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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:592149..594787- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041975 ID=XLOC_041975|Name=XLOC_041975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2639bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:592149..594787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGGGTCAAGCATTTACCGATGATGTCATCAATCCTGGCCGCTCGTG
TCCGGATTTGACCACAACCGTGGAAATGTCCGAGGTTAGTGACGTCATCC
AAACACTAACGGATTCAGATAAAATTGTCACTTCTGGCTCTATAACGCCG
CACTCAAATGGGACAGTGGCAAAAAAGAGGCCGGACTTGGCGTTAGATTT
GAGTGATATTAGTTTTACGGAACCAACTCCCGGGCAGAAATGTTTCGGTG
AAAAATCAGATGTGGAACGAGTGTTAGACAGTCGTTGTCCTTGTTTACAA
TCGAAATGTCTTCATTTATCTGGAACTTTCTTATTAATAGCAATTGTTGG
TATTGTTGTTATATTTTTCTTTCGACGCTACCTTAAAGACTGTATGCAAT
GGCTTGAAAACGCCGATGGATGGGTCAGCGGTCTATTGTTTATACTAATG
TTTACACTTGTATCGTTCCCAATGACGTGGGGTTATATTTTCTTAAACGT
GGCTGCGGGTTATTTGTATGGCTTTCTAATGGGTTTAGTCACCGTAAACG
TATCAGTTTTGGTCGGAGTTGCAGTCTCCCTTGTCGTCTGCCGTAAAATT
ATCCGTGGATTTGTGACGTCAAAATTACAATCAGAACATTTGAAAGCTAT
CATAAAAGTGGTGGAAAGTCGACGTGGTTTCAAAGTTCTTGTGCTAACCC
GTTTGACACCTATCCCGTTTGGATTGCAAAACGGTTTATTTGCTGTAAGT
ATTTCTTTCCGTTTTTCAAACAACCAAAGTCTTCCTCTGTTATAGAGAGA
TAATATATAAAACACAATATTGCTCTGTTTGCTTCTACACGTTTTTTCAT
AAGAACATAAGGCATCGAGGGCCAAAAAAATTAAAAACAAGTTAAGAACA
TTTTAAGGTTTTGTGGACTCTCAAACGGCCAATTTCTTAAGAAAATGAAC
AAAAGAATTCTCACACAATGGTGAAAATAAGAACATTTAGGTAAGGAAAA
TTTTTAGGCTCAAATCTCAAAAAGTTATGAACATCCTGAGGCTTCAAAAA
TTTAGGATGTTCTTATAAAAATCGTATATGTATAGGACACCCCGTTGAAA
ATCTCTTAAATTCTTATACCATCCTCACTTTTACTGGTAAGATATTGAAA
TAAGTGTCTCTTTTGTCACAGAAGCAAAACATCTTGTTAACATCTTGAAA
AATGGTCTAATACCCAGAGTTATACTACGTACCCACATATGAATTAAACT
ATTCCATGCGATTTGTTATGAATGGGTGTGTGTTTGTTTTATCTCTGTAA
AATTACTACAGGGTGTCCCTAATTAAAGTATCGAGTTTGAACATGCGATT
GAGTAGAAAAGTTTGTGTGTGTTATCGCTAAAATATAAGAACGTCTTCCA
TCACACAGGCTTATTACAAAAGGTAGTTACAACGTATAAATTAATCGTAA
TGACAAAGAAAAAAGAGGGAGAGCTTAAAATACAATTTTGTGAACACGCA
CATAAAACTTTCTACTCATAGTTGTGTTTCGACTCGATACTTTAATTAGG
GACACCCTGTATATCTCAAAGTTGCATTCCTATAATTACACCCTAATGAT
