XLOC_038649 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038649
Unique NameXLOC_038649
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000115_pilon:490690..508054+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038649 ID=XLOC_038649|Name=XLOC_038649|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17365bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:490690..508054+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAGCTGGTTGTTGGTTAACCAAGTCAACAAAGGAAAGATTTAGGCTGCA TTTTTTGACTGCATGagtaaatattattttgaaatttgtttcgCAGTTAT GACGTTCCAAAAACTGAAGAGTCTTTTTATATGAAAATGAATATAATAGC ACGATTATGCAAGAAGCTGAttgcttcttcttcttcatttttcatctaca ctttttagatttttttttgctatctaattcgaactcTATCAAAAGTTGTA GCCTTTTTTATCACAGTTGAAGTTtatttgagacagactttattcTAATC CTTGATATGCttaagaaaagattacgtcgtTTTTTAAacagaaacatcaa aaaatacCTGAATTCGAGCCCTCTTGCTATCTAGACGCAAAGAGGTCAAG TTTTTCCGAAAGAAAAGTGATTGTGTAATCTTGATTTATGCAAATTAAGA ATAGATAAAGTAGGGTGGTCGCAGGAGGGGTTAGTACAAGCAAGCGAGGG CGTCAAATAGACATTAAGGGACATATCTTGCCCCTCCCCCTTACCCTTGT CTTTTAAAGCAGTCTTTAGTCCTAAAggtttattttaagaaatattcttt caaagattgggtaaaaaatttctctctttcaTGAGAGTCTATAAGCGAGA GTTAAACTGGCAAAATAAATGGACTTTTACCCAGTAGCGTGAGCGAGTCG ACTAAAATTCGAGCAAACTGGAAAGGCAATTtcagaagattttgattttg gtgcccactatgaaaaataaatatctttgcAAAAATTACGCGAGCGAGGC GAGAACTTTTGGATAATTTCTCTCATTTAGGTCAAAAACTGCCAATTCTA AGACTTAAAAGCAAAGGGGCCCCAAAATAAGTAATCACAGGCGTACTTTT GCGCCCTTGACTTTCGGCGCCCCCTCAAAAAATCGGCCTCTAAGGTGCTC CTACCCCTTCCAGCACGCTACTGGTTTTACCACGTAATGCAAAGTCCTTA CGTCAAAAGAAATCAGTAATATCGATAAGATCTGAACTACCCGGAATTCG ACCATGTCtatatttttagaaaacaatgaaataggggttttggtttttaa aaagaaagacatGGTAGAATTCTGGGTTCTTCGAATCTTACTGATTGTGT AAAGGATAAGCTGTAATTTTGACACAAGCATATCAACGAATTATGTATAA GTGAGTATGCACTAACCTTCAAAGGCCTTATTATTGACAAACCATTCAGC TTCTTTCCACTCATTTTGATAAATGAAATCCAAAGTTATGAAGGCGTATT TCCCGTCATGCATATCCTCCTTGTAAGCGAGCGATAAAAGTTGTGCGATG ATATCGTTACCACAGATGAAGAGCACCactgttgaaaaaaaataacaaaa caagtgatacttttatggacctacctggttatgcatttataattgatatc tacgtgacgtgaccattaaacaatcattcagaacacaaatagtgacgatc tatcaaaattagtcgtttgtttcttataaaaaaaacgtttactgtagaaa ccaaaatttcatgctcttgaaatatacTTTCacattcaagactttgtgag caaaaacaaacatctaactcatcaaaaaattgagtaatttggctaagaac attgtatgcttattaatagtgattcttatagataaagatgcgttttttga gctgaaaaattctttttttacaaaaatctgcttgagccatcttttaccta ctttcatgcaaaaaatcagaaaaaaacaatgatccaatatttcacaaagt cgaaaaaaccctttttttggctgttttttagctgaaatttaccccaaaaa tttttttccaaaaatcgagctccgtcacatttgagggtttatagttatgc atgtttgtgcaaaaaaacataaagaatgaaagagccaatctcgagaaaag ctaataccaaagtaattgataatgttcttataaaaaaatatcgaatttgg ccagtttttttataaaaacacgccaagcaaatcaaattttctgtctaaac acacatattcttcaaaagtaagccctcatgagcaaaaaaaaacatattcc tcataaaaaaattgagtaatttgactaagaacattgatgtatgcttatta caagtgattcttatagataaacatgcgttttttgagccaaaaaatttttt ttgcaaaaatctgcttgagccatcttttacctatgatggtaccctacttt catgcaaaaaatcagaaaaaattaatgatccaatttttcacaaagtccaa aaaacctgttttttagccgttttttggcctaaatttgcccaaaaaaattt ttttttcgaaaatcgggctccgtcacattttgcccattaccattttgcac ctttgtaccaaaaatcaaaagattcctatgattcaatcccgagaaaagtt ggtaacagacggacggacggacggacggacggacggacggacggacgaac