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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000020_pilon:28757..34540- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034215 ID=XLOC_034215|Name=XLOC_034215|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5784bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:28757..34540- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATTGACATACAAAGGACCAAAAAGTTTCATAACACCTGATGATGC
AAGGACTTTGGGAATGCAACAATGTAAAACAATTTATTGTGACTACTACT
TTAGTTTGGATAGTGAAGTCACGTTGTCAAATCCTAAAACACTTCAGCTG
TTGATTGAACAAAATAGGTAAGGTCTCAACTGGAAAGACTGATACATGTT
TTTTAGTAAGTGTCTCTATCAGACTCGCATTATGCTTACCATTCTATTGT
TCTGAAACAATAGAGTTATTTTTAGGTACCAAAAAGTGAGCCTGCGCATA
TGCTTATAAACATTATGCTTATATATATAACAAAATACTACATTGTCACT
TTTTCGGAATGCCACGAGACAAAATAACAAAATTTCAATTTAGTGAACTT
CAAAGCTATAAACAAATTTTCGAGGCAGTCAATTAATCTTGTCCAAATGC
TTGTTTTTAAGGACGTTCATAACACCTATTCTGAGTCAAAGAGGGAAGCT
CTTTTCGAATTTCTGGGGAGCTATCGAAAATAACGGATACTATGCCAGGG
CACCTGACTATTTAAGCATCGTTCGAGGTGAACGCGTAGGAGTGTGGAAC
TCACCTTACGTCACAAGTTGTTATTTGATTCGACGAGAGAAATTATCGGA
TATGGTTCATGACCCGTTTTATGCACCCGGCGAAGATTTTGACATGATTT
TTGCAGCCAATAATCGGAAAAAGGTATCGCTATTGTTTTTAATACTAGTC
ATTCTTTTTTGTTAGACGGCCAAGTCTCTATAAATCCCTGCCATCTCCTC
TCATTTCATGTCACGACTCAACCATGACACCCCCTTAAATAAAATCCTTA
AAGAATTCTGTTCCCCGATTTTTTCAATTTTCTTGATGTTGGTGTGAAAA
CCTTTGGAGGATGAAAAAAAGTTATGTTACTAGTTTGTATCTCATGCTTC
CAATGCCTCCGTTACTACTGAGGGAATCTTCATTATATTTCGCCTCTCTT
ACTGAAACTCTCCGAAAGTAGATCGGTTTTACTGATGAAAATTTGCAATT
AGAGACTCGACGGTATATTATTTACCCCAACTTTGAGTTGTCTGACAAGT
ATTTCATTTGTATTTGAGTTAAGACTTTTTAAAGGCTGTCCAAAGCCAAG
TTTCTTTGAAAGTAAAATCTCCCAAAATTCTGAATGACAGCGTTACTTAT
TTCCATACCTCAGGGTATCTTTATGTATGCAACGAATATTCATGAATTCG
GACATTTGAAGAAAACAGATACATATTCGACAACAAAGAAGAATGGGGAT
CTGTACCAGCTCTTCGATAACCAATGGGTAAAACGATATATGATTTAAAT
GGGCTATTCCAGAAAAAATTTTTACCCCTACTCTTAGGTGGCAAATAAAC
GGCGAGGGGGGGGGGGGGGGTTCGAATAAACGGGGGGGGGGGGGCGGGGG
GTTGAAGAATTTTCAAAATTTAATAAACGGGGGGACCTAATTGTCGGAGG
GGTTGGAAATTGTACTTCTGAAAACCCAAAATAAGGTAAATATAGGCTAC
TTAGAGCAAAATAAGGGGCCTTCTCCTTGACAGCTGAAAATATTCTTAAA
AATTAATAAACGGGTGGGTCCTAATAAGGTCTGGGGGGGGGGGTATTGGA
AAATTTCGAAAAATTAAAAAGCGGGGGGGGGGGGCGTTTATTTGGCACCT
AAGAGTATGTTAAGAGGTCTTTTTGACCAACCTGGATTTTCCACCTCATT
TTACTGACTACTCCGGAATTTTACACTCGAAAAAACGACTCCCTGGATTT
TTATTATTTTGAAACCACCCTGGACGTCACACCTACTTGAGGGTACAGAC
TATTTCTGGAATAGCCCAATAGAAAAACAAACTTCTGAGGAGCCAAAACG
