Blg01647.4 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01647.4
Unique NameBlg01647.4
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000168:597772..621338-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01647.4 ID=Blg01647.4|Name=Blg01647.4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=23567bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:597772..621338- (Branchiostoma lanceolatum)
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TGTTTCCCTTGATGTCATCTACAATGAAAACAAAAGAAGCAATTCTTGTA ACAATGCTGTCTTTGTTACCATTCAAGAAAAACCAGCGTTGCAAGTTTTC TTCAGTTGTACCTTATATGTTATATTCTACATTTGACGTATAATATNTGA TGTATAATATTATGATGTAATGTAATATATAAGATATTATACATTAAGTG TACTACAACAGTGGTTGAAAATTTTCCTCACATTTTTAAACCTAATGCAA AATGTAGAAGTCTCTTGTTTGTTGTCCCCAAAATGCCATATTGTTCATGC ACATATTCAGGTAAGTGCACACAGCACATGCTAACACCAGCTTAGCACAA TCCTCTTTTTTTGTGCCTCCATTTATCTGGATAAAAGAATTTTTTTTCAT AATCCCAGTAGTATGTTTATTAGTACATATAATTTGTAGATCTTGGGTAA TCACTGTACCAGAGTGCTACAAATGGCAATTACTAAACTGCTGGTTTAGA CTGCAGCTTCCAACATAAGTCGAAGTCTGTGGTGGAAACTACATTGTTAG GAGGAAGATGCCACTTTTGAAAGGAGTTTCTAATTTGACCTTTACTGTAT TACTGTTATCCTGAAAACAAATTTTGAAAAGGCATTTTGGAAAACATTTG AGCCAATAACTTACCTAGCCCCATCCAGCAGTGTATTGGATGTTAAGGTC AATATTTGGACTTTGCTTTGCAAATCTCTGTCTAAACAAGAAGCTTTTTA TTCTTAATGTAAGCCCCTTGGATTTGAAATGAAACTCAGGTAACACACCA CAACAGAAGTAACTGATGTTCACCAATATTTTATACATAAGTTGCAGCAA CTGCACATGTTGCCATATGGTGCACTTTAAATAGGGGTATTTTTGAAGAC CTGCTCAAATTTCATGTATGAACAAGATGACAAATACATTTACTTAATGC TTTCCGTAATGGCTAACACTATAACCAAAATTGGCTCGCCCGTTCGGTTG AGAAGGTTTAGGTGATAAATGTATCTATCACTTGTCATCTGTTGACAGTG ATGTAGATGTTCATAATGAGGAGACAATAAATTTTGTCAGAAGCAGGATT AAACTTAATGGGACCTAATTTTTTTCTGTTTTTTCAAGGAATTAGTACTT CTCTACTTCAGAATCTATTATGCTCTTTGCTCTTTTTGAGGTCATTTTAA CATTACTTCCCGGCTGAATTATCACACAAGCAATGTTTCATTTGAATCGG AATAAAAAGAACCTCTAGAATCATCGAAAATCATATTCATTTCGGGCCCT CTTTAAGTCCCATTTTCCCCATTGTGTTGAAAATTATACAATAGTTAATG TATTTGCATTCTAATAATTGTTATATCATATATTATAATAGATGAACTTT CAAGCTAACAATACATTTTGTAAATCTGTTTGCCACTACGAGAATTGTGT TTCAGGCATATTGTATTGCACTGGTATATTATTACGTACACATACATAGC TTTGATGAAAATTCAACCTAATCTTCAGAACTCCACCATGATGTTTCATT ACTCTCCCCTGTATCATTTTTAATATAGGATGGCTCTGGAAGGATTGACT TCAGGGAGTATGTCATTGGCCTGTCTGTGGTGTCCCAACCTGCTAACACA GAGGAAACCTTACAGATGGCTTTTAAGGTAACAATTCAAATACAAAATGT AAACAAGTGGGCTGTGCTTTAAAATCTATAATACATGTATCTGTGTGTAC AGTGTATTGATCGTGATAGTGCTATTACATGTTGTTGTTCAGTTTAGATG