|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000349_pilon:143015..151654+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_008839 ID=XLOC_008839|Name=XLOC_008839|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8640bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000349_pilon:143015..151654+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GACCATTTATTTTTCGCGCGAAAAAAGAGAGAGCATAGCAAACAAAGGGT
GCCGCCCATTTCAAAAATTACCGaaaaaaaCGTGGGTTCTTTTGAAAACT
TATATGCCTTTGttacttttgaacaaaaatcttatgaaattataaagatt
ttcaaattaaattccaaaaAGTGTTGTTATTCTTGTCATGAAAATTTGCC
AAGAAGTCTGGGGTTAAGAATGGGCGGTTATCGGGTGTTGGctatcactt
tcgttttcattttcacgATGCTAATTCTTCGAATCGTTCCTTCCATCCAG
AGACTTTTGCCAACCGCTTTCAAGAATCTTTCAGTGTCAGCATTCACTGG
TACAAGAGCTATGTCAGCTGTAAGTATATTTTCCATTCTCTTTCTACATC
ACAGGCAGACTTTTGATAGCTTCTTCTTTCCTCTCTGGGAATAAAATTGG
TGagaaaatcaacataaaaaggggttgcggaacgagcgttctgttttcgc
aaagcgaagaaatttcaaaatgtataagAAATCGACGACTCCATTATCaa
tacagaatttaaaaaacaaactaataagACCTTTACATTTTACCAAGAAT
TTATTGTCATGAGTCATAACAATAATGTCAAAGAAGagggtcgtggcttc
ttcgtaaagacgaaagacagatctggatttatttcgtactttccagtctc
ttgttcgtagtttttctgactttctggttctttgtgagttatttactttt
actatgttttctaacttactgagtaacttaccgacagatcgccacgggtg
ggattcgaacccactaaatgcaaagttccgatgttttgaaacccaatgcc
ttatccactgcgccacggattcatgccgatagagcgtttctgacggctat
ttatattgtacaaactgcagaccagactgtattaagagaaaatcacaaaa
gagtgcttgtttcaagctccaaccctaaccctcacgtgcgtttgcgtagg
gtaaaatggcgaaatgcgaaaatcgaatttggcaaaaaaaaattgaaaaa
tgaccctacaagatttgactatatctttttattccatgaagagattactt
tcaaataaaaaatgtattaacaatgaatgggtaagctttctagaaatcca
aaactaaattgcatagcttttaccaaaaaatagcactttaggatcagaaa
gggtcaaaaaccagctttttccaattttcttcgagttacaggaattaatt
ccttgtttgttttgatctgaaattttcagtaggggtggccatcatggttc
ccttgctcatatcaggggggcccgagacgggggtaagagaattaaagttt
ctaagtaaaatcttaattatcacccaaaaaagtgccttttttatgtccat
atcttttaaatagattgtcccagccttatccctctttcagtaaagcttcc
tataccttttgtccttcagaaaaaccaaaaatattggccttaattgcttg
ctttcagttcctgtagccaggagtgtgaccccctgtatttctatttgtga
ccccctgtatttcgcgcgggttttttaatagagatgtcacatgactcaaa
tcccgcagtcttattggactagagaaagcgaaagtgaaatcgcgcgatct
gattggatgaaaaaagaccgcgggagctggaaacgaatggaattctctag
agTTCTCATTcggaaacaaaatggcggcgagaaaagcacgtcttttgctt
tggacgaaaggttgtaaattctggttgattttaaggttttatcttatctt
atctcatttactttaatttgtagaggcttcttcaatgtttagggaaggta