ATACAAAGGGCAATGTACCTTAAGAGAACTTTTTTTGGTGGGAACTAATT
TTCACGAACGGTCGATTAAAAAAAAAATTTAATTTTGGCGAGAACTAATT
TTGGCGAACTATGAATTTTTTTAATCTTGGCGAGAACTTATTTTGGCGAA
TCAACGATTTTTTTAATTTTGGCAAGAACTTTATATTTTGGCGAATGACA
GCGTGAATCTGTTCTATTTTGCCTTATTTGAAGTTTTTTTGTGAACTCAA
GAAGTTATTTAGGCAAAATATTAAAATTTTTAATTTTGGCGAGAACTAAA
TTAGGCGAATTTCAAGTTCGCTCACCAATCTCGCCAAAATAAGTTCCCTT
AAGGTAATGTCAATTTGATATTTGAGGGTTACAAGACGATCGTATATCTC
ATAAAGTAAAGTCTATTGATTAAGTCATTTTAAAAACATGATCCAACCAT
CATTATTCTAATTTATCTTTCAATTTTCCATAGGATTGGGAAAGAAACTA
CCTCCACAAAGACTACCATAGATATTTGAAACCTAATATCAAGAAGATAG
AGGTTCATTAATTTTCTTCTTTTTGTAAACAGTGAGCTTTTTCGGTTGCC
TGCTGAGGTTATTAAAATGGCTTTGTATTTTTAATGACGTGTAGTGCACA
ATTTCTCATACCATTCACATATGACTTTCAAGCCAAAATCTGCGTCGTAG
ACCTTTTGCTAATCTATGGTGACCAGTCAGGGAAATCCTCTTAATCAAAC
GCTCGACTTCTGAGATTATTGAAGCACAGAATTTTCAAACCAATTACACG
CGTATTTCACTTCTTTTTTAATGTGAGGTGAACGTGTAACTGCAACCTTC
TCAGCCTCGTTATTCTCATAAATGAAATTTTTCCTACCTTATAAAGAATC
TTTCTTTCTTTTGCAGCCATGTCCTGATGTGTATACATTTCCATTCGTCA
ATGAAAGGTGGACTAAACAAATAATACAAGTAAGAGAAAATATCACATTC
AATTATTTTTAGACCTTAATTGATCGAATCGTGTTCTTATGTTTTAATCA
GAATCAATATGTTTTAGTCTTTATAGCTTATTAAACTTACATTGCTTTAA
AGGAGATCTGGAAATTAAGTCCTCCCAGAATAAATTTAAGTTGGAAATTT
GGTCAAAGCCCTTGAGAAAACTAAATTTGACGAGAAAGCCGCTTATTCGC
AAAATTCAGTCAACGAGAATAATCAATTTTAAGAACGCCAATAAGAACAT
TTTAGGCTTAAAATTATAAAAAAATAAGCCCATCCAGACAAAATTAAGAA
GTTCTCATATGAAACGTGTACAACACCTGATATCTATCCTTTTTGTTTGT
TTTTACTCTTTTTATTATAGGAATGTGAAGCTTTTGGAAAATGGTCTGAT
GGGAAAAAAAAGGTAGGAGGTTTTTTATATTAAAAACAACTTTTTAGTAA
GTTGCCTTAGTGAAAGTTGACAATAGTATTATAAATTAATTTTAAAGCAA
TATTAATTACGATTTTTATTACCTGCTGTACTGACTTTTAGAATAAATTG
TAGCATTTGAAATGTTTTTATTATATGATTGAAAATGATGACATAAAGAT
CGTTGAAACATTCCTACAATATCGACTCTATTTTCTTGTTGTTTTTTATT
TAAAAATCCAAGGAAATGTTTATTTTTGGGTTATGCTTCTTTTTATATAT
TTTTTTAATATTATAAATGTATTTCAAGTTATATAATTCGGATCATGTCG
TGATTCTGGGAGGCTGGGTAGATTCTTTATCAGCTTTTGGTCAGTAACTT
GACTTTCGGGTAAATTCTTTTAACTGGTCTGATAACTGGTACAAGAATCT
ATCCAGCGCCCACGGAATCACGACATTATCTTAAAATCTCGGTCAAAAAT
CTCGAATATTTCAATTAGGGAGGGGTTTTATAGACTTTTAGGCTATATTC
TAAGCCCTATTGGACTATTCTTGGACTCTTGTGTTAAAACTCTACCCTTC
CAACCTAATTTAGAGCGCTTCCAAATCGTTTGTGGTTGTAAGATTTCGGG
TGAATTTCCCTTTTTTCTCAAATATTATGACTTTAATTGTATGATTCAAT
CAAAGTCAATTTCATTTATTATAAACATTTCCTTTCGCTTGGAGAAAATT
CCTCTCAGTTAATTGATGTACGCATTTTTTAAATATGGTCTTTAATAAAA
ATATGAATCAAATTATTTCAATGTTTAGGATAAACGTGTTGCAGGAGGAT
ATGAGAATGTTCCAACCGTCGATATCCACATGAACCAGGTCAGGCAGTGT