acaggttaatttataggacctccaggtaggtccaaaaattgtaACATCTA TCATTACAGGGTGttccgaaaaaaagtatcgagtcgtattACTTCTATAG AATGAAAGTTCTTCTGTGTGTTTCACCATGAACAGATAAATGGACATCTA ATGGACAtttatcttttaaattttttgatatttacaAATCCATTTTCACT TTCGATCCGAAATTTTAGGATCTGAAATTTAGTGACTCAATCTATTTTCa ctccaaaatttaaaaattaaattttagtctACATGAAAGGAAtaactaat ttaggtgaaaCCTTGACACAAAATTATCTCTACTTAGAAAtgcgttttca aatagttttcaacactgGTGAATCTTTGTAAGGAGCTGATTTCAACTATA TAACTCTTATATGTTTTTAGGGGACCGCAGTGTCCccaattttcatttga aaatagtcgaattatgtgcataattttctaaaattcaaaagaattcaacc aaccatgagaaaatatgcaattaaaacACGATTAGAacaaagaaaacaca ttatcattTAACACGTGCAATAGCATTCCCATTGCAATTAAGGGACCTCA CacagacacgcttcattttaaggaaaaaagcttGTATTTATTCTATTTGA TAGTAATTCTATGCTTCGTTGCTGCCtgttttcaaaattggtataaaaag tCCGATaatattccgtcacaattttatttctatgaattactaggtaaaag gattggatagagcttgaacattactattctccaattttttcacaagtttg caatatattttagcAACactttcaactctgaaatgcagaatttcaactgc gtgtatacttttgaaacacttttgtcactccaataactttttttacGACT TGAAAAAATAGTATGCCAAAGTTTAGAGTCTGCGTCATAAAAGAAcatca taatttgaatcccataatactctctaaaattattcagTACTTTTGAGTCA AAGTTTAGAAATTTTAGTctgagttttgacaagctgacgatgattttgcc tctctTATTGTTGTTATGATacagataaaagacttgagaagagtagaaca acagagacttttatCAAAGTGTTGACATTGTTAGCTAGGTATTCCCAAGA ggaatatcatcaaaatttattgtttcattttatggtTTTAACGAGGCGGC GGCGAAGCTGTTTGGAAATTGTACCAAAAAcccccccaaaataaggtaat tgtaagctaaaaccaggctatttagagtAATTGTGgcagttgaaaatatt ttcaaaaataaatagcGGGGAAGACGTTTCTCTGGGACCTTACAGTAAAT GCTTGATCTCACCTCTACTTTGAGCcttcaaaatattgataatcTGCGGA AATTCATAAGCTTCAATGGGTACCAAGGGATAAAGTGTGGTATAGTTTGA AGAGTCAATTGAATCTTTAATAATGCCAAATGTTTCTGCGAAGCGTTCCT CTGTTGAATACACGATAGCCAATTGATTCCATTTAAATTTCGATAAAGAA TTTTGGATAATACGGGCTAAAAATTATAGAGATAACtattaaaattaaaa gaaagagactttaATTCATTATTGCAAAGCAAATATAGATGTGGGGAGGA GAATTATTAAAggagacacccctgtgtcacagacccagttgaaaaatttg gccaaaatatagGCCCTGATGGGAAAAATGCCCTATGGTTTCAGcccaac tgggaaattgactgtGGTTACATTCcgattcaaaaattataaaaaattgc actccaaaatcatTCCACTGGAGTTTTTAAGCTTGGAACATTGGGATTAC AATGGaaaattttatccccgctgttggaaaaagtttcaatggggctgtga gacagcgGTGTCTTTAGATGagcaacaaaaacaaagtattgaggaatatt ttttgtttccatGCTGAGGAACCCAGCAAAAATATCAGATCCATcacacg ttcttttataagaacaaattatataagaatataGGGCTCTGATGGCCAAA TTAccttaaaaatattctaaggCTTTGAAGACGctgaaacacccaatttc ttagaaactACGCAAAAATGACTCACGAAATGgtgaaaacaagaacattt taaagaactttttagatgtttaaaactgaaaaacttaagaacctcgaaaa gttttgaaaacttttgaagttttcataaaaataaaacttgtatTATTTCG AAAAGAAGGGTAAAGGAGAATAGAGGAGGAGTCAAAGCTAGCACaggaat aaaaaataattgatatcaaagtttaaaattgaataaatatctaaaaaatc tGTCATGCTGCGTTTCACAATATTTTTTATcccaaacaaaaaatatttct tttaaaatatctCAATTTCATGGTTATACTAATTAAAAGTCTCCCTTTGT TAGAcctatttggaaatttttaaaccgttttaactttgaatttgatCCAT ACTTTTGACCGAGCAAACAACTTTTGCAGTAGAGAAAGGTTTCAAAATTG ATAAAGTTTGAGCTAGAAGGAGTAAAGGCAGAAAGAAAGTTATGTAGCAA TTATTTAGCATATTAAAGAATCCTACTATAGAGTCCAAGGCTTTTAGGAA CAATGGGTTTCGGGTGTGTGCGAGCCACAGGgataaaaaaacatgaaact gcAAAAATCGGCTCTCTCACAGGGTCATAAATTCTcgtaatttggaccaa agtttgaaaatgaaGGCTAAAAATTGTCGTAAAAACGTGAAAACGGGGCT TTCGAAATTTAGTCTCTTACAGGGtcaattttgcaaattttggctcggac atacccgtcaacCTAACCTTTATCTAGTGAAATTCGATGAGATTTTTCCA