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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000020_pilon:1107645..1113916+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044338 ID=XLOC_044338|Name=XLOC_044338|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6272bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1107645..1113916+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGCTGATAATTTATCTTGTGTTTTGTATGGAATTGATGATATGAG
GATTGtgagtaaaaaaattaattatttaaaaagcAAATTATAACACCATT
Ttacttgtttttgaaaaacctcaaggataaaaataaattttgggggatag
aaatatttggcctaaaatccaccaaattaagttcctgccaaaatttcttt
ttttgtagtcaacaaaattaaattctcgctatatgtgttttatttattta
ttttcctaatttgtgctttttcaaggtttctaaacagttttttctttaca
gtgacaatttttGGCCAATAATATTCTTcaaccaccaaattaaattccca
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ttttatttcaaCTTGCTAAAATGGAtttttttggtttataatatataaaa
aaaaatcttaaaaaaaaattctactttaaaataatcttatttacttttct
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ataagtcttaaccgaaaatcgaaattttaaaaagaaagcgATCTCTATCC
AACAATATTTTGACTCATTTGAAGTCGCCATTTCGAGGCTTTGAAAACAG
TGCTGTGTAAACTAGATAGGCAAAATCATCTTACCCTTATTTTACTATTC
CATATCAAATCTATATTTCtaaagtttaaacttaataaatataaattgta
aaataataaagtaaaatcaattaaaaaataacaacatcAGTACATGATGC
AAGTGAAATCGGTTTTAATATTTAACAACTTTGGGATTACATTTTACTTa
aatttgtaaaacaattttcatcttttaaaacaaaacatgaatTAATGAAT
TAATTCGGgtcttcctatttttttagtTACAGATAGTCTTACTTCAATAA
TAAGCCAATGACAAAGGGCTTTTAAGTCCATTAGTACCTGGTGACCTCTA
TGTGGATAACAATTATTTTGGTtagttaaaagttttttgagaAATAATTG
AGCTTTTCATCCGAAAATTTCCGGAAAAAGCGCATAAAAACGCTGATATT
AATCCCTTGATTGTCaatattttagttttgtttaaaacaaacttatcgaa
agCGTTATTTTGGCATAATATAATACATGGGGTAGACATGGGGTGTCTAC
TGTGGAAGGTACCAAGGTAGTAAAAGGTTTAGTCTTTTAATTTCCTTACA
TATTTCAGAGGTACTATTATCAATGCATTCAGTGGGAATTTGTGGATCAG
ATGTACATTACTGGAAGCATGGTCGTATTGGTGACTTTGTTGTTAATGCA
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GGGAGTAGAGCATTTGAAAAAAGGTAATTCTAATATGGTCGACTAATCTT
GGAATCAATCAATACTCCATTCTCAATAATGAACTATTTTAGGAAATTCT
ATTAATATCAatgttttaaggaaaagattaagCAATGAAGGCTTGTAATG
ATGTCATCATGTCTGTATAGAAACCACCTGACCTATAATGACGGTACcgg
ctttttgtaatcaccttacaagCGTTGACttttttttACCCTACTTGTcg
atgcaaattttttttccgtagacgggcggaaatatctttaatggtcggaa
atatcatagcgtaatggtcggaaatatcatttgatggtcggaaatatctt
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tttgatggtcggaaatatcatttgatggtcggaaatatcatttgatggtc
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gtattgaactttttattcaaacacgttctttcttgtcttttttatatcct
