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The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL96294_cuf1 >transcript:BL96294_cuf1-protein ID=transcript:BL96294_cuf1-protein|Name=transcript:BL96294_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=436bp
SAKRHACSNLDLNFWMYVESNPTTFSVGPSMGAFGLKILLLHLLFAGSLG SRNDSEPFLLVVDNVLDAAFQVNVTSGSMVELPLGDLRVPLSVDYDPMTD FVYWSDRIYGDIKRARRDGSGKETIVATDIFAVYGLALDHAGGNIYWTDA TVKTISVAQKDGSFARALLTSPAVGSPGGLVLDPGNGYMYWTDWGSDPRI DRAAMDGSNHTTIIRNVSDPNMITIDYKENRLYYCDGGAYSIYSSDLLGN DIRRLFYEEENYLFGIAINDDSIYWTSWTDGQILMLPRANTNQNKTVLVD DLSTPNDIYVYTGSSDYVTNACTSSNGGCQDLCLARPEGRTCACRAFWEL QQDGQTCLPPGLVSPSYLWLDHSSATGVTSVKMTPGNSSAIRGLEDRSSL PVTVLFTSEAPSRIEAIDYDFQRNLIFWADTGLREI Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000036:703233..718213+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL96294_cuf1 ID=transcript:BL96294_cuf1|Name=transcript:BL96294_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14981bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000036:703233..718213+ (Branchiostoma lanceolatum) CTCAGCAAAACGACATGCGTGTTCAAATTTGGATCTAAACTTTTGGATGT
ACGTTGAATCTAATCCTACGACGTTTTCAGTAGGACCAAGTATGGGGGCG
TTCGGCCTAAAGATCCTCCTTCTGCATCTTCTGTTTGCAGGTGAGCTGAT
TTTTCTGTACTACGTTCTTTAGTTGACCCGATTTAGTCTCATAAGTTATT
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GGTGTGTTCCCGTAAAGCATTCCTAACCGCTGTTTTCCATGCTATTAGTT
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ATATTTTGTGTCCTTTCCCTAATGATTGTTTCCCCCGGTTTTGTTAGCTC
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GTTGTCACGGTACCATTATTTGTTAAGACCCCCATTCCATTAGACGGCGA
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GCCGATTGAATTGACAGAGCAGTCAACGAATTTCATCCACAAAAATATGA
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TCGCCAAGGTTGGAAATACGCGACACCGGTTTATTTGCCATTCAGCAACT
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AATCCCTTGTTGCACGATAGAACAAATTCTTTTAAGAGTGCTTATTAATT
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TTTTGGATGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTTTGTCTGCTTGTCTGTCTGTTT
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TCTTCTTCTTTGGACTTTGGAATTGGCATTCTTAACATCAGTATTCGTTT
TCCGATACTTTTTGTTGCAATTTATAGCATACATATGATTTTAAGTATGG
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TCATCCATATAATTGAATCAGCATGGCCTTATAGGCTTACACAGATTCTA
TTCTATAATGCTGGGTGATTAGCTATTGGATTATTCAGATAAACGACTTG
