Blg01647.5 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01647.5
Unique NameBlg01647.5
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000168:593227..626347-

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg01647.5 ID=Blg01647.5|Name=Blg01647.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=33121bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:593227..626347- (Branchiostoma lanceolatum)
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GCTAACACAGAGGAAACCTTACAGATGGCTTTTAAGGTAACAATTCAAAT ACAAAATGTAAACAAGTGGGCTGTGCTTTAAAATCTATAATACATGTATC TGTGTGTACAGTGTATTGATCGTGATAGTGCTATTACATGTTGTTGTTCA GTTTAGATGTACATGTAGTATTGTTTTATTGACCTAATCCATCGTGTTTG AGGATAATGGTAATAGACATGCACACCGTGATAAATATAGTATTAACATA CACACTCCTTACAAAAAATGGCCTATTTGCAATTCTTCAAAATTGATGAT GTAGTCTTGCACAACTAAAATTGTTAAAATGTAGTTGCACCATGTAAAAT GTAGAAGTAGCATGGGATTCTTTAGAATAAGCTTTACAGTGACGTAGATT GTTAATAGACATTTCAGATTTGTAGATTAACTGAGACTTGCTAAAGGTGA TCCTTTTCTTCTCAGATGTTTGACACAGAGGGCAATGGTAAGATCACAGA AGACAGCCTGGCAGCAATTCTGCGCAGTGCGTTCAACATGGAAAAGATGG ACATTTCTGATCTCTTCAAAGCAGTTGACAAAGATGGGAATGGTTTTATT ACTTATGGTAAGTGCCAAATATTTGTTTATTTCGNTTTTATTACCTATGG TAAGTGCCAAATATTTGTTTATTTCGCATAGCTTGTAAACGTCTTTCGAG CTTAACGTACCAATTTTGTACAAGGTTTGATCCACTCACGCCAGGATGGA CACCTACTCTTTTCAATTAATGTTGTGGGATTTGAACAAATTGATCGAAG TGCGGCTCTCCGCAAACACGGAACCCACGGCTTTATATCCCAATGAAAAG GATGTCCCTGACTAAAGCTAGGTACTCATTTTACCTGATTTGAGTGTAGA AATAGGTGTAAAGTGCCTTTCCCAAGGGCACAGCACTGGGGCCTCCCAAA 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ACATAGTTATGATAAACAAAAACATGCAAGGCCAATAGGATTCATTCTTG AGAAAGAGAAATAAATTCGAAACCGGTCGAATTCCGTTTTAGCGCTGTCA TTGTCCCAAAGCTACGATTGATGCCAATAGGAATGCCTGTTTCTCACAAA CATTTGCCGTTCCTTATGTTGATCGCATTCCGGTAATCCGATTTCACAAG CTCTTCAGCTCTTCTTCCTTCGTTTAACTTTTAAATTTACAGTGACATTA CAGTTACCTTTCTTCTATATGAAGCAAAAACCACCTACCGGTAAGACATG AGGTCCCGTTGGACAGCTCGTAGTAAAATGACATTTGGGGAAGCTACCTT TTAAAGATGGGAGCTTCCAGTCAGGTGAAGGCGCTAAAACCTCCTTGGTT AGATGTTGAATGTGAAAGGGTTATCCCTTCATAGGAAGAGATAAACAGGA AATGAAATGGTCTTTCGGTGACGTTATTAGGAAAGCATTAACTCCTGATG TGCGTCAGTCGTTTGAATCCAGGGGTGCTCTGACAATTTACGATGGATCA CAACACCTGGGACCCTCAGGGAATTAGCGGAAAGCCGGAAATTATTTGTT TTTGACGGCACAGGGAAAATAATCTCCAAGCAGATGTAGAAAGGCAAAAT TGTAGCGTGGCCCATGGATATACTAATACTGCCTTGGACGACATAACGAT GTCGCCATGGGAAGATCTGCTCGGAGATTGTAGACCTTTCTTTGTTTGTG ACAATGTAACAATATTCGCTGTTTATTTCTTCTTTTTACTTCCCCGGTGA