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Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL90100_cuf1 >transcript:BL90100_cuf1-protein ID=transcript:BL90100_cuf1-protein|Name=transcript:BL90100_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=100bp
MSVSRALLLTALVVCAVDFGQAFHLSTPPRNRPGTPRDEDPTPVSGPENV
TAAIPGREDPTPVSGPDYVTAAIPEKENITADHGERAEEIMGKLEEKAEE Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000044:1273587..1288560- Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL90100_cuf1 ID=transcript:BL90100_cuf1|Name=transcript:BL90100_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14974bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000044:1273587..1288560- (Branchiostoma lanceolatum)
TTTGTGTTTCGAGGAAGAAAGACGACAACTAACGTCCCAGGTAAGGACTT
AGTATTGAATCGACCGATCTTTAAATTGTTGCTAATGTTTTATATAAGGT
TCTGAATGTGTAGTGCTTATTTTATATTGTCATGCACGTAAGCTTATTGT
CGTTGTGGAACTTGGTGATTTTTCTACCTCATTTCAATGATTTTGCTGCA
CTTGGAAGCACTGAATGCCTAAAGATTGCAAATTTAAAATGTCCAGGATC
GACTATCAGATAGTTGCCTATAAGTTCGGACTTTTTGTCGCTAATTTTGG
GAATGTAGGTAGCTGAAGTTAAGAACCATTTCATCGGTTCGGTTAGTTGA
CCCGCTGTTTTGCTTTAGTATAGGGATATTTTTTTCTGAGTAGAAAACAA
GAGAATTGCTCGAGCTCTCTGTTCTTGAGCGTTGAAGCCGAAATTATCAG
GAATGGTTACAAGTCAAGTAACACTCCTAATGTTTTTATATCTTGGAATA
AACTTGTTTTCTCTGATTTTGGCAAAATTGCCCTCCCATAACGTTATACG
TGTTAGATCCCGTGGCCATCACGAGTGCATTCTGAAGTATCGTGAGAACA
GTTGGACTCGTTACGCAGTTTGTTTCTTGGGGAGGGGTCTGTGTCGGACG
GTGTTTTTCGTTGATTTTCATTGATAAGAAAGCATACGTGACTAGTTGAT
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GTTATGTTTTGTGTAACCACCCTGATCGTTTTCTGATCTTTTTGAAATTC
AATTTTTTTTTTCTCTGAGGGATAGTTCAATCTCTCGTAAACATTTCTTT
CTTTGTTTGATTCTTGTGATACCTGCTTTGTGTAGCTTCCCCCAAAGTGA
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GAAAACAATACCACTTGGTGTCATTTCGAAGCAAGGGGGTTGTACATGCA
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AAAATGCTACCAGGTGATCTATGAACAACGACTTGTTACATTTACCTTGT
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GGTAGTGGGCGGGACCACTCTGTCATAAGGGGTACTGTTGGTGTGTTTTA
GGTCCGAGCAGTTCCAAGTGTATGTTTTTGACATGTGCAAATACCTGATA
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TAATTTAAAAAAAAGGAGTATTTTCAGTAGCAAAGTGCCACTCTAAAACA
AAACGGTAACGCCCACCCATCCCTATATCTCAATGGTCCGCTCCTGAGTA
GTACCCATTAGTACCCACGCATGCGCAGCTAGAATAACTCTTGTTACGCA
