Blg00969.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00969.1
Unique NameBlg00969.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:460175..471667+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00969.1 ID=Blg00969.1|Name=Blg00969.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11493bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:460175..471667+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TCTGACGTCATCTTCGATTACAGCCTACATCTGCCAAACATGCAAACCTT ACAAAACAATATGGTCACCAGGGTTTCAAATTATATGTATCAAATCAGAC GTCAACGAAAAGCCTCAAGAGGCAGCTTAACTTGTCAAACAACGCTTCAA GGCCGTCAAGAACAACACATTTACAAGACTCACTTATGATATCACGTTTG TAAGAAGTTCTCTGACTGAAGACTTAAGACCTCAACCATCCAAGCTCAGT CTTTCTTACTAAGTACTTACTTCTTAGTTTTTCTACATTAACATCGGCTC TATCAGTGAGTCTCAATCACAATGTTTCTGACTTAAGGGAGAAGAAATGC TGTTCCAGTCCAACTCATGTAACCCATGCAACCCTTCCCTACTTTATTAG GACTCCTCTTTATTTATAAGCTAAGCCCGCTGCCCAGGGGAAGTACATTT AACACTTATAACAGGTGCATGAATGCGTGTTGGAGAATGGGGAGGAAATA CAGTATCAAGAACATGTAAAACTTTCCTCTTCCTTCACCCAAGAACTCTC TTATCTCTTGCCAGACTGTATTTTTCGTGTTTTTGTCTGTACGACTGACA TAGCAACAACAGGACTACAAAGATCACTAAGCTGTTGCGTCTGTGTGTTC CAAACAGTTCTGTAGTCAGGGCATTTAAGATGTATGCCGAACACAGGAGT GCCCTTATATACCATGTTGTCTTATTTTGTCTGATCTGATTAGGAATGTT TTACATACGCGAGTTAATTATGAATATGGTGGTTTAATAATCTACTGTTG CCTTCGTGTGTTCAAAACAGTCCTGTAGTGCTGTAGTCAGGGCATTTATG ATGTATGCTGAATCGGAGTCCCAGTACTGTGTTGTCTGAGATAATAAGGA ATGTTTTAGGTACATCATGAGTAAAATAAATCATGGCTTCACCAACTGTT GCTCCGTCAAACCGTGTGATCAAAACAGTTCAATCAGTAGTCAGGGTGTT TATGATGTATGCTGAACAGGAGTGCCTTACCATGTTGTCTGACGTGATAA GGAATATTTAGATACATGATGTCATTGAGTTGAATAAATATGGTGGCTAT CAACAATTACCTATGTGTGATCAAAACAGTCCTGTAGTCAGGGTGTTTAC GATGTTTACTGATTGGCACAATCCTATAAACACTGGAGCTCTCTTAATCA CTGTCAGTGTTGTTTGACCTGATAAGCTTGTTTGACATACCATAAATATG ACGGTTATCAACTGTTGCCAATTTATATGCACCATACAGGATATTTCTTT ATACACAACCAGCTGCAGTGACTTCTTACCTGCTGACGTTTTGGTGTCAG CTGAGGTATTAAAGAAGTCACTGGTTGTGTATAAAGAAAACTCCAATGTA TGTTCTACCAACCTGTAGCTGATGAAATTATTTTTGGTATGCTCCATACA TGCACAGTTGTGTAGTCTGAGGGTTTCAATAATGTATGCTGATTGACAGC CTAAATACAGGACAATGCCCTTAGGGTGCTCCCTGATCAGATAAGCCTCC