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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00025542 ID=TCONS_00025542|Name=TCONS_00025542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2172bp AAACAACATATTTCAAGCTGAGGAGTGCTGTGTTTTTAAATTAATTGCAC CGCTTGTAATCTTTAGATCAATATTTACCTAATGCCTTATGGGTATACTA ATCGAAGATGGTCGGAAAGTAAGTACAGCAAGTCATCAAGAAGACGGATC AGCGCGTCAACGTAAACATggaaaaacattacgtcatccGTTAGACATGG TCAATTTCAATAAACAAAACCAAGAAGGTGGAGAACCATCGAGACGAAGT AGCTCAACGATGGAGAGATATCGATTACAAGAAAATATGAAAGACCACAA GCGAAGTGGAAGTAGTCTTAGTTTGCTACCGTTAAAAAGAACTGGATCCG TAACAAGTTCAATCGTATCACGAAAATCCAGTGCCAAGAGTGTCGGAAGT AATCGAAGTAAAGGCACCAGTCGATCTTTTACAACCACTCGTAGTTACAC TACCAACCGTAGCAATGGAACTGTTACATCCCAAAGCAGCTACATCAAGA AAAATTCCGGAAATTTTGACGGTAGTAATGATCGCTCTCGCCGAAAATCA TCGTTGCAACGAAAATCATCGGCTTCGAGCCGTAGAGAACAACTCATAGC AGATTTTTATCGAGATTTGGAAGAACTAGACGAGGAACGAAGTTGTTCCG ACTCTTccgatgatgaaaatgatagcCGCGGAAACGGAAGTCGGaatcga aataaaaagaaattaaagaaaggACGAATAGAAGTAGAGGAAGTCAAAAG TCATCAACGTGTCCAAGAATATTTGATGAAACTCGAACATACAGAACCCC CGGAAATTTTTGAGGAGGACGAGGGAATTCGTTCGGATATGTCAGACGGT AGATTAGGCTCGTCTTATAATAGTAACTACAGTAACGATATCCCTATGGA AACTAATAAAAATGATAACAATAATGGCGGACGTAAAAGTGAACCGAGAT ACATAAAACGACCGAACCCTCCCGATAATATGATCGCTGATTTGGAAGAT TCACCGAGAACGCACCGACTTAAAGTTCGGGACGAATACCGAAAATCGCG AAACGATAAACAAGACTCTAATAAATATGACGTCAATAAAAATAACGTCG GAAAGAAAACTCGTTCTGCAAATTACACGCCTCGAGTGTTACCCCAACAT CCAAAAGAAATCGAACTGATTGATAAAAATTTACGTGAAAGTTTTAATAA TAAACGAAAACCGAGTAATAACGACTATAAACGAGTTTCGGTTCACGAAG ACTTATATATGAACGATAGTGGTAGCGAATCATCCTGTTCAACAGATTCG GCACACGGTTCAACTCACTCCATCTCTACCGTTAGTTCCATCTCAGTAGC AcagaaacaccaaaacaaacaaattcatCAGTTAAGTTTTAAAACAACGG TACCCAAAAATTTTATACCAggacaacaacaaaaacatatACTGGACTCA CAACGTAAAAAGACAAATCGAAAACcgaaaaaagtttcattttgttTCAG AGGTATTCCTTTCAGAGTTTACAATAATACACCGAGAACTCATAGGGCGT TAGCTCACGCAGGGTGTATTGCCCTCATTATTCCCGCCCCTGGTAATCAC AAATGTAGACATTAACTTTTCGctatacacgtctttttttttaaagaaac tagttttaccaagcagcctcaatgtttcttaagaaatcggccttttgagc tttaaatgtttcttacatgtttctaaactttttgacataattagccttgg aaggttcttataaaaaaacgaattaaaaaatgttattttctcattctcag cctcagcatgtttcttagatatttcttagtttttaggcattctgagcctc atgtttcttaaaagtgtgtttcttaaaaaaaaaaagacgtgtagaAGAGT ATTGTTTAAATCATATGATGTTGCAATGTTGAACCAAAGAACATGGGCTT CCTAGCTCGGACATTATATTTGTACTGGACTGGtttaaattattcaaaat agtattttttttaagttttgtgaATCTTAATTAAAACGCACTTTTAGTTC tgttcaataaaaaaacttctttttttaagaaaatgaagacaCAAAAATGA CCTAAAAAGAGTCCTACTATTGCCTTCTTCAAAAAGAGTTTTCTCTAGAG TTCAGGCCTAGAATACACGCAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000539:70893..88323+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00025542 ID=TCONS_00025542|Name=TCONS_00025542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17431bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000539:70893..88323+ (Clytia hemisphaerica) AAACAACATATTTCAAGCTGAGGAGTGCTGTGTTTTTAAATTAATTGCAC
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CAAAAATGACCTAAAAAGAGTCCTACTATTGCCTTCTTCAAAAAGAGTTT
TCTCTAGAGTTCAGGCCTAGAATACACGCAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1491911889:70893..70976 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1491911889:70893..70976 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1510915933:70893..70976 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1510915933:70893..70976 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1575043694:70893..70976 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1575043694:70893..70976 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1491911889:73524..73783 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1491911889:73524..73783 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1510915933:73524..73783 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1510915933:73524..73783 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1491911889:86496..88323 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1491911889:86496..88323 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1510915933:86496..88323 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1510915933:86496..88323 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025542-exon-sc0000539-1575043694:86496..88323 | TCONS_00025542-exon-sc0000539-1575043694:86496..88323 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000539 | supercontig | sc0000539:70893..88323 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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