CAATTGAAGGTTCAATCATGTTTGGTGTTTCTTTCAATGATGATGAAAGT GGATGTTAAATCTATCAACCAAAACGTTGGGCAATTCATATTTCGCTGCC TGTAGAAAAGAATTCGAACCCAGCAATATCTAGAGGTAGAGGTAAATTTA AAAAAGTTCTAACACCAGTTTTTCAGGCTTTTTACGTATTTTCTTTGTCT TCTCTGTGTCACGTATACCCACGTTGTTAATCATTGTTTTGATTACAATA AGCCCTCTGAGATGGATTTGCAATAAGATTATTGTTACTAAAAGGGAACA AAGACTTCGACAACGACGGACTAATGAACGGTAGAAAGATCACAGATTCC GGCTTTAATTTACACGAAATGTAGAGACAACAGTCAGGAATCTTCAGTCA GTAATCTTCAGTCAGTAATCTTAGAACTCATCATGCGCTACAATTACACA AGACTTCAGCGTTGGAACAAAAGCGATGTCAGACAATACGGTACGTTTTT CTGGCTGTTGAAATGGACAGGTGCTCCAGCGATGATATCGTCGATAGACT CGATACTGTACATGCTTACTATCAGTATGTCCTATGTTACATTATATTAC ACGTACAAAATTAATTTTTCCAGCGAAAATCTGTTTTCAATCCAGGTAAA ATGTTCTTGGCTCCATTACGATGGGCAAAGTCTCTGAAACGTCAGTTTGC CAGTGATGTCTATACACAATTTCCTATTGATTTATCTCAACCATACGGAT ATACCATGTGCTTATTCATAACAACGTTGTAGGTGACATTGCCAACCTGA TATACTTGTTCAATGTTCACCGTAGCGCTGGCAAGGAGAAATTGGTATAA ACATGTATGAAGTGGAGTTCGCCAGACGTCCGGGAATAAGCAGGTTTTGC TGGAGCTTCTTGAATGAGCGAGTGACAAAGGTACATCTGGCGATAGATAA TATAGCACTTCCGAGTCGAAACTTTTCGCCAGACATTGTGAATGGACACA TACATCTGCAAGAGAGATATCCTTCTATACATGTATCGCCATTGGTGTGT TTCTCATCTTTAGTTCCAGGTACAAAGATAAAACAGTGGAATGTATATCT AATTGATAACAGGAGATTCGTGCGATCGCCAACTGAATTCTTGTGATAGT CGTACACGTGTCGTGTGAAATTCGAATTCGGCTGTCTTATTACAAAAAAG CTGTCTTAAATCCTTGTTGGTGGTTGCTTCAGTCACAGCCTGCTTGAAAA TCCTACGACATTAAAATTGTACGACGACCTACGACGAACGCAACCGCGCC CTAATGTAGTGTTGACGAAACAGAAACGTGGGCGTAATGTCATCCTCAAT CTAACACCTGGGGCCTTGACAAGACATCGATTGTTTTTTATCACTTGTTA TGCTTTTAAGGTTTGATTGCCGAGCAGATGTTCCATAACGAAATTATCAA ACATCTCTTGCTCTGCATATTCTGTAAAGATTAACGTAGTGTTCCCCAAA CGCAAACAATGATCTCTCGTACAGTAAAAGTCTCCAACGTGGTGTACATG TGAATAAGAATGATATTAGTACAAATTGTTAAGGTATACAAAATAATTCA CAGTTTCAACAGCACAATGTTCTGTATAAAGACATTACCCGATTTCTCGA TATGCGGCCAAGTATCAATTCTGGCAATGTTGCAGTTTTATGGACCAATG GCGCTCCAGAGATCTGTCCACTCATGTAGCAGTGATTTCAACAGTTCTCT TCATAAACAGGTACTAGTACATGTTGGCTGTTCCTTGTAAGCATAATGTG GTGCAAGATGTTGGATTTGATTATTCTGTATATTCCCCAAGCATAAGTTT ATCACGCAGTGAATGTTATCTTTTCCATCATATTATGGTGGTGTTGGCAT TATTACTCTCAACTAGATGTCGACATTGCACAAATGAATCTTACTGGTTC GTGTGAGAAATTTTACATATTCTGTAAACACATGTAGAAGTTCAATGTTT TTCTTGTAGATCAACGTTTTGTCATTTTACAGTTGTGTCACTTGCACGGC 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AGTGACGGATTCATGTAACCCGGCGGATTAATGTTAATGGAGGTTACCGC GTTACCTTCTCTCTCACCTCTGTGGGATGTATGAAGGCGTATAGTCAACA TTTATGAGTCCGTTCCTCATGGCGTCCTCTGCAGGGTCGTAGCGGCCGCC GTTGTACTTCCTAATTTGGTCGTCGCTGAAGTACCTGTCCACGGTCAAGT