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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000053_pilon:1752538..1758840+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038149 ID=XLOC_038149|Name=XLOC_038149|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6303bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000053_pilon:1752538..1758840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAATCTAATCATCTTCCTATTATTGGGTGCCATGGTGGCCACCCT
TTACGCCCACAGTGAACCGCACCAAACAACTAAACGCCCTGCACGTCTTC
GACTTCGTCACCGCATGTTCCGTGGAAACGGTTTAACCATGAAACAACGT
AGTAAGTAGTTTCTTCCTTGTATACAGATATCGACCCTTTGTAGCGCGGT
CGGCTTTTGAGAGAGTTGGTCATGAATTTATAAGGAATAATCTTTTTTCG
GTGCACTGTTTTTTGGGCTGCCCCTAAAACAAACCAAGCCAATTCGCGCC
AAACTCTATGCTATACGAGTGACGTTTCCCATTTTCACAAGAACGCTCCT
ACACTTGTCTTTTCAATACCGTCCGTCaaaaaaaaCTGTAAATTCCATTA
CCAATTTCCTAAAAAAGTCGGCTGTGTCCTTAAGGGTCGACACATTCAAT
ATTCCAATACAGATTTCTCGTAAAAGTGTCTAGTTTTAACTTTATTCCTA
ATTTCCTCATTTTCGTTTCTATTAGGGATGTGCTGGCGAAAGTGTGACAG
AAAGAACACAGAGAATTGCTTGGCATACAAAGAGACAGTGAAATGTGTTT
GCAAAACCGGCTTTCTTCCACCATTCTGTAAAGAAGGTTAGTAGGGTGTA
TTCTTCCAATAGTAcacttttatttataagaacatccacaaccttttaag
ccttcggatgttcttaactcttaagcctgaaaatgtttttatcgtgttct
tattttgaccattttttgagcatttcttttgtccattttccttagaaatt
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cttaacattttggtcatcgaagccttatgttcttatatagttcgttctta
taaaaaaacgtgtaagcaaaagaatttctcaaaatttgtattTGCACAGC
GCCgaaaaagaagaacattttATTCGAGCATGCTATGTAACCTTGAAAGT
GTAGGAAAAACATTAAATGATGTATTTTAAATCTCTTCCACAGGTATGGA
AGATTGTACACAACTTCCTTGCACAAACGGTGGAACGTGCTCCGATCACA
AAATATTCGGATTCAAATGCACATGTCCACCCGGCTACTCTGGAAAACGA
TGCACCAACGGTAAGTTTCTCGATAACGTCTTGTAAAAGCTCTCCAATCT
TGAtaatatacaccttttcgaccgtagtcgcgtggtcaggcgcgtcccac
tttattatttaattatcaccctaaactcgatccaatcttttttttacatc
tttttctaattgtctataggtgcgaaaaaaagactgggacggttttaggg
tggtaaaacggacaaaaattgTCCGGCAATTGGCGGATACggtcgaaaag
ttgtatttcGTGTATGTTTCCTACCTTTTTGTGATTAATTCCTATTTTTC
ACTGTAATAGtttttttCATGTTGATGCTTCTATCGGCTTGTCTTGCTTA
TCCAGTCCTGTTTAACAATGTTTTCAATCAAACTTTTAGATGTTAACGAG
TGTGCATCCAACCCATGTCACGAAGGAGCCACCTGCgttgatggaatcaa
tggtttcACTTGCAAATGTGCACCAGGATTCAAAGGAAAGACTTGTTGCG
ATAGTAAGCTTTCTATACTAGGCGCTCTATTTTTAGTTTGGATAAtcgag
tttctttcaaaatactATGCCTCTAACCTCGGAATGATTGTTTTAGTAGG
ACAGAGAAAGCGTATGGGTTTCATAGGTCATTGCCCCCCTTGTGGTGTTT
AGCTCTTATATTACAGAGTCTGCTAACTGTGTACCCCGTAGAAAACTTTC
GCCATATTTAGCTCGTTAAATTCTTAACAAGGCAGTTGGCGTAAGTTATG
CACGCGAAAAATTCTTcaagattttgttgaaaatatataaaattttatcc
AACGACTagtgaaagtttatgctcgtgaaaaattttttctcacatTTGGG
AAAGTAGACATTCATAATAAATTTTACACTTTCTCAACCTTCCGAAAGTT