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TGCATGCACTGCCAGCTGGATGCACTGTACGTGTTTGATTTTGGAAGCCA
AATTTTCTGCCGAACGTATGGTcattttcagatcgagtgccccccccccc
gggtaaggTCTAGAATGAGAGGGTGTCCATAGGTAGGGTTGGGACTAGCT
TTAGGGTGATTTGAGAACAGTGGGGGctagaggaggaaaggatataaaaa
agacaagaaagaaagaagagtcgtgtttgaataaaaaggttAATACCACT
TTCTCTCCCTAAAAAGCTGTCTACGTCTTGTGTAAAATACTGTATAAAGA
ACTAAAAAACAGAACAGTTCTCAGATAGTGtctcaaaaacttaaaataaa
aaactactctggcacacacaacaagttggccacacaacaccacctttgct
acaatctttgtttacatttttttgctgatgaagcatttttaaaagcgcgg
gatatttccgaccatcaaattttcaaatttttagagctttggatatttcc
gaccatcaaatgataattccgaccatcaaaagatatttccgaccatcaaa
ttttcaaattttcagagttttggatatttccgaccatcaaatgatatttc
cgaccattacgctatgatatttccgaccattaaagatatctccgcccgtc
tacggaaaaaaatttgcctCGTCAACATACGTACATAATGACATCAAAGT
CAACAGTTGAGAGTTTAAAACCAAAGAACTGCGAATGAagatttttagtt
taaaatctACTAAATTTCTTGACTTAATTAATCTATCTGTTCGATTGTGA
TCTGAAAATCGTCTTTATTCATAATGTAGGAGATCGCGTAGCAATTGAAC
CTGGAGTACCATGCAGAATGTGTGATTGTTGTAAAACTGGTTCATACAAT
TTATGTCCAAAGATGGAATTTTGTGCAACGCCACCTATCGATGGGAGTCT
TTGTCGTTATTATGTTCATGCTGCTGATTTCTGCTACAAGTACGTTGCTT
ATTTTCCTTATTATGTAAAATGAATAGGAATTAAGGAagggagatttttt
ttttgaaaacgcaAAGTAAAGATTCATATTGTaaacttcaaaattcaaac
aTCGGGTTTTTCATTTTGCCAGTAACTTAAATTCAGATCATGAATTATGG
TAGGATTATATATTAAAGTCATTTCAAGCAGCATTATTCTCTCTCAAATT
TATTCATTCTGAATCAAACCTTTATTCTTGATTGAGCTTGATTCTTTACC
TATCATCATCAGGACaaataaacattgaaaacaATGATAACACAATGAAA
ATGcttgataacttttgataaatttccgtaagttttgagaaaaactaTTC
TCCTACAATGTACAAAAAacataagaaatttttcttgttACGTACTCTGC
AGATTACCTGACCACGTGTCATGTGAAGAAGGTGCATTGTTGGAACCTCT
ATCAGTCGCTGTCAACGCATGCAAACGAGCACAAGTCAAAATGGGGGATC
ATATATTGGTCTGTGGCGCAGGTTAATAATGTTTCTTGTTGTTATCTTTT
GTTTTGGCCTTCATTTTGAATCGCGAACAACGCTTCATTGATAGGCAGAT
CGAAATCacacaatttttaaaaagtcacaaaatctttaaaaaggatATAC
TTTTATAGGATAAACCTGGAATTGCTAACTGTGATAAAATATTCCCTAGA
TAAGATACGTTTCAAAACATAATTCTTTATTTATAGGACCAATCGGTTTG
GTATCGTTATTGGTTGCAAAAGCATGCGGTGCTACACAAGTTTGTATTAC
TGGTAGGTCCGATTTCATTGTCATACACATCCTTTAAAAATATAGCGAAA
TGTACAAATAGGAAATGtttttttAGATACAAGTTGAGCTATTATAAATA
ATATGGGGGTTCTGAGATTACGGTATTGACCGGTTTTCTGGTGTTGAAAG
GCCGAATTTCAGGTAATCATATTATGACCggtatttcatgaaaaaatgtt
tttcgataTTTGTAAACTTGGATGCCACCCATAATAATGTTTGACAAAAA
TGGGTACTATGATGGGTAGAGTCGAACAAAACAGAAACGTGCAAAAATAT
CTTATAGGGGTTCATTTAACCACTCCGTCTTCGTCGTATTGTTTTAAATG
TACCAGAATGTGGGTTGATAGATAATGTTTAAATTTATATTGGAAGTTAT
