XLOC_034874 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034874
Unique NameXLOC_034874
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000230_pilon:367861..380472-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034874 ID=XLOC_034874|Name=XLOC_034874|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12612bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:367861..380472- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCTCATGATATCGACGGTGCTGGACCAGCTGCTCCTTTGAAGTCTGC ACTGAGGAGACAATCGAAGTACGATGAAGAGCTCTCCATAGAGGAGTTGC AGTTTGAGGAAGCAGATTTGAGCGATCTTACGGGTAGCGATACTGGTGAA GTTGGAGAGAATGGAAGAGGTGGAGGTGGTTTCGTTGATTGGGATGATGA GAATGATCCTGATTTCATTGAAGTCAATACTTCCAACACATACGTTGATG AGGATGGTGGTGATGGGGAGGATGATGGAAAGGGTATTTACTTCGTGTCA GTTGTCCGCTATTTTATTTTCACTATCCGTCTTCTAAGATTTTAAAAAGA AGAGCGCACCCAATACAAAAGGTAGAAATTAAAACAAAACAAGAAATACC CAAAGGAGGATTCAAGATTCTATGCATTTTTGCTTTATTCTTCATTTGTT TCAATTTTTCACTAATAACGGTGATCGGAAGACTCAAGCATGTAAAATGT AATTGAAAATTATATACAATAAAATTGAGTTGCTTCTCGTCATTGAATTT TATTTTGAAATTGTTCAAAAGGGTTTATTCGAACATTAAATCGAAATTAA TTCTAATGAATTAAATCTAATTTCGCATGAAAAATTTATATCGTTGAATT AAACTGTGCTAAGGGGCCGTCCACTTAGTACGTACGCACTAAAATGTCGA AAATCGGATATACCCCTTGGTAAATACGTACTTTTCATCCACCCCCCCCC CTCGGTTGAAGAAAATTTCGAATACAAATCGTTTGGGTCGGACCTTTATT TCATACATGAAACTCAATGTTTATTAAGAAACTTTTTCTTTTCCTTAATG CGTATAAGAAACGTAAAAATCGACAAAAAACAAGCAAAAAAGGGCTATGA AAAATTTTTCTCTGCGTACGTACATTTTCCTTTGACCCCTCCCCTCCCCC 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ATTCCCTCAAATATAAAGTATTAAAATATCCTGAATAGACTGATTGATGG AGAAAAATCTTCTGAATATTTGATGAAGATGAAAAGCTGGTCAATTGGTC ATGGACATTTTTATGGAAGATGATATTGTATGGTGATGTGTCATGTATTT CATTCTATCCATTCACATTCTCCTTCCTTCTCCCATCCCTACTTCATTAT GCATTCAGATTTTCTTTTTTTGGGAAGTGAAAAAGAAATGTCTTTCGTCA TAAGGATTGATACACAAATACAGCAAATACAGAGTGATTTCATTTCGTTA GTTGTTTCTTAACTTGATTGTACGCAGGATGACGGAGTCCTGTTTTTATT TATTTCGATGTTTTATTTTTGAGTCTTCATATTTTGTTTCTCTTGGTCTC TTGTTCAGAAATATGAGGAACTCCTCCGATCGAATCTATCATTCTGAAAA CGAAGCCGGAAATTATTTTTGAACAAGGAACTTGTTATAAAGTGTCTCTG CTTTTTTGTCATACTCACAAGGCCCCAATGCCTCAACTCTTAACTCTTTT TCTTTTGCCGTTTTACCAATTAAGGAGAAAGAAGTGTACAATGTATCGAC CACTACCGGCTATCCTTTCTAGGAAATCACGAATAATGATGTTTTCCATA