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Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL95323_evm2 >transcript:BL95323_evm2-protein ID=transcript:BL95323_evm2-protein|Name=transcript:BL95323_evm2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=353bp
MVTPSRPMSFFMLTILFTLSVILYYNFVTFDISTLTSYSLKAVQNRIQLR QTFLDTHIQANTTRATKVTKHVQPTGNKTVDVDVKNNLTRLDKSLQKLKP FENFAYFSDYKNRKKKCKKRKGCPTPKTPVHHYHACAIVGNGGILLNSSC GNEIDSHDYVIRMNMAAIKDYEQDVGRKSNLSFINWTGVKQLGTELTSKD TRTREGVLQHLTLLNNSVFSYVKLRTGAVIRSLESLEALLKENKLNITVT YSRSNVPLVFTKPLRETFIPKLKSPTSGLIAYILASRFCDVITLYGFYPF ATDMRNRTLFYHYYDKSKVARRRRSRHNFDIEHDFFTLLHQNGLVRLVSD ICE Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000021:119916..131346- Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL95323_evm2 ID=transcript:BL95323_evm2|Name=transcript:BL95323_evm2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11431bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000021:119916..131346- (Branchiostoma lanceolatum) CCATAATACCTTCTTGCCCCCCGTCAGTAGAATGGCATGACCCTAAGTGG
GTTTTCCGGTCATCGTGGCCAAGAAAAACGTCCTTCATTCTTATAGCTGA
TCTGAAGTGTTATATCTTAAGCCTTTAGCGTTTCTTCAAATCCCCCGTCT
GTCTTGGAAGAATGCTGCTATTCCTTTTTCATTATTTTGTCAAGGGAGCC
GTTTGTAAATCTTCGATGTTCTATTAGCTATTTGTTGTCTTCCGTAAACG
TTGACTACATAATGAACCCACTAATTTGTAGTTGGACGGGTTGTCTGTAA
ACACACAGTACTATCAAGATGGTGACTCCTTCTCGGCCGATGTCGTTCTT
TATGTTGACCATTCTCTTCACCCTATCGGTGATACTCTACTACAACTTCG
TAACTTTTGACATCTCAACATTAACAAGGTAAGGACATCAATATATTATT
CTAGATCACATAGCTTAAGTATTGCATTCGAACGTACGCAAAGGTCATAA
ATTGCTTACGCATACATGCATCGTTCGAAAATATTCATAATACTTGTCAT
GCGCAGCTATAGGTCCGGAGGGATCACGTGATACATTAATACTATATAAG
GGCACGCGGAAGGAGACAAGTGTCACTTGCAAGCCAGAGGTCCCCAACGC
CGGACGTAGCTTGGCGCCGTCCGTGTCCTTACCACCCAGAAATGTCCAAG
AAACCACGTATGCCAACGGGAGGTACGTTTTTGCTCCCGCTTGGGATTTT
TGATTTCGAACCAGTGACATGGGTTCTGAGACTTTAGGACACTGGAAGAC
GGAGAGCTACGACGCTGCTTTGTTCCCCTGTTCATTTTGAAATACGTGGT
AGAATGCTCGGTGATAACCTGTTTGACTTCCCCTCTTTTAGTTTTCTTCA
ACGACAGGAAGAATCAAGCGGTAACTTGGCGTCCCTGAACTTTCCTCGTG
GTTCTTTCGTCGTTTAGACTACTCGCTCAGGTATGCGCCACCGGTGCCAC
GTTGTCTTTGTTGCATGCTGTCCCCCTTTGTTCTTAGGAGCGGTTCACCA
CCAGGTGCACGTGATGAGTTGTCTGTCCTTTGTTCAAGCACCGGTGGAAT
