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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000098_pilon:516844..523324- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_019223 ID=XLOC_019223|Name=XLOC_019223|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6481bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:516844..523324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCCACAGGAAGAAGATAGCCCAAGGTCAAGCTGATCTTTCTCTGGT
TGAAGTGAAATCGAAGGTATAAAACTTCAAGTTGTTTTAGTGTTTAGTCA
GGCAGGCAGGGATTATACTCTAGATAAGAGATAAACTCTATCCAAGGGAA
GCTCTCTTTATTACCAGGGGATGTCAATCAAACTGCTCGATTACTGAACT
AATAGAACTTAATCCAACAGTAGGTGTTTGATTACCAAACCAAATCAAAC
AGTCAGTCAGGCACATCTGGCAAATGAACGGGGCTAGCATCATTTGCATG
GGGTTTCCGTCACCCACTGCAAATGAGATAGGACGTCTCAGGCTAAAAGT
GTGAAAATGAATAAAAATGAACTTCAAACTGAAAACGGTAGAAAGGTGGG
AACTTTATTTTTTTTGTTAAAAGTTTCTTCTCAATTAGCAACTCCAGAAG
ATTTTTCAAGTTTTAATTTTTTTTTCAAAATCTATCCTATCTTGTAGAGC
TTCGAAAAAGAAAGAAAATGAGGGGTCATAGGCCTCCAGAGGATTAGTGG
CTGTAAAGATATTCAAATTTTAGTGTCAAAAATTTGACTAAAAATGTCAA
AAAAAAGGTTAGGAAAATAGCTTGGAAAAATTCGAAAAATGTGTCAAAAA
AGAAAAAAAAGAAATTTTCCAGTCATGCTTCTTAAATTTTGCACGTCTCT
TTTTCAAGTGTAGCTAGAGACCTCAAATTTGGAGAGAGAATTCTTTGATG
GTGTTAAAATATTATTATATAAAAATATTTGTAAAATATTTAGTATAATT
ATCAAAATAACGAAAGATATATCTTTTTTTGAAAAAATAAGACATTGCAT
TGTTTTATTTTTTTGTTTTTGAAGAAAAATAGCTTGGGAAAAAGGTTGAA
ATGAGTCAAAAAAGGTGGTAGGACCCATTTTCAAGGGGCCTCTGGAAATG
GAGGAACAAAAACTTATGAGTAAAGAATAAGTTTTTCTGAAAGGAGAAAC
CCCAAATGAAAAGAAAATCCATGCTAAAGAAGCAAAAAAGTTAAAAAAAC
TACATGAAAATGAAAGAACTAGAATTAGCGATTGTGATTTTTGAATTCCT
CACCCTTTTTCTGATAAACATATAAAGTTTCAGCCTCCAAATACATTTTC
CTCCGTTTCCAGACACATTTGTTCTTCGATAGTTGCAAATATTTTTTCTC
CCGTCGGCAAACAATTTTCAAAATGTTGCAAAACGTTCGGCATTTTACCA
ATTTGCCGTCCAGCCCGTGTCCACAGTGTTATATACCGCTGGAAAGCTAA
GATCACGGGCTTTCATTTAGTAAAAACCGGAACGCTTTAGCATACATAGA
AAAAAAGTTCCAAGGGTTCAAAGTTCACGGAAAAATGAAACATTTGGTAT
GACGTCAACAAAAGTTGCATGACTTCTGGAGTCGCTATCTCAATCTTCAA
AAAGAAAAAATTGACCCATGGAAAAAAATTTCATCTATGCAGTTCTTCAA
AATGAAGCAAAATATTTCAAACCCGGTTCAATTGCGTGGGGTATTCAGCA
CTATTACATCACTTTTGTTTTCGACCCCTTGCATTTACCACCAATCACAA
GTGAAAAATACTCCGTTAATTTGCCAGGATGTGCCTGACTGACAGTAATC
GAACCAAGAAATTTCCGTAAAGTTTGATGGCTGTTCAATTGATCTTTTAA
AGTTTGATAGCAATTCGATTATAGTTCGATAGGTTTGATCAGAATTCGAT
AATGTCAAGAGCTGGATATTTTGATATGGTTAAATGTTCAAAAATAAAGA
AAAAATCCAAAATGTCTGTGACCAAGCTTCTGTGAAAACGGTAATCATAC
CACATTTCTACAAGAACTTGATTTTTTTTCTTCTTCATTTTTCATTTTCA
