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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000109_pilon:868319..873087+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038068 ID=XLOC_038068|Name=XLOC_038068|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4769bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000109_pilon:868319..873087+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCAAATGCTGCAAAAAAGAAAAGGCTTTTTCACAGGTATGTTTTGT
CTACAGATAACAGTGCTCGCATTCAAATTTATCCATCATTTGGGAAAGTA
GAAGTCCTTTTACAGAGCTTATAAACACCAATTTTACCTACTGGTTGATT
GAATTTTCCAAGTAAGCTAGCTGACCTTAGAAGTATGTCTCATAACAATT
TTCTCTAAAGAGAGATTTTATGGTATttaatgagcccccccccccagccg
aCCTTCAATCACGCATTTTTCTTCTCCAAATGcatgcattcacgcaatgt
ttttcgCGATTcgtgcaatatttttttattttcacgcattcacgcaagtg
aaaaagtcCATTCATGCATTCACGTAAACCGCTGGTAGAGCCCTTTTAAT
AACATTGATAAGGCACCCTCTATTGAAAAACAGTAGCACTTCAAACCACA
GTTAGTATTAGAAGCTACTGTTGGTTAGAGGATGTTGGCACTCGCATTAT
AAGTAATTCATGTTGTTATCATAGGCAATGGTTTTAAGTCAATTCGTGGA
ACCAGTGGATTATGACAACGCCTTTGATGCTATACGTCAACGGACAACGT
AAGTTGTTTTGATTCGCCTCGAATGATTTCTTCTCAAATTGTTAATGAAA
TAATCACCAAGCTATCAAAAATACACACGAATCTGATTTGTCGAGAAGGA
CTTCAAGGAGTGAAATTGATCGTCAATTCAGAATGTGTACCCACTGATCT
TTTTATATAttctggaccaagtttctctaTCCCGTCCAAGCTAAATCTTC
GATCggagttttttgttgaaaattaccCTAATGGTAgaactactcaatag
cggtgtaaatgcttCGAGACCTACTTTTCATCGAATACTTTAGATGATGc
agccactgacctttatataccctggacaaagcttctcaatcccagccaag
caaaatctttgatcggagctttttgaaaattggtaccctaatgtcggcac
tactcgatagcggtgtaaatgcatcgagagcgctaggtctacttttcctc
aaattcttttgttgatgtagcggcgttagacgttaatttttaacattgca
atggcttctccttgggtaccaattctaaaaaaactccaatcaaagatggc
agatattgtttggtccagggttatatagaGGTCAGTAGATGCAGCGCCGT
TTGACGTTAAGTTTTAACACTGCAACGGCTTCTTAATGGGTACCACTTTC
TGATCATAGATGGTGGATATAGGTCGGTCCAGGGATATACAAAGGTTGGT
GTGTGTATCCCTCCGATGTTTCGTCACTTAAAAACAGCTAATTAGTCTCA
AGTGATGAATCGTCCTCAGGACTCCGACAAATTACGATTTTCTACTTGTT
ACTCGGtgataaattgttaaaattGTAGTCTAATTTCACTAACAGTGTCC
TCGTCGTGTCGGTAGAGATGTAGAGATAGTTTCTTTTATTCTCTAACAAC
ATAATTGTTTAGTATAGATTTTTACCGGGTGGTTGGTCTCTCGAATAAAA
CTAGGTTAGCCTAAACCACTGGTCTTCCCGTAAATCAGATAAAGATATGC
ATGTCTGTATGAATTGTTAATTTGTATCAGACTCAAGAACAGTAGATCTT
TTAACAAGTAACAAGTAACAAAATCTTAGGCTACAGGGGTGTGTTGTATG
AAAGTATTCTACTTTATTTTCAGTGATGACGCTACAGATTGTTTTTACGA
TTGTTTGTGGGATGTCAACATTCTTGAATATCTTATCTGTATCTTTTTCA
TTGTCACACTGTGtttttttGCCAAAGCAAAAGGTTATCTATCTACCCTT
TTAAGGAGGGTTGATTGACTGAAGCTTTTGGAATCAGCCCGCAGTTTTGA
TCTGCAAAATTGAGGATGGTAAAAGTgctcagtcagtcagtcagtatCAT
GTCATAAAATTTTCGCGAAACAGGCCTTTAGTAAAACTTTTTTGTCTTTC
GCGATTTTTGattaatgaaatattttgtttgaattaATTTCGGGAATCGT
GAGGATAGGGTAAAAATTTTCCCTTCTTTTCCTAATGAAGTTGATACATG
GTGAAAGTATTTGTTTTGACGATTGTTAAAGCCAGTATGAGTCTGTTTGC
TCATTCTGCAAAAACATTCCACAGCTCCATTATAAAACGCAGACAATTCA
TTCAAATTCTTATTCGACACTTTGTAGTGTCATTAAAATGGTTATATTAA
AGTGAAGACATTGAAGTGTTGAGTCGAACAAATAAGTTACGTCACGcgct
atcttttgttttgatgattggttgaataaCTGCAATTTTTATGCAAGCTC
AGCGTTTTTGAAGCAGCGATTTAGACCTCGGAAAACATAATGTCAATCTA
GCTTTAAAGTTACTTGCTATAAACACTACAGgaaaaaagagtacttgaac
atttttgaaaagtgactttgaaagaaaaaagaaaatttcgcgaatttgac
gtACTTAGTCATccatagttttttctgattttttgcagaaagatgcgtat
tcgcaatgctcaaaacaatgccgagttcgattttttgagaaaaatttttt
