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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_480:33261..50784+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042579 ID=XLOC_042579|Name=XLOC_042579|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=17524bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_480:33261..50784+ (Clytia hemisphaerica)
AATTCACGTCAATGACCTATCACTGACCATTcgtaaaaaaactttaaaca
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tgttatattttccgagcctttaggcgagaccaatttaatttgttgttcta
cgggcagatcttTAGAAAAacatgggtcggtcggtcggtaaaataagaat
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gtctttttctatgtttccTTTTTTCTCTTGCTGTTATTCTCTCTCTCCTC
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GGGTCAATGGTTTATTCTACTACTGCACGAAGTTGTTTAGAATGGTTGGA
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GTCTATGATTCTTGCCTAATCGTGGAGTTTCGCTACTTTTGATACCTTAG
AGATAAAAATTCGAACTCTTTGAggtatttttgaatgttttcttgCGGGA
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aaaacaatcatatTTCCGCGGTATAATTCCAGCACTAGAAAGAGTAAATT
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ctttttgatTGTGCCGCTCATTTGCTCTTTGTCTGTCAATCTGACAGGTC
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GATTAtctaataactttttttttgcgatgctgaagaaatccaaaaaattt
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CAAAAGAACGACTCATTTGGATCGACGAGCAAAATTGATCAAGGATCGCA
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CAGGTAAGCAAAATTCGGCTAATTGAATCAGGCGGGGGGGGGGCtattag
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tctgaagatatctgacagggccCAAATTAACTGGAAATAGGGAAATAGTT
CTGATAGGGTCccgattttaccaaaaattcatatctgacagtgtcaactt
ttcaaactacagcggcacgtccccgtcggccgtcaaggtcaNAGTTCTGA
TAGGGTCccgattttaccaaaaattcatatctaaCAGTGTCAACTTTTCA
AACtacagcggcacgtccccgtcggccgtcaaggtcagtgcccccagGCA
TCTAATATGTTACTTTGCAACAAGCGTATATAGCATCATTGAAATATCAT
TGAAAGTAAGAATATAATGAACAAAGGTTTTACAAAATGTAACTTTCTTT
TTCAACAGAGCGCTGTTGTGGGAGTATTAACGTTACCGGTACTATTTCGA
GAAGATACCAAAAATTACTATGGAATCGAGAACGCGCCCTCTCCTCGAAT
CGGTCATGCTAACCCTGACACTTTTGAGGATCAAGATTTCTTCATTCACC
TAGATGGCATCACCATAGGAAAGTCAAGAGATCCTCTGACGGCATTGCCC
TATGAAATTGCTCAGTCTTATACAGAAAAAATCACGGTAGTGAATAAATG
AGAAAGATTGAATAATCTTACTGAATAGTAAATAGTNTTATAGAATCGGT
TTACTAGTTTTGTTAATTGTaacttttatttaatttatgATACATCATTC
CATTTATTGAATTATCTGGCTTTCTTCTATATTTATCAATATTGTAAATT
TCATTTAATACAATCTACAAAAATAAAGATAGGAGCTTTGATCTCCCGTA
TTAACTTTATGAGTTATTCGTTCAATTAGTATTCGCTTATTCTAGTGAAG
AAATGATAGGAAATTCAAAATACCTAGGAGGTTTAAGGAAAATACCTTTT
TCGCACCATCACATGTAAGTGATGAAAAACAACCCCGTGGGTAAAAATTA
AAACCGCTTTATCGGCACTTTTGTATCCTTTTGGTGGTGTTTTTAAAGCA
CATTAATGGTAtatcaaacaaattttaccCTAAAAGGGTCGTTTTGCGGT
ATCGTTTGAAAACTACCTTTTTGGTGACTTAGGAATACCTTTTcggagac
aaaaaaaaatttcttttggaagTATTATTTTCATACCTCAAAAGGTACCT
AAAAGTACCTTTAAAGGGTCGTTTTGCGGTATCGCTAAAATAAACCCACT
CCGGAAATGGTCGTGGAAGGTAAATAACTGATGCctattgtaaaagaggg
taaataaatacctttcaccgggtagttaagaaatccaccgggtaatCCCT
