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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000011_pilon:1128440..1134003+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036027 ID=XLOC_036027|Name=XLOC_036027|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5564bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1128440..1134003+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AtggatttcaaaagtttcttttttgttttgttgttcttgtttgCCAATCA
AACCACAGCTGGCAGAGAGCATGATGATTTCCCAAAAGATGATTACAAAA
CCTTCTTCAAAGATCTGAATGAGGCTCTTGGGTTGGAACAATTACTGGAT
ACCATTGGCTTCTATTTCAGGTTGGCTTTTAATTTCAGTAATTGTATACT
GCTTGGGAATTCATATAACCAACTTCCTGTATTACTTTGACGAAAACACT
CCTCTTTTTAAATGCTCATAGAATAAACACCtattaagttaaaaaaaatt
ttctcgataAACACCCCCTCTCAAATAAACGCCTCCCCTCCAGGAGGATT
GTTTATTTGAAGCAAAGTACCTtgttaagggaagaaatttctgCGGAAAT
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aacaaagtataaaatttttactttacaaaaaaattagcattttgtttgat
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ATACACGTGGCAGAAGTTCAATAATGATTGGAAAGATTTGCAGACATCAC
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ATTGTAAgtagaaaaaattttgacgcctatgattttttttaaatgttagt
ATTAtacgagccccccccccaagcggtttacgtgattacgtgatttggaa
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aaaaaattttgagccgtgatacgtgattcttgaactttttcaaagggatg
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tttaatatagtttatataagaacataaggctttatATATATCGGAGGCTC
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TCTTTAGGAAAAATTTGATAATTGTGATTTATGattaaataaaccagctg
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taaaaaaacgagagtaaaaaaatcatcaaatttacgttTGTATACAATAT
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TCTCTTAATTAGAATAGATATttagataataaaaattagatatacagatg
aacagcaacaaaaggctacatcaacaacagattcaagaaaataaaaatcc
ttgcaCGGAAGTTAAATGCAAGGCATacccgtgagtggtcctaaatccga
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tatgtttacaaacattccctctccaagttaagcaataaactatattgcaa
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tttctgaatttgttgctcgtgtttaaaacgttaacaatttagtaataaaa
aaaatatgttttgtttaaGAAGCAATTAgtattttggttcaattggttaa
GTGCATCAAAtgtctcagtttagttgacactttggtatcttcattgcgtc
acagcgaaaggcttgtttttattttagtttgtatctttgaaagaccccat
cagatttaggcagggctgtcggatttaggaccactcacggtactgtactt
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AGTTATAATTATATTCAAGCTCAAGCTGGTGTATTTTCCCTAATCTGAGC
CTAAATATGCTTAAAATTGCAATATTTGTCATTACTAGTCCAGAATGTAT
GTAAGTGTCCGCCATCAAATCACAGTGAAAAAATGAAAgtctagaaaaac
ataatttttgtcaataatttgatgaagaatacttcagcctttctgaaatt
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gcttgatcataattatctccaagtcaaaaagaacaaatgcaagtgtctgc