agtctgtaaaagttatttgtttttcggcggaaaaaagtgtttaaaaaagc
attttttgtgctcaaggtttatttttcttcgcaaatttttgtcttcaatc
ttaaatagatgaacgtgTATTTGGctgatgcttatgattttttcatagaa
catagtaaaactattcaggaacttagacctttttacagaatttcaaaaaa
tctgttagttctggagatatattgaaaagtttagacatgggtagtttgcg
ttcgtgtttcgcgttcccaaaccaaacgcacgtgccctaactgataataa
ccaaattcctagccaatctgatacgtaaccacacccaaaccacacccatt
cccaaccctaccaggtcgcctgcaggtcctgacactattcccgcatgccg
gatccgaaaaataggtACATGTCTTTCGcctttacgaagaagccttcacc
aaagaagaggatgttggaaaaattaaaagacagataaaaaagtcatttgt
actcgattttgtaatacttttgtagtagtttcaaaaaatcttcctgGAAA
AAGTATAAAGATATCTGCTCAAGACAACTGTTCACaaggtaaaataaaaa
aactaaaaaaactaaaactgtAAAGAGTAACATCGTATAGACTTAATAAC
ATAGGGGGATTACAGTGGTATTTAAAAGGGTAACACAGTATTTCATACAG
agcttttaaactgaaaataatttgatgagttttaaaagatccttctagaa
tttttcaacaaacgtATCCTGTGAAAAAGACCATTTCAATCATGAAGTca
ttaaaacaataacacattGATGTGTAGTTTTAGTATTAATGTAGTCTTTT
tcgtcattgttttgattctgtagttttaaaatattacagtaAATGTAACA
TTGTATTATGgactttttgatagtttaggatgtcataactaaaagtggta
aagaataaaatctatttttacaaaaatatcactaatttataattcactac
tagttttcatacattcatgcaatcaaaaaagcaaatcatACAATAACTTC
AAACCCCTTGAAACATTCCAATATTATAAGGCAGCGATCACGAACCTCTC
CATGCATTTTATTTTGCCAGTAACATGTTCaagaattttgagaaaatgct
gtgaaagagcataattggaaattatttaaagtgtttgaattgaataatga
ccaccagcagcagtgaattcgaaattttctactactgacttaaaaagatt
aaaaataagaTGGAAGTGTATTTTCTGATTGCTGCCTTAACATGTAAAAG
TTAATGTCATTAAGCATCACATGTCACACACAAAACATCCCATCAGCCCA
TGTACcaccaaaacattcacaatttgtCCCCCTTCTTGTGTTGCATTATA
TTATACGTAGCTACATAATATTAATATTGAATCTTGATGGGAATCTGGTA
ATGTTTGCgtttgcttgatctcaaacTACAACAAAGTCTTTCTTATGTCG
TGTTGAATAATAGACCTTAtttgagtttttgatttttctaaaaaagcgat
gtgtATTAAAATAGAATTCCCTTGAGGAGTTGCTAAGAGATATtatttgt
aatacactcgaaacaatcccacaatgcatcgcttttttagaaaagtcaaa
aactctgataaaaggtccattaaaaaataatgtgtCTGTTCTTCGCAGCA
TACCTCCTCAACAAATGTTACTGACCACAATCACCCAATATTCGATGACG
TATGTATGATCTTTTTCGTAAAAGCGTTTACGCGTTTACTCAAATACGTT
GAACCGTGTATTGACaacatgacaaaaaaatcattgttcggCTGAATGTA
AAGTTTAACCATGACATGACGTTTCCAATAGAATTATAAAgtttaaatgt
taaaatatttcgaaatccaaatgttgCTTTTAAGTCTGACTTGACTGTTg
cagatatttggtttgatctcaagccataaaaatagttttcgatgagatca
attgatgtaataggaatggttactccaatcaattgtcacaaaaatgtgcc
atgcagtatggatgccacaaggtaaacaaccatctgtcaaaccatttatc
gaaaattaaagttgacaacaaaaaaaaacagccacaCACATTATTGTCAC
ATTAGCAAGTGGATGATAGGACAGCTCtcctctcccagaggaagtggcaa