AATCAGACGGTCTCTTTTGACCTTTGTGTTTCGAGGAAGAAAGACGTCAA
TTAACGTCCCAGGTAAGGACTTAGTATTGAATCGACCGATCTTAAATATA
TATTGTTGCTAATTTTTTATCTAAAGTTCTGAATTTGTAGTGCTTACTTG
ATGTTGCCGTGTTCTGCAAGGTTATTATCTTTTTGTCACTCGATGCACCT
TTTTACCTCATTTCAATAATTTTCCTTGGTTTTCAAGCGCTGATTGAATA
GAGAAACCCAATTTGAAATGGACATGATTTACTTTGAGATATTTAGCTCG
TCTTTTTGTGTATGTTAGAAATCTAAAGAAGGCAGTTTAGCTGTAGATAA
CTAATGATGGAGATGTTCGGTCAGTTCACCTGTTGCTCTATTTCAGTATA
GGGACCGATGTTTCTGAATAGGAAGCAAGCGGATTTCTCAACCGCTGTAT
GATAGCGATTGAACCAAGTAGTCGGGGATGGTTAAAAGTGACATTCTTTA
ATCTGAACTATCTTGGTAGAACCTTATTTTCTCTGGTTTGGCAAATAATT
CCCCTCCCTTTTGATAAAACCGTTGTACGTGTTAGATCCCGTGGCCATCA
CGAGTGTATTCTGAAGTATCGTGGGAAGAGTTGGATTTGTGACGCAGTTT
GCTTCTTGGGGCGGGGTCTGTGTCGGACGGTGTTTTTCGTTGCAATTCTT
TGCTAAAAACATATATACTTGACGAATTGGTCCTTCTTATATTTTTATAG
GGTCATATTTTCCTTTCCTACATAGCAAGTACCAGTTATACATATATGTT
TAGCCATTTTCGCGCCATCTTTCCCATGCAACAAGCCCGAGGCCCCTCCT
GCCATTGCGCAATGTCTAGCTGAGGTAGCGTTATGTTTTGTGTAACCACC
CTGATCGTTTTCTGATCTTTTGGAAATTCAATTCTTTTTTTTTTTCTCTG
AGGGATAGCTCAATCTCTCGTAAACATTTCTTTCTTTGTTTTATCCTTGT
GATACCTGCTTTGTGTAGCTTCCCCCAAAGTGAGGAAAAGCGTTGATCGG
GTATGGCTGCTTTTCTGCGAGGTCAGGACTAAAAAAACAATGCCACTTGC
CGTCAGTAGCGGATTCCACATGAAAAATTACCGATGTTGCAGGGCATAAA
TATGTTACGAGCTCTTTGTTCGCCAGAATGCTATCAGCATGATTTAACAA
ACCACGACTTGTTACGTACATCCACCGTGTTTGACTAAATTTAGCATTTT
TACCTGCCATATTGAAAGGGCGAATCCAGATTGTGGGCGGGACCACTCTG
TCATAAGGGGTACTGCTGGCTTGTTAAAGGTCCGAGTTGTTCCAAGTGTA
TGTCTTTGGCAGCTGCAAATATCTAATGGGTGGATATAGATTTTTAATGG
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TTCTGCAAAAAATGGCACTCTAAAACAACCTAGTAACGCCACACCACCCN
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CTAGTAACGCCAAACCACCCCTATTTCGAAATGGCCCACTCCTAAGAGGT
TTCCTCCAACCTACGCATGCGCAGCTAGAATAACTCTTGTTACGCAAATC
AGACGGTCTCTTTTGACCTTTGTGTTTCGAGGAAGAAAGACGTCAATTAA
CGTCCCAGGTAAGGACTTAGTATTGAATCGACCGATCTTTAATATATATT
GTTGCTAATTTTTAATCTAAAGTTCTGAATTTGTAGTGCTTACTTGATGT
TGCCGTGTTCTGCAAGGCTATTGTCTTTTTGTCACTCGATGCACCTTTTT
ACCTCATTTCAATAATTATCCTTGGTTTTAAAGCGCTGATTGCCTAGAGA
AACCCAATTTGAAATGGACATGATTTACTTTGAGATATTTAGCTCGTCTT
TTTGTGTATGTTTGAAATCTATAGAAGGCAATTTAGCTGTAGATAACAAA
TGGTGGAGATGTTCAGTCAGTTCACCTGTTGCTCTATTTCAGTATAGGGA
CCGATGTTTCTGAATAGGAAGCAAGCGGATTTCTCAACCGCTGTATGATA
GCGATTGAACCAAGTAGTCGGGGATGGTTAAAAGTGACATTCTTTAATCT