TCATTGGTGGTGTCACGGTACCATTATTTGTTAAGTAGGACAGCATCAGC
GTTGCGTAGTTTTTGACAGGCAGTGTGATTCAACTAATACTTTTATCTTT
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CTCAAGTTTTTCAAAACTTATTTCAACAGTGCCAGGTACAGAAAACAATA
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TCCCAAGGCCAAAACAATATTTAGTTGTTTCAAATGAGTCATTCGCTTGT
TATTCTTGTCGAAGGTCATGTAACATCCTGTTATGTATTTTCGGGGCACC
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TGTGTGTCTTTGACCTTGTAACAGCATACTATTGTTGTTTTTCTACGCTT
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CTGGCGATGTCGCCAAGTTTAAAAAATACGTGACATCGCGTCGCGGTGAG
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AGCCACACCTCGAGCACGTTAAAGAACCCACCGCACTTATCGAAAAGAGT
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ACATTGGGCAATTGTCGTATTGAGGTCACCTGCGCGCCGAATGGCAGTCG
CTACAGACCCTTGCGATCTAGCCCCGCCAAATGTGCGCTCCTCGCAATTC
AGCCCATGACTGCGAAGAGAGAGTAGTCTGCCCACCCAGTAATAATAATA
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TTTAAAGAACAGCTGAAGCCACTGCCATACAGAAAATTTCAAGGCCGCTA
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CTTGGGGTCATCTTCTCGAGCAGACTGCTGAAAGCCACAGGATCGTATAC
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ATGAAAAAACATGCATTGGCAGGGCTGTCAGGCCTTTAACGTTTCAATCT
ATAGCACAATTTCAACTTTCTAATCAGCACGACCCCCTAAGTACGAATCC
GGCCTTGTTTACAAAAAATGACCTTTGACCCCCTTCTCCACCTGATCATC
ACACAAAAACAGCAAACTTTGCAGGCCGACAGACACCACATATGCACAAA
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CTGTTAAATCCAGCTCCAAAATACCAACATTTCATAAATAAATAAATAAA
TAAATAAATAAATAAATCCAGCTCCAAAATACCAACATATCATGATAAAA
AAAGCCCCTTTACAGCTACCTTTACCAAGGGTACCAAACCAAGTTGGCCT
TCTGCGCCTGCGTGGATTACTGGTGTGTCAGCTGAAGTGGAAGGGGAAGC
TGTGATTGATGGCTACTCACACCACATGTAGCCTGCTACATGGCACCACA
ATTGACCAGCTGGTTATCAACAAAAGCGAATCATGGACAAGACACTGCCC
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TCAACATCTTACCTCAAATTTTAAGCCTAATATTGTACAATTTCAATAAC
AGCTGAAGCGATTGTCAGAAAACTTCAAGGCCGCTCCTTGTCACATGTAC
AGTATGATGCTTATCTCTAATCTCTCCACAGCCCTCGGATTACTTAGACA
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AGCGGTTCTTGCGCAGTTCTTGTCCTTCAGTCACGTGGCCCGACCTTAGC
AACGGTTTCTATCCGCCATCTTGGTGCGCCCACATAGACGCGTAGCCTGT
GCTTGGTAGAGATTGGACGTTTTGCGATAGTGGGGATATTTTGTATGTAG
GTACATTGTATATGTTGTAAGCCCGATGGTTAAGGTCGACTCTGGGCCTC
CTGGTGGCCAAAGTTGGTACTGCAGTAAAACCTGGTTATCGTATCTCAAG
AAAGGTTCAAGCGATTGCAATGGTATTTTGTATGTGGGTAGGTGTTGTAA
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TGCAGCAAAACCTCTGGTTATTGTATCTCAAGAACGCTTCGAGCGATTAC
