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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045457 ID=XLOC_045457|Name=XLOC_045457|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7281bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CGGATCCTCTCATATGAAATACGTGAAAAGTTCAAGCGATTGCTTTGCTT
TCTCTTATCAAAAACAGAGAAAATTGTAACTGTTTAACAATAAACAAAAG
GGGAATAAAGTTTTGTTACATGATGCTGGTTGATACGGTTTTTCTTGTAG
TCATGGTTTTAGCTAGCCAATGTTTATGTAAGCCATGGCCCAAACGGAGG
ACATTTAGAAGTACAATGCTCCCGGAGAGGGCAAGCAAAGATAGAATGCA
GGCTTTATACAATAGTAGATCGTCAGGATTGGCTTCAGTAATCAATAACC
TTGGATCACACATTGAAAAGACTGAGTTATCCAGTTTCAATGGAATCGGC
AATCTAAAATGGTTTGAAACATCGACTAGCACCGAGACACAGCAGTCACC
GCAAGTCGTTCAAGAGCTAAATAACCAATTACCAGAATTCACCCATGAAG
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CAGAAACGCACAGTACCTTTGCTATCACCTTCAAAGACAATGTACATCAT
TGGGGAAACTGAAGACAGACCTTTAATTATGATCGAGAAGCAGCATAATA
AGCTGATTATAAAGGTTGAAGAGCAACAGATCATTGACACAGACATACAA
GAAGATAGAACTCCAGAAGAATCTATGACAACACAATCAAATCCAGATGA
ACAAAAGAATGGGATTGAAATCAAAACACAATCGCGAGTACCATACTTGA
AAAATCTACAACAACAAGTTAGAGCGCGATCAGCTGCAAGCAATCATCAT
ATGCCTTCATATTTAGCCGGTGGAGATGTTGGTGGACATGGTATTAACTT
TTTCGATGAAGATGGAACATTCAGTAAAGAAATCAGGTCGTCCAGTAAAA
AGACTAATAAAAAACCAACACACTCGTTTGACGACAAAGACGGCGTTTTT
ATACATGACGTTGACAGCCACGGTGACGATAAACATAAAGACGACATACA
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TTTTATCATCTCCCTTGAATACGAGTTTCCCAATGAGGGTAGACATAGGT
AAAAATGTTTTTCGGTATGTGCAAGCGGTAAGGGCTTCTGTCTCACACCT
CAAAATTTCCTGAGGTTGTTTTAAAAAACCAATCTTCTTTCTTAAAGGGT
CTCACATTTATGAAAATTGAAAATTTCTGAACACCCAGATCACTAATATT
TCTGTTGAATTTTGGTGAAAACTTTTTGAAATATTAGTATCTGTAATCAG
TAATCTGGGTGTTTCAGAAATTTTCAATTTTCATGAATTTGAGACCTTTT
AAGAAAGAAGATTGGTTTTTAAAACAACCTCAGGAGATTTTGAGGTGGAC
CAAAAATTTGAACAAAATCCCTCTGAAGGATCCAAAAACATCAACATATT
CGGCCAAATCTTTTGTGTATATTTTCTAATTTCCCTCTTATAATACCTCT
TTAAACATACAAACAGGAAAAAATAAAATCAGAATAGAATATTTAAAAAT
ATAATCAAAGCCGTGCTAGAAGCCTCAGGAGCAAAGAAACACAAGAAAAG
GCAACTTTGCAGAGTTCAGGAAAACAATCTAAATTTCTTAAGAGGGCCCT
