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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000036_pilon:1011477..1019167- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033830 ID=XLOC_033830|Name=XLOC_033830|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7691bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000036_pilon:1011477..1019167- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTTAAAAATGGTCTGGTTGTTTTGCATTTATTTGTTGATTTCTCC
TGTCTTAACACAAGGTAAAAAGAACTCTTATTTTTGAGACAAAAACTTAG
GGAAAGAAATATGATTACTGTATGTAGCTCAATATTACCCACCTTTTAGG
ACAATTTTTCATAATTTTGTAATTATAAAGTCTAACTGAGATCTCTCAAA
GATTTTCCAAAACTTCACCCCGCTGTAACATACAATAGCGCTCTTGTGAA
TTATAGGACTTTTTTATTCAATATAATTATTTTATTGTAAAAAGAATATT
CATTGCTATGATGAAACTGTATGTAAAATAGGGGCAAAGAAGTAGACAGA
AAACCTCAGTATAGAAACAAAATTATACCTTTCTCATGAGTAAGGTCGGC
CAGCTCTAAATTTTTTTTTTGTTTCCAGGCCTGCTGGTAAAAAATTTTTT
CATCACCATCTGGCCACAATTCTTTTTTCTACATTGTCTAAGCTTCAAAC
TTTAAGCTTTGTCACACTGAAATTTTGTTCAGACATTTATTGGGCACTGT
GTAGATTTTTACTATTGTCTTATTCTCAGATCCATGCATTGATTACATTC
TGAATCAGGATGAAGATTCATGGAAGAGAAGCATTACTTACCAGAATGTC
ACAGATAACAAAAGATGTGATCGATTGGGTTGGAAAGAAGGATGGCATAG
ATTCACCAGTGAATCAGGAACCACCATGCCAACTGAATGTCCTTCATTAA
ATTCTTGTGGTAACGAAAGAACCTTAGCTTTCTTAATCTTATAATTCTTT
TTTCAGTTTTCTAAACCAAGCTGAAATTGTTTTATCTAACTTAGATACGC
AATTACAGTCCATTCACTTTAAGACTTTAAGTGTGCACTAATTTTTTTGC
TACCTTCAATACTCAATAGGTTATGTTTATGACCTTTGATGCAAGAATCT
TAAAGGGAAATAGTTATATATTTATGATTCATTATTATTAATATATTTAC
TGTGATTTTCCTTGAGTGTTCCCAGAATACTTTCAACACCAAAAGATTTC
AGGACCCTATTTGAAACCATTATTGAGATTTTAGCCTGAGAAAATCAGAC
TTTAACTCTAAATATCGCGTTTTAGGTGGGAAATGCAATACCATAATATT
AGACTTGGGCAAATTTCTGACCCAAACCATTTTGATTCTCCCAGAGTATT
TTCAGAATACTTTCAACACCAAAAGATTTCAGGACACCATTGTTGAAACC
ATTTTTGAGATTTTAGCCTGAGAAAATCAAACTTTAACTCTAAATATCCC
GTTTTAGTGGGAAATGCAATACCATAATGGCAGACTTTGGCAAATCTCTA
ACCCAAACCATTTTGGTTCTCTGAGAGTACAGTATTTCCAGAATACTTTC
AACACCAAAAAATTTCAGGAAACCATTTGAAACCATTTTTGAGATTTTAG
CCTGAGAAAACCAAGTTTTAGCTTGAAATATTGGCAATTAGCATGAAAAC
TCAATTTCTAGGGCGCCATTATGGATTTATAGGAAATTTTTGAAAACTCA
AGTTTGATTTTTCCTGGAGCTTTCTCTGAAGTGTTTCATTGCTGAAAATT
TCAAGTGTGTACCTTAAAAAGTTTAAAAGTTGTGGGTCCTCAAAAATGCT
GCTTTCATGCATTTTGCTACCCAGAATCGGAGAAAATCAGCCTTTTTATC
TTGAAATTGAAACATTGAGCGATCTCGCTGGGATTATTTTGTCTTTTTAT
GTTGAATATATATTATGCTAAGATTAATTATGTAAAAATTTGATACCGCT