aaaaacctcaagaatgatactcgagtaaaatttctaataagtgtgaacag
cagcaacgtcattttacaagcaaaagatgccttccagtttaaaaaatcag
cagaatcctgccttgacaaaaatcgccatctttgttttgcaagtgtgcaa
aagtgaaagtagcagcaacgacacaaaaacaaacatctcgcacttgattg
gatagtcaaactcgatataattttagaaacacttttattttataaaataa
agaaaagtctaCTTTGCTCGGTGTTTTTTCGTGAGCCAAATCGGTAGCAT
TTctcgaacatatacaaatttacgtcccgcgtacgcagatcttgccaaag
gatgcggaACGCGCGTTTGAGCGCGCTGCGCGCTCAAACGCACGTTCCGC
AAATAACTTGGAAAAACTTTTGTGAAAGTTTGCTACCGTCGGCgttgtga
agtcgggtaacttgcatcagtgaagagaaacttgcatagccatcaaatga
ctgacaaattaaagcagcaaaatttcaaaataaatgaacTACACAGCTTT
GCTTGCAGCTCTAgtttaccatttttgttttgatttaaattgatttaact
ttgtattttaatgaccctttgcctttaaTGACCAAACTGATTGATGCAAT
TTATTtattacccgatctcacggtacagTTTATAGTAGTGGTTGTATGTT
TGAAAAGTGAACCCTGTCAGataccgtaggatcgtctaatgtcgacatgc
gtcttctaatttcgaaatagctgtaggctggtcttcaaaactaaaaatca
aacataaacaaatacataccaaagttatcaatccatcactaaattgtact
cgcTCTATCACGtaacagattgttaatataatatgagaaatgtgaagtgt
tattatattacttatatttgaaaagaaaactttatcgatgtagtaatcac
taaaaaactaattagcatgctttcaacgaagatgcccaaatcacaacaac
attttgcacgcacGGAagtttttagtagacctttttaccatgaaccgaaa
ataattaaaagaacccggtttccttatatgaatttgaaaagggaccgggt
gtgcTAGCTGCGGCAcctagaagtttaacgcggcctcttagcgcctagag
cgcgtgcttgcaataaacaataaggacagggaaaccaggtcgactaagcg
cgcgaattatttctatcacgtgacttgaagcgtaataaagttgtaaaatt
ttaatgatgaagacaagagaaagttacgaggaaatttgcatgcgtttcgt
gtgttgtgtgaaactgcttataatttggctgtttttttttattgaaagga
ttgcaatgtttactgaacttctagtttaatggatgaacttgttcgataag
aatgataccaagaatttcattcaaggtttgttttgattattttacagatc
cggtgtcaaAATcagaagacgcatgtcgatattagatgATCCTACGGTAt
gaattttaggcaaaattggaaCCTTGTtagaacgaaaaattgaaagtttt
tcccATCATTTTGGCCTTTACAAGTTTTACAGAACATTCTCGGGTCATGG
GCCAGAATATTGAAACATTGTTTTGGCCTGAACAGTGATGTTTTTGGagg
caaaaatccaaaattttctggTCCAAACCTGGCACGAACACGCCCCCTGT
GATCTGATGCCTGAACATGCATAGCCAAGTTCTAAGCTAATTAAAGATGT
ATACTATTAGCTTATTTACAAACAAACTTAATAAAAACATGCTCGCCTTt
catggcgtcctccagctttttggtcccccctaatatgagctaaaatcccc
catctggccttcccccccacctgtctttaaaattcgtgTTTCCcccaatt
gggaaatccccctagccgtattgtataagggttgcgaagtgatgatccag
actcgcctcaattcgcaagctactgtagcaaaaaaaagactctcaaaatc
cctagaaagacaggctcataagcctgaatgcccaaacacaccaggaaggt
ctgtatttatcctattgctccccccactaggtagaggactgaatataccc
cctattcgcctttctccccccatcaagcttgaaattttcacttccccctg
gcaccaaaatctgattcccccccccccatcttcctgggggggatgatccc