TCTACCTTttgctacgtttcgagagattcttctttCATTATCGATCTTCT
CCGATAATGGTTGGTCAAGTATGGTaaaaaaaTCGTTATGTTTTACCATA
GATCTAGACGAGAATCGATTGAAAGTAGCGAAAGAGCTAGGTGCAGACAT
GACATTCAAAATCACATCACGCGATGGACGAGAAGTAGCTGAGCAAGTGA
AGAAAGAATTCGGTCGAATCGATAAAACAATCGAATGTAGTGGAGCTGAA
TCGAGTGTCCATACTGCTATCTATGTGAGTAAAAAATCTTTTGCACACTA
CTTTTCAAGGTCTGAAGGATGGGCGATGAGTATCAAAACGccaaaatttt
tatcattttgaaatgtttattTCATCTTAAATACTATAAAAAGAcgtcaa
aaatattcttttttggCGACTTTGTGTTTGCGACAGAGACGGAAAGTTTC
TGATTTGTCTGgatcctgattgactgaggacgacggtaaatcagcacttt
taccgtcttTGATTTTGCGGATCAAAACACTGCGGGTTATTTCAAATCGT
TTCACTCCGCCTAAAAAGCGCAAATACATAAAATTACTATTGATTTCTCA
ATCGAAACTATCAGCAGCCGAGAAGACCGTTCTTCAGTACGCGGAATTAT
GTTTCTCGTTAGTCCcttcaattcaaaattgtttttcttgaaatttacaG
GCAACAGCATCCGGAGGGATTGCAATGTTGGTTGGAATGGGCAAAGCAGA
AATTAATCTCCCGATTTTCGAAGTATTAGTGCGCGAAATTGACGTCAGAG
GGAATTTCAGATACGTCAATTGGTAAATAAAGACATTTATTTGACAAGAG
ATCTGTTACTACCAGGttttttttctaagcacttttccTTGCCACCGTTT
TGGTCCGAAAAATTGAGTTTCAATGTAGTACTAAATGTCGGGCATCATAG
TTGGGCGATGAAGGAATTTTTGCCCTCAAAAGGTCCTAAATAGGTGTTTT
CATGCATCTTAATAGCCTAAAAATTCTAACTTGATTAATGAAAAACAATC
TTTAATTGCTTTCACCTTCCATAATTTCTTCTTAGACCCATTAAGTTGAT
TGTTCATCAAGTTTTTTGCACCATCATTTCTCTACTttgcttttttttaa
ctttcgtgtttaatttttcacaaaattgaaTCTGAACTTGAATAACGAAT
TGTAAAAACGGTGGTACAGTAAGAAGTGCTTGAAAAATACCCTCCTTACC
TAAATAATCGAAATGAGAAAATGTCGTGAAATCttatttaatttaatttg
gGGTGCTTAAACTCCACATTAAAGGGTgtaaaacttttaaagaaactATT
TGTAAAGGGAACATACAAGGATTtcagacaccgaaataccgacacatTTC
CCTTGGGTCACCGTCAACAACGACATGAATTGCTAAAGTTCTTATATTTT
GTCACTGCATGGCATATTTGAAACGAAAAcaccgtcacttttttcttcaa
acactaAAACACCGACGgaaaaaagggttaataccgtcAGCCCGTCAAAC
CCGTGCGCTCTCTCCCATTCGTAAATTAATTGTATTGGTTCTGGTTTCAA
TGATTTTTAGAGAATTTGATTTGATGTTATATGATATGCGTATTTCTTTT
TACAATCTCTAGCTATCCAACAGCATTGGATTTGGTAGCTTCTGGTAAAG
TCAACGTCAAACCTTTAATCACTCATCGTTTCAAACTTGAAGAATCTCAT
AAAGCATTCACCACCAGTAGCTCTCCTGGATGTAATACAATCAAAGTCAT
GATCTCTTGTCATGAAGAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:1107645..1113916+ >XLOC_044338 ID=XLOC_044338|Name=XLOC_044338|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2106bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1107645..1113916+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGCTGATAATTTATCTTGTGTTTTGTATGGAATTGATGATATGAG
GATTATGGCTGCTGATAATTTATCTTGTGTTTTGTATGGAATTGATGATA
TGAGGATTGAGTCAAGACCAACTCCCAAACCTGGACCGAATCGAGTCAAG
ACCAACTCCCAAACCTGGACCGAATCAGGTACTATTATCAATGCATTCAG
