TCONS_00016876 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016876
Unique NameTCONS_00016876
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length6657

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016876 ID=TCONS_00016876|Name=TCONS_00016876|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6657bp
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TTGAGTACTGACTGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGCTTGCT
GAGTTGCAACAGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTCGA
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ACTGGTTTCTTCAGTTTGTTGAGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTTGTGTAC
TTGCTACTTCAATTTGTTGAGTGCTGGCTATTTCAGTTTGTTGAGTTGTA
GCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTGTACCTGCTTCAGTTTGTTGAGTACTGAC
TGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGTTTGCTGAGTTGCAACAG
CTTCAGTTTGTTGAGTACTGGCTGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTGACTTTC
TCTGTGGCTTCAGTTTCGGTTGGGACTGTTTTCTCTACAAGTGGTGCTAG
CGTTGCTGTAtcgtcatttttttctgtttgaatgtttGTTGTCGCAGATA
TTGTTGACTTTGTTGTTGATGTTGTCTGTTCAATCTGTTGAGTAGTGACT
GCCTCTGTTTGCTCAGTAGTTACAACTTCTTTCGTTGCTAAAGCCTCTGT
TTGTTCAGTGGTAGGTTCTTGTGTTGCAATTTCTTCAGTTTGTTGGGTAG
ACTTTACAGCTTCAGTTTTCTGAGTAAATGATTCAGTTTGCTCAGTGAGA
GGCTTTTGAGTCGTTGAAGTTATCGTTTCAGTAAGAGCAGCCGTAACCTC
CTTCATAATTGCTGTAGTGGATTGAGCTACGGTGTTTTCAGTTTGTTGAG
TTGTTTTAACACTTTCTGTTTCTGGTTCGACAGTCGTAGCCAGGTCAGTT
ATTTCCCTTGTTACAGCAACGGTAGTCTCAGCTTCAGGTTGTTGTGTAGT
CTTTACAACTTCTGTAATTCCGTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTG
GAGCTACGGTCGTTTCTACGGCTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGA
AGTGTTTTAAGTGTTTCGGTAACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAG
TGTTGTCGATGCTGTCGTGGTTGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGT
TATCTTCTCCTTCAACAATAACAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTG
GAAGTACGTGGTTCTTTCGTTACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTCTTT
GGTTACAATTGGCCCCTCGGTTGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTT
GCGTTACAGACTCTTGAGTTGTAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTC
GTGACTGATTCTTGGGTAGCAGTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTG
TTGAGCAGTAACTTGCTCTTGTGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAG
TAACAGATTCTTGTGTCGTAACTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTG
ACATCTGAGGCTTCTGTTTGAGTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGT
TGCGGCGGTTACGTCTGGTTGTGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTG
TTTCTTGTTCAGTACTTTCAGTTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTG
ATTTCATCTGTTGTTTTTGAATCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGT
AGCTGCTTCTGTTTGGACTTGCTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGG
TTAACACTTCTTCAGTTGTCGATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTA
GCTTCAGTTTGTCCCGTTTTAGGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTG
TTGAGTAGAaacatcttttgttttaagcTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAG
TTGGTTTTTGGGTCGACAATGCAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTT
TTTCCTTCGGTACTTGAAACACTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGT
TGTGGTGATCTGTTGAGTAATGACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTG
TGGCGACTTTTTTGGTTGTAGAAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTT
GGTTCTGGAGTGGTTCTTGTTTCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGT
CACATAGACAGTAACATCCTCTGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTG
TTGTTTGAGAGACTGTTGCAACTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGT
TCTGTAACGACCTCAACAGTTTGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGT
AGTAGTCGGTGCTGGTACTTGAGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTT
CTGGTTGCTGTGTAGTAGCTGATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTT
TGCTGAGTAGTCATGACTTCAGTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGT
TGGCGAGTNGCTTCAGGTTGTTGTGTAGTCTTTACAACTTCTGTAATTCC
GTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTGGAGCTACGGTCGTTTCTACGG
CTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGAAGTGTTTTAAGTGTTTCGGTA
ACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAGTGTTGTCGATGCTGTCGTGGT
TGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGTTATCTTCTCCTTCAACAATAA
CAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTGGAAGTACGTGGTTCTTTCGTT
ACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTATTTGGTTACAATTGGCCCCTCGGT
TGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTTGCGTTACAGACTCTTGAGTTG
TAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTCGTGACTGATTCTTGGGTAGCA
GTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTGTTGAGCAGTAACTTGCTCTTG
TGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAGTAACAGATTCTTGTGTCGTAA
CTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTGACATCTGAGGCTTCTGTTTGA
GTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGTTGCGGCGGTTACGTCTGGTTG
TGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTGTTTCTTGTTCAGTACTTTCAG
TTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTGATTTCATCTGTTGTTTTTGAA
TCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGTAGCTGCTTCTGTTTGGACTTG
CTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGGTTAACATTTCTTCAGTTGTTG
ATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTAGCTTCAGTTTGTCCCGTTTTA
GGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTGTTGAGTAGAaacatcttttgt
tttaagcTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAGTTGGTTTTTGGGTCGACAATG
CAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTTTTTCCTTCGGTACTTGAAACA
CTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGTTGTGGTGATCTGTTGAGTAAT
GACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTGTGGCGACTTTTTTGGTTGTAG
AAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTTGGTTCTGGAGTGGTTCTTGTT
TCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGTCACATAGACAGTAACATCCTC
TGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTGTTGTTTGAGAGACTGTTGCAA
CTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGTTCTGTAACGACCTCAACAGTT
TGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGTAGTAGTCGGTGCTGGTACTTG
AGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTTCTGGTTGCTGTGTAGTAGCTG
ATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTTTGCTGAGTAGTCATGACTTCA
GTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGTTGGCGAGTCTGTTTGTTCTGT
GACTGTCTCCTGTGTGGTGACAATTTCTGTCTTTTCCGTTTGAGGCGCTT
GGGTCGTAGCAGATTCGGTAATGTCGGTAACATCTGTGATTGATTGAGTT
TGTGGAGCTGCGGATTGTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGCTGAGTTAC
AGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTG
TTGTAACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAA
TCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTAAATCAGTTTGTTG
AGTTGCAGGCTCTTCCGTTGTCTTTGGAGAATCGGTTCCCTTTGTTGCAG
ATCCTGGCTGCTGAGTAATGATTTCCTCAGTTTGTTGAGTTGTATATTTT
TCTGTCGAAAGTTCTTTTTCTTGAGTGGTGACAACTTGAGGAGCATCAGT
GACAATTTCTTGAGTTGTCGCAGACTCTGTTTGTTCTGTCTGTGGTTGTT
GAGTTGTGACTGTTTCAGTTTGTTGTTGCGTGACCACTGTGTTAGTTTGT