AACTTCATTTTTTTATTAAAATCACCAGGTACCATGTTCCCGATATGGAC
GAATGGTTCTCATCCAACTTCTCTAAATCAGGAGAAGACATTATCAGCCT
GTATATCAACCCACATAGACTGCTGTTCCTATCCCTACGATATTAAAGTC
AAGAAATGTAAAGATAACACTACTGGAGATGATTTCTTCACTTATTACTT
GCCACCTGTACCTGGATGTGATATGGGATATTGTATCGGTATGTCGAACT
TACTCAGACATTATTTTCAACCATCTTCTATCAGGAGGTTTGACGTATGG
CAGGGTGTGTACATGCATTTTTTCCTTTGGAAAATCATCTCAGCATTTTT
AACTAAAATTATGTGTATTCGATCCCTTTATTTTTAAACTAATTAAAAAA
TTAAAGTTAAAAACTTAACGCTTCTGGTTTTTCTTTTCACCATTAAATTA
ATCGCCCAAGGAAATATCTTTCAATAAACTAATTGAGTTTTAGATATTAT
CACTTTCTTCCTGGAAATTTCCAGTAAAACTAAGACAACAATAAGAATAT
TTTTGTTTTGACTTAGATTGTGCATGATGAAATAATACTTTAATGGGATA
AACTTTCGCGGGGATTAAATTTCGCGGATTTCGTGGATTTGGGTGTCATC
TGCAAAAATCCGCGAAATTTTTGAATTTCGTGGATAGGCCCATCCGCGAA
GTTTAATCCCCGTGAAGGTTTATCCCATTAATGGAAGGTTTCGTGTGAAT
AAAATTTTTATTGCTTATTATTTCATTTAGGTCAGGAAAATCCATGTAGT
CCCGATGTTTACAATGTTTATAACTTAACGACAATTTTTCAACGAAGCAC
TGGAAACATTGTAGCCGCAAATATAACAAACTTTGTTTGCGATATCGATA
TAAACCCTTATAATGTTTGGCAGAGGTTTATCAGCCCAGCTGGCGATGAA
ATGCCTACAACATGTCCTCCTCAGTTTGCATGTGGTAAGTTTTTTTCCTT
CTTCTCTATTAAGTTTCTTTCAGCTTGTAGATTGTGACTTTGACAAAAGG
ACGCATGGAGTCCAACATAATATGTTTTAGAAAAGCTACCGTAAGTTCGA
TTGTTTCTTGAATCTGTATGTGTGACTTTATCAAATCAGTTTATTAATGA
GCTCTCCCCTGTGGTAACGGTCATCACGTCATCACACCAAATGTTTTGCT
CATATCACGATCATGAAAATTGCTATAAAATAAACTACAATCGTGGACGA
AAATTGTGAGATTAGAGTAGAATACAAGCTTCTTCCTCTCCCCCTACTGG
CAATGTTTAAGGACATTGGAAAAGTTGTTGGGGAGGCCGTTCGCACCAAA
CATTGCCACTGAGGGGGGGAGGGGGCCGTTCCAGTGTTTTTCTCAAACAT
TAAGTCCATGATTGCAGTTCATGCTATCACGCCTAAATTTTCCTTACGCC
ACTTGATTACATCACGTTATAATCTTTCACTGTCACGGCAAAAAAATCGC
AAAATAACGGCTAGAGGCTTTGTTACCCCATCTAATTTATTTTTATTATA
GGAACCCGATATCCTGTTTGGCTTAATGATACGTACCCGACAGTATATAA
CCATGCAAAGAGTGTCAAAGCTTGTATCAATGTTGAGGGACTTTGTTGTT
TCGAAGAAATGCCAATCCAAACAGCAAGATGTAAAGACAATGTAAAAAAC
GAAGATTTCTTTGTGTACAAGCTAGTAGAGATTGGTTTGGCCTGTCCTGT
CGCTTATTGTATAGGTAGGGTATTATTTAGTAGAACCGTATATCACCATA
TTTATCTTTAACAAGCTTTTTTTTCGGGGGGGGGGATTACCAGGATAGGA
GAATGTGGAGTGCAAACCTCTGACAAACCCCAATACCTCCAAACCTTTAG
ATGCTACAGTATTTCATCAAGCTGTTCTTCCTATTGCATGTTTTCAGGTA
ATTTTAAAAGAACTTCCAAGCTGTTCTTCCTTTTGCATGTTTTCAGGGCA
TTTTAAAAGAATTTTCGAGCTCTTCTTCCTTTATATTTTTAAGGAATTTT
AATTAAATTTGAATCTTTTCCACTGGGAAATAAATGAAACATATCCGCTT
TCATATGCAGGAAAAGAAGTAAGATGTCCTGCTGGTCAAACATCAGCTAC
TGGATTTACACCTTGTCATGGTAGGTTTTGATTGTCAAGTATATAAGCAA