ACTAGGCAAGGCTTTCATATCAAAGGGGTCAAGGACCTGGCTGATCGAGG TGTTTTTGATACTAGAATTTTGCAACAATAGGGGGAATAATTTGCTGTGG GAGAGTTACATGTAGTTCGTGGGCACGTTTTCTGTCAGATCAAACCCTAA ACCAAAATCATTCTCCGTATTCCCAACGTTACAGGTGTGGTTGAATAGCC GGTGGCTTAAGGCATTAGTAGACACGAAATCCAGTTTGATTCCTGTGATC TCTGGCTAGATGTTGTGTCCTTGGGAAAAGCACTTAACACGACTTTCCTC ACTTAAAGTTGATAACAACACACTGCCCCTCACAGACTCAAAAAGACTAT GGAACAACAGTTGTAACCTTTACCTGGATACCTATAACTACAAATGTAGC ATAGTTAGTCTCACTGGTAGAGACTAGATCTGTGATAAGGAAGGTCACAA CAAGTTGTAATGACGAAACGAAGAAGTCTATGGGACTACCTTTATACCTG TTGTAACCTACAGCCAGCATACGTGCATGATTAGTCAGATAAGGATTGCT ATGACAACAGGTTGCTATGACGACGATTCGTCCCTGACCCTTTACAGTTG TTTAGATACCTGAGTGCATTACTCACATCCTGCCTCATGAATATGCATAA GCCTAATGTGCTGACGTATTTAAGCAAGAAGGATGCTGATTGGATGCCTG AAATTAGGAGGATAGCAAACTAAACCAAGCACTTTTGTGTCAGATACAGC GATTGGTTGAAATAATTCGGATTAGTAGCATGGATAGATACTAGACTTCC TTTCTGGGCACACCCAATTCATTTTCACTGACACCACTTGGGGGTAACAG ACGTCTAGAGAGGTGGGTCTGATTCTGAGGTGTTTTTCAGTCTTTACTAC ACTGCAGCGCACAGACTAAGTACTGCTATACCCTGTATTACAGACTACTA ATTAGTGTATCTTTACAGGCAACAGTTCCAAGTGTTGGATTACCCACTGG AGGGAGTAGTGCAGTCTACTGATTGAGAACAGAACCTTGTCCCGCGATCT GAACCAAGGTTGGTTAAAATCTCTTACTACTACTCTCTCACAGTCTTCGT TTAAGCTGTTGTCATCATTCTGTGCTTAAGTCTGATTCATTCTGGCGCAA GTTGCTTGAACAGACTTCCCTTGGTGCACATTGCTTCTATGTAGGTGTCA GGGATTAAAAACCAAGTTCACACCTACTAGTACGTAACAGGCGGGTCAAA AATCAATCGGAAGTCCCTATTTAATATTGGTTACGACACTGCAACGTCAT GTAGACGTGCCACAAGTGGTGAATGATAAATAATAGATGATTCCCCTGTG CAATCGTTCCATTATTTAGGGGGAGAGGATTCTTTTTGTGAACAAAGCAC ATTTCTTTGTTCTAAAAATGTTTTACTGTCCTTACATAAACTTGATTGTT CACTTGGTGGTTTAATAAAGATTTATTTGTGGCTGGTCGCTAAGTGTCAT GCAGGCGATAAGGCGTCTGTATTTATCTTTCGCACACTTTGCAGCCATAA ACTTTCAATTTAGTGTTCAAGCCAGATCGGACTGTTGGCATCTTTGGACA TTACTTATCTGAAGTGATTTATAATGTCTTTGACTGTGTCTTACATGTAC AGTGTCTCATATATGTGTATTGTAAATGCCTTGAAGTTCGCATAGATCTC ATCACATGGTTAGATAAAAAGGGGTGTTCTCTGTGGTTTTTAGTTCATGG CGAAGACGCGACTGAGCATTTAAGCACTGTAAAAATTTCAACATGTACTG TATTGTTTCAAAACCACCACAAAAATGTCACCATTTACAGTATTGCCTCA GAACCAATGCAAAAATGTCAACATTTACAGTAATGCATCAAAACCGTTTC CTCCAAAAACACAAATCAATAGCAACAATTTCCTAGCAACAACCCAAACC AGGGGGAACTCCAAATTTGTTGGCAACCGTCCCAGAATAACAAAATTCAC