TTTGTTGGAACTACATCAGTTTCAACTTGCTCTGTGGTAACAATTTCTGT
TTGCTGAGTAACTGGCTCTTCCGTGGTGATAGATTCAGTCTGTTGAGTAA
CAACGTCGGTCTGTTGAGTGGAAGGTTTTTGAGTTGTAACAAGGTCAGTC
TGTTGAATTCCTGAATCAGTTAAAGCTGCTTCAGTTTGTTCTGTGGATGG
CTCTTGAGTGGTGGTTCGCTCAGGAAGAGGCGTTGTAGAATCTGTTCTTT
GCTCTTCAGTTTGAACTTGAGGAGTAACTGAATCCGTTTGTTGAGTAGCA
GGTTCTTGTGTTGAAACTATTTCTGTTTGAGCTTGTTGAGTAGTGGCCGA
TTCAGTTTGTTGGGTTAACACTTCTTCAGTTGTTGAATCTCGCTCTGGTA
ATGGAGTTGTCGCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTTTGGGCTCTTGCGTTGAA
ACCGATCCAGTTTGTTGAGTTTTTGTAGCTTCATTTGTTGAAACTTGCTC
TAAAGGTTGAGTGGAAACTTTGCCTTGCTTTTGTGTAGTGCTTGTGACAG
ATGCTGTAACTGTTTCTTGAGTGGTAGAAGCTTCGGTTCTCTCTTCTAAG
TCTCCAGTGACCGCTGGTTGTCCTGTAGTAGATTTTGCTTTCATGGTGAT
TGGCTTTTGCGTTGAATCTTGTTTTGTTGGAAGGCTGGTAGATTTTGGAG
ATTCAGTTTGGATGTTTTTTGTGGTTTGTTGCTGTGTGGTAGTGGAAATA
GAACCCTCAACAAAATctgttgtttgttttgattctgtTGATACTTCTGG
TGAACTTGTTGTGGTAAGTTGAGGTGCATCTGTTTCAATCTTGTCTTTAG
TTGTGGTTTGTTCAGATTCTGAGTCGGTGGTGATTTCGTCGGTTGGTGAA
TCTGTCGTGCGTTCACTGGTGGATCCTTCAGTGATCACTAAAGGAGTATG
GGGACCTTCTGATGGCTTTGGTAAGGTTGACTTTGGTGAATCAGTAGTGG
TTTGAGCAGCTGTTGTAAGGACTTGTTCTGTGGTCTTAAAGTCTGGTTCT
TGAGTTGTGGATTGTTCAGTTCTAAAATCTGTGACAACTTTAGCGTCTGG
GCCTTCTGTTTGTTGTGTGGATAATACATAAAGGTCCTCAGTTGTTGAAA
CTCGGCGTTGGTCAACATCGTCAACTGTTGTCTGTTGTTGCTGTGTTGTT
GGTGTTGCTTGAGTTGTGACAACAACTAGTTTGTCGACATCATGTGTTGT
GTAAGATTCTGTTGTTCGCTCCTCTTCTGTTCGGATTGGATCTGTAATCA
GGTCTTTTGTTATCAGATCGTCAGTTCTCGTCTCTTGAGTTGTGGAGACA
TACTCAGTTTGTGGCATTTGAGTAGTTATCTCTGTCTGTCGTTTTTGCTC
AGTTGTTTGAAGATCTTCAGTAGCAACCGTTGATCGTACAGATTCAGTTG
ACTGTTCGCTTGTTCTAACACGATCAACTGGTGAAGAGGTCTTTGTGCTT
AGTGATTCTGTGGTCGATCGCTCTGTTGACTCTGTTGTCTTGGCAACTTC
TTCGGTAGGTTGTGGACGGGCCGTGGCGACCTCTGGTTCATCTGTTTCGA
GACCTTCAGTGACGACCGTTGTTTGGCGGATTTCTTCCGTCGTAGGTTTC
AATGTTGTAGTAGTTGTAGACGTTTTCGTTGTTGAAGCGACAGTAGTGGC
AACCTTACCGCATCGTTGTTGACATTCGACCAAGGTGAAAAAGTTGTTTG
AGTTTCCATCGCAACCACCGTATGCAAACTGCTCACATTTTTGTGTCTCC
ACATTGAAATAGTATCGAATCATATATCCAAAGCATTGTCCAGTATTCTT
AGGCATTTCACAAATACTTTTAAATTTCGGACATAggacgccattttgtt
ttggtgTTATTCCATCTCTACAGCAGCCGAGATCACTTTTGCAGCCTGGG
CGCGCAACAACTGGTGTGTCAGTACAGAAGCCACATGATTTTGGACACAT
GGTACCCATGAAGGACTTGTAACGTTTGCAATACCCTGGGGATGCGTACT
CCAAGCATTTCACTGGTTGCTTGTCTTGGCAATTTGATTTGTATTGATCA
ACTGGTC
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000253:124445..131647-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016876 ID=TCONS_00016876|Name=TCONS_00016876|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7203bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000253:124445..131647- (Clytia hemisphaerica)
ACTTCAGTTTGTTGTGTGCTAACTGATTCAGTACCTTCAGTCTCCGTTTG
TTGAGTACTGACTGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGCTTGCT
GAGTTGCAACAGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTCGA
GTACTGGCTGCACCCGGTTGTTGAGTACTGGCTTCTTCATTTTGTTGAGT
ACTGGTTTCTTCAGTTTGTTGAGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTTGTGTAC
TTGCTACTTCAATTTGTTGAGTGCTGGCTATTTCAGTTTGTTGAGTTGTA
GCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTGTACCTGCTTCAGTTTGTTGAGTACTGAC
TGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGTTTGCTGAGTTGCAACAG
CTTCAGTTTGTTGAGTACTGGCTGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTGACTTTC
TCTGTGGCTTCAGTTTCGGTTGGGACTGTTTTCTCTACAAGTGGTGCTAG
CGTTGCTGTATCGTCATTTTTTTCTGTTTGAATGTTTGTTGTCGCAGATA
TTGTTGACTTTGTTGTTGATGTTGTCTGTTCAATCTGTTGAGTAGTGACT
GCCTCTGTTTGCTCAGTAGTTACAACTTCTTTCGTTGCTAAAGCCTCTGT
TTGTTCAGTGGTAGGTTCTTGTGTTGCAATTTCTTCAGTTTGTTGGGTAG
ACTTTACAGCTTCAGTTTTCTGAGTAAATGATTCAGTTTGCTCAGTGAGA
GGCTTTTGAGTCGTTGAAGTTATCGTTTCAGTAAGAGCAGCCGTAACCTC