TCCCGTTGTCTAATAATTTATAACGGAAGTCATCAAACAATAATTGAAAA ACGAGATGTAGATAAATGATGTCATCTTTCTAAAATTGGTTAACATTACG TATTGTTTTGTAATCGAATTTGTGAGATATTAAAGACGTGGTAACATCCT TTTCTAAACGTTCACTTTTCGTTTTCAGCGCTCTCAGTGTCTCCTCAAAA CACAAATAAAAAATACCACATAAAAAATACATAATTGACTTTGTGTGCTT CCACCAAGTACACATAAAGAACATTGCACAAATTTCTCCTATGAAGAACT TTATGAAGATCACTCGTGACAAATTGGCGACAATGAGTTTATCTGCATAC AACACGAACCGACTGCGCATGTACAACACAATCTCACTGAAATTGTGGTA CTCGCTTTTTACACCTTTCGCAGGTAATTCCTCAATCATCGCTCATCCCT ACTCAGACTAAGTATAATAAACACTTCCTGGATATTATCACCCTAGTTAG TATTCAGATTAATATAGACTACGAATTGACACGAGTATCAGACAGAAGTT CCTGCATGAAACAGATGCTTAATCAGTCGGTTTAATATTGAGCAGCGGTA TACACATCCTATATAAAACACACGGCTAAGCAGTATCTCTTTTTATAGAT TACATAATGCGCACCCTGATCTTACGTTTATAATTTTCTTCAAATTCCAG TAGTTAAAATTGCTTTATTGACGCTGTTTAATATCGCCACGCATTTCCTG CGGTTGAAAATCTAATTATTCACCTCCCTTTCAGTCCATTAAGTTGCAAA AAATGCGCTGATAATATTTGCAAAGGTCTGCGTTACCATATGGGATTGTA ATTTGGACAAATGTTAATTTACGATCAAGCAATTACGGTCTAGCAGATTT TTAATGAAGCAATTTTTTTTTCAAATCAATTATTACGTCATCATGACATG GTTCCAGGTGGGCGAACGAACAATCTGAAACTGTTGATACGTGCGTTTAT TTGAATCCTTTGAAAGTTCAGATACCCACTATAGAACGTGCGTGGCCTTC TTCATTACAACAGCACTCTTTCTCAAATGCAACCAAAAACTACCTGAATT ATATCTCTTACCAAGAAGTTTTCTCTAATACTTACTACAGATTTAGAACT TTTTGACAGAAAGTTTTTATAGTTATAGTGTTATTAGCTTTCAGTGGTTT TTTTTTCAAAGCTTTCATTCGTTTCTTGACTTTGAACGCTTTGATGTCAA 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TTGACAAATGCATACCACGCACTGCGATTGTTTTCTTCCAGTATTTTTAC ACTGTATTTAAGTTTATTTCGAAATCCATTTGAAAAGTAGTAATTCAGAG AAAAAGAAGAGGAAAAATGCATTGATGAGTTAGACTTGTATTTTTGCTGG TGACAGCACTTTCGGTTTACGGTTTGTTAGAAGTTTTAAGTATATCCGGA GTACCGTTTTCTTGTTATAAGTAAAAAGAAATTTGATACTCTTTCAAGGT TTGCTGAAGGCTTTTTTCTTGTTGAAAGTGTGAAGTGGGACGATTATTAT GAAAGCCTTTCATAACACCCACAACCTTTTCGATATGATGTTTAAAATAA AGTAATTTCATTTCGAACTTTTCCTGGGCAGGCGCTGTTTTCCAGAAGGC TTTTCCTTTTTGAATCCTACTTATTAAAAAAATGACCCCCTTTCTTATTG AAAAAGAAGTTCGTCTCATACGTAAAAAGTAAAACGGCTTTTCGTCAAAA CACTAATAACCGCGAAAAGTGAGAAAAATGTAATTGGATCAGTTTACAGT ATCACGCTCATTTGATAAATTCAGCAATCGAAAAAGTAAATTGATAAAAA AATTTTCATCGCGTGATTTTAAAGGAACAATTTTCAGGAATCCAGTTTCA TTAGCTCCGCAGGAGTAGGAAGATTTCTTTTCACGTTACTTTCAAATAGT AAGAAATCACGTAGTGAATTGTCTGTCATTCTTTTGTTGTCTTTGTCAAT GAAATCCTTAACGATCTTCGAAAAGTGACTTTAGTAAGCGAATTCTATTG