AACTGTTAAGAATGTCATTTATAGTCTTGTGTGATGGAGTCCAAGAGAAA CCAGAGTTATTTACAGCCTGCTTTTGAGCCCCCAGCAGTTTGCGTGATGT CttgattgttattttttttggcgtgacgGCGTAATCTATCACTTCATAAA GCGTGATTGGATTTGAGAGAGATTTTTGGCGTGAAAGGCGTGATTAGAAT TTTGTTTTGGCGTGATGTGGTCAGGGGCTTCGTTGGGGTGGAGAACTCTG CGGGCGTGATCGGGGACTCCACTTGGACCTGTCCTCTGTTTTTGAATATT GTTGTTTTGTGCATATATAAATTTATAATATAAATTTAATCCGAAAACTA TTCCGTCGTCCTGTCAACGGAAAGCAAACAGGTCCATGGGAACTAGTCCC TTAATATTATAATTTGCTGCAAATCGTCTATTTGCGGTTTGTTTAAACCT CTTAGATAATGATTTTCGCAACGTAAGTCTTTTTCGAACAAAGTCTCTTT TGAAATCAATATATCTGAAGAAGctaatcaaatttcagaaaacctTTCGA AAGTCGCATTAAAAGGAAAAGGGACATTTTTGTAGACTACacgaaggaaa tatttgttgaTGGTGTTTTCAAACTATCACCAGGAGAGTATTTTTCTTCC TTATAAGGAATATAGAGATGTACTTTGTTTGCAACACTCATTCACAGATG ATAAGTTAGTGACGCTCCAAAAACATACAATGCTTCCTGTTATTATAAAA CCGAAACTGACGACGCTGAGTAATCATTACAGAGGAACATTTCTCATTAT AAAAGCTAATTAGTTTTTGCGCATTGCAATATTTATGCAGTTAATATTGT ACCATCAAGAAAGTGTAAGGTTATCTTGcttctaaagaaaaattgtaaGT GTTTCGttttaatttcttgatttttacttCCATAAAAGCGCCAATACATT TTATAGTAATTTTAACTACCATCGATGATACAGCAGCAGGAAGAGTTTCT TGATACCAGTATCAACAGCTACTTTTGTACtccatcattttttttcatcg gCTAAACGAGTTGAATCTGATAAAAACgtaaatttctgaatttttcaaat tttaaaaatcgagGACATATCTTGAATACGTTATTCGACCATTCCTCTAC CATCAAACTCCAGGTCAAAATCCTGGTCACTCAATTGATTAGTGTCTTCC GCTTCTACGAGTGGTTAAGGTGGAGTCTAGATGTCCTCTTTTGGATatac aatctcggtcaaaatatgttgaaaattttggttaattcctcgtttttagc aatttaaagttcgagcgagaaagtcgcttttggacTAATTAATAAactta ttcgaatatttcaattcgggaggggtttatagacttccaggctatattct gagccctattggaccattcttcgacgttaaaactctacccttccaaccta atttagagcacttccaaatcgattgtggctataagatttcgtgggaattt cccttttttctcaaatatattacaaccatgattgtagctcTTCTACGCTC GAACAAGTTCTGTTTTCGGTGTCTTTAAGAATCCATATGTAGTGGGAATC AATTGTTGTTTACAATTTCTGACTATTCTGTGAGACTAATGTGGTAGATA ACTGAAGTACGTCAGAAAAAGGCGGAATGGATTTTTACCCAAACACTTCG ctctaaataaaaataataaaggaTATAGCGGTTCCAAAAGAAACTGTAAT CTGATAATGAATGGTGGTTATTGATTCGATGGAGTGGGTTTTTCCTATAC AGGAATTCGTCACGGAAAATCGTCAGAACATAATCTGAATGACAAAACCA GACACAGTAGTGATCAAATTAGATCTTTGAAGTTGCAAATTTAATGGAGG TTTCAGTGATATGCCAGTAACCAAATTAATACAGACATTGACATGTacaa aaatagcatttttaaggATATTACCAAGACTAACAGTCGCTGTaacctaa cctgagatcagactgtgaatgttttctgcgcACCACGCTGAATCTCTAAA GGGAtttgtgaaaacataacaatctgacgaatatgcaatctcgaaatcgt aaggaccacGTTCGTCTGAAAGGactaggaacgacaacaaagttgcgtga ttgtgtttatgaatagggcgccgtatcagtttttaactttccgacgcaca acaagatttttattgtagaattttccgcgggagtactattttcctcagat gtataattttcaagcgccttcagttTACCgagcgcgtaagaaaattacga gCAGCTGATATCAGGTCATTGTAACCAATATATACCGTTTGACCCAGTGT TAATATATCGTTGTTTTAACCCAGTCAGTCAACCAGTTAAttgatttctt tcgaaaatgaAGTAAGTTATCAGTTTAAAGTAATAAATGAGGGATAGCGT GGATTAGGAGTGCCCCGCTGCGTCTGATTTTGAAACTGTGTTGTGCGATT TCGCATCTTTCCGTTTGGTTAAAATCATAAATCTTTCAGTGTTTGAAATA CAGAAATACAGTAGCAGTTATAGTATTTTACAGAGGTTAGCTTTTTGTTA TTTGGCTGTttgtaattttgttttaatGATTACATGGAGTAAGCGAGACa aaaaaaGGGAATTTTGTGAACTAATTAATCATCAAAATGCAGGAAGAAAG TACAGAGCTTCTTCATAAGTACAAGTGAGTATCAAAACGTTTTCCGAATC TGATTTCAAATTCTCTTTGAAGTGCTGATATTATCATTTGtttgatcgaa aaactgtttcatcaatcatatcactacccccgtttttagtaataagttgg agatttgatatttcacagaaaagtgctaccaacgggtatttcgggtccca