TCCTAATTTTACTTTCCccattcccaattaaaaacttccctgtttggaaa
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caccttcccgttcgggaaatatttcccgttaaggcaatagttatCATTTC
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tgctGTTATTTTCTCTCTCCTctattttgatgaatgaaatcaaaatcaaa
acattcgaaaaaaaaatcattaaatggAGATGGTTCTCCTTAAAGCAATA
CTTCGAAACAATCAAAActaaataaagaacttttctgattggttgaagaA
AGAGAAAATATACGAGACGCGTGCTATTTAATTTTTATCAGCTGGATTTC
GTTTTATTTCAGGTGAGGGGATATAGTATAGTgttaattataagaacttt
ctaaATTAGGAAGggatttttacagatttttattttactaaATTGAAACA
CTCAAACATTGTAGCAAAAAAGTCGATAACATCTCGGGAAAAGTGTAAAT
GTCGTAAATAGTGTTTTCATTTTGGCGAGATCGTATGCTGTCTCGAAGTA
GAGCTTTAAGGAGAACATTCTCCctttaaaaagatcaaaaaattcttttt
atgaCTCTTATAAAAGAGCTGTTGTgagtgaaaagaaaaaacagcAGTTT
TTAGTTTTCAGTTCACCAATAACGTCAATTCAGACCATCTTGAATTTAAA
GTGTTAagttttcaattaaaacttaTGACATAgttcaaagaaattttaat
tAGATTTCCAATcctaaaaaaaagttaattccTCACTCTTATAATCGCAA
AAAACATTCAACGAAGACTGTAAGCAGAAATTAAGTAATGTTCTCTGCGA
GAATACAAATGGACATGCATAAAGTAATAATTTGTAGCTTAATGGTTTCC
CTTATCATTAATGGGAATCTTGCACAAGAAATGCAACTTAACTCTCATTT
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CAGAAGAATTTGTTATCAAAGGCTCGGAAATTGAATGCTTGTTAAAATGT
CAACTCAATTATTTGGCGTGCTTCACTCTTGAAATTCTGAAGTTGGGTTT
AACAAGCTGGTTGTGTCGATTTTACAATGTCGATTTCATGAAATTGAGTT
ATGAATCAAAAGAGGGGTCAATGGTTTATTCTACTACTGCACGAAGTTGT
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GACCGTTGGAGAAGAAAAAGAAGTCTTTTGTGATATGACAGGTAAATATA
GTTAAGTTATAGTTAATTAATTTTCTAGCCTAGACTATACAGAGCTTTTC
ATTGACTGAACAATTGAATAGCAAAGTGAAACTGAACCAAATACTAAGGG
AGTATCTTCAAATTTCTCTTGGCAAGCAAAAGTGATGCCTTAAAATTTGA
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GTATGAAATCTTTGCATGTCGCACAGCTAAAGTGGGATAAAAGTGCCTTG
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ATTGATTCTTTAACAATACCTTTAACGTACCTGTATTGCAGTAAACCGCG
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GACATTGATTTCAATCGAGGTTGGCAATCATACAAAGAAGGCTTTGGTGA
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TACTTATTCTGGCGTTTTATTTCTAAGTACTCCACTGATTCTTAACGTTT
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GTATCAGCTGGCCCGCCTGGTTGGGCGATTTCCAATCGTTGAAAACCATA
AATATGgcaataaagaaaatgaattgaATGTCTTATTGATGtattctaaa
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tcaattGCTAACACACCCTTTGTTAACCTATCCGTTCaccaaattttgaa
gaaaagttcAGATAGAGGCTCAGATTATTCAACATTCTTCAGAACGCTTT
CCCAATAAAAAGAGTCAGAATTTCAACCAAGAGTTCACCGatacccagct
ggtacacaacattgtttccacGTTCATCTagcattcacaacgtccattta
acgttggattaacgttgaaataac
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_480 | supercontig | scaffold_480:33261..50784 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| FGL1 | fibrinogen-like protein 1 precursor | Homo Sapiens |
| MFAP4 | microfibril-associated glycoprotein 4 isoform 1 precursor | Homo Sapiens |
| FCN1 | ficolin-1 precursor | Homo Sapiens |
| FCN2 | ficolin-2 isoform a precursor | Homo Sapiens |
|
