XLOC_022545 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_022545
Unique NameXLOC_022545
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_022545 ID=XLOC_022545|Name=XLOC_022545|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4535bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTTGGTTGTAATTTGCTTTGCCATTTTCTTGATACCTAACATTGG CTGTACGACAACTTGTTCAGGTATGGTAATCAGTTCTTTATTTACGACCg tttcttaaccctttaagtgccacagtcatttttaaagaaaatcgctattt caaactttgaaggcttatatctccagatctagaaggagttaaaagcttgt tcatagctcgttggatagcttagagtctcatctttcttttaggcgccttT GGCGGAAAATTGAAGCATCCAGCGTGCAGCAGcacggacctgcctgaatg ataaaaagttgcccagtggtaaaacttcaaattaattcgctggaggacag aatcaagtaaagcaaggtcaaatttggaggttcttggatcactagttgac caaaaatggtcaaaaaacgatcaaaatctgaaaaaagtagatttttgtca aatctttgcattttttttgactttttggcttaaaatctcgctggaaagac ttacttttgattgtttttttgcttgataatggAGCCCAATTCAATTCCTA CAAGtcagaccaaaaatgacgatttctaactcaaactgggcattacagga gggctttaccctcctacatagcccatgtttgatatatacgacattgccac ttaaagggttaattacGGAGAAAGATTTTAgcatcaaattttgaattaat aAACAATTTCCTTTTTCATGGATTAAACCAAGAATTAAACTTCAAAAAGA AgcatttttaataagaacaagtaAACTTGAGGCTTGGTTTCTTTATATTT TCCGTGATTCCAATGTTCTTAAACTGTTCTTGATACATACATACTTTCCA TACTTTATTCACTTGATTTAAAAGAGGCTTAAACCTCCACTATTGTGTGA GTCCATTCTGATTATGAAACTGAAACttggataattttttatttcttcaa aatCTTGTCAAATTTATATACGGCTTGATAACATTTCTGCGGGCCGGACA ACTATTCCGCCGGCTGTAGAACTATTTGGACAGCCAAATTTCAGGTGGAT TCTGACCCTGACCTTTTACCCTGAtactgttcttatgaaattattcttgt gaaaaattttgtaatgagacaggggtgagttATGATTGTAATTCAAGAAC ACGTCTTGAatgtgtatttttttatttgaaaatatctttagTCATTCTTT TTTCAGATCTGTCCAATACATCTATCAACAAGACTGTATACTTATCAAAA TATGGAAAAGATATAGATGGATGTGGAAAAAATGAAAGTCATCCATGTCA TACACTGGCCTATGTATTCCACCACAGTTACGACAACGATACCAATTTGA GAGTGTTACTGGTTGGTGGGGAAACAGAACCGTATGATTATTCGGCGCAG AACTTCTACATCAAAGATAAAATAACAACTTTATCTTTAGAGCCAACCCC TGGTTCAAAACGTCGACCCAAGATAATCAACAAGGGCCAAATTACTGAAA CTTTATTTGGATTTCCACATCCACCCTGTTTATACATCGATAACATTGAT TTTGAGTATCTGACAATGGTTAAATGTTCTGGCTCATCCAACAAAACTGG TGAAATATCAATCAGTAATTCCAAATGGAGTAAAGTTCAAGGAGACCGCA ATATGAACAATATCATTTCTGAGTGGAGCGAAAGGTGAAGTGAATTATTC CATCAACGTGAAATTAACCGATGTCTTGTTAGACAGTGACGCTATGACGG CTGTACCGCTAGTTGCTATGGTGACAGATCCTAAGGATGGAGGACATTGG GATATTACGGTGTTAAGAACTGAGTTTTCCTGTGTTGGGTTATTTATGAA GCTCAACAATGGCTCATTTCAACTCATTGACTCTTCAGTAACTGGTACGG