tatcttccgaaacacttttttgtttgccttgaaatttaacaaacttctta acctaaggttgaactaccacaggtgtaaaaatgaacgttatagcataagt agaaaaaagctcaatttttacaatcgcaaattaaaccgctaaaaatcgcg aattttctcaaccaaaaatacttttgattctctaaaacaagaaaaaaaaa ttttcgcaattatatttgactatcaaaagttacagccattcttgtttcca ctgccaattatatctggacagactttagtttacAAATTTCTTCATTACCT TATTATGTTCCTTTAAGGTGTGCAGGGCAATTGCGTCAAACTTTCATTTC CTCAATACCGTTGGATGTTGGACCATCACCAACAAAAACGCAACGTAAAT GAAATCGGCAACAGCGCAAAAAATATTCATAGAAAGATTGCTAAAATTTA TCGACCGCCGGTGCGGAGGCgctttctttcatagtggtacccttatctcg ttttgccttggctcattactttgtctaccatttactttcggtctttttta actagattacccaggtgtttctctttttttttccctGGATggcttttatt cggaattgaataatcgagacatgaaaaatgaccatattgtaatctgtttt ccaACATATGCTGAAAATCAGAAATGTGGAACATTTTGAGAAAGTTgtat tttagaaaaagtcagCTACCGTTTCTGAAATTGTTAAGAAAATAAcgtca aaagttttttaaaacattttttcagcTTTATGTTTCCGCTTAAACTTGCA GCTCTTTTGATGGAAATGCATTAATGAAATCCCATTTCAATCATCGCTAC AAAATAAAATTGGTTGAACGAACACGCTCCCTCGCAGCGATGCGAATGAA TTAAAAAGAGATTATGACATTGTTAAATTGTTctttaaatgaaattattt ATGCGCGTGCGcaagtaaaagtaaaagtaaaagtacatcgctaataaaaa aaggcgaagtcaaaaagATAGGCCTGATTGAAAACATGAGCATTAAATGA AAGTAATTAAATGGtcgttcaactttttttcttttgaaaataacaatttt tctaaagaaatatTGACATATTCGATGGAGTTTACAAGCATTTCTTTATT GAAAGATTGAACAGTTTCTGCGCCATCCTTCATCTTGTAACATACTGTAT GCAGAttttttgacagaatttttctcatttttttacagaGTCCCTTCGAA CATGGAATCGAAAGTTGATGAAGAAGTAATGAGAAATGGTGCAGACCATC CTGCAGAAATGAGCGAGGAACAACGGAAGagattggaaaaaatcaaatcc AGAAATGTTGAGCGTTTGGCGCATGATCAAATGAACAGGTGAATTCTCTT TCAAGTTTGGAGTCtttttttCTGTTGATGAATCATAAGTTTCTTTTAGg agaacaaaaattaaaattccaaaatcatGATTTCAAACATCCCATGTTGG TATATGACACGGAAAGGGTTAACATTTATTTTATGAGGAAAAGGGGTAAA TTCGTTTTGATATTAAAATTGATTCTTTCTTCAGATTAATTTTCACGAGA ACTAATTTTGTGTTTTCCCGATAATAAAACTCGAAAAATCGCATGAGATT GCTGCAATACCGTGcataatatataataattttcaaaaattaagttaATT TTATCAGTTATccccctcccccccTTACTACAATGCTGGTTGTGTATTCC AGCCGAAAAGTTGCAGTTGGCTGACCGACCCATCAGCATTGTAGTAAGGG GGTTTCATGGTttgcggaggagcggaatcggccggAGGAATTTTCGGACG GAGCGGCggaatttgacgaaaatttagacggaatttcgaaaattgggtTC TCCGACGgtgacggaaaattagacaattttagtgcggaaaaacagaattt agcaaattttcgcggaatttcgaaattggcaaaaaatattcaaaattcgc ggaacttttgacaaaaatcttgaatttcaagggaattttcggtgacggaa tttcgGTTAATTcttagacggtttgacggaaatttgagaaaaattggcGG AATAGCGGAATCGGATACcccatgaacccccccccccgcccttAGCGAGG GGAAAGgaggaaattatttttcagtagtaatgaatcaaaaattatgCACG GTATCGTGAATTGCTAAATTAAAGagcttgtttttaaataagagtgatat cgtttgcttactcattaaTTTAAATTAACaagcttttttacattggatcg atacggatgtggagcaagattggtcagaaagaggaaaacaaaaacattat aatataacaataggaagatactgtctgatatgaaacgggaacacttatgt aaaaacaaagcctttaaatCTACACACGAAAATTACAAGATCAGATTCTC GGCTGAAAACAACAAATTGGCTTTTCAAGGGCCGCACCTAATGTCACACC TAAAGCCATACTtgctatcaaaatcataaaaaagcgaaTTAAGGGACTGA GTTCGAGTTTGGACCGCGCCGTCAACTGAAATTTGCAGATTCGCAAAATT AAACCTATTATTacggaaaatattttaaagtatCGATATAAAAGTGATAT CTCGGGCGGGGTTTGGGATTACAGTTAAATTCTCTTACTTGGATTAATTT TTTAGCcggtttcttaatttttaggatTTTCAGCGTTCAAATCTAATAAA AGTTACGATAACAATAGCTATCGATATCTatagatatttttaaattatgc ATACTGAATAAATACGCAAACATAGCTATGAGAGGTATtgcgattttttg aaattgtcttcATTGATGGgatgaaaaaatcataaaatttaacAGAAATT