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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:1458391..1462630+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_030406 ID=XLOC_030406|Name=XLOC_030406|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4240bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:1458391..1462630+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGAAAGGTGTTTATCAAAACAACCTAATTTCATGCATACATAATTT
TCATATTATTCTTAACTTGGTTTCAAATTTGTTGTATGCAGAGCAACTTT
TTAACTTGAAGGTAAgtctcaaaaactttttacagtATTAAATGTTATCT
ATTATAGTAAATTGTCATTGAAAATATGCATAAGCCATCAGGAATGAAGC
TGTTGAATGAGCTGTAACTTTAAATTAAAGATTGTTCAAATAtattgctt
tgtttttgtagtTTGCAGCaaaaaacttggaaagaagctcaaagaaatgt
gaaaaagaagaaaaggcagaaaaattaaaattgaaaaaggtaACAATGAT
GTGCTGTGATGTGATGAAACTATTTATTCGTACTCTCTCTATATATATGA
TGTAGATATCAACTCCCTTTTATAGCAGAACTTCCAAAATAAAGTTGTAG
CTATACCCTCAGCTTAGTATGAAAAAGTAATTATGTTACTTGAAATTATT
TATAAAATGATATCCTAATTTTAGGCCATTCAAAAAGGAAATGTAGATGG
AGCAAGGATATATGCTGAAAATGCAATCAGACAAAAGAATCAAGTAAATA
CACATTATTACACTGTTTTGTATATCGTTTGAAAATATTGTTTATTGATT
GGAAATAATTAGCTATCAATAATTAAGCTTTTTAAATGCTTCTTAAAGGC
TTTTGAAACCAATCAAGTTACACCAAGATTTTACAGTGGATATGCTTCCT
ACTGATTTATTTCTTTACCGTTTTCAGGCACTACACTTTTTGAAATTATC
TTCAAGAGTAGATGCAGTATCACAAAGAGTACAAACAGCCGTCACAATGA
AACAGGTACTTGTTGTTGCTTATATGGGATGCATGTGATTGGATATAGAA
ATTGGATTTATTGTATACTGTAAACcaggggggtcggtactaagttgtgg
gggccagtgccgggtagtggtctgataaggtaagtaaaaaacaacttagt
acatggtactaagtggtggtcctAATTGAAAAAGACATTTTTACAACTGT
GTCAAGGGACTAGATGGTGGTCTCAATACCAAATATGAGGCATCAAGTTA
GTATCTGGTACTCAAAATCCTGCAAAAgcataaaaaatgttcttttactT
TCTCTTGACTTAaccaatttttaagaaaatgcaagaaaatgcaagaaaat
gaGTTGAATAGaaagtttttaaagtttttttgctgttttcacAGCATGCA
ATTAGTGGTCACCATTTGtttgatttaatttgtttttattattttaggta
aattctaattatataagtgaataatttttttccagcaaatttattttttg
atgtcGGTCAATTGTTGAATCTGTTTATTTCAGTAATTTTCATTTGGCTA
TAATTCGGTTTGCACTGATAGCTAGAGTAGCGTGTAACCCTTTGAATAAC
tgaggagaaaaaaaaacagttattTATCAACTTAGCTTGATTAAAGTTTA
TGTTGATGATGTTTCAAATTAAAGATTAATTAATTAGTTAAATAGagcta
aatttgtttttatttgaaactttacttcttttgattaaaaaagaattagc
ttgaaaatgataatttgGCTTGACCTAACTTGACAGGAATTTTTTCTGAG
ATATTGAGGGTTGTACAGAGTGGTGTGGTACAGAGTGGtgttataaagtt
tttttcgaaaatttaaaggaggtGTACCAGAAAGTACCATTACGAAGAAA
aaagggtggtatacctattttgagGGAGAAAATCAACTCAGTAGAGGGTA
CTTAAGGGTGGTGTGTCATTTCTCAATGTTGATATCAAGATTGTACCCAG