CTAATTCCCTGCTCTAATTTCACAATCACAATGCTATAATTGTGAAGAAT
TCAAAAATGACTTCGAATTATTTTAACAGTTTTTGATTTTTCTCCTTGCC
CAAGATAACGAGTTCATTGTGCTCAAAAAATGATTAGAATACCTTTATAA
GGGTTTATTTTTGGCAACTCATTAAAACCGATTAAATAAAATAGTCCAAC
TGATTTGATCTAATGTTTAATTTGTCAAAATCAACGCCCAAAACTCTTGT
CCTTTTACAAGTCATTTTCAAAGAGTGCTAGAATCACCCGTGTTTCCGAC
TTGAAGATTTAACTGAAAATAAATTTGGTGGTAGAAATACCCTCAGAATG
GAAACTTCGAAAACACATTGGCTTTTACATCCCCATTGGTATAGAATTTT
TTCCCATGAGAGAAAACTTCCTCACTGAGACACTGAGACAGAGATGTGTT
GGTAGTGCGAGAACTCTTACTGTAGTATATTAGAGTTTCCCCTTTCAAGC
TCTATAACTGAAAATATAATCTCTACTTCCAATTCTATTTCCAGATCACC
AATATGCCGTTATCCAAATGTCTGCTCGGTTCATTTATCGGTTTATTACC
CACTCAAGCATTAAATGCGTATCTTGGATCGACATTACGTTCAATGGAAG
ATGTAGTACACAGTAACTCGGCTGGTGGTTATCTTATATTAGGTGTACAA
GTTGGTATAAGTGGATTTTTAATGTGGTATGTGATACGACGTGCTAGATA
CGAACTTAACAAAGCGTGTTTACCAAACGAAAACGAATTTGATTATTCAT
CTTTAACGAACTTTACATCATCTTCAAGTAAAGATAAAATTACAGTAAGG
ACTCCACAACCTTTACCGCTGACTAGGGCGAATAGTGGTAAAGGTTTTCG
GTACTCGGCATTACCGACTTCCGACGATGATGACGTTACCATTAAAGGAC
AGAAAAATACTGCCAAGAAACAGGGCCATAAAAGGGCGCATTCCGCCTCG
GCTATATTATACGCTCTACAGAATCGAGATGACGATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:592149..594787- >XLOC_041975 ID=XLOC_041975|Name=XLOC_041975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2478bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:592149..594787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGGGTCAAGCATTTACCGATGATGTCATCAATCCTGGCCGCTCGTG
TCCGGATTTGACCACAACCGTGGAAATGTCCGAGGTTAGTGACGTCATCC
AAACACTAACGGATTCAGATAAAATTGTCACTTCTGGCTCTATAACGCCG
CACTCAAATGGGACAGTGGCAAAAAAGAGGCCGGACTTGGCGTTAGATTT
GAGTGATATTAGTTTTACGGAACCAACTCCCGGGCAGAAATGTTTCGGTG
AAAAATCAGATGTGGAACGAGTGTTAGACAGTCGTTGTCCTTGTTTACAA
TCGAAATGTCTTCATTTATCTGGAACTTTCTTATTAATAGCAATTGTTGG
TATTGTTGTTATATTTTTCTTTCGACGCTACCTTAAAGACTGTATGCAAT
GGCTTGAAAACGCCGATGGATGGGTCAGCGGTCTATTGTTTATACTAATG
TTTACACTTGTATCGTTCCCAATGACGTGGGGTTATATTTTCTTAAACGT
GGCTGCGGGTTATTTGTATGGCTTTCTAATGGGTTTAGTCACCGTAAACG
TATCAGTTTTGGTCGGAGTTGCAGTCTCCCTTGTCGTCTGCCGTAAAATT
ATCCGTGGATTTGTGACGTCAAAATTACAATCAGAACATTTGAAAGCTAT
CATAAAAGTGGTGGAAAGTCGACGTGGTTTCAAAGTTCTTGTGCTAACCC