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TAAATTTTGGGCCTCCTGGTTACTGACGTTGGCACTGCAGCAGAACCTTC
GGTTCTCATATATTTTGTCGTGGACATGCTATGGTCGAATTTCTGTAGGC
ATTTGGTGTAGTCCATGATTTAACACCCTGTTCTTTTCCAAGACAGCTCT
GTTTTTTTTCTAGGCCATTGTAGCTTGCTGCTGTTATTATCTTTTACCTA
GAATGTCCAGATTAATTTTGAATTTTCAACCAAAGTAAAAATACTAGTTA
GTTCCTGTTGATAGACTGGTACAAAACATTATATTTCATTTTATAAAATA
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AACACTTAATCAATATGTTGGCATTTCAAGATAAAGGAAATCATCGGGGG
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AATTGTTGTACCATCATCCGAAGCAACTACACTGGGTATTCATATGCGAT
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ATACCATCATGGGCAGGAACTACACTGGGTATTCATATGCAAGGAAACAC
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TGGTGATGTCGCTAAGTTGACAGATACGTGAAATCGTCTTATCTGTCAAG
ATCAGTACGTGACTAGCACATTTTGCAAAAGGAATGTGACAAGACAGCTC
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GTCAACTAACTGTTTCTTGTTTGCAAGACGTCCCTTTCTCCTTGTCTAAC
TTGTCATCACTTAAAATTAACCTTGTTAGTAGATGTAGGCTCTGTAACGT
TCTATTCAGTGATCTTTAGTGTGACTTGACCCATTCTTTCACTGAGCTAC
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TGTGACAGGACAGATTGAAGATCAATGATAGTAAATGCCACAGCCCTTTG
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TGAGTATTATATCGCTGCAGTAGTTTGTTGGTTGGTTGGTTGGTTAGTTG
GTTGATTGGTTGATTGGTTGGTTGGTTGGTTGGCTGGTTGGTTGGTTTGT
TGGCTGGTTAGTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGTTGCTTTGTTGTTTG
GTTGGTTGGTTGGCTGGCTGGCTAGCTGGCTGGCTGGCTGGCTGGCTGGC
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GTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGNAGTTGGCTGGCCGCCT
GGCTGTCTGGCTGGCTGGCCGGCTGGCCGGCTGGCTGGTTGGTTGGTTGG
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GGTTGGTCGGTTGGCTGGTTAGATGGTTGGTTGTTTGTTTGTTTGTATGT
TTGGTTAGTTGGTTGGTTGGTTGGTTCATTAGTTGGTTAGCTTCCTGGCT
GGCTGGTTGGTTGGTTGATTGGTAGGTTGGTTAGTTATTTGGTTGTTGGT
TGGTTTGTTGGCCGGTTGATTGGATGGCTGGCTAACCGTCTGGTTGGTCA
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GAGCATTCTTTTCTGTCTCTTCCAGTGCCACCACTGACGTCTTTGGTGAG
CATTCTTTTCTGTCTCTTTCAGTGTGACCACTGACGTCTTTGGTGAGCAT
TCTCTTCAGTCTCTTTCAGTGCCACCACTGACGTCTTTGGTGAGCATTCT
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CAGTCTCTTCAAGTGCCAACACTGACGTCTTTGCAAATTTGGTGAGCATT
CTTTTCTGTTTCTTCCAATGCCACCATCATAAACATTACAATAACAGTAC
TCCATATTGTACTGTGTGTTAAATAATATGTTAAATACTTGAGCGACGAA
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ATTTTAAACATTTCCAGCACCGAAAAAAGCTGCATATTGTTTACTTCAAG
