XLOC_038145 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038145
Unique NameXLOC_038145
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000213_pilon:396233..406935-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038145 ID=XLOC_038145|Name=XLOC_038145|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10703bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000213_pilon:396233..406935- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTGTTCAAAGGAAGTATTTTATGTGCAGGATTTTAATTTGGCTATACTTA CTTAATCTAAATACGTTTGCGTTTATCGACCCAGTGATATTCATATTGGA AGTTTATCGTGGCTTGGATCACGAGATTTACGTTTGGCTACTTTTCGAGA GATTCTTCTCCCATTATTGGGCAATACTTGTACACTATTCTGCCCTTCCA TGGTACCCCTCCTCTTTATGTCATTATTTACCACCTCGCGTCATTGATAC TACCTAGAACGCAAATGTTAATGTCAAAAACCTGGAAATTAGAAGATGTA ACTTTACTTTATCTTATGGTTAAAAAAGAAGTCTTGCGCGCTTCTATCTT TGTTGGGTATTCAACTACAAAATGAACCTACCTTTTATCTTGTGACTTGC AACATTTCACTCCATTACTAGACTAAATTATGTATTTATCATTGAATCTT GTTTTTCTCACAGTGCCAGGTCAATTTTGGAGGTAAAACAATGCTAGCAA CAGAAAAAGAAAGCAGGTCAGTTTTTTCATCTATATATTAATACGCTAAT TTTGTGTTTACAACATTTTAAAAAAGTTTTCAAAAATCTAACAAAGCTCT ACAAAGACTCCTCTTGGTGGAATTGAACCATCGACTTTTCGCGCCGTATG CAGATTTTCTACCACTAAATTAATCTTGGCAAATTGGCTGTTTGGTCAAT AATGAAAACTCAGAATTTCCAATTTCAACGCCTGTTTTCATTTGAATACT TAATTAAAATGATATCATCGCTATTCTCTACCATTTATACTCTTTTTAGT GTAATGCTGGTTATCAAACAATATGAACAAGCTCTTCTACATGGACTGAA AAAAAATAAATTCCTGGAAAAAATCAACACTCTCACTGAAACTTTCAGGT ATTTGTGATTGTGTTTTTTTTTGTTTCGAATGAAGGTCCAATTATTAAGG TGGTACAGAGAAACAGAAAAGGTGGTGCAGAAAACACAGACCTTATCAGG TTCTAGCTCAATTGAAGATAATAAATAAAAGCAAGCGACAAAATTTAAAG ACTCTGGAAAATTAATGGCTGACTTGCAAACTCATGAATATAAAGTGCAA GATTATGTTTTGTTTTTTTAGGCAAGTGACTCAAAAAATGATTCCAGAAA TTGATGATAATAGTAAGTTTGTTTGTAATATTTATAGATTTATAGATTTA GCTTGGGCTAAATCATTAAGTAATGAAATACCTGTTTTTAAGGTTGAGCA AAGAGCAGCACTCATTAGAGGGCATGGCTTTTTTCAACAACAAGATGAGT AGCCTGGAGGTCCATGCTACGATTTCTTATTTTATATACTGATGGTGAAA TATATAGCATGATACGGGCTGAGAGTTTGAATTTCCCAGATCCTAATGAC GGTTGAAAACACAGCCAATCAAATTCTGTTTTTCTTTCACTGGTCACACT TTCTTAGAGAAAACGCAATTTCCGAAATTTGGTTTTTATTTTAGTAAGCG AGGACAGCGCCAAATTCGAATTTCTCACTGTAATTTCTTTGAGGCAGAAA TCTGCCTCACAGCTCATACCCGTCCTGTATACATCAGATTATAAAAAGTG CAGGACGGTCTACAAGATGAGCGACTCGACTATCAAAAGTATTGTATATA TGTTGTTTTGTACGCTTAATTTTTCTTCTCAGATTATTGGGGTGTTGTGA AAGAAGTCTTATCTCCACTTGACGTCAAACACATTGAATCTTGTGAGGGA GTCACAACAGATACTGGAAAAGGTTTGGTTCAAATCATGTTTACTTTTAT TAACAAATTTTGAAACGAAAGAATAAAAGTCTTTTGAAAATTAAAAAGGT ACAGTGTTGTTTTGCTATTTTCAGCAGATTCTTCTCGCTGGCCTTGATCT TCTTTAAAAGAGGAGGTAACATATCTGAATATTTTCTCCTTGGTTTCAAT