|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000049:1205976..1215105+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00062110 ID=BlTCONS00062110|Name=BlTCONS00062110|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=9130bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000049:1205976..1215105+ (Branchiostoma lanceolatum)
GATTACTCAATTGATCCATTCAATCATCCATCCATTCGTTCGTTTGGCAT
GCAGTCAACGGCAATTATTGGCATCATTATCATAACTGGGTGGGCCGACT
ACTCTCTCTTCGTAGCCAGGGGCTGAATTGCGGGGAGCTTACAATTGCCA
GGGCTAAAAATCAACGGTCTGGAAAAGTTGACATTCGGCGCTATCTGGGG
AGACCTCAACATGACAGTAATTGCCCAAGGTGCGGCCATAGTATTGTAGG
AAAGGGCCGCTACCAGAACCATCAGATTTTAAGTCAACAACCTTAACCAC
AAGACCGCCTTCACCGCTTGAAAATTATCTGAGACTATATCATGAAAAGT
GCTACGTACCTGGTACTTCACTACATCCGATATCGTAATCTTAGTGTCAT
ACCTGTACGTGTAACCTCGTCTACAGGTCTGAAGGCACTGATTGACGGGA
AGAACGAGAAGGGGTTTGCCTGCTTCAAGGCTAACGACATAAAGGGTGTG
GCTAACCTGTTCACGGAGGACGCCAAGCTCATGCCACCAGGATCGGACAC
TGCACATGGCCGTGAAGGTGAGGATATAGCCGAATTATGGATCATATGGC
TATTGCGATTTGAATCAAATCATATTGGGAAAACTATGATTAGAGACCAG
AAAATCGCCCCCTCTCTGTATCTCTTTCTCTCTATATATTTGTATACAGG
TGTGTATGTATGTATGTGTTAGCGTGTGTGTATTTTTGTGTTTGTTTGTT
TGTGTATGTAGTGCACGTGTGTGTGGGGGGGAGCAATCTCATCTTTTTAG
CCATTTATTCATTCATCTTAAAACACATGGGTAGTCTCTTTAGCCAAACA
AAGACTGATTTCCAAGAGAGCCCATAGAGGTACAGATAATAGAGAAATGT
AATCACATAAAATAATGATCAGACGTAAGAATACATACAGATACAAAATC
AACGTGTCAAACAATAACACTGGAATCATTAAACAACAACAAACAAATGA
TCTTGAGAGGTCAAATTCCATAATATGAACATAAGGAAATGATAATACAG
AGCAGTAACATAGGAGTAATATATCATGTAATAAAATCAAACTTAATGAG
CAAAAGTAACCAAACAAATATAATGGGTTGTCAGTTGATGGTCAATAGGC
GGTTAGTATGCTGATTTTAGTCTCTCTTTAAAAATGTTGAGGTTTGGTGC
TTGTTTAACATTCGGTTTGAGTGCGTTGTAGGTTACGGTCGCTCTATATG
CAAATGTGCGTTGATCTACATTTGATGTGTAGCTGGGTCTGTGTAGTAGG
TGTGATTGTTCAGTGTGGTAATTATGGATTTGGTTATTATAACTGAATGT
GTTGAGTAGATAGCTGGGGGCTAATCCATGCTCATCGCCAAAAAGCACTT
TGAGTATAATAAATTACCAAACTGTATTGACTGCAGGCGTAGAGAAGGCG
ATATCTGGTTATCGGGCGGCTCATGGTGTGACGACTTTGAAGTTGAAATC
AGAGGAAGTTGGACCAATGGGCAGTGACTTCACTTACGACCGAGGCACCT
ACACTGCAAAAGCAGAGGACGGCACCGTGGCCGACACCGGCAAGTAAGTC
AACATGTTTACGGCGTGTGTGTGCGTGTATGTGTGTGCGTGTGAACAGCA
TAACTCGAGAAGTCGTCAATGAACCTTTAAATATTTGGTATGTTGGTAGG
GTTTGCAGGAGGAAATAATAAAAAAAGAAGACCAACAAAGTGATATGTTA
TTCATGCAAATTAGGACCGAATTTGCATAATCAATGAAGAACATTTATAT
TTCAATCGTGCCTAATATCAGGAACTATCATACTCAGTACGTACGTAACT
TTCTTTGAGAGGAATATAAATAATGCAAATTATGACCTTACTTGCATAAT
CAATTAGAAAACTGTTTCATACGTTTGTGGTAAATGATAACATATACGTA
TAAGTGACACATGAAGGTTAGATAAAGGTGAAAGGGAAAGCTTTCTGGGT
TTAATGACACAGTATTTTGCTATAAAAAGCGTGTTGTTTCTCCAGGCTAA
ATGCTCTATAAAACTGCTTACGTGCTGAGTCTAGCTCGCTCCGAACATTT
CAGTGCATATCATTTTCTATTTTGAATCGTTCTGACGCTACACAAAAAGC
GACCAAACCTGAATAACTTGTGCCTTTCACCTCATCTTACCTATTGCAAA
TGTCTGCAGTGTCTCTAATGTACTAGCAACATGCTGAAATTGTAGTCATG
TTAAGAATATAACTTCAAACATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGAACAGCATAACTCGAGAAGTCG
TCAATGAACCTTTAAATATTTGGTATGTTGGTAGGGTTTGCAGGAGGAAA
TAATAAAATTGAGAAGACCAACATAGTGATATGTTATTTATGCAAATTAG
GACCGAATTTGCATAATTCATGAAGAACATTTATATTTCAATCGTGCCTA
ATATCAGGAACTATCATACTCAGTACGTACGTAACTTTCTTTGAGAGGAA
TATAAATAATGCAAATTATGACCTTACTTGCATAATCAATTAGAAAACTG
TTTCATACGTTTGTGGTAAATGATAACATATACGTATAAGTGACACATGA
AGGTTAGATAAAGGTGAAAGGGAAAGCTTTCTGGGTTTAATGACACAGTA
TTTTGCTATAAAAAGCGTGTTGTTTCTCCAGGCTAAATGCTCTATAAAAC
TGCTTACGTGCTGAGTCTAGCTCGCTCCGAACATTTCAGTGCATATCATT
TTCTATTTTGAATCGTTCTGACGCTACACAAAAAGCGACCAAACCTGAAT
AACTTGTGCCTTTCACCTCATCTTACCTATTGCAAATGTCTGCAGTGTCT
CTAATGTACTAGCAACATGCTGAAATTGTAGTCATGTTAAGAATATAACT
TCAAACATTTTCTTTACATTTTACAGGTACGTTATCATNCTTCAAACATT
TTTCTTTACATTTTACAGGTACGTTATCATCTATAAGAAAGTTGGTGGAG
ACTGGTTAATCTACATTGACATCTTCAACACAAACAAAGCCTGAGGATTC
TAGATCTACATTCACAAAAAAGGAAGAGCGGCAGAGAGCTGGACGCGAAA
AATGAGTCACATAGAATAGAGCAGCATTGGCTTTTCCGAGTCTGGCTTTA
ACCTCAATTATCAATATTGACTGGTCTTGCTGAAATGAATTAGCCCGGCA
CCCATCCTATTCTAGTCCCGGTTCGCTCCTCTGATCGCTTCCGAATTCCC
TTGCCAGCGATCAGAAGAGCTATCCAAAGCTAGAAAAAGATACATGTAGA
TACCAGACTATGATATACAATAAATGGCGATCAATTAAGTTTCCGATTCT
GGCTTGATTTTTACTGACATGTAATGCCTAGCTAGCCCCACAACACGTTT
TGCTAGTAGACAAAGCTTGCAGTAACATCAAAGTAATATCCTATTGGTAT
TCTGTGTTTGCTGGCTTTTGTAAACACCTCGCTGTTGCATAGTGACATTC
ACTTCGACCTTGTTGAAAAGCGGCCCGTGTGGCTGAACAAGCATTCGAAA
GAAAATAAAGGCTTTGACTTGACTTGACTT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000049:1205976..1215105+ >BlTCONS00062110 ID=BlTCONS00062110|Name=BlTCONS00062110|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=459bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000049:1205976..1215105+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAAAGTGCTACGTACCTGGTACTTCACTACATCCGATATCGTAATCT
TAGTGTCATACCTGTACGTGTAACCTCGTCTACAGGTCTGAAGGCACTGA
TTGACGGGAAGAACGAGAAGGGGTTTGCCTGCTTCAAGGCTAACGACATA
AAGGGTGTGGCTAACCTGTTCACGGAGGACGCCAAGCTCATGCCACCAGG
ATCGGACACTGCACATGGCCGTGAAGGCGTAGAGAAGGCGATATCTGGTT
ATCGGGCGGCTCATGGTGTGACGACTTTGAAGTTGAAATCAGAGGAAGTT
GGACCAATGGGCAGTGACTTCACTTACGACCGAGGCACCTACACTGCAAA
AGCAGAGGACGGCACCGTGGCCGACACCGGCAAGTACGTTATCATCTATA
AGAAAGTTGGTGGAGACTGGTTAATCTACATTGACATCTTCAACACAAAC
AAAGCCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| BlTCONS00062110-exon-Sc0000049-1564993656:1205976..1206542 | BlTCONS00062110-exon-Sc0000049-1564993656:1205976..1206542 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062110-exon-Sc0000049-1564993656:1207412..1207568 | BlTCONS00062110-exon-Sc0000049-1564993656:1207412..1207568 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062110-exon-Sc0000049-1564993656:1214494..1215105 | BlTCONS00062110-exon-Sc0000049-1564993656:1214494..1215105 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000049 | genome | Sc0000049:1205976..1215105 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | BlCUFF030609 |
|