TTGTACCGGGTACTTAGGTGTGGTAGATctattttaaggggtaaattcaa
cttagtaccagggtactaagtggtggtggtctcagataaatttcaaaaaa
caaaaaaagtacaaCTTTTCAGCACTGGTCCAGTACCACATTTTGGTAcc
ccccccATGTGTAAACAATTTTCTTGATAATATGTATCGTTGATTTCTAG
TACAGTCTCTACAACAAGAtgatatttttcacaaaaacaacACCTATAAA
CATACTAAGGCTAAGCTTAAAATGatataatgcataatatatgttatata
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AATGGACTCTGCTTTAAAGAGTATGAACCTTGAAAAGGTAAGCAAAATGA
TATTATTTTCTCAGGTGttttaaaaagtataaaagTTTGATTTAACATTC
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ttgaaaaatgtcaatttaatTATGCTCTTTTATTTTACTTTGCGCGTtcc
atttcaaaaatttataacaatAAATTCAGATGTTCCTTCTGTTGTCTCTA
TTGAGAGGAACAACAATTTTCATGCGAAAGTTGTACGTTCACAAGGATGA
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TTTGAGAAGCAATTCGAACAATTGGACGTTCAAACACAAGTCATGGATGA
AACAATGAGTGCTTCAACGACCCTTACTGTTCCACAGGTTACTATCATAA
ttatgaatatcaagaatatgATGTTAATTATTCCCTTAATATTTGCTCTT
GATATGGGTCTAAAATTGTGTTAGTTGTAAAAGAAATTCGTTGTCAGCAT
tctgtttaaaattaaaaaagtggaaatgaatggctgaatcgagggaaaaa
tagaaaatgaacaTTCAcgcttttctaaattttacactTCATCATTTTTA
GAATCAAGTGGATAGCTTGTTGCATCAAGTTGCTGACGAACACGGGTAAG
TTGCAAGAAATAAGATCTTAAAGTCACCGCTACATAAACCTTCAAGTGAT
TATTCTAGTATATGATAATGTGTAAGATTTGTTCACTGAGGAATTAAAAA
ACGTTAATGCTTGATTGTCTTCAAAACGCCATATTGTATCTTACAGTATC
AAATCCGTCCAGCTGAGAGACAAATACATCACCATGATCACTAATCCTAA
GGTTTCCGTCCATACATGCTTTTTATAGGCAAGTGTCggcccttggtcag
gctcgagtatgcttaagcttCCAAAGCATTCAGGCATAgcatatgcttat
tatatgcttatgaactattatgcttttgattcacccaacccaatttttta
taaaacttcAGAAATTATGTTaacattcgattcaaaaagcATTTAGATTT
TTGGAGCAGTAAAATGTGGCTATTCGTGGAATGTCTGTTTTTACTTGATC
ATTTCCAAACCTTTTTGAACAGAAAAAGATTGACCTCatgaaatatttca
ggctggcgTATATCCTTTTGCCATgttaggaaatctgcaaatctgagcct
tcagaTGCTCATAAgctttatgcttataaaaaaacatgtattcacAAAAc
cttgttttattttaacacaGATCTGaaaaaaaGTCTATgagttattttgt
ttttgttaaccTTTATGTATCAATTATTGCACCTACAGCCTTGAAGTGAA
TATGGAATTACCGAACAGTGAAGCTGGAGCCATTGGAGCTGCAAGCGCAT
CAACCAGTGCCTCACAAGAACAGGTAACATTAATAGCATGTACCTCCTTC
TATCTTATCGTCTCAACAtgcgcgcgctgcaatcgcaccttttggcttca
atcctaaaaaaagattacgtcataaaaatgtagcgcacgctcaaaaaaag
ttgaacaaccgctacgtcagatcgcgccaatggagcttcttcatttttct
tttgaccaatagtttggaagctttgcttgaaaaagtgcgatcgaagcgcg
cgcaagtggagatcGGCCTTTATAACAAAGATCAAGAACATTCGTTGCAT
AATTTTGCCTCTTCGTTGAAGTGAAATGCAAGTTTGAAGACTCAGTATGA
gccaacttttgttttttttgctcggATAGCTAGAAATAGGTACGAACCAA