TATACGGATTGTAGAGAGAATCAGCCCCCTACTCGAAAAATGACAATCAA
AATGTACGCTCTATTTTGATTACAAATACCACGAATTTGTTGTATGTTTT
GAATTTAGGATTAAAGGTTTAGCAATACTTTATCACGTTTTGATGTATTG
TAAATAATAAACTAGATTTCAAAGTGCAAAATTAGCAAAACGTTTGGATT
CATAGACCATGTTCACACGTTACTGTTTCATCTCGCTCCGGTATGACTTT
TGTTACGGATCGAGTGTGTTCATATTGGTTTCGGAACGTTTTGGAGCAAG
AAAACGGAGCAGTTCCGTTCCGATGAAAAAAGAGCAAAACCATTTCTGTT
TTGCTTTGTTTTTTGACATTTCGAATTTTGACGTTCACACTTGTTTTTGG
AACCGTTTCGTTTCGTTTCGTTTCGTTTCGTAACGTCTGAACATGGTCTA
AGTAGTTGACCTTTCCTAAAAAAAACACATTAGCGTTTATAGTATACCCA
TAGTATGATAGTTGATAGAAGAGAACCAATTTTAAAATGCTTAAAATATA
TTATTAGGGGAAAACAAATTAAGCCGAAATTGTATTTTTTTTTCAAGCAA
GTCGCCAATGTAGTTAGGCATGTTCAGAGTCTAGAGGTTATTTTTTTGTT
TGTTATTGTCAGTTTTACTATAAATCTCAATTTTTCAGATTTTTCGAAAA
GAATAAGGTGCAGCTATTAACCCCGTTTATTCAAGCCTGGGTTGTTTGTC
AAAATAATTGAAAAAATGGCTCCGAAGAACTTAAAAGGCCTTGGAAAATC
AAAATTGATCGGCAATTTTTGCACGCACGAAAAGAATGATTCGGTAGCAA
ACGTTTTTAAAGAATGTCGTTACTATAGACATAATCTTTGATGCCAAAAA
TCAAAGTATCACTTTAGATTGATTATTTGGCATGTGACAGAAAACGTTGG
CGTGTGGTGCCTGTCATACGAAAGTAAAAACCTCAAATAATGAAGCTTTC
TTTATGTTTATTCCTTAAGGCCGGTCTCCACTTGCGCGCGCTTCAATCGC
ACTTTTTCTAGCAAAGCTTCCACGTTAATGATCGTCTACGTTATTGGTCA
AAAGAAAAATGAAGCAACTCCTTTGGCGCGAGCTGACGTAACGGTTGAAA
ACAGCTGAAATGTGTCAAACTTTTTTTTCGAGCACACGCTACATTTTCAT
GACGTAATCTTTTTCCAAGCAAAAAGGATTGAAGCCAAAAAGTGCGATCC
CAGCAGGAGCAAGTGAAGACCGGCCTTTAGTATTTCTTTGATGTATTGAG
GTTCATTTAGGAGGTTAAAAAATCAAAATTCATTTGTGAAATAAAATATA
TTGCGCCTTCTCTATCACTACACAATATTGGAGAAAACTAGATTTTGATA
TAATTTTTAACTAGTGACGAACAAAACTGAGATAGAAATTTCGGGCTGAG
GAGTTATTTTTCGTAACGGGAGACAAGCAGATCACGCGTGACTCTTCTTA
GTCCTTTTGGGAATGTTATTGCACCTTAACCCCGCGTGTTCTTCCTTTTT
TGACCCACGCAGTGCTTGGTCGTGTTTTTCATACCCTCTTCCGACCCTTG
CATAAACTCGATTATTTTACCCATACGGGTCACTCGTCTCACCGTCGGAA
TTTATCAATTAAATTGTTGAAGGTTGCTTCACTTAGCTTTGTAGATCTAT
AGAGAACTATGATTTCGGGGGAAAGTTCTCATAATTCATCCTTAACATAG
CAGCTATAGAATTGTAGTAGCTCAATAAAAAACATGTCAAAATTAACCTC
AATATATTTTTTCTATAGGGGAAACCAATTACAACAGGGAGACAAGATTA
ACAACCATCTCCATCAACTTGACAACGATACATGATGTAATAGACGGAGC
