transcript:BL96294_cuf1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96294_cuf1
Unique Nametranscript:BL96294_cuf1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96294_cuf1

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Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000036:703233..718213+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000036:703233..718213+

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GGGATTGCCATTAATGACGACAGCATCTACTGGACGTCTTGGACGGATGG
CCAAATCTTAATGTTGCCCAGGGCTAACACGAACCAGAATAAGACTGTCC
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TCTGATTATGTCACCAATGCGTGTACTTCGTCGAACGGGGGATGTCAGGA
TTTGTGCCTTGCGCGTCCAGAGGGAAGAACGTGCGCCTGCCGAGCTTTCT
GGGAACTGCAACAAGATGGACAGACTTGTCTTCCGCCAGGTCTTGTATCT
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GAAGATGACCCCCGGGAACAGCAGCGCCATCAGAGGGTTAGAGGACCGAA
GCTCTCTTCCTGTCACGGTACTCTTCACCTCTGAGGCGCCGTCCAGAATA
GAGGCGATCGACTACGACTTTCAGCGCAATTTGATATTTTGGGCAGACAC
CGGCCTTAGGGAAATATCAGCAAAACGACATGCGTGTTCAAATTTGGATC
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CCAAGTATGGGGGCGTTCGGCCTAAAGATCCTCCTTCTGCATCTTCTGTT
TGCAGGAAGCCTCGGGTCCCGTAACGACAGCGAACCATTCCTGTTGGTTG
TTGACAACGTCCTTGATGCTGCTTTTCAAGTCAACGTCACTTCCGGTTCA
ATGGTCGAGCTTCCACTGGGAGACCTAAGAGTGCCTCTTTCCGTGGACTA
CGACCCGATGACCGACTTCGTGTACTGGTCAGATCGGATTTATGGAGACA
TCAAACGGGCCCGACGTGATGGGAGTGGGAAGGAGACCATTGTAGCAACT
GATATCTTTGCCGTCTATGGTCTGGCCCTGGACCATGCTGGTGGTAACAT
CTACTGGACCGACGCGACAGTGAAGACTATCTCAGTAGCCCAGAAGGATG
GATCGTTTGCTAGGGCACTGTTGACGTCACCAGCCGTTGGGAGTCCTGGA
GGGCTGGTCCTGGACCCTGGCAACGGATACATGTACTGGACGGACTGGGG
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CCATCATCAGAAACGTATCTGATCCCAACATGATAACCATAGACTACAAA
GAGAATCGGCTGTACTACTGCGATGGAGGAGCTTACAGCATCTACAGTTC
GGATCTGCTCGGTAACGACATACGCCGACTGTTCTACGAAGAAGAGAATT
ATCTCTTCGGGATTGCCATTAATGACGACAGCATCTACTGGACGTCTTGG
ACGGATGGCCAAATCTTAATGTTGCCCAGGGCTAACACGAACCAGAATAA
GACTGTCCTTGTTGATGATCTGTCAACACCAAACGACATCTACGTGTATA
CAGGATCATCTGATTATGTCACCAATGCGTGTACTTCGTCGAACGGGGGA
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GGACCGAAGCTCTCTTCCTGTCACGGTACTCTTCACCTCTGAGGCGCCGT
CCAGAATAGAGGCGATCGACTACGACTTTCAGCGCAATTTGATATTTTGG
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CTTCTGTTTGCAGGAAGCCTCGGGTCCCGTAACGACAGCGAACCATTCCT
GTTGGTTGTTGACAACGTCCTTGATGCTGCTTTTCAAGTCAACGTCACTT
CCGGTTCAATGGTCGAGCTTCCACTGGGAGACCTAAGAGTGCCTCTTTCC
GTGGACTACGACCCGATGACCGACTTCGTGTACTGGTCAGATCGGATTTA
TGGAGACATCAAACGGGCCCGACGTGATGGGAGTGGGAAGGAGACCATTG
TAGCAACTGATATCTTTGCCGTCTATGGTCTGGCCCTGGACCATGCTGGT
GGTAACATCTACTGGACCGACGCGACAGTGAAGACTATCTCAGTAGCCCA
GAAGGATGGATCGTTTGCTAGGGCACTGTTGACGTCACCAGCCGTTGGGA
GTCCTGGAGGGCTGGTCCTGGACCCTGGCAACGGATACATGTACTGGACG
GACTGGGGTAGTGATCCTAGAATTGACCGTGCTGCGATGGATGGTAGTAA
CCATACAACCATCATCAGAAACGTATCTGATCCCAACATGATAACCATAG
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TACAGTTCGGATCTGCTCGGTAACGACATACGCCGACTGTTCTACGAAGA
AGAGAATTATCTCTTCGGGATTGCCATTAATGACGACAGCATCTACTGGA
CGTCTTGGACGGATGGCCAAATCTTAATGTTGCCCAGGGCTAACACGAAC
CAGAATAAGACTGTCCTTGTTGATGATCTGTCAACACCAAACGACATCTA
CGTGTATACAGGATCATCTGATTATGTCACCAATGCGTGTACTTCGTCGA
ACGGGGGATGTCAGGATTTGTGCCTTGCGCGTCCAGAGGGAAGAACGTGC
GCCTGCCGAGCTTTCTGGGAACTGCAACAAGATGGACAGACTTGTCTTCC
GCCAGGTCTTGTATCTCCGAGCTACCTCTGGTTGGACCACAGTTCCGCAA
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GGGTTAGAGGACCGAAGCTCTCTTCCTGTCACGGTACTCTTCACCTCTGA
GGCGCCGTCCAGAATAGAGGCGATCGACTACGACTTTCAGCGCAATTTGA
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TGTTCAAATTTGGATCTAAACTTTTGGATGTACGTTGAATCTAATCCTAC
GACGTTTTCAGTAGGACCAAGTATGGGGGCGTTCGGCCTAAAGATCCTCC
TTCTGCATCTTCTGTTTGCAGGAAGCCTCGGGTCCCGTAACGACAGCGAA
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CTCTTTCCGTGGACTACGACCCGATGACCGACTTCGTGTACTGGTCAGAT
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CGTTGGGAGTCCTGGAGGGCTGGTCCTGGACCCTGGCAACGGATACATGT
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GGTAGTAACCATACAACCATCATCAGAAACGTATCTGATCCCAACATGAT
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CTACTGGACGTCTTGGACGGATGGCCAAATCTTAATGTTGCCCAGGGCTA
ACACGAACCAGAATAAGACTGTCCTTGTTGATGATCTGTCAACACCAAAC
GACATCTACGTGTATACAGGATCATCTGATTATGTCACCAATGCGTGTAC
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TGTCTTCCGCCAGGTCTTGTATCTCCGAGCTACCTCTGGTTGGACCACAG
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CCATCAGAGGGTTAGAGGACCGAAGCTCTCTTCCTGTCACGGTACTCTTC
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GACATGCGTGTTCAAATTTGGATCTAAACTTTTGGATGTACGTTGAATCT
AATCCTACGACGTTTTCAGTAGGACCAAGTATGGGGGCGTTCGGCCTAAA
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CAAGTCAACGTCACTTCCGGTTCAATGGTCGAGCTTCCACTGGGAGACCT
AAGAGTGCCTCTTTCCGTGGACTACGACCCGATGACCGACTTCGTGTACT
GGTCAGATCGGATTTATGGAGACATCAAACGGGCCCGACGTGATGGGAGT
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CGATGGATGGTAGTAACCATACAACCATCATCAGAAACGTATCTGATCCC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL96294gene:BL96294Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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