CTTCATAATTGCTGTAGTGGATTGAGCTACGGTGTTTTCAGTTTGTTGAG
TTGTTTTAACACTTTCTGTTTCTGGTTCGACAGTCGTAGCCAGGTCAGTT
ATTTCCCTTGTTACAGCAACGGTAGTCTCAGCTTCAGGTTGTTGTGTAGT
CTTTACAACTTCTGTAATTCCGTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTG
GAGCTACGGTCGTTTCTACGGCTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGA
AGTGTTTTAAGTGTTTCGGTAACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAG
TGTTGTCGATGCTGTCGTGGTTGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGT
TATCTTCTCCTTCAACAATAACAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTG
GAAGTACGTGGTTCTTTCGTTACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTCTTT
GGTTACAATTGGCCCCTCGGTTGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTT
GCGTTACAGACTCTTGAGTTGTAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTC
GTGACTGATTCTTGGGTAGCAGTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTG
TTGAGCAGTAACTTGCTCTTGTGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAG
TAACAGATTCTTGTGTCGTAACTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTG
ACATCTGAGGCTTCTGTTTGAGTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGT
TGCGGCGGTTACGTCTGGTTGTGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTG
TTTCTTGTTCAGTACTTTCAGTTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTG
ATTTCATCTGTTGTTTTTGAATCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGT
AGCTGCTTCTGTTTGGACTTGCTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGG
TTAACACTTCTTCAGTTGTCGATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTA
GCTTCAGTTTGTCCCGTTTTAGGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTG
TTGAGTAGAAACATCTTTTGTTTTAAGCTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAG
TTGGTTTTTGGGTCGACAATGCAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTT
TTTCCTTCGGTACTTGAAACACTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGT
TGTGGTGATCTGTTGAGTAATGACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTG
TGGCGACTTTTTTGGTTGTAGAAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTT
GGTTCTGGAGTGGTTCTTGTTTCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGT
CACATAGACAGTAACATCCTCTGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTG
TTGTTTGAGAGACTGTTGCAACTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGT
TCTGTAACGACCTCAACAGTTTGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGT
AGTAGTCGGTGCTGGTACTTGAGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTT
CTGGTTGCTGTGTAGTAGCTGATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTT
TGCTGAGTAGTCATGACTTCAGTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGT
TGGCGAGTNGCTTCAGGTTGTTGTGTAGTCTTTACAACTTCTGTAATTCC
GTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTGGAGCTACGGTCGTTTCTACGG
CTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGAAGTGTTTTAAGTGTTTCGGTA
ACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAGTGTTGTCGATGCTGTCGTGGT
TGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGTTATCTTCTCCTTCAACAATAA
CAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTGGAAGTACGTGGTTCTTTCGTT
ACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTATTTGGTTACAATTGGCCCCTCGGT
TGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTTGCGTTACAGACTCTTGAGTTG
TAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTCGTGACTGATTCTTGGGTAGCA
GTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTGTTGAGCAGTAACTTGCTCTTG
TGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAGTAACAGATTCTTGTGTCGTAA
CTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTGACATCTGAGGCTTCTGTTTGA
GTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGTTGCGGCGGTTACGTCTGGTTG
TGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTGTTTCTTGTTCAGTACTTTCAG
TTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTGATTTCATCTGTTGTTTTTGAA
TCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGTAGCTGCTTCTGTTTGGACTTG
CTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGGTTAACATTTCTTCAGTTGTTG
ATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTAGCTTCAGTTTGTCCCGTTTTA
GGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTGTTGAGTAGAAACATCTTTTGT
TTTAAGCTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAGTTGGTTTTTGGGTCGACAATG
CAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTTTTTCCTTCGGTACTTGAAACA
CTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGTTGTGGTGATCTGTTGAGTAAT
GACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTGTGGCGACTTTTTTGGTTGTAG
AAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTTGGTTCTGGAGTGGTTCTTGTT
TCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGTCACATAGACAGTAACATCCTC
TGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTGTTGTTTGAGAGACTGTTGCAA
CTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGTTCTGTAACGACCTCAACAGTT
TGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGTAGTAGTCGGTGCTGGTACTTG
AGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTTCTGGTTGCTGTGTAGTAGCTG
ATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTTTGCTGAGTAGTCATGACTTCA
GTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGTTGGCGAGTCTGTTTGTTCTGT
GACTGTCTCCTGTGTGGTGACAATTTCTGTCTTTTCCGTTTGAGGCGCTT
GGGTCGTAGCAGATTCGGTAATGTCGGTAACATCTGTGATTGATTGAGTT
TGTGGAGCTGCGGATTGTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGCTGAGTTAC
AGGTTGTTGTGTTGTAACTGAATGAGTTTGTTTAGTTACAGGTTGTTGTG
TTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTTTTGTGTTGTAACTGAA
TCAGTTTGTTTAGTTACAGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTT
AGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTAAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCT
CTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTA
ACTAAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGT
TTGTTGAGTTACAGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTGGGTTG
CAGGTCCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTCGTTTAGTAGCAGGCTCTTGT
GTTGTAACTGAATCAGTTTGTTGGGTTGCAGGTTCTTGTGTTGTAACATA
ATCAGTTTGTTGAGTTGCAAGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTT
GGGTTGCAGGTTTTTGTGTTGTAACAGAATCAGTTTGTTGAGTTGCAGGC
TCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGT
AACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAG
TTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTAAATCAGTTTGTTGAGTT
GCAGGCTCTTCCGTTGTCTTTGGAGAATCGGTTCCCTTTGTTGCAGATCC
TGGCTGCTGAGTAATGATTTCCTCAGTTTGTTGAGTTGTATATTTTTCTG
TCGAAAGTTCTTTTTCTTGAGTGGTGACAACTTGAGGAGCATCAGTGACA
ATTTCTTGAGTTGTCGCAGACTCTGTTTGTTCTGTCTGTGGTTGTTGAGT
TGTGACTGTTTCAGTTTGTTGTTGCGTGACCACTGTGTTAGTTTGTTTTG
TTGGAACTACATCAGTTTCAACTTGCTCTGTGGTAACAATTTCTGTTTGC
TGAGTAACTGGCTCTTCCGTGGTGATAGATTCAGTCTGTTGAGTAACAAC
GTCGGTCTGTTGAGTGGAAGGTTTTTGAGTTGTAACAAGGTCAGTCTGTT
GAATTCCTGAATCAGTTAAAGCTGCTTCAGTTTGTTCTGTGGATGGCTCT
TGAGTGGTGGTTCGCTCAGGAAGAGGCGTTGTAGAATCTGTTCTTTGCTC
TTCAGTTTGAACTTGAGGAGTAACTGAATCCGTTTGTTGAGTAGCAGGTT
CTTGTGTTGAAACTATTTCTGTTTGAGCTTGTTGAGTAGTGGCCGATTCA
GTTTGTTGGGTTAACACTTCTTCAGTTGTTGAATCTCGCTCTGGTAATGG
AGTTGTCGCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTTTGGGCTCTTGCGTTGAAACCG
ATCCAGTTTGTTGAGTTTTTGTAGCTTCATTTGTTGAAACTTGCTCTAAA