CAAACTCAACCTACGGATATTCAACAACACCAAAATCAAAGCATTCTATT
TAACAAATGTTGTGAAGTCTTTCAAAGTTCATCTCAGAAGAAGTTTATAC
GATGTAACACAGATATTTAACACTAAATGGTTGACCATTGATTTTTCGAG
GCAGTTGAAAGAATTGGTTAAGAAACATGGAAACAGGTAAAAACATTTAT
GGTGATTTATGGACTATTTCATAGGATTCGTGCATCTGTTACTTGCTATT
TTTTGTTCAGTTTAAAGGGGAAAATACACATATCGGTGCAGAGTTCCCCA
TCGGGAAAGTTGTGTTTAATTACTACAATGGCGTAGAAAAATATCATGTA
CTAAAAACACGAATCCTATGAAATAGGCTAATTATGTCTTAAATAGTCTA
TACATAATCCATGTGTACAAGTGTCTTGAAATAAATTATTATTTAGGCTA
CACACATCCCCTCTGATATGTTTTGATATAGGGGTTTCGTACAAAGATCT
ATAAAGCCCGAAGGGCTAGATAGGCAATTTTAAGCTTTCTCCAGCAAAAA
AAAGTGAAGCAAAAATTTAACTTTTTAAATTTCGTGCCGATGGATAGGAT
CTAGCATTTTAATTGTTTTCGGAGCGCGAGATCAAAAAAAGTAGGTGGCA
AACGCTATTTCACATCTCTTAAACTGGTGAAATTGCATATTTTAGTCACG
TGACTTTGGTAGGAAATCCTTCCAAACCTAGGCTTCACTTTTCGATAAAA
GCCGCAAATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATATCTGTGGTTTCGTATCG
TCCGAGAGAGTTGTTTTTCAGGGCTATATTTTGCGAACAGGCTGGTTGAA
CGTTACGCTCTCTGTGTGTATTTTCTTAACAAACGAACGAGATTCGTATC
AGTCTTATCAAATTCGTATCAATCAAAAAACAGATTACCACAAGGAAATT
TTATACACGATACACATCTTTTTTATATCAAAATCAATCTCTGGGCCAAA
TTAGTACTTTCTTTTGGCATAAGCACAAGAAAAAATCAAAAGAATCACTG
TGACGGCTTCCTAAGTAAAATCGGGTTAAAAAGCTTTATTCTACAGTGGA
GTCTCCATAACTCGAACCTTTTTAACTCGAATTTCGCCTTAACTCAAACA
AGTCTGTTTGTCCCTAAGGACTAGGTATTTCAATTTCTACATGTAGAATC
TGTCCGTATAGAAAATAATTTTTATCCACATCTGCTGATAGCCTTATGCG
TGAAACACCGTGTAATGGCTGTTTTTAATTTTTGAAGAGAAACTAGCCGT
ATGCGCAGCGTCGCACGCTGCGTGTCCCAATCCAGTGAATAACTACACAT
CTAAAAAATTCTAACGGAAGAAAAACAGCCACCGATCGATGATTTGATTT
TGATTTTAGGAAATAAAGGAGAAAAAAGATATCATTGCATTGCAATTTGT
AACCACAATTAAATAATTGACTTAGCAAAAGAATATTTTAGATCTTCTTA
GCCATCGTGGCTAGCCATCGTGGTTGGACATTCGAGGGTGACAGAAGGTT
GATTTTAACCCATCAAGCTCCAAACTTGGTGAATAGAAAATAGCATCTTG
GGGTCTCAAAGTTAGTCTAGTGGTAGGAAATCTGCTTAAGGTGCAATAAG
ATGACGGTTCAACGCCATGAAGAGGAGGCTTTGTAGAGCTTTGTTAGATT
TTCGAAAACTGTTTACAAAACGTTGTAAACACACACGTTTAAGCGTATTA
ATATATAGATATATTAAATTGAAGTATGCTGGTATCTTCAGTAAACCAGA
CCTTATAAACTAGTCTCGAATTTTCCATAGATCGAACAAATTTGCGCCCT
CCCCTAGGCTATCGAGTTATGGAGGTTTCTCACCGTGAATTATTACTAAA