CCAGCTGGGCATTTAGGGAGGGGGCGAGTTAAtttagaaataataataat aataataataataacgaatgttttaagtggctggctccgaaaaattctag agcttttagacagctcaagaattgtttccacgaagggccactacgaacag aacaagaacagtaacaaaaaggaacaggaaaattggattttaaatAATTG GAGAATTAGGTGAAGAAATTTGCATCTAAAGTTAGATCATGATTAATTTT GCTCTTTTATGGTCATTAGCTATCTGAAAGTTAATAATCGACACaaaata gcgcaccgcgctgaatctaaaaatagattttatttttgacataatcatta ccaTCGAtttcattactctcgatgtgtttgtacgagttccaatcctatca acctttgcgttaatctcttttgcacgttaattgcatcatttgataaaata tatatataacaacttgcacgtatctttaattcagccgcattgaattgtgg gattgcaactcgtacaaatgtcaaaaaagtgaaaaataataattatgacg tatgtgttgcggagcgctattggaAATCGAATGATCCTCGCATCTCATTT AATGGGCACATGCTGAGTTAAGTACAAACTTCAACCAGCTTGATATCAAT CTTATTAACAGTAGGATTATATGTGTAAACCGTATACAGTaatatttgaa atatatatGTAACAGTTATCATGTTGAACCTTCTCATCGTGAATAATACA AACAtcgtcaaaaatacaaaaatgatcgctcttttattgaaaaattgact taaatattttctttctttacagCTTGATCCCAATCTACAAAAGCACTCTT AGTGTTTTAGTATCGGTCTTTCAGTCTTTTGATTATGTTTTTCTTTGACA GCGTAAAAGAATTTCATCTAATCTAAACAATGTccgttaaggccggtctc catttgcgcgcgctgcgatcgcaccttttggcttcaaccctttttgctcg aaaaaaagattacgtcataaaaatgtagcgcgcgctcgaaaaaaaagttg agcatattttaacttttttcaagcGTTACGTCATATCGCGcaaatggaat tgcttcatttctcttttgaccaatagcatgGTAGCTTttctcgaaaaagt gcgatcggaACTTGCGCATATGGAGACCGGCTTTTATAGATTCGTAAGAG AGATGGGAAGTGAAGTCCACTCTCGCTTTTAtacgaacttctattattcg ttTGTACGGGCCTGCATCATAATGAAGTATTAAGATACAAATAAGATTTT CCAACTACCTACTGTGATACGCAAATCCAGATTCTTTTTGAGGCGCACAT TTAGAAAATACTATAGTAACCAGGTTGTCGAATAGACGAGGCAAAGTTTC TCTTGTAAAGGAAACAAATTTTCCGCGGGCTCGTTTAACAGATATTTACA ATTCTCAGAAGAACATTCATAAATTAGAATTATGTGCAATGATATAATCT GCTTAGCGAACAATAGGTGTCCCCCATCTTCGATTTTTTAAATGGTAAAC TTGCAAGTTGCAAGCAGTTGTATTGCAGGCGCCTGACAATCGTCTCAGTA TAGCCAGCAAGAGGAAGTTTGCAATTACTCGAAAAACTATCGTTGACAAA CCATGCAAGAAGTTACACGCGCTTTCAAATAAATAACAGAAAGATTTGAC GTGCTACTTTCTGCAATTTCTCAAACGGCCACCTGCAAATAATCTCAACA GTGCAGCCTCTGCGTAATAGTATGTCGCCACAGGTAAGATTTCATTGAAA TCGAAACTGTGGTCACGTTGCTCATTAGCCAACTTGGTTTTTGTATTATT TCAGGTGTCACCatgtttctttcaaaattggaccgctttcattttatttc aacCCGATCACCACAATCGTTTCAGCGGCCATCATTTGGATTTTTGTCAT CTTGTGTGTTGTTTATCCTGATGGTGCAAACGACTTCATGAAAGACGTCA AAACTTGGGTCACTGAGAAATGGACATGGCTGTATGTTGTCACTCAAGAT GTGTGGGCTGTTTTTATCATTGCTCtctatttttcgaaatattCGAACCT CAAATTAGGTATGTATATGTTGATTATTTTGTTCGCTGTCATCTATGCGT ACACTCGTAGTAGAAGGCTCAAAATACCAGTATTACTTCAAAGGGCCGTA ACTTTTGTTACAgaaactttcactttcttttttattgcgTTTTAGATTGT TTGATTGATGTATAATGAAATTTTAAGAGGTCAAGTTTCGATTTCTGAAA TAGGCTCGGCAGTGAACGTGTTTTTAAGTTAATAATTCCATATGAAGACT CCTATAAACACACAACACTTCATTTCTTTAGGTAAAGATGACGAGAAACC AGAGTTTTCAGATGGGACGTACTTCATGATGTTATTTTCAGCTGGTATTG CTATTGGATTATTTTATTATGGTGTCGCAGAGCCTGTCTGGCATTATCGA TCTGTGTCTGGTTCAGCACCATTTGGAAATCGATACCATGATAGGTATAA TCCACACTGAAAGTGTTTAGTTTCAAATGTTCACTTTTTCCTATTTGTTA ACGCCTTACCACATGCATTGCATCGAAAGTGTAAACCGGTTTTAATTCAC GCTTTTTGTCTGTGAACGCCTTACCACATGCATTGCATCGAAAGTTAAAA ACAAATCAACATTATATTTTATGGAAGCCTTACCACAACttcagaaaaat taatttgtgtCAGTTATCTTACCACATCCATTGCTTAAGGCCAACCATAT TTCTGATTCGATTTTCTAGATATTCGGACAATCAAATGGCTCAAGACGCC ATCAATTTGACGTATTTTCATTGGGGGATCCACGGTTGGATTGTGTACGT GATCATCGGCTTGCTGCTCGGATTCTTGAGTTACCGAAAAGGATTGCCAA