transcript:BL95929_evm0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL95929_evm0
Unique Nametranscript:BL95929_evm0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL95929_evm0

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Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000220:332584..354906+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL95929_evm0 ID=transcript:BL95929_evm0|Name=transcript:BL95929_evm0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=22323bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000220:332584..354906+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GGTTTAAAGCTCTGTGAATATTACTAACAAAAGATGCAAAAGATTATAAC GTCACCAAAACTGGTGGAAATAATGCAACTTGAAACGAAGGCTGTCATAA CTATAACCATCATTGCAGTCTTAACAACTCATCAACAGTCGCTGTAAGCT ACATCTAAAGTCGTCTGCATGTTGTAACGATAGCTCGAAGTTAGTAGCTA AGATCCTGCCAAAGCTATACCAAATGAAATAGATGGCGCAGCATTTAGGA TAGGGCGCTGGGGACGATCGGTTATTCTTGCAGCTGTCTAAAGGTAACAG GCTTGACACCTCATGTAGGCATGATTGAACACCCTTTGGGCAACACTTTT GAACCTATCTTATAGTATTACACGTATATCGTATTACAACAACGATAAGT GTTTAAGGTATCTTCGTTTCTATGTCGACGTGCGTGGCGGTTTGATGTTC ATTTCATTACTCTTGGCTCTGGCTCCAAAATGTATGGTTTTGTCTAATGG TACGGGTGTATTAACACATGACTTACTTAGACTTAGATCCTCTAGTGCCA AGTAGCACATCGGGCAGCAAGCTTCCTCCATTCAGTGTAGTTTTGGGCTA GGACTTCTGCTCCTTTCATGGTAATCCCCAGTTGTTCAAGGTCCTTCTGT AGCATGTGTCTCCATGTAAGTTTGGGTCTTCCCCTTTTTCGTTTCCCTTT GTCGGGTTTTCATTTTAGCGCTGTTTTTGCACATGGCAAGGGATGATTCA ACCATACTGGCTATATTGATGAAGGTTAGACATCTAGGTAGTAAGATAAG CCAAAAATAGTTACCCAAGCAACTGGATAAAATTTTGAAAATTTTCAAGA TTTTATCCAGCTGCTTGAGAAATGTTTTTGGCTTATCATACTGAATATTA TTCTATTCACCTCAGCTTTTTTCGTAGTCGACTAGTCTGTAACGAACCAT 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CGAAAACGATAAACAAACTTATCATGATTACAGAGATATGATTATGCATA TAAACAAAGCTCTACATATCTACCAATTCATAATCATAACGGTACGCGGT ATATTGACTAAGCCATCAGCCTTAAATTGATGTATCAATCCACTGTCGCA AATGGATGCACAAAGTTAGTTATCGAGACTGACATTCCATACACTACCAA CAATATATTTTCTTGCTTTTCTAGTTTTTCTAAACTTGTGGACGAATTTT CTCATCTTAAGAATTTCATGAATGAATAAGACCAAAACTTTGAAGAATTA GTCTGATTCTTTCTATGAAAATTATCACAATAAGAAACACTTTCCTAATT CTCTTAAGTTCAGAAACTATTTCTCAGCAACAATTTCAACCTAAAGAATT TCTAGAAATTCAAGTCTCAAAGATTATTTTTCATATGTTATTTTAATTAA CAAAATATTAGGATTTTTTCTCCCCATTGTTGAATAATCTTACTTCCAGA CAAATTTTCTAAGACAAAATAACTTGTGGACAAAATTTTTTTCTTAAACA CAGAAAGTTGTCTTCTTTTGAGAATTATTTCTGTGTATAAGAAGAAACTA GAAAAAATAAGAAAATACATTTTGGTAGTGTAGAGGTGCTTAGTTAGACT GACGGCTGCCAACAAGAGGTGCTTTGTTTCAATCATCAATACTGTATACC TTTTAGTTTCTTATTGTTAATTTATTTTTTGGAGGAAATATGTTCATCTG AAGCTGTGTTTACAATTCAAACAGCACGTTATCGCAATGTCATACTAAAT GGGCATACATGCTGCGCCCATGCACATTTTATGACTACACTAAATATCAG CCTCTTACAGCAAATGTTGTGGTGATTAAACCACGTCTCAGCAATGTGTC GTTTATTCTCAGATGCGTTGGCCTCTCCACCAAGCATAGCGGGGAACCGC 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TTCCACAAGCTCAACGTTCCAAACATCTCTCTCTTCAGCGAGAACTTTCG