GTGAATTTGTTTACCTAACAAAAATAAAGCATAGAATTACTTAGGTTGCA
CGCATCTCCTCTAATATGTTTTGATATAGGGGATTCTAATCGTGAATAAA
TTTCCCGTTTGAGATTTACCCAAAATTCGGGGGTAACCTGCTTCATTTTT
TTTTAAGGTTTAGAAATCCAATAATTGTATTAACCACTGGCCATTCAAAT
TTATAATTCAATTTTAATGAAATTTAAAAATCTATTATATAAAACTTACT
AATAAAGCTAAACAAGTTTCTAAAACTCCAAAACACAAAAACGAAGCAAT
TCTCGGATGGGAATTGTATACACGATGCGCATCCCCTATATACCACAATA
ACCGCATGTAGCATGTAGCCTAAGAATAATTTGGAAATGGTGTAAGTGTT
CGAACAGATTGTACGTTAACTCCGGCCAGCAGAATTGCTAAAATAGCAAG
CCTACTGGATTGATTAACGTGAATATGCACAGGCGAAGAGCCGATTATTT
AGACCTGTGAAATTTGCCGTTCGCCAGGTAAAAATAAGATGCCTGTTCGT
ACTGTATTCGAAATAATATAAGCAAGGACACAACTTTTTGAGGGTAGATA
GAAAACCTGGCCCACCTCTCTGGCCCGGGCCATATGGCCTACCCTTGGCC
TACCCTTTGGCCCACCTTACAGCTCTAAAAAAGATTTGATTCTTATCATT
CTGAAAATCTGCAAACCAATTCTGAAGTTGGACTTTGGTTTTTCTGGCAT
TTAGAAAAACAACGAGATTGAAATAAACAAAAAAAAATAAAAGGTTTTGA
GTCTGTATTTTATACACCTGACATAGATTAAGGGGACCCCCGGGAGAGGG
TCTGGTTAAGTCCTGTACGGGTGCCAACAAACCCCGTAGCGCTGTTTCTT
CAACTTTTCAGGACTTCGGACCCCTTTTTTCGGAATCTTCACCCAAAAAA
ACATAAAGTATCAAAACCTGGCGAAAAACTTTGACGTTGACCCGAACCCG
ACTCGAACTCGAGATCCCTAGTGCAAGAGCACAATGCGCTACCATTAGGC
TAACTTCTGTTGAAATTAATTATTAATTTTAAGGGTCTTATCCCTTGGTC
AGATAAACAAGACCTACGTTAAGAATATATCACCCTCAATTTTGCCACTT
TCTTAAGAATAATTGACCCTCTCATCCAAAGTACACTATTCTTATTAAAA
AAAAGCATTTAGAAGATTTGACCAATTGTTTGTCGTAAAACGGCTGATGC
AATAACGCCATAACGCGCTTTATGATGAGGCCCGGAATTCCCGAGTTATT
TTTTCCGAGTTAAAAAAACCGAGTTAAAAAAAACCGAGTTATCCCGAGTT
ATGACGTCATTTTTGGAATTTAGTGACGTCATTTTTCATTTTTTAACTCG
GGAATTTTTGCTTCCTTTAACTTTCCGAGTTATTTTCCATTTTTTAACTC
GGGAATTTTTGCTTCCTTTAACATTCCGAGTTATTTTCCATTTTTTAACT
CGGGAATTTTTACTTCCTTTAACTTTCCGAGTTATTTTTCATTTTTTAAC
TCGGGAATTTTTTCTTCCTTTAACTTTCCGAGTTATTTTTCATTTTTTAA
CTCGGGAATTTTTTCTTCCTTTAGCTTTCCGAGTTATTTTTCTTCATAAA
AAAACACCAGCTTTAATCTATTGATCCCATACCAACCTAAATCAAAGACA
TAACCATCCATTACCAACTAGAAAAACCTTAACCTGCTTAATAAAATGAA
AAATCAACAAACAAGTGAATAATTGAAAAGCAAGAACTGAAGTTAAAACC
TGCTAGATAAACAAAGTGTAAGCCTTTCAAAAATATTACAGCATAAATAC
TGTGTAAATCTCAAAAAATACAGCAGGTAAGTGATGAGATAAAGCTATTT
CAAAATTATATTCCTCCCTATTTCATTAAGAATACTGTAAGTGACATGAC
AAGATTCTCAGAAAAATTCACTGAGTCCTTCCCCCTTCGCTGTAAAAATT
TTGAATGAATCACCAACAACGATTATTGAATCAATTATTTCACAGATTAT
TCGTAGATTTTTATGAGAGATGTTAAAAAATAAATAAATAAAACTGTCCA
GAGTGCACACACTCACCAAATCAACTTACAGAAAAACATCAAAAGTTTCC