TTTTTTTTTTCTTTTTCCAAAATTTTTACTTGATAATATTCCACTCACAA
ATATATTTTCAACAAGCACAAAATCTCAACTTGATTCAAATTCTATCAAA
AGTTACAGCCATTTTTGTCTCCAGCTGCAAATTATTTTGAGACAGACTTT
AGTATACCTGAGAAAAGTAGCCAAATGATTCCGGAAAAGCACCATAATAC
TCGAACACTCGTCGAACAACTCGAACACTCGTCAAACAACTCGAACATGC
ATCAACAACATTGAACTATAATTTTAATCAAACTAATTGAACTAATCAAT
ATATTTCTGTGGTAAAGTACGATTACTGTCCGATTTGGTTCACGATCCTG
CCGACGCACCAGACAGTCCGGTGCCAAAAGTATCCCTCAGTCACACCGGA
AATCTTTCGTCCAGTTGTTAATTTTTTCAACTTCTGGACACCGGACACAT
GTTTTCCAAAACTCGAGTCTGGTGTTGAGATTGTCAGGTGTTAAAAAGTA
TCTTTGTCCGACACCGGACTTTGCTTGTCTGTTGTCAGTAAAGTCCGGTG
CGTTGGCAGTAATCTAACACCTATTGTTCGATTTTTAAGTTAGGTAATCG
AACATCTATCGTTCAATTAAGTTTGATTGAGTTTGATGGTTCAATTAAGA
AAATTGGCTTGATAGAGTTGGGTTGACATCCCCTGGTCATTAGGAGATAT
CTTTACCTTAGTTAGGAGATTTTTTTTACTCTGCTTATTTTTGGCCTTCC
AATCATATTGCGCAAGTTTTTAACTCTATAGATCGACTTAGTTTGTCATT
TTCTTCCTTCTGACAAAAATTGGTTGGATTCTGCTTATGTTTAGAAAAAG
GTGTTGTGAAGGTCATTATCTTTCATTTTGATTTGGTTTCGTCAGCAGTA
ATACTAAGGCTAATTTTGTGTTTTTTCGACAATTGAAAACAAATCGCTAC
CTTAATTCAAAAGGGGCCTAAGTCCAGGTACCCCCCAGTTCAAAAGGGGC
CTAAGTCCATTTTTATGAAATTTGAGATCTTTAGTTTTTCTCAATCTCTG
GCTCATTTGCTCTCTTTTGATGTACATAACAAGTAGTTTTTAAAGTTAAA
AAGGTTCAAAACTTCATACTGAAGCTCTGATAAAAGTGATGTTTAATTCA
AAAGAGGCCTAAGTCCATCATCTTTTTACAATTAAGGGCCTAAGTCCATC
AACTTTTTACAATAAAAAGGCCTAAGTCCACCAAAATAAGTTTGTTAAGT
TTTGAAGAGGCCTAAGTCCAATTGAATTGCAAATGGGCCTAAGTCCATGC
ATCCTAAAAAGTTTAATTGAGTTTTTCTTTATTTTACTGAGATTGTCTTT
TCTCTTATCTTGAATCTAGGTGTAAGTGGTTTTATTTTGGAGTGTCATAT
GTGCAGGTTTTGAACTCTAAAAGGCAGAAATTAACCCTCACACGTTTTTC
AAAATTCATGTTTAATTCAAAAAAGGCCTAAGTCCACTCTGCCAGATTTA
CTAAGTTGCACCTGTTACATACAAAAATACATTCCTTTCAAACGAATGCC
TTTTCATTGGAAAAACAACTTATAGCCATGGCTTTCAGAAAACACTTACA
TCAAAGCTTTACCATCAAAAATGGTTTCAGAATCAAGGAAAAACTTTAAT
TGCAATTTTCTCAAAATGACCCAAATGGACTTAGGCCCCTTTTGAATTAA
GGCTCACAGGACTTAGGCCCCTTTTGAATTAAGGTAGCGAAATAAAAGTT
GTTTTTCGTTTTTGGGTTATTGGCATCAGTGAAACGTGATCTTTCATGTC
TTCATATTTTCATATTGCGCAAATAATTAACCTTAATGCAAATCTGTCAA
ATTATGCCAAATTCTCCTAGTTTAGGCATGGTTCTCTTGTAGGACAATAA
AAATCTCCTAAAAAAGGTTATCCTCTGGGTATTCTCTTAACTTGAGTATA
ATCCTAGCCCGTTAGTCCATATATTTTTACCTCGTTATCGACAAAAGTGT
AATGTGTTCTTTTCATAAAAAATGTATATTTCAGGCTGGGAGGATTTTGA
TGTATAAACAGCTTAGCTTTAAGGCTTATTTTTATTTCTGGAACATAAGC
AATAATAGACTTTTTAGGCATAATGTCATCATGTACGGTAACTTTATGTA
ATGCCAACAAACCTTGTTTTTAAAATTCTGTCATAGCAACTATCTGATCT
TCTAAATGTTTATGTATAAAACCTTCTGAGTTAGCTGTTTGAAAAATACC
ATAAAAAATCACCATACTTTGCAGACCAGATATTGCTATAACAGAGTTAG