TGACGATGAGGACATGCTTCTATCCGATTCTTGGAGACCTCATTTATGGA ATCATCGGTGATTTAATCGACATCCTATGCATCATTTGCACTATGTTTGG TGTCTGCACGAGTCTTGGTTTGGGAGTCATGCAATTGAACAATGGAATTC ATCGAATCAACAGCGATATTGCTGAAAGTACCGACAACCAAATTATCATC ATTTGGTGTGTCACAGCTTTGGCTACCATTTCTGTTATCAGTGGTTTGAA AAACGGAATTCGAAGATTGTCAGAAGTTTGTTTTGGAATTGGTAAGGTAC TACGTTTTAGTTCTTTGACAAAACCATAGAtatataaagcccgaagggct agatgtaaagcttttgctgaaaagtgtgccgtggttaggtaggaaatcta ACCTAAGTCACGttacattacaatagaatttcaacgattgaccaatcaga agcttcgcggattttcgaaaacaatagcaacaatattctTTCCAATACTC ACtttttttGTCTGCATCTAGTCCTTTCGGCTTTTTAAATCTACGAACAA AACGTGTTGTCttcatcttaaaattttaacatttcacTTGCGGGCCTATT TAActgtgaaattttaaagaaaaaaacatagcaatctcgtacccagaacC AATTCCACCACTTTTTGGATTCACTGATAGACGTAACACAACCTTTCATG AGTGCTGTCATAATCATAGATAAACCGAACTAAGgaactgggttcgagtt tgacagcaaacaattttcaatttcaggttGTTTCATCATGTTCTTCATCC TGTACTCCAATGACACTTGGTTCATTCTGAATCTGTTCGTTCAATCTATT GGTTATTACTTGCAATGGATCATCCAGTTAGGATTTCACACAGATGCTTT TGCACAAGAAGGAAATGCACCTGACGGCAAAGAAGCACCAAATTGGATTG ATGGGTGGACTATCTTTTACTGTAAGTTAATTTCTACGTCAGAAAGTCAG GCAAATAAATGACGTATTAGGATGTATTAGGTTCCAAAATATTTATCTTT GTCGAAATGAGTAAAGAATAGTAGACTTGAAATGTTATGAAATTTGCTGA ATTCTGTGTAATAAATTATTGTTTGTTTTGGCTGCGATGTTGGGGATATA CCATGTAAAGTAAGGTCTAGCTTAAGCGCCTAAGACCGTCAGGATGACGG CCTGTCGAAGGACTGTGATGACAGTCATACGAGCGTGGACAGCCTCTACT CCTAACCTTGTACCGCCCGGGACAGTAGCCTGACCTTAGCACTGTCCTCG GAGAACAAGGGTTTACTTTATTGTTCGCAATATATATATAACACATCATT TTTAGGAGAAACTTGTTTGTGTTTTACAAGccattttattcttcttttct ACTCATAATATATTTGTTGTCTTGATTTCAGGGGGTTGGTGGATCAGCTG GTCACCGTTTGTTGGAATGTTTATCGCAAAAATCAGTCGTGGAAGAACTA TCAAAGATTTCATCATTTACACTTTGACATTACCTTCCCTGTACTCTTTC CTTTGGATGGCCATCTTTGGTGGTGTTGGAATTCAAATGCAAAACACAGC TGAGAAAGCTGGGATGAATTGCTCTTTGTACAAAACAGCAGTTCAGGATC CATCAAAGTAAGAATCCAAATGTCGAGTTACTTCACTGATCTTCATAAAC ACTTGACTAAGCCATGTCCGCCATCGTTGctaagaagtttttttttttga acgtggtacccgcaaagaagccattgcagcaGTGTTAGAAATTAACGTCA AATGGCGCTACTAGATCTAGCGTTCTCGATACATTTACTCCGGTATTGAG TAGTGCTCCCATTAGTGTACCActattagggtaccactttcaaaaaaccc TGGGATCAAAGTTTTCGTTTGCTGGAATTAAGGAACTGACTTTAAGGTCC ATATAAAGCTCTGGGGAGATTTAGTGTGTATGGCAAAGGCCTCAATCCTT TATGAACGCAGCCGATCGTTCactcattttttcaaagtcgaAGCTTGATA AAAAGCTTCTATCTTGAAAGTTAAGCAATGATTTTGGTTTAATTTGGAAA CAATTTTGAATCTTCTTTTATTAGCATTCGGTTTGAATTAAAACTCATAA ATCCAGTAATCAGTGGTTATGTTATAACGGAAAGTTCAGAACTTGTACAG TATTTATTCAGAgtcaaaattctttgttaatcTTAGGTACAACACTCGAT GGGATGAAGTATACGCAATGTATGGTACAACCATGCTGGCTTGTCGTGGT ACAACTGAAATGTGGTTCGATGTGATGATGTCACACAAAGATCTTGGAAT GATGATGGCTGTTTTGTCTCTCATTGCTATCATCTTATATTTTGTTACAA GTTCTGATTCTGGCTCTCTTGTCATTGACTGTTTGTCTGCCAATGGAAAC CCCGAACCACCTGTAATGCAAAGAATCTTTTGGGCTTTGACTGAGGGAGC TACAGCAACCGCTTTATTGAAAGCTGGAGGCTCAGAAGCGCTTTCTGCCT TACAGACAGTTTCTGTGGCATGTGGTCTGCCGTTTACATTTTGTTTGAAT TGGACATGTGTTGCAATGTGGAGAGCTGTTCGTGAGGAGTATGGTGAAAT TGACGAACAAGAAGGGAGATGGTATCGAAGTATGTGGTCATTCGCCGACT TCAAAATCCTCTCTCAGATTCCACTCGATATCGTTGCACCCTGGTATCGA CTGGCCAAGTTAAGATTGAAACTTGACAAACAAGAGTCGAATGGTGGTAT GTTCATTTTGTACGCAATCCAGTTTGGATTACCATTCTATTTGtggatta ttttgatgattgtgGAAGTTGGTGTAGAGCAAATCTCATATGTTGCTTGG GCCTGTTTGATGGCTTTTTTCGCTTTCTCAAGTGGTGTACGTGGTGAAAT CAGAGAGCAATTTGATATTGAAGGAAACATGATTGAAGATCTTTTCACAA TGGTGTTGGTGTATCCTTTGGCTTTGTCTCAACAAAATGATCAAATGATG TATGGCCAAAAATACAAAGAGCAACAACACAACGGGCTTGAGATGGGTGT AAACGGCACTTATATTCCCAACGCTTCAAACGCCCACTACCCACCACCAC CCACCTACCCTTCAAATGGTGGTTATGTCATTAGTGCACCGCCCAATGGa aaccaaaaaatgtaa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:490690..508054+