CGCGCGCGTGTGACCTTTGCAAAACATTCGAATTATGAATCGAATCTTTT
TGTGTCATAAGGCTCTAATTAGACTTGCGGTTAAAAAACGTTCCGGGGGT
CAAATACGCTACTTTTTCAAAGTGGAAAGTCTTTAAATGTTGACCTGAGG
CAGCATGAGGGTATATTGTTATTCGAATGTTTGCCCCCGTCTTTTTATAA
AAACAATTCGAACGTCAAATCCCATTCTGCGCAATGTGAAGTGAAAGATA
CTGGACACTTGTTCGAAACTGAAAAACGTGCGATGCAAAAATAAGAAGAG
AAAACGTGTTGTGTTCATTTCATAATCTTGACATAAAGTTTGTCGCCATT
GCGCCATAAAGTTTGCCATGTCGATTGAAAAGAAATTTAAAGAGAGATGA
AAAATAACTCGGAAAGCTAAAGGAAGCAAAAATTCCCGAGTTAAGAAATG
AAAAATAACTCGGAAAGTTAAAGGAAGCAAAAATTCCCGAGTTAAAAAAT
GGAAAATAACTCGGAATGTTAAAGGAAGCAAAAATTCCCGAGTTAAAAAA
TGAAAAATAACTCGGAAAGTTAAAGGAAGCAAAAATTCCCGATTTAAAAA
ATGAAAAATGACGTCACTAAATTCCAAAAATGACGTCATAACTCGGGATA
ACTCGGTTTTTTTTTAACTCGGTTTTTTTAACTCGGAAAAAATAACTCGG
GAATTCCGGGCCTCCTTTATGATGAAATCATAATGAAATTATAGCGCATC
CCGACGCACACATATCATTATAACCTGGTTGTCCGATAATAAAATCGGGG
AAAAAAATGTTTGAAGGTGGGCCAAAGGGTGGGCCAAGGGTAGGCCATAT
GGCCCGGGCCAGAGAGGTGGGCCAGGTTTTCTACCTACCCACTCTTTGAG
GTGAATTTGCTTCGTTTGTTTTTATCTTGAAATGTAGATATCTTCTTTTT
AAATCCCTTACTACCAGTCCCTTCAGAAGTCGACCGCTCCTGATAGATAT
ATTTGACACGAGATGGTTGAAGAGGTGTTTATTTTTGAGTTCGTCAGCGT
TTACTTACAGAGACAGGCCTTTATACTATTATAACACTGAAATATATATT
TATTCTATTTTATTATAGTACCAAGCACAACACCAATTACCGCACTCAAT
ACCACAACAGGTAATTATATTGTAAGCAAACATTGCTGGTCATGTTTTTT
TTGTTTCACTTTAAAAAAAGTTACAATATTCCTGTTTTGTGAAACTTTCA
GATATAAAGAAGAACATGACAAAAATCTTATTATTAATTCGGCACGTGTT
TTTCTTTGCACGAAATCGTGGCACATCTTTCTGGTACTTGCTCCATGGAA
TATTTGTGTTGGATACGGGAAAAAAGTTTTTCGTTTGATTGAATTGAATT
ATTAAGAGTTTCTTTTCATTTCTTTTAGTTCCTGAGCAATTACCAGGGGA
CAAGGGTTCAGCAAAATCGAGAAGTATTCTTCATCAACCAGGAAAGTTGG
TAACCATGGTATCAATTATTCTCGCTACAATGATGATTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000036_pilon:1011477..1019167- >XLOC_033830 ID=XLOC_033830|Name=XLOC_033830|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2172bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000036_pilon:1011477..1019167- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTTAAAAATGGTCTGGTTGTTTTGCATTTATTTGTTGATTTCTCC
TGTCTTAACACAAGATGGTTTTAAAAATGGTCTGGTTGTTTTGCATTTAT
TTGTTGATTTCTCCTGTCTTAACACAAGATCCATGCATTGATTACATTCT
GAATCAGGATGAAGATTCATGGAAGAGAAGCATTACTTACCAGAATGTCA
CAGATAACAAAAGATGTGATCGATTGGGTTGGAAAGAAGGATGGCATAGA
TTCACCAGTGAATCAGGAACCACCATGCCAACTGAATGTCCTTCATTAAA
TTCTTGTGATCCATGCATTGATTACATTCTGAATCAGGATGAAGATTCAT