GAACTATCTTGGTAGAACCTTATTTTCTCTGGTTTGGCAAATAATTCCCC
TCCCTTTTGATAAAAAACGTTGTACGTGTTAAATCCCGTGGCCATCACGA
GTGTATTCTGAAGTATCGTGGGAAGAGTTGGATTTGTGACGCAGTTTGCT
TCTTGGGGCGGGGTCTGTGTCGGACGGTGTTTTTCGTTGCATTTCTTTGC
CAAAAACATATATACTTGACGAATTGGTCCATCTTACATTTTTATAGGGT
CATATTTTCCTTTCCTACATAGCAAGTACCAGTTATTCATATACGTTTAG
CCATTTTCCCGCCATCTTTCCCTTGCCACAAGCCCGAGGCCCCTCCTGCC
ATTGCGCAATTTCTAGCTGAGGTAGCGTTATGTTTTGTGTAACCACCCTG
ATCGTTTTCTGATCTTTTTGAAATTCAATTTTTATTTTCTCTGAGGGATA
GTTCAATCTCTCGTAAACATTTCTTTCTTTGTTTGATTCTTGTGATACCT
GCTTTGTGTAGCTTCCCCCAAAGTGAGGAAAAGCGTTGATCGGGTATGGT
AATTCTCCAACGAGGTCAGGACTAAAGAAAACAATACCACTTGGTGTCAT
TTCGAACATAGGGGATCGTACATGCAAAAGTTCCGATGTTACAATAAATG
TAAATGTTACAAGCTTTTAGTTCGCCAAAATGCTACCAGGTGATCTATGA
ACAACGACTTGTTACATTTACCTTGTTTGACTAAATGTGTCGTTTTTACC
TGCCATATTGGGACGCCACGATTCCAGGTAGTGGGCGGGACCACTCTGTC
ATAAGGGGTACTGCTGGTGTGTTTTAGGTCCGAGCAGTTCCAAGTGTATG
TTTTTGACATGTGCAAATACCTGATAGACAAGTTTATACCGTTAGTGACG
TACTAAAACATCTTAAGTCCTTTTTGTAATTAAAAAAAAGGAGTATTTTC
AGTAGCAAAGTGCCACTCTAAAACAAAACGGTAACGCCCACCCATCCCTA
TATCTCAATGGTCCGCTCCTGAGTAGTACCTATTAGTACCCACGCATGCG
CAGCTAGAATAACTCTTGTTACGCAAATCAGACGGTCTCTTTTGACCTTT
GTGTTTCGAGGAAGAAAGACGTCAATTAACGTACCAGGTAAGGACTTAGT
ATTGAATCGACCGATCTTTATATTGTTGCTAATCTTTTATCTAAAGTTCT
GAATTTGTAGTGCTTACTTGATGTTGCCGTGTTCTGCAAGGGTATTGTCT
TTTTGTCACTCGATGCACCTTTGTACCTCATTTCAATAATTTTCCTTGGT
TTTAAAGCAATGATCGCTTCGAGAATTCCAATTTGAAATGTACAGGATAT
TCTATGAGATAGTTAGCATCTGTTTTCTGTATATTAGCAATCTATAGAAG
GCAGTTTGGTTGAAGTTAACAAATGGTGCAAATGGTTGGTAAGTTCAAAT
GTTGGTTTATCTTATTTATAGGCACATTGTTTCCGAATAGGAAGCACGCG
AATAGCTCGACCGCTCTATGGTAGCGATTACACCAAGTAGTTGGGGATTG
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TCTGGTTTTGGTGAGAATTGTCCTTCCATTTGATTTAAAAAATGTTCTAC
GTGTTAGATCCCGTGGCCATCACGAGTGTATTCTGAAGTATCGTGGGAAC
AGTTGGACTCGTTACGCAGTTTGTCCTTGTTTTTCGGTGCATTTCAGGAA
CTTGGATGTGTGGCGATTTGATACTTTTAGCAATTCATTCAAGGTTCTTG
TTTCCTTTTCTACATAGCAATTTCCAGTTACATTAACATTTTCCGATATT
CCTGCCCACTTTCCCATGTGTTGGCATGTCACAAGGATGAGCCTTACTAG
GTTTACCGATATCCCTGCCCTATTTGAGCCTTCATCGTGTCATTGCGCAA
TGTCTAATTGATACAATGTCACCTTCTTGGTTTGTTTCCTAACCGACTAA
ACTTAGGCATTTTGATTTTTATACTCGGCCCTCGTAGACAAAAAGCTTTT
AGCTGAAACGGTAAGTTTCCTGTGCAGCCAGGACTAAGAAAAGAGTGCCA
CATGATAGCCTTCGTTGCAGTCCTTCCCACTAGCGGTTTTTCAACTTATC