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ATTTATTTTAATAGATTGAAGTAAACATAACATTTACGCTCCTTTTTTCT
AGCCGTCTATGGTCTGGCCCTGGACCATGCTGGTGGTAACATCTACTGGA
CCGACGCGACAGTGAAGACTATCTCAGTAGCCCAGAAGGATGGATCGTTT
GCTAGGGCACTGTTGACGTCACCAGCCGTTGGGAGTCCTGGAGGGCTGGT
CCTGGACCCTGGCAACGGGTAACTTGGTCTATAGAGCGTTTTGACGTGAT
AGCATCGCTGTGTACGCCGCCATGTCCCAATTTGTATTTCAGTGAATCAG
AGATCAAGCGTTTTCGGATATTCAAAGATCTTCTGTAGCTCTTGAAATTC
CATTTTCACAGCGGAAAGTCCTCCCCACACCAGACGGTGCATGGGGCAGC
GCCCATCTCCGTTTCAGTATCCCCTGGGCCACACAACTTTTTGGAATAAC
TACAGCAGCATATGGTGTTTAGCTACCATATTTTCCCAAAACGCTGAGTG
CTAAGCAGAGAAAGCAGTTGGTATCATTTTAAAGTCTTCGGTGTGACTCG
TCCGGGATCGAACTCATGCACCAGCTACCATTTGCACGGAGAACACTCTA
CCCATTAGGCTATTGCACCGGTCCTGGATACTGAAACCGGGGTAGAAATG
ACAAATGTTTGTGTCGCTAATTGCATTTCAATAAATCAAAGTTCAAGGAT
TTCTTCGGACATCTAAAGTTCTGACTCTCTCAAAATTCCTTTACCGCAGA
TACATGTACTGGACGGACTGGGGTAGTGATCCTAGAATTGACCGTGCTGC
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ACATGATAACCATAGACTACAAAGGTGAGAAAACATACCTTAGTCGCGTT
TGATATTCGAAAAATTTGATTCAAGTGTGTTAGAAACAACATTTTACACT
GTGTCTCTGCTTCTACTTTCCTTTTTGTATGTTTATGTTGTTCCGTATGT
AACATCTACATTGCATAAATCCACCAGAGTACATAATTCCGCCACCCGGA
AATCATACGTCCAATCCAAAGTTTAACGTCCCTAGTAAAATGCACTCCTG
TATATATAACTATGCATATATACCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA
TGTGTGATTGTGTGTGTGTGTTCGCGTGTGTGTGTGTGTGCTGCACTAGA
GATCTCTCAAACCTAGCGCTTTTCAAAGTGGTGGATTTATGTAACCCGGT
GGAATAATGGAGGTTGTTGTCTCCAGCATACGTCATACTTAAGATAAACA
CTAGTAATCTCATCTTTGTATAAATCAATTTCTTCCATTTATTAAATCCA
GAGAATCGGCTGTACTACTGCGATGGAGGAGCTTACAGCATCTACAGTTC
GGATCTGCTCGGTAACGACATACGCCGACTGTTCTACGAAGAAGAGAATT
ATCTCTTCGGGATTGCCATTAATGACGACAGCATCTACTGGACGTCTTGG
ACGGATGGCCAAATCTTAATGTGAGGAATTCCTGTTCTTCTACTAAGTAG
ATAGATTATAAGATGAACAACACTTTATCCTAGATTGTCCACGATATCAT
GAGAAACGCCCAAGGCTGTTCAACCTTCTTTCCGCATGTTCAACAGAATT
TAGTACATTCCAGTCTATAGATAAATTCAAATACATTCTAGAAGGAGACA
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GCATGTATAGCTGTAGAAGACCACACGAAAGTCGCTGTACTTTTGTCGTG
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AAAAGTGGTTGATGAAAAGTATTTTCCAGAAACATGCAATGTAGTATTGT
GTTCAGATCATTGCATTGGTTTGTTTGCTTGTTCGTTTGTTTGTTAGTTT
ATTGTTTTGCTAGTCGATTTGTTGGCTTGTTAGTTTTTTATTGATTTATG
GTCTAGCTGGTTGCTTTGTACAGAAGCAATTCAAGATAACTAAAAATAAA
AGCACTTGAATTGATTTTCATGACTTAACGTGTTTGCTTGAATTTTGCTG
CTAGGAAATAAATACTATTAAACGTTACTATTCGTTACAGGTTGCCCAGG
GCTAACACGAACCAGAATAAGACTGTCCTTGTTGATGATCTGTCAACACC