TCAAAAGAAACCTCAAATTACAATTAAAAATGTTGTGATGTCATCATCTA TGTAAACGACATACATATAAAGCGAAAGTAGTGCTTATTGTCAATCAATT GATTTGAATTACGACTGATATAAAAGGAAAACAGAAAGAAAGAGGAGAGA AAATTTATCGTACCACTATTTAGTAGTGTGGAGATTGAATAATTCGGAGG TCTTAAGGAGGAAGGATAAGAACACGAACAGTAGTTGTAGAGCGATTCAC ATTGCATCCAGTTGATCTTTACGATGGCTGTTCAAAAGATGAAGCAGTGT TACAACCTTACCATCTCATCAATGTAGAAAACAATATCTTTCTCCATCTT CTTTTCAACACACCGCTTTTCTTGATCACCCAACTTTACACCATCCTTCA TCTACCTTCAACTGTGACACAAACACACTTTGTAATGTCCGACATTGCGA CATGTCCTGTTTATCAAACTGCTCTACATTTCTCTCGAAATCTAGCAACA GCAAGGACATACATATGGAACACTTTAGCAATTTTGAGTCGTGGACCGTT CGGTTATCTCAGCGAGACACACGTTTTGGATTTCCTTATACTGACTTTCT ATGTTATGACGGACATTTTATATGCTTTTTACACGGACACTAATTCCAGG AAGCTTGATGTAAATGTAAATAATGATGAAAATAATAATAATGTGAATAG TGTACATATAACTGCTACAAGTAGACACCACAAGAAATTAAGTACTGTAA ATATTTATGTAAATAATCGCAAACAGGATTTAAGTTATTCAGAGTTTATC GAACGAATCAAGATTGTATATAAACGTCAAAGGGTGAGTGTTTGTTGCTT TGTTGCTGGTCCGACTTCTATTTTGGGTATTTGATTTTTGGTATTGTGAT ACTTTTCAAGAGTTTAGGAGTATTTTGGTCCTGTTGGTTATTCTAAAGAG TTCCCCTGTATTCTAATGCCTGGTTCGCTATTCAAATTAATATTCGACCT TTCATGAAAATTGAATTTTCTTTTCTTTCATTTTCAGTTATCTCGTCGAC CTACCATCAAAGAGTTACGAAAGAAGAAAATCATCGGTTTTAACGAATAC GTCGAGGTTTTCGAAGTCCAAGAGTATGACCGAAGGTACTGATTCGTTTT TTCCTATATTACATAAATCGCATTTTGGGAACATACTGTTAATCTCTTTT AATTTTAGCATCTATTCAACAATTTGGTATTTTGTTGTTTGAAGAATTTT AATGATCCTCACTAATGACCTGCAATTTAAAAGAATACTTATTTTGGTGC CGTGTGCAAATAAATCTTACTTCGTAAAGACTCCCTAGCTCTCTTTCTTT TCATTGAGCGATAAGGTTTTGATTTAAAGCTTTTTGATTAATCTTTTTTA TCCCACTTTTCCTCTATCCCGTCTTTCCTTTAACAAAATCTTTTAATTCA TTAAAATCAATCTCTTGAACTTCTTTGACTTCACGATCAGTCAGCTTTTT TTGATAGTGGAACGATTCCCTCAACTATATTCCCAGGCTCTTTCCTCTTT CTGAGTAAAGCTTTTCTGAGTCAGGTTGCTAAGCGATTGTAATTCTATCA TTTGCAAAACAGACTGTCTGAAACCATGTTTTGAATGTTAGTAATGTTTT AAAAAGCACGCTATTCAATCGTTTGATAGGACGATATATTTTTATAGCAT CTATGTGCCAATGTTTAAAAAAAAAACTATCAATGATAAAACTATGACAT TTATGTCTACCCTCTATTTGCCCTTTTGCTGTGTATGAGTTTGCCCACTG TCTTAAATCGATTTCTTTCCCCATCTGGTTGAATCATTATACTGTAACCC TGAAAACATTATATTTCAACACTTTGACTATCTTCTTCTCTTGTACAGAG CTGACAAACCATGGACACGTCTGACACCCAAAGATAAAGCCTCCATCCGT AAAGAATTGAACGAATACAAAGAGTATGAAATGGATGTTCACGAAGAAAG CAAAATTTATACTAGGTAACAATCTTCCCTTGCTTTGTGTCCACTTCCTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000230_pilon:367861..380472-