TCTACTTTCTACTTCTAAATGCCTAAACCCATCGAAGGACAGCCTGAAGG
TCCAGAGTTTACCAGTTCGTCAATGTTTTGAATTATCACATTCATAagtg
tcatttttttctcataaGAAATCATGTCTTGTGTTATGCCAACTTTGATG
GGTGAAGAAGCACCTCCTGTCTGCAAGAATGGTGGTTGGTGCACAGATTC
TGATGAAGGCTTCCAATGCAACTGCAAACCAGGTTTCAGCGGAACCACTT
GTGAAATTAGTAAGTGTTATCTTGCTTTCCCAAACTTCTTTAACAGTATT
TTCTATGAAAACTATACAAGAGTAGTAGATATGTATTGAATTCTCCTGAA
TTTCAATGCAACTGCAAGCCAGGTTTCAATGGCACTGCATGCGAAATTAG
TAATGGTATCTTGCTTTCCCAGACACATTTAATAATGTTTtctatgaaaa
tcaaatcaaagtaGCGGATGTGCATAGATTTCTTATCTAACAGTGTTTTG
AATGCAGTGTTTTTCCCTTATAGATAACGattacaaaaaaatcaattttg
tctcACTAAGCCAGTATCGTTAAACAATGTTTTGAACGAAAACTTTTCTC
CCTTATAGACAACGATTGCAAACAGTTTCAATTTTGTCTCGCTTAGACAG
TATCATTTCACTGTGTTTTCAATGCAAACTTTTCTCCCTTCTAGACAACG
ATGAGTGTGCATCAGAACCATGTCAAAACGGAGCACATTGTGTGGACAGG
GTGAACAGATTCCAATGTATCTGTCCTAAAGGATTCCGAGGAAAATACTG
CgaaaaaggtttgaaattttcatttgcCTTGCTTTCCCAGTCTTATTATC
AACGCAAGCATTtcttctgaaaatattttatgaaatgCAGATCTTCCTTT
TTGTATTCCTTGCTTTGGCTCCTTAAGATTTCCATGGCAAAAAAGCGTTT
TTCGTACAATATTCTGTATGTAGCAATTTTGTATTCCTTGCTTTGGCTCC
TTAAGATTTCCATGGCAAAAAAGCCAAGCGTTTTTTCGTACAATATTTTG
TATGTAGCAATTTTGTATTCCTTGCTTTGGCTCCTTAAGATTTCCATTGC
AAAAAAGCGTTTTACGTACAATATTCTGTATGTAGCAATTTTGTATTCTT
TGCTTTGGCTCCTTAAGATTTTCATggcaaaaaagcgttttttcgTACAA
TCTTCTGTATGTAGCAATTTTGTATTCTTTGCTTTGGCTCCTTAAGATTT
TCATggcaaaaaagcgttttttcgTACAATATTCTGTATGTAGCAATTTT
GTATTCTTTGCTTTGGCTCCTTAAGATTTCCATggcaaaaaagcgttttt
tagTACAATATTCTGTATGTAGCAATTTTGTATTCCTTGCTTTGGTTCCT
TAAGATTTCCATggcaaaaaaacgttttttcgtACAATATTCTGTATGTA
GCAATTTTGTATTCTTTGCTTTGGCTCCTTAAGATTTCCATggcaaaaaa
gcgttttttagTACAATATTCTGTATGTAGCAATTTTGTATTCTTTGCTT
TGGCTCCTTAAGACTTCCATggcaaaaaagcgttttttagTACAATATTC
TGTATGTAGCAATTTTGTATTCTTTACTTTGGTTCCTTAAGATTTCCATG
GCAAAAATGCGTTTTTTCGTAGTAATTGATTTAAAAAGGTTGCCAGAGCC
TACGAACTGttttttgatctcacgattgtttttaatgttataatttcttt
tttcgagtgttaaactgatttttaaaatatcaaCAATAATTTGCCTTGCT
TTTCCAGTCTAATTTAACAATGTTTTCAacataaaactttctttaaagat
aTCAACGAATGTGCGAGATTTCCTTGTCAAAATGGTGCAACTTGTACAGA
TTTACCAGGTGGTTTCAAATGTGACTGTGCCCCTGGATTCTCTGGTACCA
CTTGTTGGAGAAGTGAgcattgattatttttttgcttttctatCTGTAAT
ATATTCCATTTAAGGATCTAATAGTGCTTTTTTACTGTTAAGTCATAATC
TTATGGAAAACTTCTTTTCGTTTCATTTATCAATCAAAACCAATAAATGC
CTCGTTTTACCAAGCAAAATTAAGAGTTACCTAGACGGAAAACCTTATTT
CATACATCATTGAATGTCTTGCTTTCCCAAACAAAATTAACTGATATTTC
TATTGAAACTTCTTTTCAGATATCAATGATTGTCACCCTAACCCTTGTGC
TAATGGCGCTAAATGTACTGATAAGATCAACGGTTTTGAGTGCGCATGCC
CAGATGGTTTCACTGGAGATACGTGTGCTGCTAGTATGTTTTCATTACCC
AGATTTATTGTCAATTCTATGTGAAGTGATGCCAATGATACGGTTTTATG
CCGAAAAGCTCAAATGATACGTCATACTTTAGatgcacattttttataag
caaccagaaGGCTCAATGCCTCAAATTAGCCGAtttttttACaattcgta