CTCAAATGCAACAGGAATTTGTCAATCACAGGTGATCTACACCTGGTTTA ACCAGGTAATCACACCTGGTGACGTCACCCGGCCCAGGTAATCACACCTG GTGACGTCAACTGTTTTACCTGGAGGTAATGATGACGTCACCTGGGCAAG TTAATCACACCTAGGCTACATTGGCTTTGTACAGGTGAACGACAGTATGG TTTACCCAGGTAATGACATCTGGTTACCTCACCTGTTTTACCCAGGTAGT CACACCTGGTGACCTCACCTGGGCAGCACTGATTTTGCCTACCTAGCCTA CTGTCATTCAGACTTTACAGACTAAAGAAACACACTACGCAGACAAAAAT TACACATCAAACAAAAACTGCATTAAAAAAAACTTTCAAACGGTCAAAAC ATATATACAGCTGAAAAGTACAAAAACAGTTTGGTTCTAATCAGTACTAG TATTTTTCAAAATAGGCTGTTTGCTTGACGTCATGTGCGCCATCTTGAAT TACAGACGTCTGTAAAATGCACAAAGATGCCGTTGGTTAATGCAATCATC CGCCCACATACATGCATGGTCACCGGGGGATTTGATTATAATTACGTCAT TGAAAGGGCCAAATAGAGTTATTTCAAAGCTGCAGTTTTCAACAGAGTTA GGATGTTGCCTAGCAAATCTCAAACATGACATCAAGAACTTTCCTGGCAC TTGTCAATCTTTGTTCTTCAATATGTGATACATTATAGAGAAATAATCCA TTCCTGTGTGAATTTTTTCAGGCATCACTTCCTCATATTGGGTTACCCAG TGACGTGTGTGCAGTCAAAGAGAAGAATTCTGCCCCAGAGCGACCTTAAC TTAAAGGTTGGTTCAAATCCCTTAAACTCATTTAATCACTTGTTGTTACA ATCATTATTATTGATAGGCCTGGAGTCTTGTGTATTGAACTCAGCACACC TGCTTCTGCTACTGGGTTACTTATCTAAGTTGACCTTTGTTCTCATTATG CTCATCTGTTGTAATGTAGGAGCATCCTCACTAGATAATGCTTTAAAGAA TGCTTGCAGTCAGATTGTGCAAAGACTAGGTGTGACAGACCGTTCGGTGT AATATGAATAACCAGCTGCTGCCGCGCCGCGTGCCTGCGAAGCTGGTTTG TTACACTGAAGGGTGGTTATACCGGCTATATAATGAGATATAGATACAGA AGCTGGTGTGTTACGCCAAAGGGCAGTTATACAGGCTATACTGTTTATGT TATTCTATGTCGGCATTCTCCCCCAGGATTCATTAAAAACTGCCAGAAGA CAAAATGTATGTCCTGGTGAAATAAATAAACTGAAACTCAGATACAAACT GAGTAAGAGCTCTGGTTAGACTCAGGATCAAGTGACAACCATTTTTTAAA ACTTTCTCCCTGCTGCCTAACTCTGTAACCACTAGAGAATGGGGTGCCAA TCAGCTAGTTAAGTGTGTTAAAGGTTAACCTGTACTTATTCTGTGTTCCT TGCAGACAGAATGCAGACCCAGCTGAAGAGTGTTCTGGTGTTGGTGTTGA TCGTGCTGCTGCAGTTTGGGCAGACAGAAGCCGCCTGCGACTGTACAGCT ACAACATGTGACTGTTCCGACATTTCCAGGGTGCCTCAGGACCTGAACAT AGCTAATACAAACATAACCGCCCTGACTCTGCGAGATAGTGTCATGAGAT CACCTCTAGGTTCATTCCCAAGCCTCCCCCAGCTACGACAGTTATCCCTG GTCTCAAACGAGATGACTAGCATCCAACCCGACGCATTTGCAAACCTGCC CAACGTCCAAAACATCACCCTTTCTTACAATAACATGACTAGCATCCAGC CCCGCGCATTTTCCGATCTAGCCCAGGTCCAAACCATCTCCCTTTCCTAC AACCGCATCAGTTCCGGCATCCAGCCTGCCGCGTTCTCAGACCTGCCCCG GCTCCAAGACCTGGTCTTGGACAACAACGACATAACCGCGGTTCAGCCTG