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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_022545 ID=XLOC_022545|Name=XLOC_022545|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4535bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTTTTGGTTGTAATTTGCTTTGCCATTTTCTTGATACCTAACATTGG
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tttcttaaccctttaagtgccacagtcatttttaaagaaaatcgctattt
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CTGTACCGCTAGTTGCTATGGTGACAGATCCTAAGGATGGAGGACATTGG
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TGATGAACCAAAACTTTTTTATCCAACTATCAAATTTTGATAGGTTTTAT
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TTACATGAAAATTGACCATATCAGTAAAGTCACAATTGTCAATACCTCTG
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TGCAGGTATGTCTGTAAATGGTGATGGAAAGTTGGTTTTAAAGAATTGTA
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GATAACGATGATAGCCATCAGATAGCTGACAAAAGTTATGAAGGCACAAG
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CTATTCAACTTCTACCAAATCAAACTTCTGATCACCATTGAGAAGCCTTC
GAGACACCTGCATCAGAAGTATGAATGGATTCGACAAATCTTACCGACAG
TTTTCAATCTTCGAGTCACTATCGAGGATTTCTCTACATCGTTCTGTTTT
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TCTTGCTCGAATCGTTTTTATCGGGTACACAAATATCGTGACCTTTTTGA
TGGCGATGACGTCATGGGCGCATGTAAAAGACGATGAACTGGTCCTTCTC
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ATTCTTGGTTTTATGGGCTGCTCCTTTCCCGTTCAACGTTTATTTCACCA
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TTCTTGTTTCCACCGTTATCATTGTTGCTATGTAAACAAGCAGACGATGA
AACACAAATCGATGAGCCAAAAGCTCCTTATTTATTGTCCATGTACGAAG
CGCCGTTTCGAGCAAAAGAGAGTAAAGAGGATAAAAGAATTTTGCTCTGG
GACGGTGTTATTGCATTTCGCCGCTTCCTAATAGCTGGAGTATGTGTCTG
TACATGATTATATATTCCGTATGGTTACAGTCTCTCCCATAATGCTCATT
CTTTTGTATCCATATAATTGCTCGAGTCACCTTACAAACAAAATGGAGAA
CCATCTTGTGGACCTGTATCttttttttACTCTCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+ >XLOC_022545 ID=XLOC_022545|Name=XLOC_022545|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6798bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTTTTGGTTGTAATTTGCTTTGCCATTTTCTTGATACCTAACATTGG CTGTACGACAACTTGTTCAGATGTTTTTGGTTGTAATTTGCTTTGCCATT TTCTTGATACCTAACATTGGCTGTACGACAACTTGTTCAGATCTGTCCAA TACATCTATCAACAAGACTGTATACTTATCAAAATATGGAAAAGATATAG ATGGATGTGGAAAAAATGAAAGTCATCCATGTCATACACTGGCCTATGTA TTCCACCACAGTTACGACAACGATACCAATTTGAGAGTGTTACTGGTTGG