aagtaaaagcttttcagATAATCTGACCATGACAAAGGATAGCCCTTGat
ccaataagcataaatatggtataatatcgaGGATATAGCAAGGCAAACTt
ttagaaaatgagctagaatgttAAGCAGTCAGGCCTGACCTGAAAATTGG
agtaaattatacaaaaatgtgtAGACAATTACTTAATAATAACAgaaaca
taatttcaaaaaaacaggTGATTAGGAGCTCTCATGTACTTCACATTTTG
TCTCGCTCACACGAACTCTTTGAATAGACATTTGACCACAAACTTTCTTT
TGCATCATAGATACTGACAACTGTAACCCAAACCCTTGCCAGAATGCAGG
AACATGTACAGATGGGGCTAATGGATTCACTTGCCAATGTCAACCAGGCT
TCACCGGAGCCATGTGTGAAATCAGTAAGTAGttaaggccggtttccact
tgcgcgcgctacgatcgcacttttttgcttcaatcctttttgcttggaaa
aaagattatgtCATAAAATGTAGCGCatgcttaaaaaaaaagttgaacac
attttcaaccattacgtcagatcgcgccaatggagttgcttcatttttct
tttgaccaatagcgtggaaacttttctcgaaaaagtgcgatcgcagcgcg
cgcaagtggagaccggcctttataaATTGATAGGAGATAGCTATCACACA
ACTTAGCACACCTGTCTCAGTAGACTAAAGTCTACTTCTGGTAGAACTTT
GCTTTCGGATGATCTGATGATTGCCCAATATATGAAGCGTGCCATATAAC
ACCGGGCAAATTATCAGTGCCAATAAAGTCcatataaaaaaccctggtct
ggaagccttttgtttctttccattgtttcttacttgaacttgcgttgaaa
aattagtttgttttgctcactttttgatcatgtgattgaatcttaaacca
atcccaagaggggTAAttatttggtaacgtgatcaaaaactgagcaaatc
gattttcatctttCGATAATAGCATAGGAAAAAGGTAATAAAAAGTtgac
cagtgttttttataaggactattAAAAGCAAGAAGTGATGGCCTCGGGCT
GCTACTGTCTTAGCGACCCGGTGTGAATTTCTTACCCAATGAGAATGGAA
GAGCTAAAAATACCAATGGGGGTTGAAAGTTTATTGTCTTAATCGGTGGG
GGTTTCAAACTCTAATGGTATAATATTAGGGGTTGTTAAAGcgaaatgag
ctagaatgctaagcaaccccaggCCTGACCCAAGAAATAAATCACTCATC
AAAGAAATTTGTACTTGACTTAGCCCTtacaaatacaccttttcgaccgc
agccgccaattgccgggcgagaatttttttgtccgctttatcccactaaa
atcgtcccagtccttttttcgttcctatagacaatagacaaatgtgtcaa
aaaaggattggatcgagtttagggggataattaaataattaacgGATCGA
GTTGTTTAGGGGGGtgattaaataattaagtgtcacgcacctgaccgcgc
gactacggtcgaaaaggtgtattgaaattATGAGATGACTGAGATACCCT
CTTTTTCTAGACATCGATGACTGTGCAGACAAACCTTGCAAGAATTTAGG
TATCTGCGTTGATAAAATCAACGGTTTCAGATGTAAATGTACTGGCGGAT
GGCGTGGAAGATTATGCAGACGCCCTCCAATCAAACCCCATTTCTGGAAA
TAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000053_pilon:1752538..1758840+ >XLOC_038149 ID=XLOC_038149|Name=XLOC_038149|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2466bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000053_pilon:1752538..1758840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAATCTAATCATCTTCCTATTATTGGGTGCCATGGTGGCCACCCT
TTACGCCCACAGTGAACCGCACCAAACAACTAAACGCCCTGCACGTCTTC
GACTTCGTCACCGCATGTTCCGTGGAAACGGTTTAACCATGAAACAACGT
AATGAAGAATCTAATCATCTTCCTATTATTGGGTGCCATGGTGGCCACCC
TTTACGCCCACAGTGAACCGCACCAAACAACTAAACGCCCTGCACGTCTT
CGACTTCGTCACCGCATGTTCCGTGGAAACGGTTTAACCATGAAACAACG
TAGGATGTGCTGGCGAAAGTGTGACAGAAAGAACACAGAGAATTGCTTGG
CATACAAAGAGACAGTGAAATGTGTTTGCAAAACCGGCTTTCTTCCACCA