TTCAAAAGCAGGATTCAAAAAAAGAAGTTTTTGGAGTGTAGCCTTTCCCT TTAGAAGAATATAAACGCAGATTTGTAACAATTCGATTAAGAAGGTCGTT ACTAAAATTTTGATATAAATTTTTCCAAACGGTTTTACCCCATATCTATA TTCTAGTAGTAGTTACAAGTTCTTTTCTTAATTCCATTTGCAGCACGTGT TTGGCTAAGACAAGCTTTGAACGAGCACAGTTTGGAACGTCATCTCAACG CAATGTTAGCCAATGGAAACTTGCTTAGGTACATGATGGTGATTATAATT GATTCAATTTGCTCCTGAGATTATATAATTATCGAAACAAACAAAACTTT TTACAAAGTTTGAGCAGTTTGAGCAAATTACCCAAAAAAATACCTGACCC AGAGTCCGTTCTATATACCTTATTACACGAAAATAAGTAGACATTTTAAT TAAGAAATTTCGTGTTAATTATTAAAACCCCTTTCATTAAAACCAGCCGT GGTGTCCTTGAAAAAGCAATAGTTCATGTTAATTTTTTGCGTGTTAATTT CAAGGCCGTTGAATACTTGCCTAGTAATATTCGTGTAATAAGGTAATATA TTAATGGGATCAAATTTGCTGTAAACTTCATTAAGGAGGTCTGTGTCGGA TACTAAATCTTTTTTTATAAGAACAAAATTGATTTTGACCGGTCCTAGCC TCTTACAACTAGTCTTGCCCGCTCACGGACAGTCTTGACTGCTACTGGTC CATCTGTTTGTTAAGGGCTACTTAGACTACACAATATATTGGTGAGCAAT ATTCGACAGTATAGATTGTGGACCGTAATGTACGGAGTAAACAGCAGGTG CTCTATTATAAAAAGTAATTTTCTTTCTGTAAACAATCCTCCTATATTTT TGGAATATTGCAAATCGAGCTGACAATTTATTGCGGACACCTTTTTAATA TACTGCCGGCATTCAGCGATATACTAACAATATATTGCCTGACAATATAT TGTGTAGTGTGTGTAGCCCTTTAGTAACATTGACATTGAAATGGTAATAT TAGCGGCCAATCAAGGTCGGTCTAAGACATTTTCAATCGTTGCAATAGAC GCTTTAAAATGGCTGTTTGATGACCAGGACTCCTAGTGACCTTTTGGTAA ATTTTTACCGGGTATTTACCGGCCATTCAAAGAGACTGGTACAATTTTCA GGTACTTTAAATCGCTTGAAAAAGTCACACGAGTCACACGTGGTAAATTC ATCATGTCAAGGTTTGAGCTCCTTTTTAGTTCACTTCTCCTTTTGTTTAG GAACTACTACGAATCATGGGCACTCGTTTTGGATGAAGAAGTTGCAAGCA ATCTACCAGTCATGGCTAGAGGTCTGTTGTAACTTTGTTTTTAGATTGCA ATAATCCCTCAATATTACGATATTAACCAGAAATAACTGGACATGTTAAT TTTACAGAGATATTGCAATTAAATTGCCTTTGTGTTTAAAAAGTATATTT TTGTTATCGTAATTTTTTATTTTAAACTCTAAAATTGCACTTAAAGGTTT TAGTTTCAAGTCCTTGTTTGTTATATCAGACCGGTTTTTATATTGTGTTC GATTTTGTGCTGAAAAAAAAAATTGTTTTTCTTTTCCTCCTTTCTGACAT TCTATTGCTCCACAACCGTGTCAACTCAATGTAAATGTGAAACTTTTTTA AAACTCTTATTTATAAACAAAACCTTTAAGTGTAAACAAAACAATACATA TATTACGCTCAGAACTTTGATTTAGCATTCTATAGACTCTGTTGAGGAGC AAGCTCTGCTTCTCCGTTTACTACAAGCGATTATGCGACGCTCAACACTT AGTGTTTTGAGCAGTCTGGTGACAACAGCAGTCTATGCTCGCTTACCCGA GCCGCAATGACGAGTCCTTGGAAGGGAAAAACACGTGTCTGCGGATAGAT GGTAGTGTAAACAATATAAGTATAAAATATAAAAGAGTATTTTTTAAGTA ATATAAAAATACCATTCTTTTTTTTTGCAGGTTTAAGTTCAATTATTTTT GCTTTGGAAATTAATGGAGAAGATCTTAACAAGCCTTTTCAGGTAAAGCT ATGTTTGAAAATCCACAGTTTACCAAAATTGAGCTAAAAGTGATTACTTA GATTAAAATTAATAATATAGTAATGATAACAATAAACTTTACTATAAGAT TATTGGCCACAATTAATACAGTTTTAATTCTTGATTTTGTGTACATGGTT TTTCGATTGGCCTAAGCTATTTCTTTTTATTTGTCAGATACAGTATAAAA ATTATTTTTCCTAGCTATATACTTATGTATTAAAGGTTAAGCGATGCTTC