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AACTTTGCTGCTTCGCCATCTGGATTGAATTCCGTGGATCCTAGGGCCCG
AGTTCGATCCCAGGGCAGGCTCAGCTCGATTGCTCTCGTCATTTCGGATG
GTGACGTAAAGCCGGCGGCCCCGAGTATTATGGAGCTTCGGACGTAAGCC
TCAAGCGTCAAACCTCTGCACGTAAAAGAAGCCAACACACTTATCGAGAA
GAGTAGGGGTGACCCGGTGTGCTTGGCAAAAAACGCGAGCTTGGCGAAGC
CGCATTGCTCTACCACTAGCTACTTGAAAAAGCATCATGCTTCACTCAAT
TGAAGATGACTGCTTTACCTTTACCTTATCAAACACCTGCTGTAGGTAGC
CTCTACGTTTAGATACCAAGTTTTAAGATATGTTTGTCACATATTGCATT
CGGAAATGTGACCACCCGTCTAATATCTTTTTGTAGCGTGTACTTCGTCG
AACGGGGGATGTCAGGATTTGTGCCTTGCGCGTCCAGAGGGAAGAACGTG
CGCCTGCCGAGCTTTCTGGGAACTGCAACAAGATGGACAGACTTGTCTTC
CGCCAGGTAAAGTACAGAAATCAAACCATCGCAAATTTTCCTTGAAGGTC
GATGTGATGATATTATTGTTCTTAAAGGGCGTAGTCATCAATAATTATCT
GTGTGTTTTAATTTTTTTACTGTTTATCTACGTCACGGTAACGTCAAACT
CTTTGATCTTACAATGACGTTTCAACATAAATCTATCAAAGTCAATTATT
GTTCCTCATTAGTTAGTTCTACTACAGGCAACCCAACTGATCATCACACC
CTTCATATATCTCTGATGGTATGAGAATTGTTTATTTGTACGTCAAAACA
TACCAGATTATGATAAAGCAACAGTAATATATAAGTTTGACCCGTATCAC
AGGTCTTGTATCTCCGAGCTACCTCTGGTTGGACCACAGTTCCGCAACCG
GAGTGACGTCAGTGAAGATGACCCCCGGGAACAGCAGCGCCATCAGAGGG
TTAGAGGACCGAAGCTCTCTTCCTGTCACGGTACTCTTCACCTCTGAGGC
GCCGTCCAGAATAGAGGCGATCGACTACGACTTTCAGCGCAATTTGATAT
TTTGGGCAGACACCGGCCTTAGGGAAATACA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000036:703233..718213+ >transcript:BL96294_cuf1 ID=transcript:BL96294_cuf1|Name=transcript:BL96294_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=10464bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000036:703233..718213+ (Branchiostoma lanceolatum) TCAGCAAAACGACATGCGTGTTCAAATTTGGATCTAAACTTTTGGATGTA CGTTGAATCTAATCCTACGACGTTTTCAGTAGGACCAAGTATGGGGGCGT TCGGCCTAAAGATCCTCCTTCTGCATCTTCTGTTTGCAGGAAGCCTCGGG TCCCGTAACGACAGCGAACCATTCCTGTTGGTTGTTGACAACGTCCTTGA TGCTGCTTTTCAAGTCAACGTCACTTCCGGTTCAATGGTCGAGCTTCCAC TGGGAGACCTAAGAGTGCCTCTTTCCGTGGACTACGACCCGATGACCGAC TTCGTGTACTGGTCAGATCGGATTTATGGAGACATCAAACGGGCCCGACG TGATGGGAGTGGGAAGGAGACCATTGTAGCAACTGATATCTTTGCCGTCT ATGGTCTGGCCCTGGACCATGCTGGTGGTAACATCTACTGGACCGACGCG ACAGTGAAGACTATCTCAGTAGCCCAGAAGGATGGATCGTTTGCTAGGGC ACTGTTGACGTCACCAGCCGTTGGGAGTCCTGGAGGGCTGGTCCTGGACC CTGGCAACGGATACATGTACTGGACGGACTGGGGTAGTGATCCTAGAATT GACCGTGCTGCGATGGATGGTAGTAACCATACAACCATCATCAGAAACGT 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| Sc0000036 | genome | Sc0000036:703233..718213 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Transcript id | BL96294_cuf1 |
| Biotype | protein_coding |
|