GTACGTTCGCAAATTTACCCATGCTCCAAGAGCTGGACCTGTCCTCCAAT CAGATCGATAGGGTCCAGCCGAATGTTTTCAAAAATCTCACCGGCCTCCG AGAGTTGGATCTGTCCGAAAACCGTATAACAGCCAGTAGCCTTCTTGCCT CAGATGTCTGTAGTGACTTGTCGGGTATCACGACTGTCGAGCTGGGCGAC AACGAGTTTCAGTGTGACTGCGATTCCCTCCCGACAGGGGCGACTTGTTC ACTGGATATAGTAAAGCAGGTCAGATGCACAGGCGCAGGTGATTTGACAT ACCCGCTAACCCTGAAGGACGGTAGTCTCATGTGCACCAGTGCTGCAGCT GACCTGCGCGGCAGTCTGTATCACCTGCCCCTGATTCTGCTGGCAGCACT GCTGATTAAAAATGCGGTGTAAACCTGATGAAGCAATGCCTAACTACCCT CCTACCTAGTCCCGAGAAGCACTGCAGATTCTTATAAAACAGGTCCTTTA CTAAAAAAGTAAACCCCAACCTTGAAACTGCACTGCTCTCTATGCCACCT CCCCCTCTTCTGCTGTCAGCAGTAAGTAAAAAATCTGATGATGTAAACAT GAAGGGATACAGCTGGGCTGTCTAAAGGACCCGTCTCTCCGTCCCGGGAT GGAAATTTGCTTCTTGGGGCGGACAAAAGGTTCACCAGGACTCATCTGTC CAAAATGTTCCTAACTTTACTAAAAATCTTAATGAAATTGATGATAATGT GTTTTTGTAAGGTTAGATTAAATGACAAATTTTACCAAAGAAAATTGACA ATGTCGGCTCCCAAACAATGAGTCCAAGAACAGAAAATAATTAAAGCTGG AGACAGTCCTGGCCTGCAGTGTCTTGTAAAAAAGTGCCTTTGCTAAAAGC ATAAGCCCTAAACCTTAACAAACTTAAGCTTGACCAAAAACGTAAAGAAA ATAAATAACAAGAAGTAACTTTATCTTCAAAGATAATATACAGGGTAAAT ACAGGGTTCTTATTTCCAAACTGCATATCTATCGCCAAACAGTTATCTGA ATAAGGAGGACAAAATGACTAATTGCTCATAGATACTGATATACATGTTG TTTGATAACAGACTTTTTTACCAGAAAAATGTATTAGTACTCTCCAAGCA GATGGCTGACAAAAGGGAAAGCCAGATAGAAATGCCTTCGATCAAAGTCT TCAAAAGCAAGCCTAACATCTGCTTGGAGAGCATACAAAGTTGTTCCTGA CTCCTGTACAAAATGTAAGCTCTGTGTAACACTATGGGATGATAGAAGCA TCCCAGGCTAGAGAGGGGAGAACACAATTAATGTTGTAAATGTAATGAAA GAAAGTTTCACCCTCATTGACTTGGTACGTATAGAAGCTGTAACTAGTTT GAGTGCGTAAGATGAGAGAGCAGAGGTGGGACAATATTTGATCTTAACTG CCTTTTTGGCTGGTATAATGTGAGCTTATAGCGAAACATTATATTGCAGG TAATACTAGAGCTTTCTTATATATATATATTGCTATTGTTGTTACTAAAG CAGTGAAATAATTAACAGAATTGCCGCTTGCATGTACATGTACATGTACA TTGTTATCTAATGTCGACAACGGTCAAGTTAGTCTGTTTTAGATAAAGGG TTATGATAGATAGATGTAATGGTAGCAAAAACACCCGACTTGCATGGACA CAGCTATCTTCTGATTAATCAAAAAGAATTGGCACACAATCTAGTCTAGA ACGATTTAGACATTATATGTTTAGGAAGGGAAAAACTAACTAAAGATAAG TAATAGATAATAGATTGCTAAAGCAGATTTCAAATTAGTAACTTTGAAGT TGTAGCCTTAGTTTGAGTTGAAGGACAGGTTAACTTATCATTGTGATAAT AGATTTGAGGTCTCTACAATAAGATGGCTTTGATGTACTGAATTACTATA TTCTATACAAGTTATATTGGACTGTTAACTAACTTAGACAAGCTATAATT GTAATGTTGTGAAGATGCAATGTTCTTGGATGGAATAAAATTTGTTGCTT TGAGGCAAATATTTCTAATGGTGACTCCTTCTAACTACATAACAAGACAA TCAGAGATGGCAGACTTCACCCCTTATCCAAACATCCTCACTG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:460175..471667+