GGGTCCAGGTTCTTGGGGGGTGGGGCCGTATCTGCTTGTGGCCCCGTCTC
TGCTTGGGATTCTGTTACCGCTGTGTTCCTGTGACCGCTGTCTAGCCACA
TGATGTCATTACAAAGTGTAACGCAAGAGATAGGTACCTAGGTACTGATG
GTGGCGTAGATACTACTTTTTGAAACTTTTGGTTCGCTAGAATCTAAATG
TGATCACTTTGAGTGTATTTGTCATCTTCGAATTGTTATAGCCGTCGCGT
TTTACTTAATGTAAAATTTTCACATTGTTAAGAGGGCGTATCGTGTTTGT
GTGCGGAGACACGCTTGTCATCAAAAACCTCTGCTACTTTGTTGAAGGTT
TTAGTAGGTCCATCTATAGGTGCACTTTGTGCACTAACGTGGGGTAACGA
AAGTATAACAACAGGGTGTTCGATCCAGAACAAAGCGGTCCCGGGTTCGA
ATTCCCCAAACGCCAACAATGTTGTGCCCTTGCGAAATGCACTTTTCACG
AATTTCCTCACTGCAGCCAGGTGTAAAAAAAAAACACGGGTATATGGTTC
TCTGAAAATCTGTTGAAATAAGTGCAGGGCCACGATGTCCTTTTCTGAAA
GAAAAAAAGGTGCACTTCCGACTACCTGAAAAGTTCCAACACCATCTGAC
AGGTGCAAACAGGCTCTTAAGTCTTAACACGACTTTACTCACTCAATTCA
GGTTTTTAAAATGTATGGTATGTTGTACTCTGTACGTGGCACTGTTAAGA
TACGTTATGAAACCTTGAATCCAATGCCACGTCACCCTTGCCTGACAAAA
AATGTAAAAAGGTGCACCTACGAGTACCTGAATAGTTACATCACCATCTA
ACAGGTGCAAATATCTGATAAATGGATATGAAGTGTTAAAGACTTTCTTA
AAGAAGCAGACTTTCAGTTGGAAACTTGCAAAGAATATTTTCTCAAACAT
AAGTGCACTTAAAAATCACAGTATTGCCCAGCCATCCATATGCCTGTTTC
AAAATGGGCTGCTCATTCATGCTACGTGTCCACCCATATGTACAAAATAA
GCTCATACCTATTGTTATTTTTTCTCTCATTTTTTCCAGTTACATTCATT
GAGAATCGTATCAGCCAAGTAAGATACATCAAACAAAATGAGGTAAGTCC
ATCCGTGTTAAATTCCTGCCTGCCACTTTGGAACTCAGCATCAAGTAATA
GTCTTTATTGCATACTCCTGCCCAGAAGGGCTAAATGCACAGATGACCAC
ATGTGGTTTATAAGAAGCATAATGTTAAACATTAATTGATAAAATGGTAC
ATTCTAACATTGAAAAACAGACAAACTGTTGACTATTGCTAAACTAATGT
TCATCACACAGTAGTTTCTTCTCTCTTGTTAAATCATTTGGAAACATGAC
TAGATACTTTGTCCATTATATGTTCGTTCTTACAGAATAAGTAATTCACT
TTATTATAAGGTTATTACTCTTTAAAGGGACCCAAAGCAATTTCAGAACG
TTAGAAGTAGGATTTTCAAGTTAAATTTCCTTGTCCTTCCTATCAATAAT
AAGTCGAAATAACAGTATCCCATTGTATATTGACCTTTATGGAGCAAATA
TGCGATGTCGGTTTGTGGTGAGAAATCCGGGCGCTGATTTTGTGTATCAG
TAATTGCAGCTTGTTCTTGTGTTCTTTTTAATCGCCCTAAGAATGAAGTC
ATATTAGAGATGTACTAATATGATCAATTCAATATGAGCAATTAATATGA
TTAAGTCAATATGAGCAATTAAATGTCAATATCACACAGATTGCCATATC
CACAATATCTACATTTTTAACGTGCTGAACTTGTTTTGAGCTCCTCTAAA
GCAAACGCAGCTGCACACGATGTTGTAAGCCCCGTTATCAGACCCTTCGC
ATTTCGTTACGCGTCTTAGTCGTGAAGTTAAACCGGTTCCGTCTGGTTTT
GTTTTGTTTAGTGTGTCCCGCGCCCTTCTGCTGACCGCCATGNTTCCGTC
TGGTTTTGTTTTGTTTAGTGTGTCCCGAGCCCTTCTGCTGACCGCCCTGG
TCGTGTGTGCTGTTGACTTCGGTCAAGCATTTCACCTTTCAAGTAAGTAC
ACACAAGAACACAAACATCATTTGGTGTTTTTAAACCAAATATTTATCAC
