAAGAGGCCAATCTCATAATGCGGGTAGGGGAGCAGGTAGA
GGCAGAGGGCGTGGCAGCAGTCGGGGAAGTCCTTCAATCAGTCGAGGTGG
TGGTGGCGGTCAAAGTGCCGAATGGTGGAGGGATGATGGTCCTACTCCTG
CCAAGATGCAGAAAGAAAATGATACCAATTTTTCAGGTTTGATTTATAAG
TCGATTAGTTATTGATTAAAATGGTGAAAGGTATGGTACTTGCAATTAGC
AACTTctgtttttttgcaaaactttttcaaattaaaaagtaaaatttctt
caaaacaattaccgtattacttcgaataaacgcccccttcttttaaacgc
cccctcgaataaacgcccatcctaaaagaaaaataatttaataaacgccc
ccctcaaataaacgccccctttgaATGAACGCCCCCTCtaggggaggggc
gtttattagaaacttatgactttaatacttcaatatcagtgttgattggg
tttgaaagggaagattttagtcatttcttgtaaccaaAGCAGTTTCCGAT
GCAATTTCAAtcgttgaaccaaagaaattttgcactataatcctgataaa
gaactaaaacaaagaaaGGGTATATTTGTTCTAAATATTCGAATTTAGac
taaaataattcaataaacgcccccttcttttaaacgcccccttcgaataa
acgccactcctaaaatcgaaaaaatttaataaatgccCCGGGCGTtgatt
cgaagtaatacggtaaaaTTTTAAGCACAGTTTTCTCATTTAAAATCATT
CTTTACTTTTAGAAATCAGCAACCCTAAGCCTTGGATTAGAGGAGGATTC
AATAACATGAGGGGTGGAAGGAGAGGCGGACCACCCTCAAGGGGTGGTGG
TGTTATAAATCGTTTGCAAAGTATGGCGAGTTAAGATCGATCTTTGATTT
TATTGTGAATTTCctctaaatttttatttttgtttcttttttcacttttt
taacctttttttaaaagaaagctATCACATTGTTTTTTTATGTTGTTCAT
TTTTACCATATTCTTTTTTAATGTCAGAAACTTTCGCGGCCAGGCaattt
cgccaaaataaaattaagaacactaatttcgaaaaaatcgcGGAAATTTG
TGGccgcgaaaatttttgacattaaagTAATAATAGCCGTCGTGTCGATC
AAAGGCTTGGCCATCCATTTCAATGGACGTAATACCTGTCAGATTCCATT
TGTTTTATGGTGGaagtaggctacgtcatatcttctttCGTTTTGAgggt
aaaactcctactcttcgggatatgaccactgctcttgttttgaaaattga
atttttcggaTACatcgcactgaggttttaatgaagcaatagagagtttc
gaaacctaagccaatgtgttttaaacattcttttatttgaaatgtctatt
gataaacatcttttgtgaaaattGTTTATTATTCTTAAACATATGATAaa
caattcccggtgggggttacAAGTGACCGCNTTTTATTGTGAATTTCctc
taaatttttatttttgtttcttttttcatttttttaacctttttttaaaa
gaaagctATCACATTGTTTTTTTATGTTGTTCATTTTTACCATATTCTTT
TTTAATGTCAGAAACTTTCGCGGCCAGGCAATTtcaccaaaataaaatta
agaacacTAATTTCGCAAAAATCGCGGAAATTTGTGGccgcgaaaatttt
tgacattaaagTAATAATAGCCGTCGTGTCGATCAAAGGCTTGGCCATCC
ATTTCAATGGACGTAATACCTGTCAGATTCCATTTGTTTTATGGTGGaag
taggctacgtcatatcttctttCGTTTTGAgggtaaaactcctactcttc
gggatatgaccactgctcttgttttgaaaattgaatttttcggaTACatc
gcactgaggttttaatgaagcaatagagagtttcgaaacctaagccaatg
tgttttaaacattcttttatttgaaatgtctattgataaacatcttttgt
gaaaattGTTTATTATTCTTAAACATATGATAAACAATTCCCGGTGGGTG
TTACTAGTGACCGCCTATAGCAGTACCTAAAGACAAAGATTAAGGCCTAA
AAGGCTGGAGCTGTCTATCTATCATGTAGACTATGGTGGAAGCAGTGCCT
AAACTCGGAATCCCTGTATTTTCTGTATTAATGTGAATTTTATGACTAAT
ATATTGTTCttctttttagtgaaaaaagagaaaaattgacgaatgataaa
aaaataaaagaattagtCGGTGTCGATTGActggattgaaaataaaattg
cgAGTGGTGGTCTAAACTTGCATagggaaattttaattttccctagttag
atttttttttggttatGATGAATATGAATTCTACTGGTATGCCCATGATG
AATCATCATACAACTCCAAATACTCATGACATGTCTGGACATTCCCCTAG
TGGGAATAATTCAAATTCACATGGTGGTATGGGAAATTCCCACGGTGGAA
TGGGTAATTCCCACGTTGGAATGGAAATGATGATGATGCAGGTTTTAAAA
TCGTTTATAGTTTATAGTGTGCACAAGGCCTAGCAAGCGACGTGCAGcga
cttaaaggttttatttttacataagtgttccgtttcatatcagacacata
tttgaTATCCAGGACACTGTTTTGCTATTGTTATTGTTATAGGCTTATAC
AAGCAAAAGAAATGTGAATTAAATTTGATGAACTTTatcattcttattta
aaaacaaaacctttaaatttgcATTGAATATAATGCCTTATTATCGATGC
agtaaaatttaatttcacaCCACATCTCAAATCTAATCTTCTTTCGCTTT
