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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000084_pilon:1105920..1106674+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037215 ID=XLOC_037215|Name=XLOC_037215|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=755bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1105920..1106674+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GACACAAGCTGTGGTATCAATGCTTTGTTGCAATATCAATTATGGTATCT
ATGCTTTGTTGCAATATCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCA
ATTACGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAACTATGCTATCGGTGTTTA
GTTGCAATTTGAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAACTGTAA
TATCAATACTCTGTTACAATATCAATTATGGTATCGGTATGCAATGCGTT
GTATCAATATCAATTATGGTTATCAATGCTTTTGCTTGCATGTTGTTGCA
ATACCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAATTATGGTATCAA
TGCTTTGTTGCAATACCAATTACAGTATCAATGCTTTGTTAACATATCAA
CTGCTGTTACAATATCAATTATGGTATCAATGCATAATTTGCAATGCTAT
GACCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAATTATGGTATCAAT
GCTTTGTTGCAATACCAATTACAGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAAC
TGTAATATCAATACTCTGTTACAATATCAATTATGGTATCAATGCTCTGT
TGCAATATCAATTACGGTATCAATGCTTTGTTGCACTACCGACTATGGTA
TCAATGCTTTGTTGCAATACCACATTATCTTCAGGTAtaagagttatttt
taaaaacttttttcatccttattttaTTAAGGCATCCCCGAAGAACCCTC
ATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:1105920..1106674+ >XLOC_037215 ID=XLOC_037215|Name=XLOC_037215|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1408bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1105920..1106674+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GACACAAGCTGTGGTATCAATGCTTTGTTGCAATATCAATTATGGTATCT
ATGCTTTGTTGCAATATCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCA
ATTACGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAACTATGCTATCGGTGTTTA
GTTGCAATTTGAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAACTGTAA
TATCAATACTCTGTTACAATATCAATTATGGTATCGGTATGACACAAGCT
GTGGTATCAATGCTTTGTTGCAATATCAATTATGGTATCTATGCTTTGTT
GCAATATCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAATTACGGTAT
CAATGCTTTGTTGCAATACCAACTATGCTATCGGTGTTTAGTTGCAATTT
GAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAACTGTAATATCAATACT
CTGTTACAATATCAATTATGGTATCGGTATGTTGTTGCAATACCAATTAT
GGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGC
AATACCAATTACAGTATCAATGCTTTGTTAACATATCAACTGCTGTTACA
ATATCAATTATGGTATCAATGCATAATTTGCAATGCTATGACCAATTATG
GTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCA
ATACCAATTACAGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAACTGTAATATCAA
TACTCTGTTACAATATCAATTATGGTATCAATGCTCTGTTGCAATATCAA
TTACGGTATCAATGCTTTGTTGCACTACCGACTATGGTATCAATGCTTTG
TTGCAATACCACATTATCTTCAGGTAtaagagttatttttaaaaactttt
ttcatccttattttaTTAAGGCATCCCCGAAGAACCCTCATTAGGTTGTT
GCAATACCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAATTATGGTAT
CAATGCTTTGTTGCAATACCAATTACAGTATCAATGCTTTGTTAACATAT
CAACTGCTGTTACAATATCAATTATGGTATCAATGCATAATTTGCAATGC
TATGACCAATTATGGTATCAATGCTTTGTTGCAATACCAATTATGGTATC
AATGCTTTGTTGCAATACCAATTACAGTATCAATGCTTTGTTGCAATACC
AACTGTAATATCAATACTCTGTTACAATATCAATTATGGTATCAATGCTC
TGTTGCAATATCAATTACGGTATCAATGCTTTGTTGCACTACCGACTATG
GTATCAATGCTTTGTTGCAATACCACATTATCTTCAGGTAtaagagttat
ttttaaaaacttttttcatccttattttaTTAAGGCATCCCCGAAGAACC
CTCATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000084_pilon | genome | sc0000084_pilon:1105920..1106674 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 541-732:564 |
| Aaloc | 421-537:445 |
| Aaloc | 262-414:292 |
| Aaloc | 22-261:1 |
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