TGGGAATTTGTGGATCAGATGTACATTACTGGAAGCATGGTCGTATTGGT
GACTTTGTTGTTAATGCACCTATGGTGTTGGGACACGAGGCTAGTGGTAT
TGTTGTCGAAACTGGAGAGGGAGTAGAGCATTTGAAAAAAGAGGTACTAT
TATCAATGCATTCAGTGGGAATTTGTGGATCAGATGTACATTACTGGAAG
CATGGTCGTATTGGTGACTTTGTTGTTAATGCACCTATGGTGTTGGGACA
CGAGGCTAGTGGTATTGTTGTCGAAACTGGAGAGGGAGTAGAGCATTTGA
AAAAAGGAGATCGCGTAGCAATTGAACCTGGAGTACCATGCAGAATGTGT
GATTGTTGTAAAACTGGTTCATACAATTTATGTCCAAAGATGGAATTTTG
TGCAACGCCACCTATCGATGGGAGTCTTTGTCGTTATTATGTTCATGCTG
CTGATTTCTGCTACAAGAGATCGCGTAGCAATTGAACCTGGAGTACCATG
CAGAATGTGTGATTGTTGTAAAACTGGTTCATACAATTTATGTCCAAAGA
TGGAATTTTGTGCAACGCCACCTATCGATGGGAGTCTTTGTCGTTATTAT
GTTCATGCTGCTGATTTCTGCTACAAATTACCTGACCACGTGTCATGTGA
AGAAGGTGCATTGTTGGAACCTCTATCAGTCGCTGTCAACGCATGCAAAC
GAGCACAAGTCAAAATGGGGGATCATATATTGGTCTGTGGCGCAGATTAC
CTGACCACGTGTCATGTGAAGAAGGTGCATTGTTGGAACCTCTATCAGTC
GCTGTCAACGCATGCAAACGAGCACAAGTCAAAATGGGGGATCATATATT
GGTCTGTGGCGCAGGACCAATCGGTTTGGTATCGTTATTGGTTGCAAAAG
CATGCGGTGCTACACAAGTTTGTATTACTGGACCAATCGGTTTGGTATCG
TTATTGGTTGCAAAAGCATGCGGTGCTACACAAGTTTGTATTACTGATCT
AGACGAGAATCGATTGAAAGTAGCGAAAGAGCTAGGTGCAGACATGACAT
TCAAAATCACATCACGCGATGGACGAGAAGTAGCTGAGCAAGTGAAGAAA
GAATTCGGTCGAATCGATAAAACAATCGAATGTAGTGGAGCTGAATCGAG
TGTCCATACTGCTATCTATATCTAGACGAGAATCGATTGAAAGTAGCGAA
AGAGCTAGGTGCAGACATGACATTCAAAATCACATCACGCGATGGACGAG
AAGTAGCTGAGCAAGTGAAGAAAGAATTCGGTCGAATCGATAAAACAATC
GAATGTAGTGGAGCTGAATCGAGTGTCCATACTGCTATCTATGCAACAGC
ATCCGGAGGGATTGCAATGTTGGTTGGAATGGGCAAAGCAGAAATTAATC
TCCCGATTTTCGAAGTATTAGTGCGCGAAATTGACGTCAGAGGGAATTTC
AGATACGTCAATTGGCAACAGCATCCGGAGGGATTGCAATGTTGGTTGGA
ATGGGCAAAGCAGAAATTAATCTCCCGATTTTCGAAGTATTAGTGCGCGA
AATTGACGTCAGAGGGAATTTCAGATACGTCAATTGCTATCCAACAGCAT
TGGATTTGGTAGCTTCTGGTAAAGTCAACGTCAAACCTTTAATCACTCAT
CGTTTCAAACTTGAAGAATCTCATAAAGCATTCACCACCAGTAGCTCTCC
TGGATGTAATACAATCAAAGTCATGATCTCTTGTCATGAAGAGTAACTAT
CCAACAGCATTGGATTTGGTAGCTTCTGGTAAAGTCAACGTCAAACCTTT
AATCACTCATCGTTTCAAACTTGAAGAATCTCATAAAGCATTCACCACCA
GTAGCTCTCCTGGATGTAATACAATCAAAGTCATGATCTCTTGTCATGAA
GAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000020_pilon | genome | sc0000020_pilon:1107645..1113916 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 895-1053:6114 |
| Aaloc | 772-891:5151 |
| Aaloc | 601-771:4554 |
| Aaloc | 535-597:3989 |
| Aaloc | 415-531:3654 |
| Aaloc | 256-411:3082 |
| Aaloc | 91-252:1361 |
| Aaloc | 55-87:526 |
| Aaloc | 1-54:1 |
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