TAAGTAAATATCAAGCTTTTATCCAATCCGCATACCCTCATTGAAGAGAA
ACCCATGATTGCTCTTATTTAGTTCAGAATAATTTCCTAATCAGCTTTAG
AAGTATATCTTTTTCTTATAAAGTGTGTCCCAACTTTCTTAGTCCCAAAA
AAGGAAGAAAGATTTTTAAAAAATCCCCGAAACTCGTTATCTAAACTGGG
CTTATAGTAATTAAAATAATATTACAAGTCTTTGTTCAGTCAATAGCTAT
TCAATTCCCAAGATCATTGAAAAGGTTCTCGAGATTGAAATATAAAGTAA
ACAAGCCATAAAATTTTGCATAAATCATGACAATTGAGGATTTGACCGCT
TTTTTGGGACACACTGACACTGTGCAAAAAAACAGTACGGCTAACCTTGG
TGTTTGTTCATTTGATAGATTGGTTATGAGAAGCATTGGTTGCAGATGTT
GAAATTGTACATAAAACGCATTGTGGAAAACTTCTATACAGGTTACAGGC
CAAAAGTAAGTTCATATTTTTCCACGTTTGTCTGTACGTCATGTTTGTCA
TAATTAAGATTAGTTTGTTTAATTTTTACATCTTTATCTAAAAGAGAAAA
CAAATACAAAAACCAGAAAGTCTTAAAAGCAAAGTCAATCGACAAAATGT
TACTTCAAGCCAATAGATCTAAGCTTAATTTTTATCTACAGTGTCTGGAA
AAAGCGAAACAGAATTTGTACAAATAAAAATCCTCATAATTCATATCAGT
TTTAATGACCTTCTTATTATCCAATTCCCTCCGACAACTTTTTTTAATCT
CCTTGGGGATTGAATTTATATCAATTCAACAAAGAAATGCCACCCTTTTT
CAATTATTCTAGACTTCAGCAAGATGATGAGATTTCGGATTTCTACTTGA
TACAAAAATGTTCCGATTTTTTTGGAAACACTGCAGATCTCTATTCTATC
TCTTAGTGTGTGGCAAATATGAATTTTGTAGTCAAATACATAACAGAAGG
TCAGAATTCGTTACCAGCACACCACGACACTTCTACCTTCACCATCAACC
TCGCTTTGAACAATCAAAAGACAGACTATGAGGTAAACTATTTTGTTCAA
ATATTCCTTCTGATAACAGTTTCTAAAATGACACTATTTGGTGTTGAGAG
ATACACGTTTTCTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACAGAAGACTTC
GATGGCCAAAATGTTAAAAACAAGTTAAGGACATTTTAAGGCTTTGTAGA
CTCAATAACACCCTATTTCTTAGGAAAATGGTCAAAAATACTAACAGTAT
ATATGTCTTATGAATAAATACAAAATATAGATCAAAGCAGTTACACCAAA
AGAAACATGATATTAACTGTTTGTGTTGAAAAGAATTGGAAATAATGACC
AAATGTTTTTAACATTTCCCCAATTTAGGGTGGTGGTGTACGTTTCACAA
GATACAATTGTTCAGTGAAGGGAGCAAAAGTGGGATGGGCATTGATACAT
CCTGGACGATTAACCCACCAACATGAAGGGTTACCAACCACTAAAGGTGT
TCGTTATGTCATGATCTCATTTGTTGACCCTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:28757..34540- >XLOC_034215 ID=XLOC_034215|Name=XLOC_034215|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:28757..34540- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATTGACATACAAAGGACCAAAAAGTTTCATAACACCTGATGATGC
AAGGACTTTGGGAATGCAACAATGTAAAACAATTTATTGTGACTACTACT
TTAGTTTGGATAGTGAAGTCACGTTGTCAAATCCTAAAACACTTCAGCTG
TTGATTGAACAAAATAGATGTCATTGACATACAAAGGACCAAAAAGTTTC
ATAACACCTGATGATGCAAGGACTTTGGGAATGCAACAATGTAAAACAAT
TTATTGTGACTACTACTTTAGTTTGGATAGTGAAGTCACGTTGTCAAATC
CTAAAACACTTCAGCTGTTGATTGAACAAAATAGGACGTTCATAACACCT
ATTCTGAGTCAAAGAGGGAAGCTCTTTTCGAATTTCTGGGGAGCTATCGA
AAATAACGGATACTATGCCAGGGCACCTGACTATTTAAGCATCGTTCGAG