AAGAGGGATAATAAGAATTTATTTACATCAATTTTAAAAGGGGTCAGTGT
TAGTCACACTAGGAAGTTTTAAGGTTTCAGAAAAATAACATTAATCATCT
ACTTAATCAGGCTGGCTTTAAAGATCTAAAACAGCATCTAGTTACAAGAT
AAAAACCATAATATGATTCTTCAATGGGAAGCAAAACTATACAGTGCACA
AACATCAATTTGTCAGATCTAACAAAATTAATAACGGCACTGTCATCATT
TGACAGTCAAATGAAGGATTTTCTGTCAAGAATCTTGTAAACATTCCAAC
AACTTCCATCGAAATGATTTACTGCAGCTAAGATCTACCATTTTGCGCGG
TTAGAGGATTGAGCCAACCCCCCAGAACACCCCAACTCTGTGAAAATTTT
ATCTAATTTTTTAATAATTATCATTATCCCTTTATTCTCATTTCTGGAAG
TTTTGCAAAAAAAAGGAAAAATACTAAATTTGAATTTGAAAGATCTTCTA
TATGGCGTTTTTTTGGAGAGTTAGGGCTAGATTGATGATGTACTTTCAAC
AATAAGAATGAGCAATGAGAGTTACCTGAATCAAGTTTATGATCCAGAGG
CAATTAAATATAAAATAAATATTGAAAACTTAAACTACCCAAAATGACTG
ATTGCTAACACACAACACCCAACTAATCAACCAACCAAAATTTTTGTCGA
CCCACCACGCTCATTCTCACCTGTAGATCTTTTTCTTGCAGTTTCTTGGG
AAGTTGTTCTTCAAATTAGTTTTCAGGTTTGCTCGGTTCAAATCTTTTCA
TCTATGACACAAAATTTAGGTTATGTTAGTTGTTAATTTCATTCAAAACG
CCGGTTCTTAACTAATTCGTTGGAAAATCATGAAATTTACGCCATTTACT
TTCGCAAATATGACAAGTAAAAAAACGTTAGTGATTATAAAATTTCACAA
ATCAAAACAAAAAAGAAATTTCACATAAAAATGGCTTTAGAGGGACAAAT
ACTTCTTGAATTGAATTGAAACTTTTTTCGGAAACTTATGAGGTGTCAAC
AGACTAAAAAGTGCTATAAATCTTACATTTTATTTTAAAACCAATATTTC
ACGCTAACATTCCAGGGCCCAAAACTAGAAACTATTCATATAACTTTGTT
TTTTATAGTTTGAAGCAGAGTTTCGAAGATTTTCCTTGAAGAGGGACCAA
CTGGAATCTTTTTCTGAGTTCTACGATCTTCTGGAGCAGACACACTGTCT
TGAGAAGACAACATTTTCTATATATTATCGACACCCTCAAGATGGAGACT
TGCTACCCATCAATAATAAAGAAAATTTTATGCATGCACTGGGGACAGCT
ACCCCTCTATTACGACTGTTTATTCAAAGAGGTAACAATTTGTTTTTCAT
TTAAAATCTTACTAATTTTTACAAGCTAAAGAGGGTATTTCAGGCTTCCA
TATCTTGAATAAAAACTTGACATTAACAAGCAACCTCAGCTGAGCTGACT
TCATTGATGTTACTATTGTAGGAAGTATAGGTTAGCTTTTGTCATTCTGA
TGTCTCGAGTTGCAAAATATCAAACAAGTGACCTTAATTTCAGAAAATGT
AAATCTTGTCAATCTTGTAAATTTTGAAGGGCGCTATACATAACATACTC
TTTTGATATTTTTTTCCTAGGTGATATGCCAGAACCTGTAAATGGAGTGA
CCAGGAGACATGTGCAAAGTAACCCTACAGCAGTTGTTAATAAACGTTTA
CAAATTAGTGTACCGCAAGACTTTCGACGCGTATCCGCTATTATTGATGT
TGATATTTTACCAGAAAGTATACGAAGGGTGCGTCTTTGTAAATATAATT
CAGATAAGCCTTTGGGATTTTATATTCGTGATGGTACAAGTATCAGAGTA
ACACCTGAAGGACTAGAAAAAGTACCTGGTATTTTTGTATCCCGTCTTGT
CCCTGGTGGATTAGCTGAAAGCACTGGTCTGCTATCAGTGAACGATGAGG
TATTAGAAGTTAACGGTATTGAAGTTGCAAATAAAAGTTTGGATCAAGTG
ACAGAAATGATGGTTGCTAATAGTCAAAATTTAATTGTTACTGTTAAGCC
AGTTGGTCAGGCACCTCCAGAAGAAAAGACTCGCAGTGGTATGGAATATA
GAGCATCTACTGGCAAACGTCAACCAATCAAAGAGAAAATGGGAGTAGTA
GCCGCCCATATGGAACCAATTGTTGATTCTGATGAGGAGGAAGGTCCGTT