TGGGGAAACAGAACCGTATGATTATTCGGCGCAGAACTTCTACATCAAAG ATAAAATAACAACTTTATCTTTAGAGCCAACCCCTGGTTCAAAACGTCGA CCCAAGATAATCAACAAGGGCCAAATTACTGAAACTTTATTTGGATTTCC ACATCCACCCTGTTTATACATCGATAACATTGATTTTGAGTATCTGACAA TGGTTAAATGTTCTGGCTCATCCAACAAAACTGGTGAAATATCAATCAGT AATTCCAAATGGAGTAAAGTTCAAGGAGACCGCAATATGAACAATATCAT TTCTGAGTGGAGCGAAAGGTGAAGTGAATTATTCCATCAACGTGAAATTA ACCGATGTCTTGTTAGACAGTGACGCTATGACGGCTGTACCGCTAGTTGC TATGGTGACAGATCCTAAGGATGGAGGACATTGGGATATTACGGTGTTAA GAACTGAGTTTTCCTGTGTTGGGTTATTTATGAAGCTCAACAATGGCTCA TTTCAACTCATTGACTCTTCAGTAACTGGTACGGTGATGAACCAAAACTT TTTTATCCAACTATCAAATTTTGATAGGTTTTATGCTAAAAATATGACGT GTGGTGATGATGTATGCTCATCTGGAAATTGGGGTTACATGAAAATTGAC CATATCAGTAAAGTCACAATTGTCAATACCTCTGAGCcatttatatataa tataaactCAAACGTAATTCAAGTGACCAATGTTGACTATTTGAATGTCT CTAATAATAATTTCTCAAGATTATATTCCTACTCTGGAGTCCTTGTATTT TCTGacattcaaaatttgatttttaatcgaAACACTATAACATCAATGAC GAAGTTTACGTATAATAATGGTGCGTTTTTATGGTTAAAGAGAATCAACC ACACTTTGATGGACTTTACAACTTTCGACAATGTTCAAGCACCTACTATC AAGTGCACTGATTGCAACGCGTTCAATATGTATAAGACAAATTTTACCAG TTCTTACTGTCCTATCAACATTGTTGGCTTTCAAAATATTAACGTAGACT CGTGTCATTTTTTCAACAATACTGCAGGTCGTGGTGCAGGTATGTCTGTA AATGGTGATGGAAAGTTGGTTTTAAAGAATTGTAATTTTACCGAGAACAA AGCACTCTTTATGGAAAGTTATTATAACTCTGGTTTTCAAGCAGGAGCTA TTGATAGCGTCGATGCTAATATTGACATCAGTAATTCTGTTTTCCTATAC AATAACGCTGAAACAAGTGGCACTTTTCGTATTACAGGGGATCACTTTAA AACAGTGCGTTTGTCTAACGTAAATATTACGACGCCAGATAAAGATATAC CCAAATTTGCCACCGCTTTCGAGATAAACGGACCAAATCTTATAACAAAA GGTTTAAAGGTGGTGATTCAAGCATCAAAGGGTGACATTGATATTTTCAC GACGCATTTCAACAAATCATTATCTGAACTGATGTTCCAATGCCCTAAGA ACGCACAAGTCAACAATGCGGAGGAGAtttttttCAGTTGTAAACATTGC CAAAAAGACAAATACACAGAACAGGCTGGATCTTTACATTATCACATGCA TAACAATACCATGCCGTACCGTATTTCAGAGTCATTCAAATGTCATGCAT GTCCTTACGGGGGTCAATGCACAGGAATGGAACAATTATCCAGTCGACCG AACTTTTGGGGTTTTGTGCAAAACGAAATCGTCAAATTCATTCAGTGTAA GTCAGGTTACTGTTGTGGAGTAGGTGACAAATGTGCCGGTATCGATAGCT GTGCTAATGGACGAACTGGTCCGATTTGCGGCCAATGTCATGAAAACCAT TACGTAAACTTCTTTGACAGTAAATGTATACCAAATGAAGAATGTActca tcaaattttgacatgggTGATCTTTAGTGTAGCTGCAGTTTTAGTGTTTC TTGTTGTCGCCTATTTTCAAGACCCATGGAGTTTGTTCCCTTGCTGCAAA CTGTATATTTGTAAgacttgtaaaaatattgactcTGATACTCATGAAGG AGCAGAAAGAGAATCTTTATTGACCCCTTTACTCGATAACGATGATAGCC ATCAGATAGCTGACAAAAGTTATGAAGGCACAAGCGATGCTAGAAATAAC AAAGTCAACAAGAAACATGAACGGGATCATCATAGTAGCAATAAACCAAA GCAAACAACAGTCATTTTCGGCTTCATCAAAATCCTATTCAACTTCTACC AAATCAAACTTCTGATCACCATTGAGAAGCCTTCGAGACACCTGCATCAG