CCTCGAGGTTACAATAGAGATAGGCTGTGAAATCTATATAATATTATCCT
TTTATGAAATAAAGGAACTTGCTTTCTATGTTATATTGCTACAAGttctt
cttcaaaataaagataGATGTATAAATATTATTTACTTCTTCGCTTTTTA
GGACGATTTATCACTTCGATTGGCCAAGCTTCGGCAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:1458391..1462630+ >XLOC_030406 ID=XLOC_030406|Name=XLOC_030406|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1362bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:1458391..1462630+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGAAAGGTGTTTATCAAAACAACCTAATTTCATGCATACATAATTT
TCATATTATTCTTAACTTGGTTTCAAATTTGTTGTATGCAGAGCAACTTT
TTAACTTGAAGATGTTGAAAGGTGTTTATCAAAACAACCTAATTTCATGC
ATACATAATTTTCATATTATTCTTAACTTGGTTTCAAATTTGTTGTATGC
AGAGCAACTTTTTAACTTGAAGtTTGCAGCaaaaaacttggaaagaagct
caaagaaatgtgaaaaagaagaaaaggcagaaaaattaaaattgaaaaag
tTTGCAGCaaaaaacttggaaagaagctcaaagaaatgtgaaaaagaaga
aaaggcagaaaaattaaaattgaaaaagGCCATTCAAAAAGGAAATGTAG
ATGGAGCAAGGATATATGCTGAAAATGCAATCAGACAAAAGAATCAAGCC
ATTCAAAAAGGAAATGTAGATGGAGCAAGGATATATGCTGAAAATGCAAT
CAGACAAAAGAATCAAGCACTACACTTTTTGAAATTATCTTCAAGAGTAG
ATGCAGTATCACAAAGAGTACAAACAGCCGTCACAATGAAACAGGCACTA
CACTTTTTGAAATTATCTTCAAGAGTAGATGCAGTATCACAAAGAGTACA
AACAGCCGTCACAATGAAACAGGTCACAGGCTCAATGTCCAGCGTAGTAA
AATCAATGGACTCTGCTTTAAAGAGTATGAACCTTGAAAAGGTCACAGGC
TCAATGTCCAGCGTAGTAAAATCAATGGACTCTGCTTTAAAGAGTATGAA
CCTTGAAAAGGTGTCAGCTATGATGGATAAATTTGAGAAGCAATTCGAAC
AATTGGACGTTCAAACACAAGTCATGGATGAAACAATGAGTGCTTCAACG
ACCCTTACTGTTCCACAGGTGTCAGCTATGATGGATAAATTTGAGAAGCA
ATTCGAACAATTGGACGTTCAAACACAAGTCATGGATGAAACAATGAGTG
CTTCAACGACCCTTACTGTTCCACAGAATCAAGTGGATAGCTTGTTGCAT
CAAGTTGCTGACGAACACGGAATCAAGTGGATAGCTTGTTGCATCAAGTT
GCTGACGAACACGGCCTTGAAGTGAATATGGAATTACCGAACAGTGAAGC
TGGAGCCATTGGAGCTGCAAGCGCATCAACCAGTGCCTCACAAGAACAGC
CTTGAAGTGAATATGGAATTACCGAACAGTGAAGCTGGAGCCATTGGAGC
TGCAAGCGCATCAACCAGTGCCTCACAAGAACAGGACGATTTATCACTTC
GATTGGCCAAGCTTCGGCAGTAAGACGATTTATCACTTCGATTGGCCAAG
CTTCGGCAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:1458391..1462630 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 643-681:4202 |
| Aaloc | 559-642:3590 |
| Aaloc | 514-555:2852 |
| Aaloc | 406-513:2530 |
| Aaloc | 337-405:2169 |
| Aaloc | 259-336:778 |
| Aaloc | 190-258:525 |
| Aaloc | 112-189:262 |
| Aaloc | 1-111:1 |
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