GATATATATATATATCTGTATCAGTCTACGTGCGCCGGGAAAGCCTCTAC
CATGCAGGCCCCGTGGATGCCTGGGAAAATAGTAGAACCTGGCCAAATAG
AGTGAATAGTACGCTAAATGAGTCGGCTACGGAGGTAGGGACCATTTGCC
ATCCACAGTAACTTCTATAGCGGACTAACCTCTCTGGCATGTATCCGTCT
ATTAGGCCAATTTCTACGATTTTTCTGACGAGCCGTAGAGCCTGGTAGAG
ACTCGGTGAAAATTACTTTAAACAAGGGTAATGGCTTAACACGCCCTAGC
CTCTACCAGGCTCCACAGGTCGCTGGAAAGATAGTAGAAATTTGCCAAAT
AGACGGACAACAGACAGTTTAGAGATATAGGATGCGTATTTTGAAAGGTT
ATAGATGTTTTGTAAAACTAACATATATGTGTCCAAGACTGCATAAAAAT
GGCATTTACCAATAGCTCAGAATGCCTGTAAGTCTTCCGAAAGCATTCAG
TACGTTAAACGGCTACCATTAATGCCATCTAAGTCCGGTTCTGATTTACG
ATCGTAAGGAACAACTGATGCCAGGTTAATTTATTTTCAGTTGTCCAAGG
TAACCACTAATGTCCCGTAAGTTTATTACATTGATTGTCCAAAGTAGTCA
GTAATACCAGGTAACTTAATCATTAGTTGACCAAGGCAATCACTTATGTC
AAGTTAGTTTATCATATTGGTTGCACAAAGTAACCAGTAATACCAGATGA
ATTTGTTTTTGGTTGTCCAGTTACAACGTACATATCGCAAAACTAATATG
CGACGCTTTTTTATATGTCTCTTTCCATCTTTCCACAGCTCCACCTCGAA
ACCGTCCCGGAACCCCGAGAGATGGTAGGGTTTCATAAACAGTATTTCAG
AAATTTACCGCGTGCATATCACGAAACTAATCTGCGACGCTTTTTCATAT
GTCTCATTCCATCTTTCTACAGGTACAGCTTGCAGTAAAACTGGACCAGA
GACAAAATGAAACGTTAATTTGTCAGGGGGTGTATGATACATAGTAATAG
ATGTAGCAGACACGTTACAGATATAGGATACATATTTCGAAAGGTTACAG
TTGTTTTGTAACCTAACATATGTGTGTCAAAGACTGCACGAAAATGGTAT
TAACCAATAGCTCAGAATGCCTGTAAGTGCTGTTGTTGAAAACAAATGCC
AGTTGTTATTGGTTGTCCCGTTATATCACGAAACAAATATGTGACGCTTT
TTTTATGTCTCTTTCCACCTTCCTACAGAAGACCCTACTCCCGTTTCTGG
ACCGGAGAATGTTACGGCAGCAATTCCTGGACGTGGTAAGAATTCATAAA
CAGTATTTCATACAGTTACATCGTGTATACCGCGAAACTTATATGTGACG
CTTTTTTATGTCTCTTTCCACCTTCCTACAGAAGACCCTACTCCCGTTTC
TGGACCGGATTATGTTACGGCAGCAATTCCTGAAAAGGGTAAGAATTCAT
AAACAGTATTTCATACAGTTACATCATGTATACCGAGAAACTAATATGTG
ACGCTTTTTTTGTACGATTGATCTCTTACCATCTCTCTACAGCACTTATT
GATCTAGAGGCTCTGGATGGATCTAACTTTGTTTCTAAACCTCTTGATAA
GAACCTATAGTTACAACTACTTTGTCTATTATTTACATCAATTATGTTAT
CTGTTACTAATTTTTGGGGATAAAAATGACATGACATGTATTTTTTGGGT
CGTAGTGAGTTCTTTGTAAGTAAGTCACATGTAAGTGCTGGGGTCAGAAA
GGTGGATTTGCCAATAGCTCCAAATGCCTGTAAGTCTTCCCCGAAGGTAA
CCACTGACTTAAAGCAACGCACGTTAAAGCAACGGCTACCATAGTTGCCA
GCTTCGACAGGACTGGTTTACGGTCCTAAGGAACCACTAGTGCCAGTTAC
AGTTGCTATGATTTGTCCAATGTAATCACTAATTTCATTACACCGGTTGT
CCAAAGTAGCCAGTAATACCAAGTAACTTTGATATGAGTTGTCCAAGGCA
ATCACTAATGTCACGTAGTTTATTATATTAGTTGTCCAAAGTAACCAGTA
ATACCAGGTAAATTTGATATTTGTTGTCCAGTTATAACTTGCATGTCGCA