TACATGTAGTATTGTTTTATTGACCTAATCCATCGTGTTTGAGGATAATG GTAATAGACATGCACACCGTGATAAATATAGTATTAACATACACACTCCT TACAAAAAATGGCCTATTTGCAATTCTTCAAAATTGATGATGTAGTCTTG CACAACTAAAATTGTTAAAATGTAGTTGCACCATGTAAAATGTAGAAGTA GCATGGGATTCTTTAGAATAAGCTTTACAGTGACGTAGATTGTTAATAGA CATTTCAGATTTGTAGATTAACTGAGACTTGCTAAAGGTGATCCTTTTCT TCTCAGATGTTTGACACAGAGGGCAATGGTAAGATCACAGAAGACAGCCT GGCAGCAATTCTGCGCAGTGCGTTCAACATGGAAAAGATGGACATTTCTG ATCTCTTCAAAGCAGTTGACAAAGATGGGAATGGTTTTATTACTTATGGT AAGTGCCAAATATTTGTTTATTTCGNTTTTATTACCTATGGTAAGTGCCA AATATTTGTTTATTTCGCATAGCTTGTAAACGTCTTTCGAGCTTAACGTA CCAATTTTGTACAAGGTTTGATCCACTCACGCCAGGATGGACACCTACTC TTTTCAATTAATGTTGTGGGATTTGAACAAATTGATCGAAGTGCGGCTCT CCGCAAACACGGAACCCACGGCTTTATATCCCAATGAAAAGGATGTCCCT GACTAAAGCTAGGTACTCATTTTACCTGATTTGAGTGTAGAAATAGGTGT AAAGTGCCTTTCCCAAGGGCACAGCACTGGGGCCTCCCAAATTTGAACCG AGAACCTACTTGTAAGTCAAGAACCCAAACAACAATACCACTGTTCCAAG TGTTGTATTCACTATGTAAGTTTGAGGCTAGAAAAGTTATCCTTTCAGTA CTACAATTCTATAAAAGAATTGGGGTTTTTTCAGTTTCACAGTACTAGTA AATATTCATATGTTTAAAACCAGGAAAAGAATGAAAGTAGCAAAGAACAA AGACATTCTTGTGACTAAAGTCCTGAATTCTTTGCCTCAACTTTAGATGA 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AGAATGAATACATATTTTGCTTAAGAAGTCCTTTTTTTAGAATACAATGT ACATGATGATGAGGATAAACATGCATGTATTAGGCTCATTTTGGGAGGGC AGACCACTATCAGAAAGCCTTAAGTTTTATTATTAAAGTAATTCTGCTTG ATTAGCTGTTCCGCTTATGATTTTGCCGAGAGAAACAGTGTAAATGTTCT TGGCAGAGGACAAATACAGGAATGAGCTTTCACTCTCATTACATTGTTGT GACCAAACGAGGAGGAAACGTGCCAGTATGTAAGCTGCTCATTATCAGAT GGATGATGATGCAACAAGTCTGTCTAGTTTGTTTTAACCTTTTCCCTGCT GTCTTACTCTGTAACCGATGGGGAATAGGATGCCAAACAGCTACTCAGTG TGCTAACGGTAAAAGAAAAGATTTCTATGTTGTTTTTGATATGCTGCTTT TTGCAAAGATATGCAGTAACCTTTTCCTTGAAGTTGCGATTTTGCATTGC AGAACCTTTGGTAATATATATTTCATTGAAATGTGTTTGATGAAATGTAT GCAAAGGTTGCTTTAAGGGGCAATTGGTGGCTAATATTTTGGCTGGTATT CATTGTATCCAAAGTAGGGTACTTAAATGTTAAAGAGTGTGCAAGATGCT TGCCATATACTGACATCTACAGTAGCTTCATATCATAAGCTTTGGTGGCA GCCACTTGTGTTATTATCGTTGGTGCTATACGCCTTAGCAATGTTGACAA CCAACACTTATGCATGCTTATGTTTGCAGCCGTCAAGCCATATACAGCGC CTGCAATGTTTTTTATTTCATTTGTTGCACGTTATGGTCTTTACTTTAGA GGGTGTTATCATTATGGATTGATCACAACACTGATAATCAGGGTGAAAAC TTGTTTTAGAAACACCACACTTTAGTAATGCACTCACTTTGTTGCATATT TAGTTCAATGTTTTTATATAAGATGTGATTGTATATATGCATGTAATGTA CTTTTGTACTTTTATTATGTATATAATGAGTTTCTAAGCTTAGGTAATTT TAATTAGCAAGCCACATACAATGAACATGGTTGTGTAATATATTTTTAAA TGGATGCATTGTACTGCTAAGAATATATTTCATATCTGGGTTAATCGGAG TTAAGTTTGAGGACTAAGGTATTATGAATTGCACTATTTCATACACAGCA