AAGAGTGCTCTACAAAGTGAAGAAGCATGATACAATTTCAGAAAAAAAAA CACAATTTGTACAGCTGATGATTGTATTAACATGAAACTTGTGTATTTTT TTCTGAAAATTGTAGCAAATGTAGCAATAATTTTACTGCCGTGTTAAATT TTAACTGAGTTTTTATACATAGATTTGAAGAATTTTCCATCGAAAGCTTC CTTATCTTAATCCTTTTCTTCGTTTTGTAGCCATTAGTATTCCCAACGAC AGAGAAAACACACAGAAGGGTCAATTCAAATCCGCTTCCTGTTTTCGCTG GTTTTGACACAGGTTTGTCGAACTGCTTTTCTTTCCGTTAAAAGCTGTCA AGAGACTCAAGTCTCCATAACATAATCATTAAATCGAAGAAGTTTTCTGG TCCCTTCAAACAAACAGTACTGGTAACCCTTGTAAACCCAGTATCTATAA CTGGTAACAAACCCGTGTAAACCCAGTCCTTATAACTGGAAAAAAAAATT CAGTTCGCAGTATGTGTTCGATAGACAGTGTGTGTTTGTAGAGACTATTA ATTACTTACTTTTCCTGGTCCCTTCAGGTAACAAACCTTTGTAAACCAGT CTTTATAACTGGAAAAAAGTTCCCCAGTACATGTTCGAGCTCATGAAGCC TCCACTGTTGCTTATTATTCTTTTAGAGCCAAATATTGTCAAAAAAATCA AGAAGAAGAAGCGAAAAGTAGTAGAAGCAACTATAAACGATTTAGAAGAA ATTCCAGACGAACATTCATTATCTCAATCATATACTACCAATAGTTCACT AGAAAATCTTATATTACAAAGTAAACAAGACGACGATCGAATATTATCTC CACAATCTGGAGCTAGCAGTGATAGAAGTTCAACTAAAGACTTTGAAACG CTTAGTGGGCGTGCGTTAGAAACACGATCAGCTCCTGTGTCCCCTGTACC CTTATCTTATGGAGATAATACTAACACAGAGAATCTATCTTCTGCTGACA GTCCTACTCCAAATGACAGAGTTTCCTCGCAAAAATCAATTTCAAAAGAC AATACGAAAAGAAATTCATCAGACAATCTAACTAGTGAACCAACGGAAGA AAATACAAAACAAACTGAAAATACAATCGCAAATATTAATAATACGACGA AATTACAGGACAAGCTAAAAGACACTCCTGTCTTACAAAATGACAAGACG AATGGACTTCGTAAGACTGGGTTCGATAATGTTACAACTTCATCCAATAA AAACTTCTCAAACGCGTTGACTTTAGAATCCAATTCAATCGACATTCTTC AAAAAGAGAAAGATAACTTAATAGATGAGAATCCTCTTCCTAAAGATAAC TTAACAACAAATCATTCTAACGAACCTAAAAATATTTCTTATGGACTTCA AAAATCTTCATCAGTTATTACTAAAGAAAACCACGGTGGTGCTAGATCAA GGACTTCTAAACTAATACCGGATGATAATATATTAACTGAAGCGAAAAAT ACAATTTCTAAAACGCCATCTTATAACGACTCTACAACGGACAATACAAA TGTATTAGATTTGAATGCACCACAAGTGAAAAGTACTCCTTTGGAGATTA ACAATCAACTGCATTGTGGAGCAATCATTGCTGGCGATTCTGAAGACGCT GAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000213_pilon:396233..406935-

>XLOC_038145 ID=XLOC_038145|Name=XLOC_038145|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3246bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000213_pilon:396233..406935- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGGTATTTACAAAACAAAGGCATCATTTGATGAAGAAATTATTGGA
TGCTGTAAAACAGATGGAGGTATTTACAAAACAAAGGCATCATTTGATGA
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ACAATGCTAGCAACAGAAAAAGAAAGCAGTGCCAGGTCAATTTTGGAGGT
AAAACAATGCTAGCAACAGAAAAAGAAAGCAGTGTAATGCTGGTTATCAA
ACAATATGAACAAGCTCTTCTACATGGACTGAAAAAAAATAAATTCCTGG
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GGGCACTCGTTTTGGATGAAGAAGTTGCAAGCAATCTACCAGTCATGGCT
AGAGGTTTAAGTTCAATTATTTTTGCTTTGGAAATTAATGGAGAAGATCT