AAACTAACGCTTTTTTATATGTCTCTTTCCATCTTTCTACAGAGAATATT
ACAGCAGATCATGGAGAAAGGGCTGGTAAGATATCATAAACAGTATTTTA
TACAGTTACAACGTGCATATCGCGAAACTATTCTGCGATGCTTTTTTATA
TGTCTTATTCCATCTTTCTACAAGCTAAAAGTACAGCTTGCAATAAAACT
GGACCAGAGACTAAATGAAACGTTCTGATTTAATTTGTCAGGGGTGTTTG
ATACAAAATAATAGATGTAGCAGACATTTTAGATATAGGATGCATATTTT
GAAAAGTTACAGTTGTTTTGTAAAACTAACATAGGTGTATCAAAGACTCC
ACAAAACGGCATGAGCCAATAGCTCAGAATGCTTGTAAGTCTGCCGAAAG
CATCCAGTAAACTGCTACCATTAATAATAGCCAAGTCATGTGTTGGTTTA
CGATCCTAAGGTACAACTGATGCCTGGTTAATTTGTTTTTAGTTGTCCAG
GGTAACCACTAATGTCACGTGAGTTCATTACATTTGGTTGCAAAAAGGAG
CCGGTATACCAGGTAACTTAATCTTTAGTTGTACCAGGCAATCCTTAATG
TTAAGTTAGTTTATTATATTGGTTGTCCAGAGTAACCAGTAATACCAGGT
AAATTTATTATTTGTTATAACTTGCATGTCGCAAAACTAACGCTTTTTTA
TATGTCTCTTTCCATCTTTCTACAGAGGAAATTATGGGAAAACTTGAAGA
AAAGGCTGGTAAGATCTCATATACAGTATTTTTTACAGTTACAACGTGCA
TATCGCGAAAATAATCTGCGATGCTTTTTTATATGTCTCCTTCCATCTGT
CTACAGGTACAGCTTGCAATAGTGGACCAGAGACTAAATGAGATGTTCTG
ACCTAATTTGTCAGGGGTGTTTGATGCAAAATAATACATGTAGCAGACAC
TTTACAGACAAAGGATGCATATTTTGAAAGGTTACAGTTGTTTTGTTAAA
CTAACATAGGTGTATCAAAGACTCCACAAAACGGCTTGAACCAATAGCTC
AGAATGCTTGTAAGTCTGCCGAAAGCATCCAGTAAACGGCTACCATTAAT
ACTAGCCAAGTCCGGTGTTGGTTTACGATCCTAAGGAACAACTGATGCCT
GGTTAATTTGTTTTTAGTTGTCCAGGGTAACCACTAATGTCACGTGATTT
CATTACATTTGGTTGCACAAAATAGCCAGTAATACCAGGTAACTTAATCA
TTAGTTGTACAAGGCAATCACTAATGTTAAGTTAGTTTATCATATTTGTT
GTCCAAAGTAACCAGTAATACCAGGTAAATTTATCATTTGTTGTCCAGTT
ATAACTTGCATATCGCAAAACTAACGCTTTTTTATATGACTCTTTCCATC
TTTCTACAGAGAAAATTATGGGAGAACTTGAAGAAAAGGCTGGTAAGATC
CTATGTATAGTATTTTTTACAGTTACAACCTGCATATCGCGAAAATAATC
TGCGATGCTTTTTTATATGTCTCATTCCATCTTTCTACAGGTACAGCTTG
CAAATGGGTCAGAGACTAAATGAAATGTTCTGACTTAATTCGTCAGGGGT
GTTTGATACAAAATAATAGATGTAGAAGACACTTTAGATATGGGATATAT
ATTTTGAAAAGTTACAGTTGTTTTGTAAAACTAACATATGTGTATCAAAG
ACTCCACAGAAACGGCATGAACTAATAGCTCAGAATGCTTGTAAGTCTGC
CGAAAGCATCCAGTAAACGGCTACCATTAATACCAGCCAAGTCCGGTTTT
GGTTTACGATCCTAAGGAACAACTGATGCCTGGTATATTTGTATTTAGTT
GTCCAGGGTAACCACTAATGTTACGTGAATTCATTACATTTGGTTGCACA
AAGTAGCCAGTAATACCAGGTAACTTAATCATTAGTTGTACCAGGCAATC
ACTCATGTTAAGTTAGTTTACTATATTGGTTGTCCAAAATAACCAGTAAT
ACCAGGTACATTTGTTATTTGTTGTCCAGTTATAGCTTGCATATCGCAAA
ACTAACGCTTTTTTATATGACTCTTTCCATCTTTCGACAGCGGAAAAAAT
GGATGAACTTGGAAATATGGCTGGTAAGATCTCATACACAGTATTTTATA
CAGTTACAACGTGCATATCGCGAAACTAATCTGCGATGCTTTTTTATATG