GTTTGACACCTATCCCGTTTGGATTGCAAAACGGTTTATTTGCTATGGTG
GGTCAAGCATTTACCGATGATGTCATCAATCCTGGCCGCTCGTGTCCGGA
TTTGACCACAACCGTGGAAATGTCCGAGGTTAGTGACGTCATCCAAACAC
TAACGGATTCAGATAAAATTGTCACTTCTGGCTCTATAACGCCGCACTCA
AATGGGACAGTGGCAAAAAAGAGGCCGGACTTGGCGTTAGATTTGAGTGA
TATTAGTTTTACGGAACCAACTCCCGGGCAGAAATGTTTCGGTGAAAAAT
CAGATGTGGAACGAGTGTTAGACAGTCGTTGTCCTTGTTTACAATCGAAA
TGTCTTCATTTATCTGGAACTTTCTTATTAATAGCAATTGTTGGTATTGT
TGTTATATTTTTCTTTCGACGCTACCTTAAAGACTGTATGCAATGGCTTG
AAAACGCCGATGGATGGGTCAGCGGTCTATTGTTTATACTAATGTTTACA
CTTGTATCGTTCCCAATGACGTGGGGTTATATTTTCTTAAACGTGGCTGC
GGGTTATTTGTATGGCTTTCTAATGGGTTTAGTCACCGTAAACGTATCAG
TTTTGGTCGGAGTTGCAGTCTCCCTTGTCGTCTGCCGTAAAATTATCCGT
GGATTTGTGACGTCAAAATTACAATCAGAACATTTGAAAGCTATCATAAA
AGTGGTGGAAAGTCGACGTGGTTTCAAAGTTCTTGTGCTAACCCGTTTGA
CACCTATCCCGTTTGGATTGCAAAACGGTTTATTTGCTATCACCAATATG
CCGTTATCCAAATGTCTGCTCGGTTCATTTATCGGTTTATTACCCACTCA
AGCATTAAATGCGTATCTTGGATCGACATTACGTTCAATGGAAGATGTAG
TACACAGTAACTCGGCTGGTGGTTATCTTATATTAGGTGTACAAGTTGGT
ATAAGTGGATTTTTAATGTGGTATGTGATACGACGTGCTAGATACGAACT
TAACAAAGCGTGTTTACCAAACGAAAACGAATTTGATTATTCATCTTTAA
CGAACTTTACATCATCTTCAAGTAAAGATAAAATTACAGTAAGGACTCCA
CAACCTTTACCGCTGACTAGGGCGAATAGTGGTAAAGGTTTTCGGTACTC
GGCATTACCGACTTCCGACGATGATGACGTTACCATTAAAGGACAGAAAA
ATACTGCCAAGAAACAGGGCCATAAAAGGGCGCATTCCGCCTCGGCTATA
TTATACGCTCTACAGAATCGAGATGACGATTAGATCACCAATATGCCGTT
ATCCAAATGTCTGCTCGGTTCATTTATCGGTTTATTACCCACTCAAGCAT
TAAATGCGTATCTTGGATCGACATTACGTTCAATGGAAGATGTAGTACAC
AGTAACTCGGCTGGTGGTTATCTTATATTAGGTGTACAAGTTGGTATAAG
TGGATTTTTAATGTGGTATGTGATACGACGTGCTAGATACGAACTTAACA
AAGCGTGTTTACCAAACGAAAACGAATTTGATTATTCATCTTTAACGAAC
TTTACATCATCTTCAAGTAAAGATAAAATTACAGTAAGGACTCCACAACC
TTTACCGCTGACTAGGGCGAATAGTGGTAAAGGTTTTCGGTACTCGGCAT
TACCGACTTCCGACGATGATGACGTTACCATTAAAGGACAGAAAAATACT
GCCAAGAAACAGGGCCATAAAAGGGCGCATTCCGCCTCGGCTATATTATA
CGCTCTACAGAATCGAGATGACGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:592149..594787 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 745-1239:496 |
| Aaloc | 1-744:2640 |
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