GGAAGAGAAGCATTACTTACCAGAATGTCACAGATAACAAAAGATGTGAT
CGATTGGGTTGGAAAGAAGGATGGCATAGATTCACCAGTGAATCAGGAAC
CACCATGCCAACTGAATGTCCTTCATTAAATTCTTGTGGTACCATGTTCC
CGATATGGACGAATGGTTCTCATCCAACTTCTCTAAATCAGGAGAAGACA
TTATCAGCCTGTATATCAACCCACATAGACTGCTGTTCCTATCCCTACGA
TATTAAAGTCAAGAAATGTAAAGATAACACTACTGGAGATGATTTCTTCA
CTTATTACTTGCCACCTGTACCTGGATGTGATATGGGATATTGTATCGGT
ACCATGTTCCCGATATGGACGAATGGTTCTCATCCAACTTCTCTAAATCA
GGAGAAGACATTATCAGCCTGTATATCAACCCACATAGACTGCTGTTCCT
ATCCCTACGATATTAAAGTCAAGAAATGTAAAGATAACACTACTGGAGAT
GATTTCTTCACTTATTACTTGCCACCTGTACCTGGATGTGATATGGGATA
TTGTATCGGTCAGGAAAATCCATGTAGTCCCGATGTTTACAATGTTTATA
ACTTAACGACAATTTTTCAACGAAGCACTGGAAACATTGTAGCCGCAAAT
ATAACAAACTTTGTTTGCGATATCGATATAAACCCTTATAATGTTTGGCA
GAGGTTTATCAGCCCAGCTGGCGATGAAATGCCTACAACATGTCCTCCTC
AGTTTGCATGTGGTCAGGAAAATCCATGTAGTCCCGATGTTTACAATGTT
TATAACTTAACGACAATTTTTCAACGAAGCACTGGAAACATTGTAGCCGC
AAATATAACAAACTTTGTTTGCGATATCGATATAAACCCTTATAATGTTT
GGCAGAGGTTTATCAGCCCAGCTGGCGATGAAATGCCTACAACATGTCCT
CCTCAGTTTGCATGTGGAACCCGATATCCTGTTTGGCTTAATGATACGTA
CCCGACAGTATATAACCATGCAAAGAGTGTCAAAGCTTGTATCAATGTTG
AGGGACTTTGTTGTTTCGAAGAAATGCCAATCCAAACAGCAAGATGTAAA
GACAATGTAAAAAACGAAGATTTCTTTGTGTACAAGCTAGTAGAGATTGG
TTTGGCCTGTCCTGTCGCTTATTGTATAGGAACCCGATATCCTGTTTGGC
TTAATGATACGTACCCGACAGTATATAACCATGCAAAGAGTGTCAAAGCT
TGTATCAATGTTGAGGGACTTTGTTGTTTCGAAGAAATGCCAATCCAAAC
AGCAAGATGTAAAGACAATGTAAAAAACGAAGATTTCTTTGTGTACAAGC
TAGTAGAGATTGGTTTGGCCTGTCCTGTCGCTTATTGTATAGGAAAAGAA
GTAAGATGTCCTGCTGGTCAAACATCAGCTACTGGATTTACACCTTGTCA
TGGAAAAGAAGTAAGATGTCCTGCTGGTCAAACATCAGCTACTGGATTTA
CACCTTGTCATGTACCAAGCACAACACCAATTACCGCACTCAATACCACA
ACAGTACCAAGCACAACACCAATTACCGCACTCAATACCACAACAGTTCC
TGAGCAATTACCAGGGGACAAGGGTTCAGCAAAATCGAGAAGTATTCTTC
ATCAACCAGGAAAGTTGGTAACCATGGTATCAATTATTCTCGCTACAATG
ATGATTTAATTCCTGAGCAATTACCAGGGGACAAGGGTTCAGCAAAATCG
AGAAGTATTCTTCATCAACCAGGAAAGTTGGTAACCATGGTATCAATTAT
TCTCGCTACAATGATGATTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000036_pilon | genome | sc0000036_pilon:1011477..1019167 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 976-1086:112 |
| Aaloc | 934-972:422 |
| Aaloc | 874-930:3780 |
| Aaloc | 661-870:4339 |
| Aaloc | 457-657:5110 |
| Aaloc | 247-453:5862 |
| Aaloc | 67-243:7111 |
| Aaloc | 1-63:7692 |
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