TATTGTATTAATTTTTTAAAAGTTAACTTGTATTTACAGCAATTTTCATG GTTTCTAGATGTTTGTCGCTGAAAGAGGTTAAAGTAAAAGAACGCATTAA AAGGAGGCTATTTTGAATGACTATTTTGTATCCTTGGGTGCTGAGTACTA AACATATTTTTAGGTGGTGTGACCTATTGCTGATTTAGTGATTAGCTAAA GTGTCAAGGCAAAATTTCTAACGATTATTTTCACAGTAATGATGTTTCAT TGCTGTTCGACCAAGGTTGGACAAAGGATATGAACTATGACAGCGATACT TAATAGACAGGATCCACCGACAAAGCCAATTCGTTGGTGCGACTTATTGG GAATTGCGTGTTGGTTAAGTCATTTGTGCACGCAATTGTCATATTTTGCC GATTTCAATGTTGATCAACTGCAAATTCCAACCATCGCAATACATAGTTA TGATAAACAAAAACATGCAAGGCCAATAGGATTCATTCTTGAGAAAGAGA AATAAATTCGAAACCGG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000168:597772..621338-

>Blg01647.4 ID=Blg01647.4|Name=Blg01647.4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=654bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:597772..621338- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCTGATGGTGGCAGCAGGGAAGAGTGACATGCCCATGGATGCAGGATT
GGTTGAGTTCCAGAAGCTCCGGGAAAAGCTGGGCCTTAAACTGGAGGACA
TGCGCCAACTACTGAAGCAGTACAGCAATATTGCTGAGAAGGAGGGTGGT
GTGATTGGCATTGATGACTTTGCTAAGCACTTGAGCCTGCCTGTCACAGA
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AACACAGAGGAAACCTTACAGATGGCTTTTAAGATGTTTGACACAGAGGG
CAATGGTAAGATCACAGAAGACAGCCTGGCAGCAATTCTGCGCAGTGCGT
TCAACATGGAAAAGATGGACATTTCTGATCTCTTCAAAGCAGTTGACAAA
GATGGGAATGGTTTTATTACTTATGATGAGTTTGAAGCTTTTTCCAAAGT
CCATCCGGAGTATGCAGGCCTGTTTAAGACCTACCAGGACCTGAAGCATG
AAGAAGAACTGACACGTGTTGAAGAAGAGATAGAAAATGTTGAAGAGGAT
AGCCCTGAGTTGGAAGTATTGGGGAGTCCAGTGGAAGGCAAGAAAGAAGC
TTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01647.4Blg01647.4-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:620353..620478Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:620353..620478Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:618803..618953Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:618803..618953Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:601612..601710Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:601612..601710Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:601041..601182Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:601041..601182Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:597772..600442Blg01647.4-exon-Sc0000168-1570713199:597772..600442Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000168genomeSc0000168:597772..621338 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01647