XLOC_034878 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034878
Unique NameXLOC_034878
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000230_pilon:292749..304508-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034878 ID=XLOC_034878|Name=XLOC_034878|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11760bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:292749..304508- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACGAGAATGTCTTTTCCTTAGAGGTGGACGATAAGTAATAGTTATCACAC GGTACAGAGTACAATATGGGATATATTTTTCGAGTTCAGAATTTTCGTTT TATTTTCTGAGAAAATATACAAAACTCCGAGCGAGAAAAATATATCCAAT ATTGTACGAGTGAAAGTGTGATAGCTGGTTTATTGTGAACTTGAAAAATA TCAACAAACAACTTTCTCTCTCCATTTGCCTTTCTCTATGTTTTGTTTTG TTTTTACTTCCTGTATTTTGGCGAAATCAACATCAAAACATTCGAAAATG ATTCGAATACTCATGAAAAGATCAAAACACTCTTATTTGACAACTTTTTT GTGATTTGAGAGGAAACGAAACATTTCTGGAATAAATTTCGGTAAAAGAT ACAACAAGAAATTTAAAATTCGATCTCTCGCTTACCAGACCCCTTTTTGG AACGCGGCCTTGTATTTGTACGGTACAATATGAAATACAGCATTTATGTA CGCGTTTTTAGCCAATTAGATTGCTTATATTTTTCATGTTGATGATAAAT TATGTGATTTGGAGAAACAGTTGATCTATTAGTGTATTTTTCACCACGAA AAGCTTTCTAAGTTCGAATCTTCTTTTTATAGTTGGCATTCTCAAGGAAA TCGACCGACCGAAGTTTTTCATTTGATGCAGTCGCTAAAGAAACTCGATT ACCTGTCAACGAGGTTTGCTTTCCAATTGTTCTTTTACGGCTGACCTGAT TAAAAAGTATCTACCGCTGCTTTTTTGCTCGATCCTCTATTTAAACCAAG GGCTGTATAAAATGCCAGAATTTGAAAGACTTCTGTTCAGCCAGGGGGGG ACATGCAGTTAGTCCCTGACACTAGGTGGAGTAACTGAAAATTTTGACCT TTCTCGCTGACACCACCACCCTTGCAGTTACTCCACGGTGGAGTAACTGA 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AGACTAGATGTGACTTCTGGTTGATCTCGATTTATGCTTACATATTGTAA GCATGAAAATCGTTTTGCTCTCTTATGATTCGAAAAACTGTTTGCCCATT TAAATAAATTTGAGTTTATCGCCCCAGTGATATATTGAAAGTTTATCGTG GCTTGGATCACGAGAATTACGCTTGGCTTAGTTTATTGGGTCAAGCTGGG GGTCTTAGTACAAATAGTGGAGAAAGCAAGCCACGATAAGCTAATTACCC ATTTTTGGTTTTCATTTTTGATTTCCCAATAGTTTCATTTCATTCATCAT TGTTTTTCAATAGGAACTATCGATGAAGTTGAAAAGATGATACATATCAC TTGGGTGCAACCACGAGTTCTTGACAAAGATCAAGTAAGTGAATAGTTAA GTTTTTCCTTCCTCTTTTTTCGTCCTGCCACAATGTTCTATGATTGTGTT TATTGAATTATTTATTGAAATTCTATATTTGTAAATGTGAATGACTTCAT CATGTTTAAATTCGGACGGTCGTTTTTTGGACACATTTCATGCTTTATTC AGCCTTTTAACATATAATTTAAAGGTTTAGGGGATAGTTTAACGTCGATT CTAACATTGGTTTGCTTACACTGCATTTTTTTAAATAAAAGAAAGAACAA TTTGCCCCCCCCCCTCCGCGCTGTGCGAGCACAAATTTTAGGAATTTTGT TTATTCTTTGTCAGCATAAGAGCTAAATGCATTTTCTAAATTCTTGAATA AATTTGAATAGCGTTGAAAAGTTATACCCGACATAGAATGCACCCTCCCC CCTGAGCTTAAAGGGTCGCTAAACCATTTTTGTATGACTGGGGGCTTTAT ATTTCAAAAAAAAACTGGGGGCTAGCTAGGTGGGGGCTGAGTGTTGTGTA GTAGAACTGATGGCAGAGCTTATAGGTTACAAATATTTTGAATTACTTAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000230_pilon:292749..304508-