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ctttaatatacttgatcaatttccatttacgctttatcaatattatctcc
aagtcCAGAAGAACAAGCATATCAAATAtctatcaaatcaaaagaaaaca
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tattctatattcaagtctaaaatgaaaaaaatatgttggTCTAGCAGGTA
AAAAATTACTCACAATTCAGGAAAACACTTgagcaaataagttaaaatct
tcatactttaaggaaagaacatccttataatctaactccagtgttgtatc
ttccttagttataagtttaaaagccaCTTCAGCAAGGTATAATGAtcgta
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GCcttggcagccatattgaattgtttttacACATATCGGGAAACCAAACT
TAGCCCGATCGGATAAAACTttagaaatcggggaaaccctttttttAAAC
TGACGCTTCGCTAGCGCATGGAAAAAACCGATTTGAAAGCTCAGCTTTGG
CTGACCACTTAATATGCTATTGTATCCACTTACAgtatcttttcaaaaaa
cacACATCGTAACTTTAAGTATGATACGAaatgtctttttcttcaaaaat
atgcaACGGTGCCAATTTTCTGTCAATTTTCTTAAAGATTTTGGATCTCT
TAAAAGAAAAGATGGAATATCATCACTCAAAACTTGCGGATTTGGCGAAG
TATTTGTATTGGGGTTAGTAGTACAGCATTGGGCTTTttcccggacaagc
atcagttgacctcccgaacattcaaaatcacccctaatcagggaaagttt
gcccctaaaacaaggcaaattttgcaaatttttcactACCTCTTGGACAC
AAAATCCAATATATCCTGCACCAcacatgtacaaaaattttctggaagag
ccccttttttatttttctcatattttcatatattttttagcTGCACTCCA
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TGTTTGTGTATGGTCTCATGATTTCTTTGATCCTCATCAAAATATTAAGC
TGGTGGAATTTTATGGTCTATCTAGCATTCGGCTTTCTTGTATACTCTTT
TGGTGGACCATACATGGTATTTAAGTGGTAAGTAAGCAGAgacaccccta
tctcacagccTCCAGGAAATTCTATAGAATTCTCAATGGGATAGAAACTT
TATCCTTTCATAGTctgtataaaaaaccctggtctggaagcttattgttt
taactttttgttaactttttcctttattaatatcaaaagataaaaatcaa
ttttctcagtttttaatcacgttaccaagtactcctcttggAATTGGTTT
AAGtttcaatcacatgatcaaaaagtgagcaaaacaaaccaatttcTCAA
CGTAAGCTCAAGtataaaacaatggaaagaaacaaaagtctTCCAGGCCG
GgattttttatacggactatgatccTCCTCAGGTCTAAGTCTATTTTCCA
CTAGGACTGAAATTTTTACGAGCTTTTCCtactggggacgaaattttggc
taaattttccagttgggGTCCAAACGGTTCGGTGAAACCGGATTTCAGAC
ATTGGACATTTCTCCCTGAAATTGTGTAAGATTGCACCAGGGTTTTTTAA
ATCgcatttttgatggaaaatcaAGTTCGAATCCACCATTTTGTTGTAGA
ATTCGGCCATTTTAAGGCCTAAATGGTGAATTTCTTAAATTCCGAAAATT
CTAGTGATTCTTTTGCTTCGCAGATTTAATCTGAAGTCAGAACTTTGACA
TTatcttttttctctctttaaTTCCATCTTTTCTGAGCTTCCTTCTAATT
CTTTGATTGGAAAGGGGCTTTACTATCAGGAACagaaagtaatattttta
acttgtGGTTCTAAAATTTCTCACATTTTTTATTCAACTGTGATTCGAAG
AGTAGTAAAACTCATTCCCTCCTTGAAAAGATTTATCAAAGttttatatg
aagatgtttttaataaattttgtcattttgggaagatcaaaattttcatt
ttttaacttaacTCTTGATTGACTGAACCGATTCTAAAGTTAAGTTATCT
CCTGGaggataaaaaatatttcacagtaagctcacaatatcttgatAAAA
TGGTATACtttttttAATACACTCggtatgatatattttttattttttag
gctATTAACCATCACAGCTTTGGTTTGGTTTATATTCGATTTCGTGTTGA
CCTACCCTTTCCAAACTGCAATTGCTATTCTAACATTATACGGTATGGTT
CATATAACCTGGCTTCTACGTAGCATTGTCAATCTCATTTTCGGGCGTTC
AGACACGCCCCCGCCCACGCCAAGACATTATAGAGATTACCCTGATGCTT
CTCCACCGAGGGATCGACATCGGGCGGAGGGTGAATTCACAGAGTTGACA
AATCGGATAGATGGTATGGAGAGACGAACGGAACTTTTGAATGATCGGTT