tccggccgaaaatgctggaaatatacCAGAAATTACCGTTTTGCAGATTT
TAATTGGACTTTAacttactttaatcgtagaaattttagcgagacaaatt
ttagcgtatatcagcgagtcaggaaaatcttgattttttttcgatttatt
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CCCCTCCcctctcccccatcaacaatcaatgatgaaatttaatgcgttat
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AAAAACTCTATCCCGTCACAGAAAAATAGAGATACATTAATAACTAATAA
CAGAATGTTAGTTCAAGtttcgttatttttatttttcgttaatttgatat
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TAttcatatatttttgttttttctgacaATAATTCGGCTACTGAAAACTG
CTcactttttcttaacattttcttccCATAAAGATACTCACGAAAAACGT
GGTGAAATCGACAAACGAAAACTAGCGGTAAGTCATCGTATTCTTATTAA
TTCTTGGATAATTTATGAACAGAGAGAACCGTTTCATACTAAAGGGGCGA
GATTTAGATTTGAAGAGTTTAtggccccggggggggggggggggggtact
agggtaaAATGGGTTACGGGAATGCgcctggtcagggtaccttttttagc
ctccacgagtcccaggtagggtcgcaaaaacaccaaaataggaaaatcag
tccctcgtagggtgccttttttggaaaattttggggacaagtcgaaaatt
tgagaaaatttgagaaaattttggaatttcagtcccattcagggtcactt
ttttcgcagtttttcggcaaaatttttgaaaaaacgagccCCACGTATga
tccatttttcgaacctcagcggagcacccccgttggtcggcaagggtagt
acacCCCCGGGTTGTTATGGGAATGCTCCTCAATAAAACTGTAAACGGGT
TGCAAAGAAATTTTTGTCAGGGGGTTTGCAAAGcatttgtaaattatttt
tctgaatGGGTGACACTTTTATActttaatttattttccttttatgATGT
GAACATATACTtgggcgtacaaactttcgcgaacagaaactttcgtgATT
TTCGCGAAtcttggcctttttcgcgaaattaaatgtctttgaagattctt
aacagggcaattcgcgaaagttcgcGACAGACTTCTCagtgatttccaaa
aaaaaaaacagtgggaTCTCTCGCGGACCTTTCACGTTGTAAAGAGCTCA
GAATTTTAGCTCCGCAATTTTAAAGTGGAATGTCCTGATACAGACTCGTC
AGTTGACAAAACTACTTGGGGAATCACGTTTTCTCATTTATAAGAACAGG
TACCTTAACATCTCAAACTATCTGTTTATCTCTTTAAGTTAATGGAACCG
AAGGTTTTTATCAAAAGGTTTAGAGACAGAACCCTTATAAAGTGATGGGT
CAAGGCATTACTCCAGacaatattatatttttatttatttctcacCCAGG
TTCAAATTATTGGACAACCGGAACTGAATACTAAATGTAATACGGAAACC
CTCCAACAAGCACAATGTATACGGAAAACACGTTTCCTACGGTCGTTGAC
ACGTGATTACTGGAGATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000109_pilon:868319..873087+ >XLOC_038068 ID=XLOC_038068|Name=XLOC_038068|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=684bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000109_pilon:868319..873087+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCAAATGCTGCAAAAAAGAAAAGGCTTTTTCACAGATGATCAAATG
CTGCAAAAAAGAAAAGGCTTTTTCACAGGCAATGGTTTTAAGTCAATTCG
TGGAACCAGTGGATTATGACAACGCCTTTGATGCTATACGTCAACGGACA
ACGCAATGGTTTTAAGTCAATTCGTGGAACCAGTGGATTATGACAACGCC
TTTGATGCTATACGTCAACGGACAACTGATGACGCTACAGATTGTTTTTA
CGATTGTTTGTGGGATGTCAACATTCTTGAATATCTTATCTTGATGACGC
TACAGATTGTTTTTACGATTGTTTGTGGGATGTCAACATTCTTGAATATC
TTATCTATACTCACGAAAAACGTGGTGAAATCGACAAACGAAAACTAGCG
ATACTCACGAAAAACGTGGTGAAATCGACAAACGAAAACTAGCGGTTCAA
ATTATTGGACAACCGGAACTGAATACTAAATGTAATACGGAAACCCTCCA
ACAAGCACAATGTATACGGAAAACACGTTTCCTACGGTCGTTGACACGTG
ATTACTGGAGATGAGTTCAAATTATTGGACAACCGGAACTGAATACTAAA
TGTAATACGGAAACCCTCCAACAAGCACAATGTATACGGAAAACACGTTT
CCTACGGTCGTTGACACGTGATTACTGGAGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000109_pilon | genome | sc0000109_pilon:868319..873087 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 223-342:4650 |
| Aaloc | 181-222:3586 |
| Aaloc | 115-177:1725 |
| Aaloc | 40-111:525 |
| Aaloc | 1-39:1 |
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