GCAGGAGAGGCGCTGTGGAATTAGCGCTTAATTTTTAACAAATGTGTTTT
CCCTTGAGGAATTTCAGGACTCAAGCGACGTACGGCACTCGTCACAGTTT
ACAGCTTTAGCTGGGCCGTTCGTGTTTCTGCTCGTTACGTCTTCGTTTCG
GTTCTCTGGTAAAGTTGTTATTTGTGGATGAGTGGTTGATGAGTGATGGT
GAATCAGTGCACGAATGGCCCGAGCAGCTCATGTTATCGTGTCGATGCGC
ACCTTTGAGCGCCGAGCAGAGTGGTTGAGTATATGAGTTGGTTCTTTATC
ACGCGTGGTATTTCGTTAGACATGGGCTCACCTTTCTTATTATTCATACA
GGCCTAAACCTTCTAGCGCCGGCTTCACAGGGCGCAGCACCACCACCGCC
GGCTTCACAGGGCGCAGCACCACCACCGCCGGCTTCACAGGGCGCGGGAC
CACCGCCGCCGGCTGCACAGGGCGCAGCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCCGGAGGGATCACGTGATACATTAATACTATATAAGGGCACGCGGAAGG
AGACAAGTGTCACTTGCAAGCCAGAGGTCCTCCAACCGCCTGACGGAGCT
TAAAGCGACCCACCCACCCAACCCTGACATTTCTGGGTGGTAGCAGGCGC
CCGCTAAGAAGCGGCCGCCATGCCCTACTTATCCTTTAGGCTCCAGACGG
CAATCTCCGCATCACCCATTCCGGAGGACCGATGGCTACGCATGACAAAT
AGGAAACTACGTAAGCCTTATCGCGTATAAAAATAGAGTCAAGAAAGAAA
CTGATTTTTTAAATTACGCCAAGGTACTTTAACATAACGTATTGGTAAAT
GTGTCTATTAATCGTTTAAACGTTTGTGTTTTGTTAACCATTTAGACAAT
GGCGCTTTGTATTGTGTTATGGTATTAATACGAGCAATGCCAATATTCCT
TACTATCTTATACTGCCGTACTGTAGCGCGTTTTACTATTATTACATTTT
TTGCCAAAACATTTGACTAAATCATGTTTGTTTTTCCAGTTACAGTCTAA
AGGCAGTGCAGAATAGAATACAGTTGAGACAGACGTTCTTAGACACACAC
ATACAAGCCAACACTACAAGGTGAGTTACAGTTCATGACATTACAGGTAC
GGCCCTGCATGTAAGACAAGCGAACAGGGTCACGCCCACCTCTCTGAATA
CACCCTTCAATATTGACAGATGTATTGGAAGGGGTGCAGACATTATTTCT
TAACTGTTAAAGGCAACCAAAGCAATATTAGGGCCCAAAAAATAGACATT
AAAAATGCTAAAATCTTTACGAAAGTGACATGTACTAACATTGTTTAGTA
CAGTTGCGTAATAACTTCATACTTCGAACATTTTAAAACCACGCAAAATC
GTGCTATACAATGATCCCCTTAGTTTCACGAGCCTACAAAAAATTTTCAA
TGAGTTCTCACATCACAACAACGTCATATTTTTGCATGATGGACGTTGCT
ATACATTGTGATAACGTTCTTTGAACTAATCATGTATAAAAATGACTAAA
TAACTTGACTTTCAAAATCCAATTTTCGGGCCCTAATATTGCTTGGGTTA
CCTTTAACAGTATAACTGACAATGCTATAGCTATGCTCAATCATGATATA
GTAACTTGACCTCTACTACTGACATCACAGAAGCTATTATACAATTTTGA
TGTTCCTCATACAATAACTGCTGTCTATTCATATCTGTTCTATGAGGGCC
ACTAAAGTGACGAAACATGTCCAGCCAACAGGAAACAAGACGGTCGACGT
GGACGTGAAAAATAATCTCACAAGGTAGTTTATATATTTAGTCTTTTTAC
ATATTCATCATTTACAACTATAGAAGAACTTGATTGCACGACAAATGTAC
ATGGTACAAAGTATGGCCAGAATTCGTAAACATAATACAGAATAGAAGTA
TAGAATAAAACTTAACATCCTAATTACTAATAAAATACAATAAGGGCTAG
CATACGTTTTGACATAGTGTTATAATCGAGTTGGTTAAATCATTAGTTTC