>XLOC_034878 ID=XLOC_034878|Name=XLOC_034878|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2262bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:292749..304508- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGAAGACACAAAAGTTTACCTTAGCAGAGTTTGTTCTGGACCTTT
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AGACACAAAAGTTTACCTTAGCAGAGTTTGTTCTGGACCTTTAGCTGAAC
AATGGGTAAATTTGGAACAACTATATGATAAAAAGTTATATCATGAGCTT
ACCATAGAACTTTTGAAATTCGTAAAACATGAACATTTTCAACAAAATGG
TGGACTGTTAGAGGTTATATCATGAGCTTACCATAGAACTTTTGAAATTC
GTAAAACATGAACATTTTCAACAAAATGGTGGACTGTTAGAGCTATATGA
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AATCGAACACAGGATAAATCCCTTATCATTCACAGAAATTATGCTTGTAA
TATCTGGTGAAGTTAAAGGATAAATCCCTTATCATTCACAGAAATTATGC
TTGTAATATCTGGTGAAGTTAAAGAATATGAAAAGGCATTAGAGTTGTTC
AGCAAAGTCGAAGAAAAGAATATGAAAAGGCATTAGAGTTGTTCAGCAAA
GTCGAAGAAAAGATAAAAACTTGTGTAGAAGGGAAAGTGTTATGCTTGAT
CACAAAAGGTTCACTTCACTTGAAAGCCAATAAATTGGATTTGACAAAGA
TAAAAACTTGTGTAGAAGGGAAAGTGTTATGCTTGATCACAAAAGGTTCA
CTTCACTTGAAAGCCAATAAATTGGATTTGACAAAGGAGGCGATCAAATC
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GATTTTATGATTTATCCAGTAATTACAGTAAAGAGGCGATCAAATCTGCG
GAAACGTTGCTTGATACATTGGATGGAGTGACGACAGTTCATGCACGATT
TTATGATTTATCCAGTAATTACAGTAAAATCGTTGGAGCATACAACGAAT
TCTACAAAGACGCTCTTAGATATTTGGGATGTTTAGATATAACAGAATTG
AAAGATCGTTGGAGCATACAACGAATTCTACAAAGACGCTCTTAGATATT
TGGGATGTTTAGATATAACAGAATTGAAAGGTGACGAACTAAGACAAAGA
GCATTCAATTTATCACTGGCAGCTTTATTGGGAAATGAAGTTTACAATTT
CGGAGAATTGGTGACGAACTAAGACAAAGAGCATTCAATTTATCACTGGC
AGCTTTATTGGGAAATGAAGTTTACAATTTCGGAGAATTGCTAGCGCACG
ATGTCTTAGAATACTTAAAGGGTACAGAGCACGCTTGGTTGATCGATGTT
CTATTCGCATTCAACAGCGCTAGCGCACGATGTCTTAGAATACTTAAAGG
GTACAGAGCACGCTTGGTTGATCGATGTTCTATTCGCATTCAACAGCGGT
AACATTCAAAAGTTTTTGGATATGAAAAGCAAATGGGCTCAACAGGTAAC
ATTCAAAAGTTTTTGGATATGAAAAGCAAATGGGCTCAACAGCCGGACCT
TGCAGCCAACGAGACCGCTTTACTACAAAAGATCACACTTCTTTGTTTAA
TGGAGCCGGACCTTGCAGCCAACGAGACCGCTTTACTACAAAAGATCACA
CTTCTTTGTTTAATGGAGTTGGCATTCTCAAGGAAATCGACCGACCGAAG
TTTTTCATTTGATGCAGTCGCTAAAGAAACTCGATTACCTGTCAACGAGT
TGGCATTCTCAAGGAAATCGACCGACCGAAGTTTTTCATTTGATGCAGTC
GCTAAAGAAACTCGATTACCTGTCAACGAGGTCGAACTTCTAGTTATGAA
AGCACTTTCTCTTGGCTTAATAAAAGGTCGAACTTCTAGTTATGAAAGCA
CTTTCTCTTGGCTTAATAAAAGGAACTATCGATGAAGTTGAAAAGATGAT
ACATATCACTTGGGTGCAACCACGAGTTCTTGACAAAGATCAAGAACTAT
CGATGAAGTTGAAAAGATGATACATATCACTTGGGTGCAACCACGAGTTC
TTGACAAAGATCAAATTGGTAAATTGCGTGAATTGATCGGTCTATGGGGA
GAGAAAGTCAAGAGTTCAGTATACCTCGTTGAAGAGCAAGTCCCTGAATT
GATGGTCAACTGAATTGGTAAATTGCGTGAATTGATCGGTCTATGGGGAG
AGAAAGTCAAGAGTTCAGTATACCTCGTTGAAGAGCAAGTCCCTGAATTG
ATGGTCAACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034878XLOC_034878-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000230_pilongenomesc0000230_pilon:292749..304508 -
Properties
Property NameValue
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