GGTTGAGTGGAAACTTTGCCTTGCTTTTGTGTAGTGCTTGTGACAGATGC
TGTAACTGTTTCTTGAGTGGTAGAAGCTTCGGTTCTCTCTTCTAAGTCTC
CAGTGACCGCTGGTTGTCCTGTAGTAGATTTTGCTTTCATGGTGATTGGC
TTTTGCGTTGAATCTTGTTTTGTTGGAAGGCTGGTAGATTTTGGAGATTC
AGTTTGGATGTTTTTTGTGGTTTGTTGCTGTGTGGTAGTGGAAATAGAAC
CCTCAACAAAATCTGTTGTTTGTTTTGATTCTGTTGATACTTCTGGTGAA
CTTGTTGTGGTAAGTTGAGGTGCATCTGTTTCAATCTTGTCTTTAGTTGT
GGTTTGTTCAGATTCTGAGTCGGTGGTGATTTCGTCGGTTGGTGAATCTG
TCGTGCGTTCACTGGTGGATCCTTCAGTGATCACTAAAGGAGTATGGGGA
CCTTCTGATGGCTTTGGTAAGGTTGACTTTGGTGAATCAGTAGTGGTTTG
AGCAGCTGTTGTAAGGACTTGTTCTGTGGTCTTAAAGTCTGGTTCTTGAG
TTGTGGATTGTTCAGTTCTAAAATCTGTGACAACTTTAGCGTCTGGGCCT
TCTGTTTGTTGTGTGGATAATACATAAAGGTCCTCAGTTGTTGAAACTCG
GCGTTGGTCAACATCGTCAACTGTTGTCTGTTGTTGCTGTGTTGTTGGTG
TTGCTTGAGTTGTGACAACAACTAGTTTGTCGACATCATGTGTTGTGTAA
GATTCTGTTGTTCGCTCCTCTTCTGTTCGGATTGGATCTGTAATCAGGTC
TTTTGTTATCAGATCGTCAGTTCTCGTCTCTTGAGTTGTGGAGACATACT
CAGTTTGTGGCATTTGAGTAGTTATCTCTGTCTGTCGTTTTTGCTCAGTT
GTTTGAAGATCTTCAGTAGCAACCGTTGATCGTACAGATTCAGTTGACTG
TTCGCTTGTTCTAACACGATCAACTGGTGAAGAGGTCTTTGTGCTTAGTG
ATTCTGTGGTCGATCGCTCTGTTGACTCTGTTGTCTTGGCAACTTCTTCG
GTAGGTTGTGGACGGGCCGTGGCGACCTCTGGTTCATCTGTTTCGAGACC
TTCAGTGACGACCGTTGTTTGGCGGATTTCTTCCGTCGTAGGTTTCAATG
TTGTAGTAGTTGTAGACGTTTTCGTTGTTGAAGCGACAGTAGTGGCAACC
TTACCGCATCGTTGTTGACATTCGACCAAGGTGAAAAAGTTGTTTGAGTT
TCCATCGCAACCACCGTATGCAAACTGCTCACATTTTTGTGTCTCCACAT
TGAAATAGTATCGAATCATATATCCAAAGCATTGTCCAGTATTCTTAGGC
ATTTCACAAATACTTTTAAATTTCGGACATAGGACGCCATTTTGTTTTGG
TGTTATTCCATCTCTACAGCAGCCGAGATCACTTTTGCAGCCTGGGCGCG
CAACAACTGGTGTGTCAGTACAGAAGCCACATGATTTTGGACACATGGTA
CCCATGAAGGACTTGTAACGTTTGCAATACCCTGGGGATGCGTACTCCAA
GCATTTCACTGGTTGCTTGTCTTGGCAATTTGATTTGTATTGATCAACTG
GTC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009445XLOC_009445Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1575043694:127496..131647TCONS_00016876-exon-sc0000253-1575043694:127496..131647Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1575043694:127340..127378TCONS_00016876-exon-sc0000253-1575043694:127340..127378Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1575043694:124445..126910TCONS_00016876-exon-sc0000253-1575043694:124445..126910Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1510915933:127496..131647TCONS_00016876-exon-sc0000253-1510915933:127496..131647Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1510915933:127340..127378TCONS_00016876-exon-sc0000253-1510915933:127340..127378Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1510915933:124445..126910TCONS_00016876-exon-sc0000253-1510915933:124445..126910Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1491911889:127496..131647TCONS_00016876-exon-sc0000253-1491911889:127496..131647Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1491911889:127340..127378TCONS_00016876-exon-sc0000253-1491911889:127340..127378Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016876-exon-sc0000253-1491911889:124445..126910TCONS_00016876-exon-sc0000253-1491911889:124445..126910Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000253supercontigsc0000253:124445..131647 -
Expression

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Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0.282805	3.48297e-10	0.0450539	0	0	0.684784	0.00271936	0	0	0.0863689	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3.46488e-10	0.00227543	0	0	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016876 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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