AAGTATGAATGGATTCGACAAATCTTACCGACAGTTTTCAATCTTCGAGT CACTATCGAGGATTTCTCTACATCGTTCTGTTTTCTACTTGGCATGGATG ACATTTGGAAACTCTTCATCCGATATGTTCTTCTGTTCCTTGTTTTGATC GTTCTCGCAGTCCTTGCTATACTTGCTTACCATGgattcaactttttgtt ttatcGTGAAAAGAAAACTAGAACACCAGAAGTCGACTTACCCCCGGATG ACACTTTCACTTTTGATATTCGCTGCAAAATATTTCTTGCTCGAATCGTT TTTATCGGGTACACAAATATCGTGACCTTTTTGATGGCGATGACGTCATG GGCGCATGTAAAAGACGATGAACTGGTCCTTCTCGTCAAAGGAGACACTG GATATTTCAACGCTTGGACTATAACTTGTATGGTATTCTTGGTTTTATGG GCTGCTCCTTTCCCGTTCAACGTTTATTTCACCACACGCTGGCTTCAAAA CAAAGATATCACAATCAACAAGTTTATAATCTGCTTCTTGTTTCCACCGT TATCATTGTTGCTATGTAAACAAGCAGACGATGAAACACAAATCGATGAG CCAAAAGCTCCTTATTTATTGTCCATGTACGAAGCGCCGTTTCGAGCAAA AGAGAGTAAAGAGGATAAAAGAATTTTGCTCTGGGACGGTGTTATTGCAT TTCGCCGCTTCCTAATAGCTGGAGTATGTGTCTGTACATGATTATATATT CCGTATGGTTACAGTCTCTCCCATAATGCTCATTCTTTTGTATCCATATA ATTGCTCGAGTCACCTTACAAACAAAATGGAGAACCATCTTGTGGACCTG TATCttttttttACTCTCAATCTGTCCAATACATCTATCAACAAGACTGT ATACTTATCAAAATATGGAAAAGATATAGATGGATGTGGAAAAAATGAAA GTCATCCATGTCATACACTGGCCTATGTATTCCACCACAGTTACGACAAC GATACCAATTTGAGAGTGTTACTGGTTGGTGGGGAAACAGAACCGTATGA TTATTCGGCGCAGAACTTCTACATCAAAGATAAAATAACAACTTTATCTT TAGAGCCAACCCCTGGTTCAAAACGTCGACCCAAGATAATCAACAAGGGC CAAATTACTGAAACTTTATTTGGATTTCCACATCCACCCTGTTTATACAT CGATAACATTGATTTTGAGTATCTGACAATGGTTAAATGTTCTGGCTCAT CCAACAAAACTGGTGAAATATCAATCAGTAATTCCAAATGGAGTAAAGTT CAAGGAGACCGCAATATGAACAATATCATTTCTGAGTGGAGCGAAAGGTG AAGTGAATTATTCCATCAACGTGAAATTAACCGATGTCTTGTTAGACAGT GACGCTATGACGGCTGTACCGCTAGTTGCTATGGTGACAGATCCTAAGGA TGGAGGACATTGGGATATTACGGTGTTAAGAACTGAGTTTTCCTGTGTTG GGTTATTTATGAAGCTCAACAATGGCTCATTTCAACTCATTGACTCTTCA GTAACTGGTACGGTGATGAACCAAAACTTTTTTATCCAACTATCAAATTT TGATAGGTTTTATGCTAAAAATATGACGTGTGGTGATGATGTATGCTCAT CTGGAAATTGGGGTTACATGAAAATTGACCATATCAGTAAAGTCACAATT GTCAATACCTCTGAGCcatttatatataatataaactCAAACGTAATTCA AGTGACCAATGTTGACTATTTGAATGTCTCTAATAATAATTTCTCAAGAT TATATTCCTACTCTGGAGTCCTTGTATTTTCTGacattcaaaatttgatt tttaatcgaAACACTATAACATCAATGACGAAGTTTACGTATAATAATGG TGCGTTTTTATGGTTAAAGAGAATCAACCACACTTTGATGGACTTTACAA CTTTCGACAATGTTCAAGCACCTACTATCAAGTGCACTGATTGCAACGCG TTCAATATGTATAAGACAAATTTTACCAGTTCTTACTGTCCTATCAACAT TGTTGGCTTTCAAAATATTAACGTAGACTCGTGTCATTTTTTCAACAATA CTGCAGGTCGTGGTGCAGGTATGTCTGTAAATGGTGATGGAAAGTTGGTT TTAAAGAATTGTAATTTTACCGAGAACAAAGCACTCTTTATGGAAAGTTA TTATAACTCTGGTTTTCAAGCAGGAGCTATTGATAGCGTCGATGCTAATA