>XLOC_034874 ID=XLOC_034874|Name=XLOC_034874|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1578bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:367861..380472- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCTCATGATATCGACGGTGCTGGACCAGCTGCTCCTTTGAAGTCTGC
ACTGAGGAGACAATCGAAGTACGATGAAGAGCTCTCCATAGAGGAGTTGC
AGTTTGAGGAAGCAGATTTGAGCGATCTTACGGGTAGCGATACTGGTGAA
GTTGGAGAGAATGGAAGAGGTGGAGGTGGTTTCGTTGATTGGGATGATGA
GAATGATCCTGATTTCATTGAAGTCAATACTTCCAACACATACGTTGATG
AGGATGGTGGTGATGGGGAGGATGATGGAAAGGATGCCTCATGATATCGA
CGGTGCTGGACCAGCTGCTCCTTTGAAGTCTGCACTGAGGAGACAATCGA
AGTACGATGAAGAGCTCTCCATAGAGGAGTTGCAGTTTGAGGAAGCAGAT
TTGAGCGATCTTACGGGTAGCGATACTGGTGAAGTTGGAGAGAATGGAAG
AGGTGGAGGTGGTTTCGTTGATTGGGATGATGAGAATGATCCTGATTTCA
TTGAAGTCAATACTTCCAACACATACGTTGATGAGGATGGTGGTGATGGG
GAGGATGATGGAAAGGGACTGGCATCGAAAGTGAAGCGTTCAGATAGTTT
AGCCTTGAAACTTGGTGCCCGACCGTCAAGATCTGAACTTGAGGGCAAAA
ATATCATCCCAAGACTGGCATCGAAAGTGAAGCGTTCAGATAGTTTAGCC
TTGAAACTTGGTGCCCGACCGTCAAGATCTGAACTTGAGGGCAAAAATAT
CATCCCAACACAATCGGACGATGAAAAACTAGCATTACGTTCGAAAGTCG
GGACCAATCTCGTCAGCACAATCGGACGATGAAAAACTAGCATTACGTTC
GAAAGTCGGGACCAATCTCGTCAGACGGCTAAGCCAGCGTCCATCAAAAG
AAGAGTTGGAACAAAGAAACATTTACCGCAACGGCTAAGCCAGCGTCCAT
CAAAAGAAGAGTTGGAACAAAGAAACATTTACCGCACCACCACAGACGAG
GAGACACACCAAAAGAACTTAGAAGAAACTAAACGACAACTCTCTAGAAA
GCCACCACAGACGAGGAGACACACCAAAAGAACTTAGAAGAAACTAAACG
ACAACTCTCTAGAAAGTTATCTCGTCGACCTACCATCAAAGAGTTACGAA
AGAAGAAAATCATCGGTTTTAACGAATACGTCGAGGTTTTCGAAGTCCAA
GAGTATGACCGAAGTTATCTCGTCGACCTACCATCAAAGAGTTACGAAAG
AAGAAAATCATCGGTTTTAACGAATACGTCGAGGTTTTCGAAGTCCAAGA
GTATGACCGAAGAGCTGACAAACCATGGACACGTCTGACACCCAAAGATA
AAGCCTCCATCCGTAAAGAATTGAACGAATACAAAGAGTATGAAATGGAT
GTTCACGAAGAAAGCAAAATTTATACTAGAGCTGACAAACCATGGACACG
TCTGACACCCAAAGATAAAGCCTCCATCCGTAAAGAATTGAACGAATACA
AAGAGTATGAAATGGATGTTCACGAAGAAAGCAAAATTTATACTAGGTTT
CATCGACCATAAGTTTCATCGACCATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034874XLOC_034874-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000230_pilongenomesc0000230_pilon:367861..380472 -
Properties
Property NameValue
Aaloc775-789:16
Aaloc658-771:414
Aaloc559-654:1276
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