GGACCAATTAAGCCGTTCTATGGAAAGAGTACTGCAAAATATGGGAGACG
AAGATTCTGATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000011_pilon:1128440..1134003+ >XLOC_036027 ID=XLOC_036027|Name=XLOC_036027|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1896bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1128440..1134003+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AtggatttcaaaagtttcttttttgttttgttgttcttgtttgCCAATCA
AACCACAGCTGGCAGAGAGCATGATGATTTCCCAAAAGATGATTACAAAA
CCTTCTTCAAAGATCTGAATGAGGCTCTTGGGTTGGAACAATTACTGGAT
ACCATTGGCTTCTATTTCAGAtggatttcaaaagtttcttttttgttttg
ttgttcttgtttgCCAATCAAACCACAGCTGGCAGAGAGCATGATGATTT
CCCAAAAGATGATTACAAAACCTTCTTCAAAGATCTGAATGAGGCTCTTG
GGTTGGAACAATTACTGGATACCATTGGCTTCTATTTCAGAACGTACATC
AGAATAGGGCAAGCATACACGTGGCAGAAGTTCAATAATGATTGGAAAGA
TTTGCAGACATCACCCTCTGTGTTCAAGTTATTCCATTTCATACACAAGT
TGTTTTGGGTTGCAATTTCACAAACCGGTGTGAAGTTGATCCATGCCATG
AGGGATGGTCAGGTCTTCTTATTGCACTTCTTGAAGAAGAAATGTGACAA
GACACTGGATAAGAATTAACGTACATCAGAATAGGGCAAGCATACACGTG
GCAGAAGTTCAATAATGATTGGAAAGATTTGCAGACATCACCCTCTGTGT
TCAAGTTATTCCATTTCATACACAAGTTGTTTTGGGTTGCAATTTCACAA
ACCGGTGTGAAGTTGATCCATGCCATGAGGGATGGTCAGGTCTTCTTATT
GCACTTCTTGAAGAAGAAATGTGACAAGACACTGGATAAGAATTcTGCAC
TCCACCCATGGAATGTTCTGATGGAGCAAAACGAACAAAGCGTCTCATTT
CTGGTGTTTGTGTATGGTCTCATGATTTCTTTGATCCTCATCAAAATATT
AAGCTGGTGGAATTTTATGGTCTATCTAGCATTCGGCTTTCTTGTATACT
CTTTTGGTGGACCATACATGGTATTTAAGTGcTGCACTCCACCCATGGAA
TGTTCTGATGGAGCAAAACGAACAAAGCGTCTCATTTCTGGTGTTTGTGT
ATGGTCTCATGATTTCTTTGATCCTCATCAAAATATTAAGCTGGTGGAAT
TTTATGGTCTATCTAGCATTCGGCTTTCTTGTATACTCTTTTGGTGGACC
ATACATGGTATTTAAGTGgctATTAACCATCACAGCTTTGGTTTGGTTTA
TATTCGATTTCGTGTTGACCTACCCTTTCCAAACTGCAATTGCTATTCTA
ACATTATACGGTATGGTTCATATAACCTGGCTTCTACGTAGCATTGTCAA
TCTCATTTTCGGGCGTTCAGACACGCCCCCGCCCACGCCAAGACATTATA
GAGATTACCCTGATGCTTCTCCACCGAGGGATCGACATCGGGCGGAGGGT
GAATTCACAGAGTTGACAAATCGGATAGATGGTATGGAGAGACGAACGGA
ACTTTTGAATGATCGGTTGGACCAATTAAGCCGTTCTATGGAAAGAGTAC
TGCAAAATATGGGAGACGAAGATTCTGATTAGgctATTAACCATCACAGC
TTTGGTTTGGTTTATATTCGATTTCGTGTTGACCTACCCTTTCCAAACTG
CAATTGCTATTCTAACATTATACGGTATGGTTCATATAACCTGGCTTCTA
CGTAGCATTGTCAATCTCATTTTCGGGCGTTCAGACACGCCCCCGCCCAC
GCCAAGACATTATAGAGATTACCCTGATGCTTCTCCACCGAGGGATCGAC
ATCGGGCGGAGGGTGAATTCACAGAGTTGACAAATCGGATAGATGGTATG
GAGAGACGAACGGAACTTTTGAATGATCGGTTGGACCAATTAAGCCGTTC
TATGGAAAGAGTACTGCAAAATATGGGAGACGAAGATTCTGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000011_pilon | genome | sc0000011_pilon:1128440..1134003 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 586-948:5202 |
| Aaloc | 400-582:3943 |
| Aaloc | 172-396:778 |
| Aaloc | 1-168:1 |
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