>Blg00969.1 ID=Blg00969.1|Name=Blg00969.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=912bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:460175..471667+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTGGACCCAGCTGAAGAGTGTTCTGGTGTTGCTGCTGATTGTGCTCCA
AGAGTCTCGGCATACAGAAGCGGCCTGCACTTGTACAGCTACAACATGTG
ACTGTTCCGGCATTTCCAGGGTGCCTCAGGACCTGAACATAGCTAATACA
AACATAACCGCCCTGACTCTGCGAGATAGTGTCATGAGATCACCTCTAGG
TTCATTCCCAAGCCTCCCCCAGCTACGACAGTTATCCCTGGTCTCAAACG
AGATGACTAGCATCCAACCCGACGCATTTGCAAACCTGCCCAACGTCCAA
AACATCACCCTTTCTTACAATAACATGACTAGCATCCAGCCCCGCGCATT
TTCCGATCTAGCCCAGGTCCAAACCATCTCCCTTTCCTACAACCGCATCA
GTTCCGGCATCCAGCCTGCCGCGTTCTCAGACCTGCCCCGGCTCCAAGAC
CTGGTCTTGGACAACAACGACATAACCGCGGTTCAGCCTGGTACGTTCGC
AAATTTACCCATGCTCCAAGAGCTGGACCTGTCCTCCAATCAGATCGATA
GGGTCCAGCCGAATGTTTTCAAAAATCTCACCGGCCTCCGAGAGTTGGAT
CTGTCCGAAAACCGTATAACAGCCAGTAGCCTTCTTGCCTCAGATGTCTG
TAGTGACTTGTCGGGTATCACGACTGTCGAGCTGGGCGACAACGAGTTTC
AGTGTGACTGCGATTCCCTCCCGACAGGGGCGACTTGTTCACTGGATATA
GTAAAGCAGGTCAGATGCACAGGCGCAGGTGATTTGACATACCCGCTAAC
CCTGAAGGACGGTAGTCTCATGTGCACCAGTGCTGCAGCTGACCTGCGCG
GCAGTCTGTATCACCTGCCCCTGATTCTGCTGGCAGCACTGCTGATTAAA
AATGCGGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00969.1-exon-Sc0000003-1570713199:460175..460221Blg00969.1-exon-Sc0000003-1570713199:460175..460221Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00969.1-exon-Sc0000003-1570713199:460392..460507Blg00969.1-exon-Sc0000003-1570713199:460392..460507Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00969.1-exon-Sc0000003-1570713199:469146..471667Blg00969.1-exon-Sc0000003-1570713199:469146..471667Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00969.1Blg00969.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:460175..471667 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00969