ATGTAGAAATTAACAAAAATTTGATTTTTTAGAAAAGTTGAAAACAATCG
ATTATATGAAAGTAATCAATTGTAAATGATGCATTCCATCGGAAATTTGA
TGTAATATTTTACCCCCTTCGTTAATTGCGTAGAAAAAATGCGGGTGGCG
TCTAATGTAGGCTAATTCTACCCCCGTCCCTTTGAATGAATTTAGTTGAC
CCAAGTGATCGTATATCTGTTTCACATTTGCTTTATACAGTCAACTCTCT
ATAATTCGAACCTCTATTATTTGGATTTTTCTGTAATTCGAACTCAAGTA
TTGGTCTCCTCAGCTGGAAAGATGTGTATAAGGCTCCCTGTAATTCAAAT
CTTTGTCTCGTTCAAATAAAATTGATGAGCTATGTAAAACAATTTCGAAT
ATACAGTCAACTCTCTCTAATTCGAATTTATAAATGAATTTTTCTGTAAT
TCGAACTTAAGTATTTGTCCCATTAGGCTAGAAAGTGGTTTGAATTATTT
CCATAAATCGAATCTTTCTATAATTTGAACAAAATTTTAAGCACCTTGAA
CATCGTATTAGATATGGATATCAATGGTATGATAGTTGAACAAAAGGAAA
CATAAGACTTGTTCGAGTTAAGGAAACATTCGATTTATAGAGGTTCAAGT
TATAGGACTGCAACATTGTATGATATGGCATGACTGAAACCATGATTTAA
TGCACGCTTTACAATATATTATCCACCCAAAATACACACTTTTATATAAG
AGCTAGCATATTTGACTGCGAGAGATCAGATGTTCTTATTTTTGCATATT
CCTAGGGTCAATTGTTCTCAACTTATTCTTACTTTCTTTGAGAACTTTAA
TACCTTTCAATTTTTAAACATTTTCAAAATCATACATTCTCAAATTATTC
CTAAAACCTTTTAGCTTTAAGCAAAAATTGAGGTTCGTGTTCTTATAAAA
AGCATGTATACTTAATAGGCTTAGATAAACAAGGAGAATAACCACTTCTT
GGCTTCTTGAAGTACTTTTGGAACCATCAATTCGTGTCCCCTCCCAATTC
CAAATTTCATCTTTAGTAAAAACCACTTTGCACTTTCCTATTCATAATAT
AACATTACAATTTAAAACTCAAACGGTCAAATTTCATAAAATTTACCCAA
TTAAAGCGAACAACAAAGATATTTCACCCGGATTTCACCAAGCTCTTGAA
TGAATAGGTTTTTGACTCGAAAGTTTTTATCCAGCTTTCACAATACCAAT
CTGCTTGATAATGAAAAAAAGTCACGGTGATAGTTTAAAGTTCATGGCGA
ACGGCAATGATTGTACATATAGTCAATATTCTTATCAAAAATTTAAATCC
TCTATAATTCGAAATTGTCAATCGTAAAAGATTATTGGCCCGTTAAGGAT
TGAATTAGAGAGAGAAAGTTAACTGTAGCTTTCTTTCACTTTCATTTTTC
AGTATGCTGTTACGTATCCAGATCACGTCGACTGATCGAGCAACGTCACT
CAAGCAACGTAAAGAAACATACGTCAAGTTAGCTATCAAGCCACCGAAAA
CTCGTACTAAAAGACATAAAGATACCGATTGTGCGCTTAAATCCTCCTAT
TTGAATCTAAGCGATCTTGGTTTGAAATCTTTAACACTTTGGGATAATAA
ACTAGCGATACGATATTGTGTTGGCAAGTGTAATGGTAAAAATGGCCAGG
GTGACGTCAAATGTTGCGTGCCGAGTAAATGGGGTAAACGTGAGGAGCAT
ACGGTGCGGATAGGTGGGGTGCACGGTATAATGACAGACATTTTTATTGA