GTGAACGCGTAGGAGTGTGGAACTCACCTTACGTCACAAGTTGTTATTTG
ATTCGACGAGAGAAATTATCGGATATGGTTCATGACCCGTTTTATGCACC
CGGCGAAGATTTTGACATGATTTTTGCAGCCAATAATCGGAAAAAGGACG
TTCATAACACCTATTCTGAGTCAAAGAGGGAAGCTCTTTTCGAATTTCTG
GGGAGCTATCGAAAATAACGGATACTATGCCAGGGCACCTGACTATTTAA
GCATCGTTCGAGGTGAACGCGTAGGAGTGTGGAACTCACCTTACGTCACA
AGTTGTTATTTGATTCGACGAGAGAAATTATCGGATATGGTTCATGACCC
GTTTTATGCACCCGGCGAAGATTTTGACATGATTTTTGCAGCCAATAATC
GGAAAAAGGGTATCTTTATGTATGCAACGAATATTCATGAATTCGGACAT
TTGAAGAAAACAGATACATATTCGACAACAAAGAAGAATGGGGATCTGTA
CCAGCTCTTCGATAACCAATGGGGTATCTTTATGTATGCAACGAATATTC
ATGAATTCGGACATTTGAAGAAAACAGATACATATTCGACAACAAAGAAG
AATGGGGATCTGTACCAGCTCTTCGATAACCAATGGGATTGGGAAAGAAA
CTACCTCCACAAAGACTACCATAGATATTTGAAACCTAATATCAAGAAGA
TAGAGGATTGGGAAAGAAACTACCTCCACAAAGACTACCATAGATATTTG
AAACCTAATATCAAGAAGATAGAGCCATGTCCTGATGTGTATACATTTCC
ATTCGTCAATGAAAGGTGGACTAAACAAATAATACAACCATGTCCTGATG
TGTATACATTTCCATTCGTCAATGAAAGGTGGACTAAACAAATAATACAA
GAATGTGAAGCTTTTGGAAAATGGTCTGATGGGAAAAAAAAGGAATGTGA
AGCTTTTGGAAAATGGTCTGATGGGAAAAAAAAGGATAAACGTGTTGCAG
GAGGATATGAGAATGTTCCAACCGTCGATATCCACATGAACCAGGATAAA
CGTGTTGCAGGAGGATATGAGAATGTTCCAACCGTCGATATCCACATGAA
CCAGATTGGTTATGAGAAGCATTGGTTGCAGATGTTGAAATTGTACATAA
AACGCATTGTGGAAAACTTCTATACAGGTTACAGGCCAAAAATTGGTTAT
GAGAAGCATTGGTTGCAGATGTTGAAATTGTACATAAAACGCATTGTGGA
AAACTTCTATACAGGTTACAGGCCAAAATGTGTGGCAAATATGAATTTTG
TAGTCAAATACATAACAGAAGGTCAGAATTCGTTACCAGCACACCACGAC
ACTTCTACCTTCACCATCAACCTCGCTTTGAACAATCAAAAGACAGACTA
TGAGTGTGTGGCAAATATGAATTTTGTAGTCAAATACATAACAGAAGGTC
AGAATTCGTTACCAGCACACCACGACACTTCTACCTTCACCATCAACCTC
GCTTTGAACAATCAAAAGACAGACTATGAGGGTGGTGGTGTACGTTTCAC
AAGATACAATTGTTCAGTGAAGGGAGCAAAAGTGGGATGGGCATTGATAC
ATCCTGGACGATTAACCCACCAACATGAAGGGTTACCAACCACTAAAGGT
GTTCGTTATGTCATGATCTCATTTGTTGACCCTTAGGGTGGTGGTGTACG
TTTCACAAGATACAATTGTTCAGTGAAGGGAGCAAAAGTGGGATGGGCAT
TGATACATCCTGGACGATTAACCCACCAACATGAAGGGTTACCAACCACT
AAAGGTGTTCGTTATGTCATGATCTCATTTGTTGACCCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000020_pilon | genome | sc0000020_pilon:28757..34540 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 991-1146:157 |
| Aaloc | 865-990:629 |
| Aaloc | 778-864:1167 |
| Aaloc | 718-777:1657 |
| Aaloc | 676-717:2515 |
| Aaloc | 613-675:2969 |
| Aaloc | 544-612:3402 |
| Aaloc | 430-543:4572 |
| Aaloc | 169-429:5323 |
| Aaloc | 1-165:5785 |
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