TTCTGTAAAGAAGGGATGTGCTGGCGAAAGTGTGACAGAAAGAACACAGA
GAATTGCTTGGCATACAAAGAGACAGTGAAATGTGTTTGCAAAACCGGCT
TTCTTCCACCATTCTGTAAAGAAGGTATGGAAGATTGTACACAACTTCCT
TGCACAAACGGTGGAACGTGCTCCGATCACAAAATATTCGGATTCAAATG
CACATGTCCACCCGGCTACTCTGGAAAACGATGCACCAACGGTATGGAAG
ATTGTACACAACTTCCTTGCACAAACGGTGGAACGTGCTCCGATCACAAA
ATATTCGGATTCAAATGCACATGTCCACCCGGCTACTCTGGAAAACGATG
CACCAACGATGTTAACGAGTGTGCATCCAACCCATGTCACGAAGGAGCCA
CCTGCgttgatggaatcaatggtttcACTTGCAAATGTGCACCAGGATTC
AAAGGAAAGACTTGTTGCGATAATGTTAACGAGTGTGCATCCAACCCATG
TCACGAAGGAGCCACCTGCgttgatggaatcaatggtttcACTTGCAAAT
GTGCACCAGGATTCAAAGGAAAGACTTGTTGCGATAAAATCATGTCTTGT
GTTATGCCAACTTTGATGGGTGAAGAAGCACCTCCTGTCTGCAAGAATGG
TGGTTGGTGCACAGATTCTGATGAAGGCTTCCAATGCAACTGCAAACCAG
GTTTCAGCGGAACCACTTGTGAAATTAAAATCATGTCTTGTGTTATGCCA
ACTTTGATGGGTGAAGAAGCACCTCCTGTCTGCAAGAATGGTGGTTGGTG
CACAGATTCTGATGAAGGCTTCCAATGCAACTGCAAACCAGGTTTCAGCG
GAACCACTTGTGAAATTAACAACGATGAGTGTGCATCAGAACCATGTCAA
AACGGAGCACATTGTGTGGACAGGGTGAACAGATTCCAATGTATCTGTCC
TAAAGGATTCCGAGGAAAATACTGCgaaaaagACAACGATGAGTGTGCAT
CAGAACCATGTCAAAACGGAGCACATTGTGTGGACAGGGTGAACAGATTC
CAATGTATCTGTCCTAAAGGATTCCGAGGAAAATACTGCgaaaaagataT
CAACGAATGTGCGAGATTTCCTTGTCAAAATGGTGCAACTTGTACAGATT
TACCAGGTGGTTTCAAATGTGACTGTGCCCCTGGATTCTCTGGTACCACT
TGTTGGAGAAataTCAACGAATGTGCGAGATTTCCTTGTCAAAATGGTGC
AACTTGTACAGATTTACCAGGTGGTTTCAAATGTGACTGTGCCCCTGGAT
TCTCTGGTACCACTTGTTGGAGAAATATCAATGATTGTCACCCTAACCCT
TGTGCTAATGGCGCTAAATGTACTGATAAGATCAACGGTTTTGAGTGCGC
ATGCCCAGATGGTTTCACTGGAGATACGTGTGCTGCTAATATCAATGATT
GTCACCCTAACCCTTGTGCTAATGGCGCTAAATGTACTGATAAGATCAAC
GGTTTTGAGTGCGCATGCCCAGATGGTTTCACTGGAGATACGTGTGCTGC
TAATACTGACAACTGTAACCCAAACCCTTGCCAGAATGCAGGAACATGTA
CAGATGGGGCTAATGGATTCACTTGCCAATGTCAACCAGGCTTCACCGGA
GCCATGTGTGAAATCAATACTGACAACTGTAACCCAAACCCTTGCCAGAA
TGCAGGAACATGTACAGATGGGGCTAATGGATTCACTTGCCAATGTCAAC
CAGGCTTCACCGGAGCCATGTGTGAAATCAACATCGATGACTGTGCAGAC
AAACCTTGCAAGAATTTAGGTATCTGCGTTGATAAAATCAACGGTTTCAG
ATGTAAATGTACTGGCGGATGGCGTGGAAGATTATGCAGACGCCCTCCAA
TCAAACCCCATTTCTGGAAATAAACATCGATGACTGTGCAGACAAACCTT
GCAAGAATTTAGGTATCTGCGTTGATAAAATCAACGGTTTCAGATGTAAA
TGTACTGGCGGATGGCGTGGAAGATTATGCAGACGCCCTCCAATCAAACC
CCATTTCTGGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000053_pilon | genome | sc0000053_pilon:1752538..1758840 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1093-1233:6163 |
| Aaloc | 979-1089:4863 |
| Aaloc | 865-975:4272 |
| Aaloc | 751-861:3901 |
| Aaloc | 637-747:2747 |
| Aaloc | 496-633:2171 |
| Aaloc | 382-492:1542 |
| Aaloc | 265-378:1046 |
| Aaloc | 154-261:528 |
| Aaloc | 1-150:1 |
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