GGTATTTTTACTTATGTGAAAGCAGTCGTTAAGATATTTACCTATATTCG
CATTGTGAGGATTGTTGCATTTAAATATGTACTCAAAACGGTCTGTAGCA
TCGAGACTCTTAAAACTTGTACTTGTTTTGAGAAGTGTGAATAGCTTATG
ACGTAAAACATCATATATCATGTCGTCGACATGATAAATATCTATGGCGT
CGACACTAGGCTTAATAATCATACAGCAACGTGACTTCTTCTGGCACTTG
ACGCTATTATGTCATGTTGTTGTTATTATTTTCACACAATAACTACTGTC
TATTCGTTTATTCAGAGCACATAAGGTGACGAAGAATTTGCAGCCACCAA
GAAAGAAAAAGTTAGACAAGGACATGAAAAAGAATCTCACAAGGTGGTTC
AAAATTCCATGAGTAGTATTTGATCTTTCGACAAAGAAGTCACTTTTTCT
CCAACGTATTCGATTATCCAAGAATACATTTTTTGTATGAAAAAAGGTAT
TGCCTACTACTACAAACTATCAATATTTAGAACTGAGTCGACCTTGAATT
CTGGCTGCGTAAGATCAAACATTGAATTCTAGGGCAAAAATCTTCATATG
TGATACGTAACGTTATCATTAGTTGTTTTGTTAAAGATGGACTGGAGATC
ATTCATGTGTATTGGTAATGAATTGAATTATTGATGAAATCTATCTTTCC
TTTTTTCAGACTTGACAAATCATTGCAGAAACTGAAACCGTTTGAGAATT
TTGCCTACTTCTCCGACTACAAAAACCGTAAAAAGAAGTGTAAAAAGAGG
AAAGGCTGTCCAACACCAAAAACACCAGTTCATCATTATCACGCATGCGC
AATTGTTGGAAATGGTGGGATACTTCTCAACAGCAGCTGTGGGAACGAGA
TCGACAGTCATGATTACGTCATCAGAATGAATATGGCCGCCATTAAAGAT
TACGAGCAGGTAAGAAATGATATCTTGTAAGAAGACACATTCTTCAGATT
CTTAATTTCTTAAGAAGCAAACTCAACTTCCCTACAATGCATAACCGTGT
TAAGGAGAGCAACACCTCAATCACGTTAACCTTAAAGAACCCACCACACT
TATCGAAAAGAGTACAGGGATCATTCTTGTTGCGAGTGGATCAAACCTTC
CAGTCCTGTCTTTCGAAGCTTGTGCCTACTGTACTCAAGTGATGCGTTAC
CGTAACGCCTATACAGTCATTTAACCGGGATATAGGAGATTCTTTTTACA
CAACCAGGTAATCTCACCTGCTAACGTTTCGATGTCTATCAGACACCTTC
TTCGGAGCTTCTGACTGTAGTACTGCTTCTCACCGCTAAGCTTGTATCCT
CCCTCGTCTCGGTTCATAAACTTAGCCACGTTTGGGATAGTGTTCTCACC
GCAAAAGCGCCACCTACATCGGCTACTTATAGCGGTGAGAAGCAGTACTT
CAGTCAGAAGCTCTGAAGAAGGTGTCTGACAGACACAGAAACGTCAGCAG
GTGAGATTACCTGGTTGTGTAAAAAGAATCTCCTATATTCTATATTCTAC
CAACCCGATGAAATTATTTTCGGAAGTCATTTAACCGGTTATGTAAAAGA
AGGGAACAAAAAATCTTTATCGAGACTTCTATTAGTAGCTTATCTAACAT
CTAACACCTGTTTGTACAGGTGCAATTTTTTTCAATGTATACTCAAATTT
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GGACGGGAGTAAAACAGCTGGGAACGGAACTTACGTCAAAAGACACGCGT
ACGAGAGAGGGCGTTCTCCAACATCTGACCCTACTAAACAACAGCGTCTT
CAGCTATGTGAAGCTAAGGACAGGCGCAGTTATCCGGTCTCTTGAGTCAC
TGGAGGCGCTCTTAAAGGAGAACAAGCTAAACATCACCGTCACATACTCG
AGAAGTAATGTTCCACTGGTGTTCACAAAGTAAGGGCCTTATTGTGGCAA
TGTTTGTGTGCGTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTCTATATGTGTGTGTGTGT
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ATGTATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTATGTGTGTATATGTGTGTAT
GTGTGTGTGTCTGTGTGTGTATGTATGTACGTATGTATGTGTGTGTGTGT
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GGTGTGTGTTTGTTCGTTTGTGTTGGCGTGTGTACGTAGTTATTTGAGTG
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AAGCACTACGTATACTCAAAGAGTAGCCCGATGAGAAAAACTGTGTTTGA
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TCTTTCTCTCTTTTTATTTCAGACCACTACGCGAAACGTTTATTCCCAAA
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CTGTGACGTCATCACCCTGTACGGCTTCTACCCGTTCGCCACGGACATGC
GCAATAGGACGCTGTTTTATCACTACTACGACAAAAGCAAGGTTGCTAGG
CGTCGCAGAAGTCGACACAACTTCGACATTGAACATGACTTCTTTACCCT
CCTGCATCAGAATGGACTTGTCCGGCTGGTCTCCGATATATGTGAATGAT
AGGTTTATTGCAAATTCGTACCCTTGGGCTAATGGCAAGCAACTTGAAAA
GGGCAGACAAATAATGTATAACAGTATAGCATGTGCGTGAATAGTTTCAT
CAGGTTGGTAAGTCACTGAATAAAAAAGACT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000021:119916..131346- >transcript:BL95323_evm2 ID=transcript:BL95323_evm2|Name=transcript:BL95323_evm2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=6372bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000021:119916..131346- (Branchiostoma lanceolatum) ATGGTGACTCCTTCTCGGCCGATGTCGTTCTTTATGTTGACCATTCTCTT CACCCTATCGGTGATACTCTACTACAACTTCGTAACTTTTGACATCTCAA CATTAACAAGTTACAGTCTAAAGGCAGTGCAGAATAGAATACAGTTGAGA CAGACGTTCTTAGACACACACATACAAGCCAACACTACAAGGGCCACTAA AGTGACGAAACATGTCCAGCCAACAGGAAACAAGACGGTCGACGTGGACG TGAAAAATAATCTCACAAGACTTGACAAATCATTGCAGAAACTGAAACCG TTTGAGAATTTTGCCTACTTCTCCGACTACAAAAACCGTAAAAAGAAGTG TAAAAAGAGGAAAGGCTGTCCAACACCAAAAACACCAGTTCATCATTATC ACGCATGCGCAATTGTTGGAAATGGTGGGATACTTCTCAACAGCAGCTGT GGGAACGAGATCGACAGTCATGATTACGTCATCAGAATGAATATGGCCGC CATTAAAGATTACGAGCAGGACGTTGGACGAAAATCAAACTTATCCTTCA TCAACTGGACGGGAGTAAAACAGCTGGGAACGGAACTTACGTCAAAAGAC ACGCGTACGAGAGAGGGCGTTCTCCAACATCTGACCCTACTAAACAACAG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| Sc0000021 | genome | Sc0000021:119916..131346 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Transcript id | BL95323_evm2 |
| Biotype | protein_coding |
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