AGTCTTTGCTTATCCTGGAAAAACATACAGAAAAAAGTGGCTATAAAAAA ACTTACATCACCATGGGGCATGCCAGAACCAAATATGAGATATTTTTCTT GGGATGCATTCGTGGGATGTCGCATAGGTGGGATTTTTATAGTACTTTAG ATTTTTAAATCGGGCCCGATACTATCAAAAAAGGCGGCTCCCCCAGTGAG GCGTCGCCAAAAAGAGCTGGCCTTCACCAATCAGACGCTGCCATATGATA AGGAATTAATGCATATGTCCCATTCTGAGGTGTATATGGTGACTTACAGT TGATCGTTCTTATAAGCACCGAATAAAACCACCGAATGAGTGAATCCCCT TATGGTATACATGTATCAATAATGACAATACAGCACTCTGGGTATTTTGA GATCAGTCTGTTTTCCTGCGACCTCTTTTAGGTTCATTGATGTCATCTCC ATATATGAATTGACACGGCCCGTCTCACGTGAGCTGTCTTATTACTGTCC TCGGTGGACTGTATTCGCTTGCTGGCAAAAAAGTAGTACTCCGCTACAAT TGATGACAGAACAGACTATCCAATAATTTCTTCTGATAATTTACATCCCT ATGTTTAACATTCAAAGGTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000168:593227..626347-

>Blg01647.5 ID=Blg01647.5|Name=Blg01647.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1365bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:593227..626347- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGCATGGACACATCCAAACCAATGACTGGCTGGAGAAAGTTTTGCAA
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ATGACTTGTGCGCCACATTCCACCTACTTTGACATCATCACTGTCTTTGT
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GCAGTCTGCAGGTGCATGGCCACAGATTATCATCTTTCCAGAAGGCACCT
GTACTAACCGGTCCTGTCTTATCAACTTCAAACAAGGAGCATTCTTCCCA
GGCATGCCTGTACAGCCAGTAGCCCTCAAATACCCAAACAAACTGGACAC
GTTTACATGGACGTGGCAGGGGCCTGGAGGATTGAAGATCCTTTGGTATA
CATTATGTCAGTTCCACAACAGGCTGGAAGTGGAGTTTCTGCCCGTCTAT
CATCCAAGTGAAGAGGAGAAAAAAAATGCTAGGCTATATGCAGCCAACGT
ACGAGCTAAGATTGCAGCTGTCCTGAATATCCCCACCACTGACCACACGT
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CTCTGGAAGGATTGACTTCAGGGAGTATGTCATTGGCCTGTCTGTGGTGT
CCCAACCTGCTAACACAGAGGAAACCTTACAGATGGCTTTTAAGATGTTT
GACACAGAGGGCAATGGTAAGATCACAGAAGACAGCCTGGCAGCAATTCT
GCGCAGTGCGTTCAACATGGAAAAGATGGACATTTCTGATCTCTTCAAAG
CAGTTGACAAAGATGGGAATGGTTTTATTACTTATGATGAGTTTGAAGCT
TTTTCCAAAGTCCATCCGGAGTATGCAGGCCTGTTTAAGACCTACCAGGA
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TTGAAGAGGATAGCCCTGAGTTGGAAGTATTGGGGAGTCCAGTGGAAGGC
AAGAAAGAAGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01647.5Blg01647.5-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg01647.5-exon-Sc0000168-1570713199:593227..593230Blg01647.5-exon-Sc0000168-1570713199:593227..593230Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000168genomeSc0000168:593227..626347 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01647