AAAAAATGTTTTAGAATGTGAATGTAGGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660- >XLOC_045457 ID=XLOC_045457|Name=XLOC_045457|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CGGATCCTCTCATATGAAATACGTGAAAAGTTCAAGCGATTGCTTTGCTT TCTCTTATCAAAAACAGAGAAAATTGTAACTGTTTAACAATAAACAAAAG GGGAATAAAGTTTTGTTACATGATGCTGGTTGATACGGTTTTTCTTGTAG TCATGGTTTTAGCTAGCCAATGTTTATGTAAGCCATGGCCCAAACGGAGG ACATTTAGAAGTACAATGCTCCCGGAGAGGGCAAGCAAAGATAGAATGCA GGCTTTATACAATAGTAGATCGTCAGGATTGGCTTCAGTAATCAATAACC TTGGATCACACATTGAAAAGACTGAGTTATCCAGTTTCAATGGAATCGGC AATCTAAAATGGTTTGAAACATCGACTAGCACCGAGACACAGCAGTCACC GCAAGTCGTTCAAGAGCTAAATAACCAATTACCAGAATTCACCCATGAAG TCAACAGACATATACAATATAAATCATTACGGCGGAATGCACACAAGAGA CAGAAACGCACAGTACCTTTGCTATCACCTTCAAAGACAATGTACATCAT TGGGGAAACTGAAGACAGACCTTTAATTATGATCGAGAAGCAGCATAATA AGCTGATTATAAAGGTTGAAGAGCAACAGATCATTGACACAGACATACAA GAAGATAGAACTCCAGAAGAATCTATGACAACACAATCAAATCCAGATGA ACAAAAGAATGGGATTGAAATCAAAACACAATCGCGAGTACCATACTTGA AAAATCTACAACAACAAGTTAGAGCGCGATCAGCTGCAAGCAATCATCAT ATGCCTTCATATTTAGCCGGTGGAGATGTTGGTGGACATGGTATTAACTT TTTCGATGAAGATGGAACATTCAGTAAAGAAATCAGGTCGTCCAGTAAAA AGACTAATAAAAAACCAACACACTCGTTTGACGACAAAGACGGCGTTTTT ATACATGACGTTGACAGCCACGGTGACGATAAACATAAAGACGACATACA GATACCGGCAAAATTTCTTTATCTCTACGATAAAGCGGATCCTCTCATAT GAAATACGTGAAAAGTTCAAGCGATTGCTTTGCTTTCTCTTATCAAAAAC AGAGAAAATTGTAACTGTTTAACAATAAACAAAAGGGGAATAAAGTTTTG TTACATGATGCTGGTTGATACGGTTTTTCTTGTAGTCATGGTTTTAGCTA GCCAATGTTTATGTAAGCCATGGCCCAAACGGAGGACATTTAGAAGTACA ATGCTCCCGGAGAGGGCAAGCAAAGATAGAATGCAGGCTTTATACAATAG TAGATCGTCAGGATTGGCTTCAGTAATCAATAACCTTGGATCACACATTG AAAAGACTGAGTTATCCAGTTTCAATGGAATCGGCAATCTAAAATGGTTT GAAACATCGACTAGCACCGAGACACAGCAGTCACCGCAAGTCGTTCAAGA GCTAAATAACCAATTACCAGAATTCACCCATGAAGTCAACAGACATATAC AATATAAATCATTACGGCGGAATGCACACAAGAGACAGAAACGCACAGTA CCTTTGCTATCACCTTCAAAGACAATGTACATCATTGGGGAAACTGAAGA CAGACCTTTAATTATGATCGAGAAGCAGCATAATAAGCTGATTATAAAGG TTGAAGAGCAACAGATCATTGACACAGACATACAAGAAGATAGAACTCCA GAAGAATCTATGACAACACAATCAAATCCAGATGAACAAAAGAATGGGAT TGAAATCAAAACACAATCGCGAGTACCATACTTGAAAAATCTACAACAAC AAGTTAGAGCGCGATCAGCTGCAAGCAATCATCATATGCCTTCATATTTA