TTCGGTCATATTCACACCTctcaaaaacataaataaaatttttcttcctC
CGAATACAcgattctttataagaacaaactatatagaaACATCAGACTTC
GATAGCTACAATATTACGATCGAGTTACTCagttataagaacatttcaag
gctttgcagactctaaaacaccaaaattgaacaaaagtttttacgaatgg
ttgaaattaagaacatttaagaatattttcagacttaaaactcaaaaggt
ttaagaacatccgaaagcttcaaaaattttgaatgttcctATATTAAAAA
TACGTGTAATATCGTTTATCACTAATTCAAAATGTTCTTCAAAGCCCTCT
TAGTCATTCTGTtatctttcttcaaaaattttgatttccatAATATAacg
ttttacattttttgcagaTGTATTTTGTATTGGGAAAAGAAGTCACCATT
TTATTTAAGCAATGGAAAACCAACACGGCTGCTGGTAAGATGAAATGTGT
AACCAATCTAACaaatgaaccaatcaaaatgagATGGTTCCTCTAATTAT
TACaacattgaaatttgaaatagactacCACTTCAAGTTCGCccactttt
ttggaaaaacagaTCCATTTCTTCCATCCAAAATTTAATAGAATTGTGTT
AAATTGTGCCAGAATAATCTTCTCGAAaaattttatcttttgaaagattt
tttgtttttagccaAACAACTGTTacttaactctgagttttattttcaaa
ttttcaatcatattttctttcttctcaGAACTTTTTGGatcctgttttgt
tttgtttgtacTTGGTGTTTTATATGAAGGATTGAAAGTCTACAGACAAA
GAATGCTTTTGCAACCTAACAAACACCatctaaatgaaaaattgactgAA
AAGTGAGTGTTTTTCTAatatataaaccaaaatactACGATGAAGGTTGT
TACCAAAACATTGGCCTTTACcgggtaaagaaattttgataattattttt
gTACTTTCTGGTTTCACGTTTATCTAATACCCTTAGGGTGAATTTGCGTG
AGCCTCGTTATactgttatcttttttttagCCTCGAGTATGCTCATGCTA
TGCTTAATGACGGAGatatttttaatactttttgaaatatattttacagT
AAATTTAAGAATAGCTTTGAGATTTCATTAACTATACAAGTATACGCCTC
AGTAAACGCTTAGGCAAAGCTTAAGTTTTTCAAGATTTGAGTCTGAAATA
ATCTGTGTTTTAATAAACTTGATTTTCAGAACATAGTTTAATTGCATGGA
AATGTTCATTGCTCAGTAACGTactttttcatcttcctttCTAGCTCTGA
ATCTAATGGTAGTCACACAAATCAAGTCCTGATTACGAATCCAGCAAGAA
AACAAAGTGGCAGCAGTATAAAAACGTGATTTTCGTTTATTCCTTCCGTG
TTCCCTTAGCGCTAGTTTAGTTTTCTTGGTTTTGTAGTTTTCCACGCTTT
ACTATCcgaaattttgttattttggtgCGTTTCATTGTTGAGTNTCAAAG
TAGCTGTACCGCTTTACTATCcgaaattttgttattttggcgCGTTTCAT
TGTTGAGCCAGCTTGTGGGTTGTGAATCGTACCCATGGTATAATGGGCTT
TTCCTTttccccctggatatcctactttattagtaaagaacccctggata
tcctctcttataaaggatatcgtattttttacttgaaaagacactttacc
cctggatatccgctcccttgtataTATTTAACCCCCAGGATAtccatttt
tgaacaaaaattgttaaccccctggatatccgatatcctcaacagggggg
cacggactatttctggaaaagcccaatggtTTATAGGTGTTTGTTAATCC
ACAGCCggaataccttaaaggaagaaattttgaaagaaattttcttttga
tttagtCTCCCATTCtcctaaaaaccctttttttcctcttttttcagcta
aaatattgaacaaaaaatggatcgttcgccaaaattaattctcgccaaat
ttagaaattttatctaatcgccaaaataaattccgccaaattgcatcaaa
atttttttctcgccgaaatgggcttttccagaaaaaaccgtataccccct
gttgaggaggtccatttccgttccaagggggtaaggtttgatatgttgtg
gaaaatctgtcaaaaaaagctggaattccatgggagtagccttttaaatc
ctactaaaattcagaattccagagggatttaaacctgaaattgcctggaa
ttccagggggttgcaGCATTTCCAACCACAGagggttggacctcctcaac
agggggtatacggtttttttctggaaaagcccaatttctTCTCGTAAGGT
AATAGCTTAAAAATCTCCTTTCGCTCCTGTCctatgaaatattttcaaac
ataatattttctttCCCTTAGATGCCGACTCAACCGTTTTTCAGGGCGAC
ACCTTCTACAGACTTTCCTGCACATGTTACAAGTATTTATCGGTTATCTA
CTTATGTTGGCATTTATGACGTACAACGTTTGGGTTTGTATCGCCGTCAT
ATTGGGCGCAGGTTTTGGTTACTTTTTGTTTGGTGTACAGCCTGTTATTA
TAAGTTCTGATCACTGTAATTAAGTATTAAGGAGATAAGTTTTTCGTTTA
AATTATGGAATAAAGTTATAGAAAATTGTCATTGTTGTGGTTTTCCCTAA
GTTACGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000100 | supercontig | sc0000100:342978..352684 + |
|