>XLOC_038649 ID=XLOC_038649|Name=XLOC_038649|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4866bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:490690..508054+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAGCTGGTTGTTGGTTAACCAAGTCAACAAAGGAAAGATTTAGGTAGCT
GGTTGTTGGTTAACCAAGTCAACAAAGGAAAGATTTAGaGTCCCTTCGAA
CATGGAATCGAAAGTTGATGAAGAAGTAATGAGAAATGGTGCAGACCATC
CTGCAGAAATGAGCGAGGAACAACGGAAGagattggaaaaaatcaaatcc
AGAAATGTTGAGCGTTTGGCGCATGATCAAATGAACAGaGTCCCTTCGAA
CATGGAATCGAAAGTTGATGAAGAAGTAATGAGAAATGGTGCAGACCATC
CTGCAGAAATGAGCGAGGAACAACGGAAGagattggaaaaaatcaaatcc
AGAAATGTTGAGCGTTTGGCGCATGATCAAATGAACAGGTGTCACCatgt
ttctttcaaaattggaccgctttcattttatttcaacCCGATCACCACAA
TCGTTTCAGCGGCCATCATTTGGATTTTTGTCATCTTGTGTGTTGTTTAT
CCTGATGGTGCAAACGACTTCATGAAAGACGTCAAAACTTGGGTCACTGA
GAAATGGACATGGCTGTATGTTGTCACTCAAGATGTGTGGGCTGTTTTTA
TCATTGCTCtctatttttcgaaatattCGAACCTCAAATTAGGTGTCACC
atgtttctttcaaaattggaccgctttcattttatttcaacCCGATCACC
ACAATCGTTTCAGCGGCCATCATTTGGATTTTTGTCATCTTGTGTGTTGT
TTATCCTGATGGTGCAAACGACTTCATGAAAGACGTCAAAACTTGGGTCA
CTGAGAAATGGACATGGCTGTATGTTGTCACTCAAGATGTGTGGGCTGTT
TTTATCATTGCTCtctatttttcgaaatattCGAACCTCAAATTAGGTAA
AGATGACGAGAAACCAGAGTTTTCAGATGGGACGTACTTCATGATGTTAT
TTTCAGCTGGTATTGCTATTGGATTATTTTATTATGGTGTCGCAGAGCCT
GTCTGGCATTATCGATCTGTGTCTGGTTCAGCACCATTTGGAAATCGATA
CCATGATAGGTAAAGATGACGAGAAACCAGAGTTTTCAGATGGGACGTAC
TTCATGATGTTATTTTCAGCTGGTATTGCTATTGGATTATTTTATTATGG
TGTCGCAGAGCCTGTCTGGCATTATCGATCTGTGTCTGGTTCAGCACCAT
TTGGAAATCGATACCATGATAGATATTCGGACAATCAAATGGCTCAAGAC
GCCATCAATTTGACGTATTTTCATTGGGGGATCCACGGTTGGATTGTGTA
CGTGATCATCGGCTTGCTGCTCGGATTCTTGAGTTACCGAAAAGGATTGC
CAATGACGATGAGGACATGCTTCTATCCGATTCTTGGAGACCTCATTTAT
GGAATCATCGGTGATTTAATCGACATCCTATGCATCATTTGCACTATGTT
TGGTGTCTGCACGAGTCTTGGTTTGGGAGTCATGCAATTGAACAATGGAA
TTCATCGAATCAACAGCGATATTGCTGAAAGTACCGACAACCAAATTATC
ATCATTTGGTGTGTCACAGCTTTGGCTACCATTTCTGTTATCAGTGGTTT
GAAAAACGGAATTCGAAGATTGTCAGAAGTTTGTTTTGGAATTGATATTC
GGACAATCAAATGGCTCAAGACGCCATCAATTTGACGTATTTTCATTGGG
GGATCCACGGTTGGATTGTGTACGTGATCATCGGCTTGCTGCTCGGATTC
TTGAGTTACCGAAAAGGATTGCCAATGACGATGAGGACATGCTTCTATCC
GATTCTTGGAGACCTCATTTATGGAATCATCGGTGATTTAATCGACATCC
TATGCATCATTTGCACTATGTTTGGTGTCTGCACGAGTCTTGGTTTGGGA
GTCATGCAATTGAACAATGGAATTCATCGAATCAACAGCGATATTGCTGA
AAGTACCGACAACCAAATTATCATCATTTGGTGTGTCACAGCTTTGGCTA
CCATTTCTGTTATCAGTGGTTTGAAAAACGGAATTCGAAGATTGTCAGAA
GTTTGTTTTGGAATTGgttGTTTCATCATGTTCTTCATCCTGTACTCCAA
TGACACTTGGTTCATTCTGAATCTGTTCGTTCAATCTATTGGTTATTACT
TGCAATGGATCATCCAGTTAGGATTTCACACAGATGCTTTTGCACAAGAA
GGAAATGCACCTGACGGCAAAGAAGCACCAAATTGGATTGATGGGTGGAC
TATCTTTTACTgttGTTTCATCATGTTCTTCATCCTGTACTCCAATGACA