TCTCATTCCATCTTTCTACAGGTACAGCTTGCAAATGGGTCAGAGACTAA
ATGAAATGTTCTGATTTAATTTGTCAGGGGTGTTTGATACAAAATAATAG
ATGTAGCAGACACTTTAGATATAGGATGCATATTTTGAAAAGTTACAGTT
GTTTTGTAAAACTAACATAGGTGTATCAAAGACTCCACAGAAACGGCTTG
AACCAATAGCTCAGAATGCTTGTAAGTCTGCCGAAAGCATCCAGTAAACT
GCTACCATTAATACTAGCCAAGTCCGGTTTTGGTTTACGATCCTAAGGAA
CAACTGATGCCTGGTAAATTTGTTTTTAGTTGTCCAGGGTAACCACTAAT
GTCACGTGAGTTCATTACATTTGGTTGCACAAAGTAGCCAGTAATACCAG
GTAACTTAATCTTTAGTTGTACCAGGCAATCACTTATGTTAAGCAAGTTT
ACTATATTGGTTGTCCAAAGTAACCAGTAATACCAGATGAATTCATTATT
TGTTGTCCAGTTATAACTTGCATGTCGCAAAACTAACGCTTTTTTATATG
TCTCTTTCCATCTTTCTACAGACAAAATTGTGGGAAAACTTGAAGAAATG
GCTGGTAAGATCTCATATACAGTATTTCATACAGTTACAACGTGCATGTC
GCGAAACTAATCTGCGATGTTTTTTATATGTCTCATTCAATCTTTCTACA
GGTACAGCTTGCAATAAAACTGGACCAGAGACTAATTGAAACATTCTGAC
TTAGTTTGTCAGGGGTGTTTGATACAAAATGATAGATGTAGTAGACACTT
TAGATATAGGATTCATATTTTGAAAAGTTACAGTTGTTTTGTAAAACTAA
CATATGTGTATTAAAGACTCCACAAAACGGCATGAACTAATAGCTCAGAA
TGCTTGTAAGTCTGCCGAAAGCATCCAGTAAACGGCTACCATTAATACTA
GCCAAGTCCGGTTTTGGTTTACGATCCTAAGGAACAACTGATGCCTGGTA
TATTTGTATTTAGTTGTCCAGGGTAACCACTAATGTCACGTGAGTTCATT
ACATTTGGTTGCACAAAGTAGCCAGTAATACCAGGTAACTTAATCTTTAG
TTGTACCAGGCAATCACTAATGTTAAGTTAGTTTATTATATTGGTTGTCC
AAAGTAACCAGTAATACCAGGTACATTTGTTATTTGTTGTCCAGTTGTAA
CTTGCATGTCGCAAAACTAACGCTTTTTTATATGTCTCTTTCCATCTTTC
TACAGACAAAATTGTGGGAAAACTTGGAAATATGGCTGGTAAGATCTTAT
AAACAGTATTTTATACAGTTACAACGTGCATGTCGCGAAACTAATCTGCG
ATGCTTTTTATATGTCTCATTCCATCTTACTACAGGTACAGCTTGCAATA
AAACTGGACCAGAGACTAAATGAAACGTTCTGACTCAGTTTGTCAGGGGT
GATTGATACAAAAAATAGATGTAGCAGAAATTTTAGATATAGGATGCATA
TTTTGAAAAGTTACAGTTGTTTTGTAAAACTAACATAGGTGTATCAAAGA
CTCCACAAAACGGCATGAGCCAATAGCTCAGAATGCTTGTAAGTCTGCCG
AAAGCATCCAGTAAACTGCTACCATTAATAATAGCCAAGTCATGTGTTGG
TTTACGATCCTAAGGTACAACTGATGCCTGGTTAATTTGTTTTTAGTTGT
CCAGGGTAACCACTAATGTCACGTGAGTTCATTACATTTGGTTGCAAAAA
GGAGCCGGTATACCAGGTAACTTAATCTTTAGTTGTACCAGGCAATCACT
AATGTTAAGTTAGTTTATTATATTGGTTGTCCAAAATAACCAGTAATACC
AGGTACATTTGTTAGTTGTTGTCCAGTTATAACTTGCATATCGCAAAACT
AACGCTTTTTTATATGACTCTTTCCATCTTTCGACAGCGGAAAAAATGGA
TGAACTTGAAGAAAAGGCTGGTAAGATCTCATATACAGTATTTTTTACAG
TTACAACGTGCATATCGCGAAAATGATCTGCGATGCTTTTTTATATGTCT
CATTCCATCTTTCTACAGGTACAGCTTGCAAATGGGTCAGAGACTAAATG
GAATGTTCTGACTTAATTCGTCAGGGGTGATTGATACAAAAAATAGATGT