CCTGCATGAATACGTTGAATTACCCGTTGACATCTACTGTACATAATGGA AAGATAAGTTATCGTTTCCCGACACATTTCGCAAGTATTAAAAAGCAATG GCAGCCAGCTGTCACTTTGTGGAGGCAGACGCTGTTATTTCTGTCAAGAG ATAAAAACGAGTGACAGTAACATGGCATTGATGCGCTCGTGCAGATCCTC CGGCCGTCAGCGTGCCAGAAAGGTCTGTTGTCGCCCTGGAGGGGAGGAAC GTAAGTCTGAGCTGTCTGTCTGATGGGAACCCACCTGCTGGCGTCACATG GAGGAGAGACGGAGCGGTCCTTCCGCAGGGTGCGATAATAAGGTGTGGGC AAGATTGCGAAATGGGCTATTTATCATAAACGGTACTCTACGCTCGTTCT CATTTAAATGTACACATTTTGTAAGTTACGTTACCGTTTGAAGTAAGACG TTCCTCACATTAAGATATGCCACATATAAGGTGCCAAACTGCCGTTTTTA TGAGCTAGCAAAGTTTTAAGTCGTCATAAAAACGACAGTTTGGCACCTTA TATGTGGGATATCCTAATGTCAGGAACATCGTACTTCAAACGGTAACGGA AGTTACAAAATGTGTACATTTTTAAAATGAGAACGAGCGTCTAACGTTAC AGCAAGTAAAGAAATGTTTATAAACACAGTCATTACGATAGAATACATCA ATGTTCACAAAATTACATGTTACTGAAATTGTTACTGTCAAGTTAAGCCA TAATAACGGTGAGACATACTGCTGCTCAAGCCTTGAGGCCGTAGAGATGC AAAACACGACAAAATACCGCTGTATCATCATCACTCGTTGCAAGGACAGA CATGTCCTGCATTGAAAAGGAACGGCTTTCATTTGTACTTCATGTCATCT TAAGCAGATCTACGTAAAAAGGGTGATGACATACTTGTCAATTTGTGGGT TATCGACCTGACGTATTTCTAGGAACCTCTGGGCAGCTGTTATGAACTAA ATCCCAAAATAACTTGCTTCTTAGCGCTTTCTTGGCGATATCAAACAACA AACCACTTTCACACTAAGCTCTTGACGCTACTAGGTTTGGCTTAAAAGCC TACAGTGACAGTGTTTTGTGAATCTTCACGGGGTTTTCTGTCAGCGAAAA GCCTTTCAATTCTCCCATTCTTGTTCAACCATTCAGGAACTCGTCGCTGT TGATACCGCGGGTGTCCCAAGCAGCCGGCGGCTCTTACGTGTGCGAAGCC GATAATGGGATCGGGCCGACTGGGACCGGACAAATCACTATGGAGGTCAT ATGTAAGGCAGACATCCATTCTATCGATGCCTTCCCTATCTTTGCCATCA AGGGCACTAAAAGCTACCGCTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000220:332584..354906+

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CTCTTGGCGCTCCTACCCATCGTCAACGCTGCCTTTTACCGCATACGACC
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AATGGGTGGGTGCGTTGCGATATTCTCTGGTACTCTTGGCGCTCCTACCC
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AATGGCACTAAGTTGTTGAAGCCAACCGAGGAAGTCAAGCGGACAGAACC
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GGGAGAATGGGGCGAACATCACGTGCTTGGCCGATCAGGGGGTGCCCGGA
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GTCATATGTAAGGCAGACATCCATTCTATCGATGCCTTCCCTATCTTTGC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL95929gene:BL95929Branchiostoma lanceolatumgene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL95929_evm0-E1BL95929_evm0-E1-1564476830-394662Branchiostoma lanceolatumexon
BL95929_evm0-E2BL95929_evm0-E2-1564476830-394664Branchiostoma lanceolatumexon
BL95929_evm0-E3BL95929_evm0-E3-1564476830-394666Branchiostoma lanceolatumexon
BL95929_evm0-E4BL95929_evm0-E4-1564476830-394668Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL95929_evm0transcript:BL95929_evm0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
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Properties
Property NameValue
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Biotypeprotein_coding