|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00036334 ID=TCONS_00036334|Name=TCONS_00036334|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=438bp cgataccgatatccaATTGCCGCTGTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATA GTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAattGATGAATGCATCTGGAGAT CAACTAATCACAAAAATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCATTACC TATTTTCTACctatttattttcattatctACATACACCCGTCACGAGACA ACAGGTCCCAATCGACTATTCTCTACAAGACCAGAAGGAAAACGAAtgat attttaaaatatatagTATATTCTAACAAATGTACAATATTCTTCTTCTT TAAGAAATTTATACTTTAATATGACATATCTCTTTcatcttttattgaaa aatccaTTAAACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTATTTTcccaagaaa aaatatttattctacAGCAAGAATATTCGATAGATTAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001443:50340..59103- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00036334 ID=TCONS_00036334|Name=TCONS_00036334|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001443:50340..59103- (Clytia hemisphaerica) CGATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATA
GTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTTTAAAGGTTACACA
GACACGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATCATTATTTTATACA
CATGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTTACGCTTTTTTTTTTAAT
CATTTTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTCGAAGATAAT
TTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTCCTATGGAGATGCTGTACCCCA
TACCGATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATCGTTCAAATTTCA
ATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTTTAAAGGTTAC
ACAGACACGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATCATTATTTTAT
ACACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTTACGCTTTTTTTTTT
AATCATTTTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTCAAAGAG
AATTTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTCCTATGGAGATGCTGTACC
CCATACCGATACCGATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATCGTT
CAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAA
ATGTTACACAGACCTATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATCATTA
TTTTATACACTTGACTTGCGATTGTTTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTT
TTTTAAATCATTTTTGTAGTTATTTGTATCTGTAATANATCTGTAATATA
TGGGAACTTTTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTTTTCCT
ATGGAGATGCTGTACCCCATACCCATACCCATACCGATATCCAGTTGCCG
CTTTTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAG
CAACCTAAAGGTTACACAGCTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTTT
AAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGTGTTTACTTTTTCCTATGGAGATGCT
GTACCCCATACCGATACTGATACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGAT
ATTCAATTGCCGCTGTTACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGAAATCG
TTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTT
AAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCGTGAT
CATTTTATGCACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTTGGTTTCTCTT
TTTTTTAAATCATTTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTAATATGTGGGAACTT
CTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTTCTCCTATGAAGATG
CTGTACCCATACCGATACCGATACCAATACCGATATCCAATTGCCGCTGT
TACCGAAATCGTTCAAATTTTAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAAC
CAAGTAAGCTTAAATAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTT
CTCAAACTGCGTGATTATTTTATACACTTGACTTGCGATTGTGTTGATAC
TTTTGGGTTTCTCTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
CCAAACTGTATGGGTGTTCAGCTGAATGGAAGATACTTTCAATACTTCCC
CAATTCATATTATGCTGACACAGTCATCCATCAAGATAGAATAAATCAAC
TTCCAGACGAGGCCGCTCAGCTGCCAGGACTAAAAGTTGTTGAAACACAG
GAGGACATGACAGAAGATGAAAAAGGACCTGCTCCCAATCAATTTTTCAT
TCCATTCAACGAGGGAGATGACAGTGTTACTGGGTCAGGCATCACCTGTC
CTGTCGATCCACAGGATGCTGATAAGGAGCTCAAGATGATCATACAAAAA
ATGACTGGATCTGAAGAAATTCTACATCAAGGCGGTGTTGCATCCGCTGA
TTGGGATCGAACTCGAGAAGTTCCCATAAAGGAATTGAAAACGCCTGGTT
TTTTTACCATGGTTGCTCCTGACATCTTTGTCAATGGAAGTTGTGACATC
ACCTGCAAGAAGTTGGTAACTGTACATCTCGACGAATGGATACAACATAT
TTATTTTGTTGGGGAAGATCGTGTTCCAAAGCATCCATTTCTGAAATTTC
TTCTCCATAACCTGAAATTACGGCAACAGGCACTTGACCATGGAAGCTTT
TTGGTCGCACAGCAGTTGAATGATGCACATCTGACAATTGACGAACTCAG
AACAAATCTGAATGAAAACAATGATCAGAGTGTCCCACTCAAGATCATAA
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNTTTCCAATGATACCAAATTTATAAAGATTAAAGAATTCCTTCA
AAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAATAGATTG
ATGAATGCATCTGGAGATCAACTAATCACAAAAGTTTGAAATTCAACTTT
ATTAATTAGTTATATCGTTTTCGAGTGCTTTAATCTACTAGCAAGTTGAG
TATTTCTAATGACTATTATTGCTTATGTGGGACTTTCCAAAATGTGATTT
GTAAATGGTTAAAACCCAATGCTATCTACTTTATATCTTAATTTTACTTC
TGCAGATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCATTACCTATTTTCTAC
CTATTTATTTTCATTATCTACATACACCCGTCACGAGACAACAGGTATTA
CTTATAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTT
TTTGCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTC
TAAACTTTAAAGTGTATTTTAAGCNACAGGTATTACTTATAGTAAATCGG
ATTTATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTTTTTGCGATTCTTCCA
AGAATAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCAAAACTTTAAAGTGT
ATTTTAAGCAAAATCTGATTACTTGCTAAAATTAATTATGTGCGATATTT
ACTTTTTACCTTTCCTGTTTTTACTTGCAGGTCCCAATCGACTATTCTCT
ACAAGACCAGAAGGAAAACGAATGATATTTTAAAATATATAGTATATTCT
AACAAATGTACAATATTCTTCTTCTTTAAGAAATTTATACTTTAATATGA
CATATCTCTTTCATCTTTTATTGAAAAATCCATTAAACACTCGGTTGAAG
TCATTTCCAATTATTTTCCCAAGAAAAAATATTTATTCTACAGCAAGAAT
ATTCGATAGATTAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:59026..59103 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:59026..59103 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:59026..59103 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:59026..59103 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:59026..59103 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:59026..59103 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573 | TCONS_00036334-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0001443 | supercontig | sc0001443:50340..59103 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|