TAACAAGCCTTTTCAGGTTTAAGTTCAATTATTTTTGCTTTGGAAATTAA
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TTTGACACAGCCATTAGTATTCCCAACGACAGAGAAAACACACAGAAGGG
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ATTGTCAAAAAAATCAAGAAGAAGAAGCGAAAAGTAGTAGAAGCAACTAT
AAACGATTTAGAAGAAATTCCAGACGAACATTCATTATCTCAATCATATA
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TAAAGACTTTGAAACGCTTAGTGGGCGTGCGTTAGAAACACGATCAGCTC
CTGTGTCCCCTGTACCCTTATCTTATGGAGATAATACTAACACAGAGAAT
CTATCTTCTGCTGACAGTCCTACTCCAAATGACAGAGTTTCCTCGCAAAA
ATCAATTTCAAAAGACAATACGAAAAGAAATTCATCAGACAATCTAACTA
GTGAACCAACGGAAGAAAATACAAAACAAACTGAAAATACAATCGCAAAT
ATTAATAATACGACGAAATTACAGGACAAGCTAAAAGACACTCCTGTCTT
ACAAAATGACAAGACGAATGGACTTCGTAAGACTGGGTTCGATAATGTTA
CAACTTCATCCAATAAAAACTTCTCAAACGCGTTGACTTTAGAATCCAAT
TCAATCGACATTCTTCAAAAAGAGAAAGATAACTTAATAGATGAGAATCC
TCTTCCTAAAGATAACTTAACAACAAATCATTCTAACGAACCTAAAAATA
TTTCTTATGGACTTCAAAAATCTTCATCAGTTATTACTAAAGAAAACCAC
GGTGGTGCTAGATCAAGGACTTCTAAACTAATACCGGATGATAATATATT
AACTGAAGCGAAAAATACAATTTCTAAAACGCCATCTTATAACGACTCTA
CAACGGACAATACAAATGTATTAGATTTGAATGCACCACAAGTGAAAAGT
ACTCCTTTGGAGATTAACAATCAACTGCATTGTGGAGCAATCATTGCTGG
CGATTCTGAAGACGCTGATAGCCAAATATTGTCAAAAAAATCAAGAAGAA
GAAGCGAAAAGTAGTAGAAGCAACTATAAACGATTTAGAAGAAATTCCAG
ACGAACATTCATTATCTCAATCATATACTACCAATAGTTCACTAGAAAAT
CTTATATTACAAAGTAAACAAGACGACGATCGAATATTATCTCCACAATC
TGGAGCTAGCAGTGATAGAAGTTCAACTAAAGACTTTGAAACGCTTAGTG
GGCGTGCGTTAGAAACACGATCAGCTCCTGTGTCCCCTGTACCCTTATCT
TATGGAGATAATACTAACACAGAGAATCTATCTTCTGCTGACAGTCCTAC
TCCAAATGACAGAGTTTCCTCGCAAAAATCAATTTCAAAAGACAATACGA
AAAGAAATTCATCAGACAATCTAACTAGTGAACCAACGGAAGAAAATACA
AAACAAACTGAAAATACAATCGCAAATATTAATAATACGACGAAATTACA
GGACAAGCTAAAAGACACTCCTGTCTTACAAAATGACAAGACGAATGGAC
TTCGTAAGACTGGGTTCGATAATGTTACAACTTCATCCAATAAAAACTTC
TCAAACGCGTTGACTTTAGAATCCAATTCAATCGACATTCTTCAAAAAGA
GAAAGATAACTTAATAGATGAGAATCCTCTTCCTAAAGATAACTTAACAA
CAAATCATTCTAACGAACCTAAAAATATTTCTTATGGACTTCAAAAATCT
TCATCAGTTATTACTAAAGAAAACCACGGTGGTGCTAGATCAAGGACTTC
TAAACTAATACCGGATGATAATATATTAACTGAAGCGAAAAATACAATTT
CTAAAACGCCATCTTATAACGACTCTACAACGGACAATACAAATGTATTA
GATTTGAATGCACCACAAGTGAAAAGTACTCCTTTGGAGATTAACAATCA
ACTGCATTGTGGAGCAATCATTGCTGGCGATTCTGAAGACGCTGAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038145XLOC_038145-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000213_pilongenomesc0000213_pilon:396233..406935 -
Properties
Property NameValue
Aaloc649-1623:976
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