CTTGGTTCATTCTGAATCTGTTCGTTCAATCTATTGGTTATTACTTGCAA
TGGATCATCCAGTTAGGATTTCACACAGATGCTTTTGCACAAGAAGGAAA
TGCACCTGACGGCAAAGAAGCACCAAATTGGATTGATGGGTGGACTATCT
TTTACTGGGGTTGGTGGATCAGCTGGTCACCGTTTGTTGGAATGTTTATC
GCAAAAATCAGTCGTGGAAGAACTATCAAAGATTTCATCATTTACACTTT
GACATTACCTTCCCTGTACTCTTTCCTTTGGATGGCCATCTTTGGTGGTG
TTGGAATTCAAATGCAAAACACAGCTGAGAAAGCTGGGATGAATTGCTCT
TTGTACAAAACAGCAGTTCAGGATCCATCAAAGGGGTTGGTGGATCAGCT
GGTCACCGTTTGTTGGAATGTTTATCGCAAAAATCAGTCGTGGAAGAACT
ATCAAAGATTTCATCATTTACACTTTGACATTACCTTCCCTGTACTCTTT
CCTTTGGATGGCCATCTTTGGTGGTGTTGGAATTCAAATGCAAAACACAG
CTGAGAAAGCTGGGATGAATTGCTCTTTGTACAAAACAGCAGTTCAGGAT
CCATCAAAGTACAACACTCGATGGGATGAAGTATACGCAATGTATGGTAC
AACCATGCTGGCTTGTCGTGGTACAACTGAAATGTGGTTCGATGTGATGA
TGTCACACAAAGATCTTGGAATGATGATGGCTGTTTTGTCTCTCATTGCT
ATCATCTTATATTTTGTTACAAGTTCTGATTCTGGCTCTCTTGTCATTGA
CTGTTTGTCTGCCAATGGAAACCCCGAACCACCTGTAATGCAAAGAATCT
TTTGGGCTTTGACTGAGGGAGCTACAGCAACCGCTTTATTGAAAGCTGGA
GGCTCAGAAGCGCTTTCTGCCTTACAGACAGTTTCTGTGGCATGTGGTCT
GCCGTTTACATTTTGTTTGAATTGGACATGTGTTGCAATGTGGAGAGCTG
TTCGTGAGGAGTATGGTGAAATTGACGAACAAGAAGGGAGATGGTATCGA
AGTATGTGGTCATTCGCCGACTTCAAAATCCTCTCTCAGATTCCACTCGA
TATCGTTGCACCCTGGTATCGACTGGCCAAGTTAAGATTGAAACTTGACA
AACAAGAGTCGAATGGTGGTATGTTCATTTTGTACGCAATCCAGTTTGGA
TTACCATTCTATTTGtggattattttgatgattgtgGAAGTTGGTGTAGA
GCAAATCTCATATGTTGCTTGGGCCTGTTTGATGGCTTTTTTCGCTTTCT
CAAGTGGTGTACGTGGTGAAATCAGAGAGCAATTTGATATTGAAGGAAAC
ATGATTGAAGATCTTTTCACAATGGTGTTGGTGTATCCTTTGGCTTTGTC
TCAACAAAATGATCAAATGATGTATGGCCAAAAATACAAAGAGCAACAAC
ACAACGGGCTTGAGATGGGTGTAAACGGCACTTATATTCCCAACGCTTCA
AACGCCCACTACCCACCACCACCCACCTACCCTTCAAATGGTGGTTATGT
CATTAGTGCACCGCCCAATGGaaaccaaaaaatgtaaGTACAACACTCGA
TGGGATGAAGTATACGCAATGTATGGTACAACCATGCTGGCTTGTCGTGG
TACAACTGAAATGTGGTTCGATGTGATGATGTCACACAAAGATCTTGGAA
TGATGATGGCTGTTTTGTCTCTCATTGCTATCATCTTATATTTTGTTACA
AGTTCTGATTCTGGCTCTCTTGTCATTGACTGTTTGTCTGCCAATGGAAA
CCCCGAACCACCTGTAATGCAAAGAATCTTTTGGGCTTTGACTGAGGGAG
CTACAGCAACCGCTTTATTGAAAGCTGGAGGCTCAGAAGCGCTTTCTGCC
TTACAGACAGTTTCTGTGGCATGTGGTCTGCCGTTTACATTTTGTTTGAA
TTGGACATGTGTTGCAATGTGGAGAGCTGTTCGTGAGGAGTATGGTGAAA
TTGACGAACAAGAAGGGAGATGGTATCGAAGTATGTGGTCATTCGCCGAC
TTCAAAATCCTCTCTCAGATTCCACTCGATATCGTTGCACCCTGGTATCG
ACTGGCCAAGTTAAGATTGAAACTTGACAAACAAGAGTCGAATGGTGGTA
TGTTCATTTTGTACGCAATCCAGTTTGGATTACCATTCTATTTGtggatt
attttgatgattgtgGAAGTTGGTGTAGAGCAAATCTCATATGTTGCTTG
GGCCTGTTTGATGGCTTTTTTCGCTTTCTCAAGTGGTGTACGTGGTGAAA
TCAGAGAGCAATTTGATATTGAAGGAAACATGATTGAAGATCTTTTCACA
ATGGTGTTGGTGTATCCTTTGGCTTTGTCTCAACAAAATGATCAAATGAT
GTATGGCCAAAAATACAAAGAGCAACAACACAACGGGCTTGAGATGGGTG
TAAACGGCACTTATATTCCCAACGCTTCAAACGCCCACTACCCACCACCA
CCCACCTACCCTTCAAATGGTGGTTATGTCATTAGTGCACCGCCCAATGG
aaaccaaaaaatgtaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038649XLOC_038649-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000115_pilongenomesc0000115_pilon:490690..508054 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1456-2433:16388
Aaloc1231-1452:15584
Aaloc1036-1227:14929
Aaloc613-1032:14021
Aaloc451-609:13584
Aaloc196-447:13056
Aaloc46-192:9540
Aaloc1-42:1