atggCCTTTGCAGAAGACTTTTCGTATTTGCCATACCTTGAATTTAATTA
TGATTCCCAACACCTTTTTTAGAGCTACTGTCGTTTTGTAcaagtttccc
atttccgccattcgcactaagattcctttttaattttctaggggaaaaag
accaggactccgggtagttgaaaaataagcttgGTAAAGTTATGCAGTTT
CATGAGTAAACACAAAATTTTCTGTACCTTTAGaaaaaaaccctttccaa
tctcatgcctGTTATCCCTGaaaaatagcagaaaaattCTGGGAAAAGTG
atacaagaatcttagtgccaAGAATCTTAGTGTCaaaatgggaaacttat
aaaaaacagcGTTAGGTATAGGAAAGGTAGAATCACTGATACGCATATTT
TGTTGTTCTCCACTGTTGGTCtctgggaggtaaacaaacttGTTTTTGCT
TGCGTTTCCATAGGGAAAGTCGGGGTTTtaagcttttcttaagttctgtc
taGCAGAATCCTCTCAAGTTTCTATGATATTACAGACTTTTCATCTACCG
TTTTCCAGACCatttaaaaagaacaacaaataactattaaaaagcaacaa
aaagaacaacagaccccaaccctaaccctaactatcaaagaacaaTATAT
TTTGCCGTCCCAAACGTGACCTTGGTCAGTGACTACCACCCCTAGATACA
TGCATGTGTATAAGTCtttatttgggtgagctggaaattAGATTAACCAA
CTTTTcaccaccctgaaaatttgtTCCCAAAAATATGTCAGCATCAacag
ttagaagctgaaaaacCAATTTTCTCCAAACCTGTTGGAGGCAAAAACAC
ATTtatttacctcccaaacaatttgaTACATAATGATGGAGTGCGCATTT
TCctgggccatttctgagaattTGAATTACAGTATGGGATGGTATATTGA
AACTAGATTTCACCCTCAAAGAAAAAAGGTCATCAACCCAATTTTAGGAA
AGAAGACTacgtttttcagccaaagtgTCAAATTGtgatgttcaattttt
ttaaatttagtccAGCGGCTgttaaagttaaaaggttttaaaaaatgcaa
aaagtcatttttcaaaagttaaaaaaaaacatgcgtaaaattgatattga
tttttaaaaaaagttatgattGATTCGTAACTAATTTTTCAATAGAATTA
CAGATAGTGCTTCGATTCATCAGGCCTTGATAAcacactaaataaaaata
atcatgCACATGGATAAATGGATCAGAGATTGAGGTCTTGAAAAattgac
acccaaatccgcgaaatccgagAAATTTAATCCCTACAAAAGTTCATTAA
GTACTAAATTTGTTATTTAAGTGTAATATACTTTTTGATAATTATGAAGG
TGATTTATTTAGCCTTTCAGTCACACTTGTGTTAGACGACAAAAAGCTAA
TAAAATAGTATGGTTTAGATTGATGTAGTGGTAATTTTTTATGATTAGCA
CCCAAATGCTGTCAAATATGTTTTGTAATTGATAGTAAAACAATCTTTCT
AATAGATTTCTACCTATATGGAAACTCATTTTCCCATAGAAATCTCAAGC
AGACTTGGTAGCTGAGGCGAAAGCAAAATATGGAGATTTGGTTGCTGAGa
atattttcactaaaatcttGAACAAAGAGATTCCTGCCAAGCTGATTTAC
GAAGATGACAAATGTGTTGCATTCAATGATGTCAACCCGCAAGCACCAAC
ACATTTCCTTGTTATTCCACGTTTCCCAATACCAAGACTTCAAGATGTTA
AAGAAGATGACAAAGCTTTGTtaggtacacattttttataagaacaaact
atatactttcttttgccctttttattttgatatttatttttagGGGGAGA
ACAATTTTGTATGAAATTGAGCCTAACAAATaataatataagaacaaact
atataagagccaaaagttatgaacattcgaaggcttcaaaaactttgtgt
aaaaaacgtgtatttgatcATAGGCTAATGATTAAGTCAACCTTTGAGCA
CTTTAATCGGAGGCTggttttgttttgagaagtcGTTTGAAAGAAAGTAG
GactaaatttgaatttgaatactCTTAGTAAGTAAATACTCTACAGTGCt
tccgaaaaaaaaagttggaacACATTTTGTATGaagtaatttaaattttt