AGTTTCTGAAGATGGAGTCGTCCATGTATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:516844..523324- >XLOC_019223 ID=XLOC_019223|Name=XLOC_019223|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:516844..523324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCCACAGGAAGAAGATAGCCCAAGGTCAAGCTGATCTTTCTCTGGT
TGAAGTGAAATCGAAGATGTCCCACAGGAAGAAGATAGCCCAAGGTCAAG
CTGATCTTTCTCTGGTTGAAGTGAAATCGAAGTTTGAAGCAGAGTTTCGA
AGATTTTCCTTGAAGAGGGACCAACTGGAATCTTTTTCTGAGTTCTACGA
TCTTCTGGAGCAGACACACTGTCTTGAGAAGACAACATTTTCTATATATT
ATCGACACCCTCAAGATGGAGACTTGCTACCCATCAATAATAAAGAAAAT
TTTATGCATGCACTGGGGACAGCTACCCCTCTATTACGACTGTTTATTCA
AAGAGTTTGAAGCAGAGTTTCGAAGATTTTCCTTGAAGAGGGACCAACTG
GAATCTTTTTCTGAGTTCTACGATCTTCTGGAGCAGACACACTGTCTTGA
GAAGACAACATTTTCTATATATTATCGACACCCTCAAGATGGAGACTTGC
TACCCATCAATAATAAAGAAAATTTTATGCATGCACTGGGGACAGCTACC
CCTCTATTACGACTGTTTATTCAAAGAGGTGATATGCCAGAACCTGTAAA
TGGAGTGACCAGGAGACATGTGCAAAGTAACCCTACAGCAGTTGTTAATA
AACGTTTACAAATTAGTGTACCGCAAGACTTTCGACGCGTATCCGCTATT
ATTGATGTTGATATTTTACCAGAAAGTATACGAAGGGTGCGTCTTTGTAA
ATATAATTCAGATAAGCCTTTGGGATTTTATATTCGTGATGGTACAAGTA
TCAGAGTAACACCTGAAGGACTAGAAAAAGTACCTGGTATTTTTGTATCC
CGTCTTGTCCCTGGTGGATTAGCTGAAAGCACTGGTCTGCTATCAGTGAA
CGATGAGGTATTAGAAGTTAACGGTATTGAAGTTGCAAATAAAAGTTTGG
ATCAAGTGACAGAAATGATGGTTGCTAATAGTCAAAATTTAATTGTTACT
GTTAAGCCAGTTGGTCAGGCACCTCCAGAAGAAAAGACTCGCAGTGGTAT
GGAATATAGAGCATCTACTGGCAAACGTCAACCAATCAAAGAGAAAATGG
GAGTAGTAGCCGCCCATATGGAACCAATTGTTGATTCTGATGAGGAGGAA
GGTCCGTTAGTTTCTGAAGATGGAGTCGTCCATGTATAAGTGATATGCCA
GAACCTGTAAATGGAGTGACCAGGAGACATGTGCAAAGTAACCCTACAGC
AGTTGTTAATAAACGTTTACAAATTAGTGTACCGCAAGACTTTCGACGCG
TATCCGCTATTATTGATGTTGATATTTTACCAGAAAGTATACGAAGGGTG
CGTCTTTGTAAATATAATTCAGATAAGCCTTTGGGATTTTATATTCGTGA
TGGTACAAGTATCAGAGTAACACCTGAAGGACTAGAAAAAGTACCTGGTA
TTTTTGTATCCCGTCTTGTCCCTGGTGGATTAGCTGAAAGCACTGGTCTG
CTATCAGTGAACGATGAGGTATTAGAAGTTAACGGTATTGAAGTTGCAAA
TAAAAGTTTGGATCAAGTGACAGAAATGATGGTTGCTAATAGTCAAAATT
TAATTGTTACTGTTAAGCCAGTTGGTCAGGCACCTCCAGAAGAAAAGACT
CGCAGTGGTATGGAATATAGAGCATCTACTGGCAAACGTCAACCAATCAA
AGAGAAAATGGGAGTAGTAGCCGCCCATATGGAACCAATTGTTGATTCTG
ATGAGGAGGAAGGTCCGTTAGTTTCTGAAGATGGAGTCGTCCATGTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000098_pilon | genome | sc0000098_pilon:516844..523324 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 814-897:85 |
| Aaloc | 292-813:610 |
| Aaloc | 67-288:1124 |
| Aaloc | 1-66:6482 |
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