TTGACATCAGTAATTCTGTTTTCCTATACAATAACGCTGAAACAAGTGGC ACTTTTCGTATTACAGGGGATCACTTTAAAACAGTGCGTTTGTCTAACGT AAATATTACGACGCCAGATAAAGATATACCCAAATTTGCCACCGCTTTCG AGATAAACGGACCAAATCTTATAACAAAAGGTTTAAAGGTGGTGATTCAA GCATCAAAGGGTGACATTGATATTTTCACGACGCATTTCAACAAATCATT ATCTGAACTGATGTTCCAATGCCCTAAGAACGCACAAGTCAACAATGCGG AGGAGAtttttttCAGTTGTAAACATTGCCAAAAAGACAAATACACAGAA CAGGCTGGATCTTTACATTATCACATGCATAACAATACCATGCCGTACCG TATTTCAGAGTCATTCAAATGTCATGCATGTCCTTACGGGGGTCAATGCA CAGGAATGGAACAATTATCCAGTCGACCGAACTTTTGGGGTTTTGTGCAA AACGAAATCGTCAAATTCATTCAGTGTAAGTCAGGTTACTGTTGTGGAGT AGGTGACAAATGTGCCGGTATCGATAGCTGTGCTAATGGACGAACTGGTC CGATTTGCGGCCAATGTCATGAAAACCATTACGTAAACTTCTTTGACAGT AAATGTATACCAAATGAAGAATGTActcatcaaattttgacatgggTGAT CTTTAGTGTAGCTGCAGTTTTAGTGTTTCTTGTTGTCGCCTATTTTCAAG ACCCATGGAGTTTGTTCCCTTGCTGCAAACTGTATATTTGTAAgacttgt aaaaatattgactcTGATACTCATGAAGGAGCAGAAAGAGAATCTTTATT GACCCCTTTACTCGATAACGATGATAGCCATCAGATAGCTGACAAAAGTT ATGAAGGCACAAGCGATGCTAGAAATAACAAAGTCAACAAGAAACATGAA CGGGATCATCATAGTAGCAATAAACCAAAGCAAACAACAGTCATTTTCGG CTTCATCAAAATCCTATTCAACTTCTACCAAATCAAACTTCTGATCACCA TTGAGAAGCCTTCGAGACACCTGCATCAGAAGTATGAATGGATTCGACAA ATCTTACCGACAGTTTTCAATCTTCGAGTCACTATCGAGGATTTCTCTAC ATCGTTCTGTTTTCTACTTGGCATGGATGACATTTGGAAACTCTTCATCC GATATGTTCTTCTGTTCCTTGTTTTGATCGTTCTCGCAGTCCTTGCTATA CTTGCTTACCATGgattcaactttttgttttatcGTGAAAAGAAAACTAG AACACCAGAAGTCGACTTACCCCCGGATGACACTTTCACTTTTGATATTC GCTGCAAAATATTTCTTGCTCGAATCGTTTTTATCGGGTACACAAATATC GTGACCTTTTTGATGGCGATGACGTCATGGGCGCATGTAAAAGACGATGA ACTGGTCCTTCTCGTCAAAGGAGACACTGGATATTTCAACGCTTGGACTA TAACTTGTATGGTATTCTTGGTTTTATGGGCTGCTCCTTTCCCGTTCAAC GTTTATTTCACCACACGCTGGCTTCAAAACAAAGATATCACAATCAACAA GTTTATAATCTGCTTCTTGTTTCCACCGTTATCATTGTTGCTATGTAAAC AAGCAGACGATGAAACACAAATCGATGAGCCAAAAGCTCCTTATTTATTG TCCATGTACGAAGCGCCGTTTCGAGCAAAAGAGAGTAAAGAGGATAAAAG AATTTTGCTCTGGGACGGTGTTATTGCATTTCGCCGCTTCCTAATAGCTG GAGTATGTGTCTGTACATGATTATATATTCCGTATGGTTACAGTCTCTCC CATAATGCTCATTCTTTTGTATCCATATAATTGCTCGAGTCACCTTACAA ACAAAATGGAGAACCATCTTGTGGACCTGTATCttttttttACTCTCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000228_pilon | genome | sc0000228_pilon:74957..79491 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 3316-3399:4452 |
| Aaloc | 3265-3315:4400 |
| Aaloc | 520-3261:1657 |
| Aaloc | 73-519:1209 |
| Aaloc | 1-69:1 |
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