ATCAGACACTTTAGATATAGGATGCATATTTTGAAAAGCTACAGTTGTTT
TGTAAAACTAACATAGGTGTATCAAAGACTCCACAAAACGGCATGAACCA
ATAGCTCAGAATGCTTGTAAGTCTGCCGAAAGCATCCAGTAAACTGCTAC
CATTAATACTAGCCAAGTCCGGTTTTGGTTTACGATCCTAAGGAACAACT
GATGCCTGGTATATTTGTTTTTAGTTGTCCAGGGTAACCACTAATGTTAC
GTGAATTCATTACATTTGGTTGCACAAAGTAGCCAGTAATACCAGGTAAC
TTAATCATTAGTTGTACAATGCAATCACTAATGTTACGTGAATTCATTAC
ATTTGGTTGTCCAAAGTAACCAGTAATACCAGGTACACATGTTATTTGTT
GTCCGGTTATAACTTGTATGTCGCAAAACTAACGCTTTTTTTTATGACTC
TTTCCATCTTTCTACAGAGGAAAT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000044:1273587..1288560- >transcript:BL90100_cuf1 ID=transcript:BL90100_cuf1|Name=transcript:BL90100_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2400bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000044:1273587..1288560- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAGTGTGTCCCGAGCCCTTCTGCTGACCGCCCTGGTCGTGTGTGCTGT
TGACTTCGGTCAAGCATTTCACCTTTCAACTCCACCTCGAAACCGTCCCG
GAACCCCGAGAGATGAAGACCCTACTCCCGTTTCTGGACCGGAGAATGTT
ACGGCAGCAATTCCTGGACGTGAAGACCCTACTCCCGTTTCTGGACCGGA
TTATGTTACGGCAGCAATTCCTGAAAAGGAGAATATTACAGCAGATCATG
GAGAAAGGGCTGAGGAAATTATGGGAAAACTTGAAGAAAAGGCTGAGGAA
ATGAGTGTGTCCCGAGCCCTTCTGCTGACCGCCCTGGTCGTGTGTGCTGT
TGACTTCGGTCAAGCATTTCACCTTTCAACTCCACCTCGAAACCGTCCCG
GAACCCCGAGAGATGAAGACCCTACTCCCGTTTCTGGACCGGAGAATGTT
ACGGCAGCAATTCCTGGACGTGAAGACCCTACTCCCGTTTCTGGACCGGA
TTATGTTACGGCAGCAATTCCTGAAAAGGAGAATATTACAGCAGATCATG
GAGAAAGGGCTGAGGAAATTATGGGAAAACTTGAAGAAAAGGCTGAGGAA
ATGAGTGTGTCCCGAGCCCTTCTGCTGACCGCCCTGGTCGTGTGTGCTGT
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ACGGCAGCAATTCCTGGACGTGAAGACCCTACTCCCGTTTCTGGACCGGA
TTATGTTACGGCAGCAATTCCTGAAAAGGAGAATATTACAGCAGATCATG
GAGAAAGGGCTGAGGAAATTATGGGAAAACTTGAAGAAAAGGCTGAGGAA
ATGAGTGTGTCCCGAGCCCTTCTGCTGACCGCCCTGGTCGTGTGTGCTGT
TGACTTCGGTCAAGCATTTCACCTTTCAACTCCACCTCGAAACCGTCCCG
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ACGGCAGCAATTCCTGGACGTGAAGACCCTACTCCCGTTTCTGGACCGGA
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GAGAAAGGGCTGAGGAAATTATGGGAAAACTTGAAGAAAAGGCTGAGGAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000044 | genome | Sc0000044:1273587..1288560 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL90100_cuf1 |
| Biotype | protein_coding |
|