GCCGGTGGAGATGTTGGTGGACATGGTATTAACTTTTTCGATGAAGATGG AACATTCAGTAAAGAAATCAGGTCGTCCAGTAAAAAGACTAATAAAAAAC CAACACACTCGTTTGACGACAAAGACGGCGTTTTTATACATGACGTTGAC AGCCACGGTGACGATAAACATAAAGACGACATACAGATACCGGCAAAATT TCTTTATCTCTACGATAAAGGGGAAACCAATTACAACAGGGAGACAAGAT TAACAACCATCTCCATCAACTTGACAACGATACATGATGTAATAGACGGA GCCAAACTCAACCTACGGATATTCAACAACACCAAAATCAAAGCATTCTA TTTAACAAATGTTGTGAAGTCTTTCAAAGTTCATCTCAGAAGAAGTTTAT ACGATGTAACACAGATATTTAACACTAAATGGTTGACCATTGATTTTTCG AGGCAGTTGAAAGAATTGGTTAAGAAACATGGAAACAGGGGAAACCAATT ACAACAGGGAGACAAGATTAACAACCATCTCCATCAACTTGACAACGATA CATGATGTAATAGACGGAGCCAAACTCAACCTACGGATATTCAACAACAC CAAAATCAAAGCATTCTATTTAACAAATGTTGTGAAGTCTTTCAAAGTTC ATCTCAGAAGAAGTTTATACGATGTAACACAGATATTTAACACTAAATGG TTGACCATTGATTTTTCGAGGCAGTTGAAAGAATTGGTTAAGAAACATGG AAACAGTATGCTGTTACGTATCCAGATCACGTCGACTGATCGAGCAACGT CACTCAAGCAACGTAAAGAAACATACGTCAAGTTAGCTATCAAGCCACCG AAAACTCGTACTAAAAGACATAAAGATACCGATTGTGCGCTTAAATCCTC CTATTTGAATCTAAGCGATCTTGGTTTGAAATCTTTAACACTTTGGGATA ATAAACTAGCGATACGATATTGTGTTGGCAAGTGTAATGGTAAAAATGGC CAGGGTGACGTCAAATGTTGCGTGCCGAGTAAATGGGGTAAACGTGAGGA GCATACGGTGCGGATAGGTGGGGTGCACGGTATAATGACAGACATTTTTA TTGAAAAAAATGTTTTAGAATGTGAATGTAGGTGATATGCTGTTACGTAT CCAGATCACGTCGACTGATCGAGCAACGTCACTCAAGCAACGTAAAGAAA CATACGTCAAGTTAGCTATCAAGCCACCGAAAACTCGTACTAAAAGACAT AAAGATACCGATTGTGCGCTTAAATCCTCCTATTTGAATCTAAGCGATCT TGGTTTGAAATCTTTAACACTTTGGGATAATAAACTAGCGATACGATATT GTGTTGGCAAGTGTAATGGTAAAAATGGCCAGGGTGACGTCAAATGTTGC GTGCCGAGTAAATGGGGTAAACGTGAGGAGCATACGGTGCGGATAGGTGG GGTGCACGGTATAATGACAGACATTTTTATTGAAAAAAATGTTTTAGAAT GTGAATGTAGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000064_pilon | genome | sc0000064_pilon:916380..923660 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1309-1686:379 |
| Aaloc | 1042-1305:3812 |
| Aaloc | 982-1038:6305 |
| Aaloc | 835-978:6449 |
| Aaloc | 658-834:6629 |
| Aaloc | 73-654:7211 |
| Aaloc | 67-69:7214 |
| Aaloc | 1-66:7282 |
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