aatcttttcttacattttaatgattttaggtCACTTGATGTTCGTTGCTA
ACAAAGTAGCTGGGGAGCAAGGCTTACACGAGAAAGGATATCGTATGGTA
GTCAACAATGGAGAGCAAGGCTGCCAGTCTGTGATCCACATCCATCTTCA
CGTTATCGGTGGACGCCAACTCACCTGGCCACCAGGCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000349_pilon:143015..151654+ >XLOC_008839 ID=XLOC_008839|Name=XLOC_008839|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000349_pilon:143015..151654+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GACCATTTATTTTTCGCGCGAAAAAAGAGAGAGCATAGCAAACAAAGGGT GCCGCCCATTTCAAAAATTACCGaaaaaaaCGTGGGTTCTTTTGAAAACT TATATGCCTTTGttacttttgaacaaaaatcttatgaaattataaagatt ttcaaattaaattccaaaaAGTGTTGTTATTCTTGTCATGAAAATTTGCC AAGAAGTCTGGGGTTAAGAATGGGCGGTTATCGGGTGTTGGctatcactt tcgttttcattttcacgATGCTAATTCTTCGAATCGTTCCTTCCATCCAG AGACTTTTGCCAACCGCTTTCAAGAATCTTTCAGTGTCAGCATTCACTGG TACAAGAGCTATGTCAGCTGACCATTTATTTTTCGCGCGAAAAAAGAGAG AGCATAGCAAACAAAGGGTGCCGCCCATTTCAAAAATTACCGaaaaaaaC GTGGGTTCTTTTGAAAACTTATATGCCTTTGttacttttgaacaaaaatc ttatgaaattataaagattttcaaattaaattccaaaaAGTGTTGTTATT CTTGTCATGAAAATTTGCCAAGAAGTCTGGGGTTAAGAATGGGCGGTTAT CGGGTGTTGGctatcactttcgttttcattttcacgATGCTAATTCTTCG AATCGTTCCTTCCATCCAGAGACTTTTGCCAACCGCTTTCAAGAATCTTT CAGTGTCAGCATTCACTGGTACAAGAGCTATGTCAGCTAAATCTCAAGCA GACTTGGTAGCTGAGGCGAAAGCAAAATATGGAGATTTGGTTGCTGAGaa tattttcactaaaatcttGAACAAAGAGATTCCTGCCAAGCTGATTTACG AAGATGACAAATGTGTTGCATTCAATGATGTCAACCCGCAAGCACCAACA CATTTCCTTGTTATTCCACGTTTCCCAATACCAAGACTTCAAGATGTTAA AGAAGATGACAAAGCTTTGTtagAAATCTCAAGCAGACTTGGTAGCTGAG GCGAAAGCAAAATATGGAGATTTGGTTGCTGAGaatattttcactaaaat cttGAACAAAGAGATTCCTGCCAAGCTGATTTACGAAGATGACAAATGTG TTGCATTCAATGATGTCAACCCGCAAGCACCAACACATTTCCTTGTTATT CCACGTTTCCCAATACCAAGACTTCAAGATGTTAAAGAAGATGACAAAGC TTTGTtaggtCACTTGATGTTCGTTGCTAACAAAGTAGCTGGGGAGCAAG GCTTACACGAGAAAGGATATCGTATGGTAGTCAACAATGGAGAGCAAGGC TGCCAGTCTGTGATCCACATCCATCTTCACGTTATCGGTGGACGCCAACT CACCTGGCCACCAGGCTAAgtCACTTGATGTTCGTTGCTAACAAAGTAGC TGGGGAGCAAGGCTTACACGAGAAAGGATATCGTATGGTAGTCAACAATG GAGAGCAAGGCTGCCAGTCTGTGATCCACATCCATCTTCACGTTATCGGT GGACGCCAACTCACCTGGCCACCAGGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000349_pilon | genome | sc0000349_pilon:143015..151654 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 607-765:8482 |
| Aaloc | 370-603:7840 |
| Aaloc | 1-369:1 |
|