TGATGAACCAAAACTTTTTTATCCAACTATCAAATTTTGATAGGTTTTAT GCTAAAAATATGACGTGTGGTGATGATGTATGCTCATCTGGAAATTGGGG TTACATGAAAATTGACCATATCAGTAAAGTCACAATTGTCAATACCTCTG AGCcatttatatataatataaactCAAACGTAATTCAAGTGACCAATGTT GACTATTTGAATGTCTCTAATAATAATTTCTCAAGATTATATTCCTACTC TGGAGTCCTTGTATTTTCTGacattcaaaatttgatttttaatcgaAACA CTATAACATCAATGACGAAGTTTACGTATAATAATGGTGCGTTTTTATGG TTAAAGAGAATCAACCACACTTTGATGGACTTTACAACTTTCGACAATGT TCAAGCACCTACTATCAAGTGCACTGATTGCAACGCGTTCAATATGTATA AGACAAATTTTACCAGTTCTTACTGTCCTATCAACATTGTTGGCTTTCAA AATATTAACGTAGACTCGTGTCATTTTTTCAACAATACTGCAGGTCGTGG TGCAGGTATGTCTGTAAATGGTGATGGAAAGTTGGTTTTAAAGAATTGTA ATTTTACCGAGAACAAAGCACTCTTTATGGAAAGTTATTATAACTCTGGT TTTCAAGCAGGAGCTATTGATAGCGTCGATGCTAATATTGACATCAGTAA TTCTGTTTTCCTATACAATAACGCTGAAACAAGTGGCACTTTTCGTATTA CAGGGGATCACTTTAAAACAGTGCGTTTGTCTAACGTAAATATTACGACG CCAGATAAAGATATACCCAAATTTGCCACCGCTTTCGAGATAAACGGACC AAATCTTATAACAAAAGGTTTAAAGGTGGTGATTCAAGCATCAAAGGGTG ACATTGATATTTTCACGACGCATTTCAACAAATCATTATCTGAACTGATG TTCCAATGCCCTAAGAACGCACAAGTCAACAATGCGGAGGAGAttttttt CAGTTGTAAACATTGCCAAAAAGACAAATACACAGAACAGGCTGGATCTT TACATTATCACATGCATAACAATACCATGCCGTACCGTATTTCAGAGTCA TTCAAATGTCATGCATGTCCTTACGGGGGTCAATGCACAGGAATGGAACA ATTATCCAGTCGACCGAACTTTTGGGGTTTTGTGCAAAACGAAATCGTCA AATTCATTCAGTGTAAGTCAGGTTACTGTTGTGGAGTAGGTGACAAATGT GCCGGTATCGATAGCTGTGCTAATGGACGAACTGGTCCGATTTGCGGCCA ATGTCATGAAAACCATTACGTAAACTTCTTTGACAGTAAATGTATACCAA ATGAAGAATGTActcatcaaattttgacatgggTGATCTTTAGTGTAGCT GCAGTTTTAGTGTTTCTTGTTGTCGCCTATTTTCAAGACCCATGGAGTTT GTTCCCTTGCTGCAAACTGTATATTTGTAAgacttgtaaaaatattgact cTGATACTCATGAAGGAGCAGAAAGAGAATCTTTATTGACCCCTTTACTC GATAACGATGATAGCCATCAGATAGCTGACAAAAGTTATGAAGGCACAAG CGATGCTAGAAATAACAAAGTCAACAAGAAACATGAACGGGATCATCATA GTAGCAATAAACCAAAGCAAACAACAGTCATTTTCGGCTTCATCAAAATC CTATTCAACTTCTACCAAATCAAACTTCTGATCACCATTGAGAAGCCTTC GAGACACCTGCATCAGAAGTATGAATGGATTCGACAAATCTTACCGACAG TTTTCAATCTTCGAGTCACTATCGAGGATTTCTCTACATCGTTCTGTTTT CTACTTGGCATGGATGACATTTGGAAACTCTTCATCCGATATGTTCTTCT GTTCCTTGTTTTGATCGTTCTCGCAGTCCTTGCTATACTTGCTTACCATG gattcaactttttgttttatcGTGAAAAGAAAACTAGAACACCAGAAGTC GACTTACCCCCGGATGACACTTTCACTTTTGATATTCGCTGCAAAATATT TCTTGCTCGAATCGTTTTTATCGGGTACACAAATATCGTGACCTTTTTGA TGGCGATGACGTCATGGGCGCATGTAAAAGACGATGAACTGGTCCTTCTC GTCAAAGGAGACACTGGATATTTCAACGCTTGGACTATAACTTGTATGGT ATTCTTGGTTTTATGGGCTGCTCCTTTCCCGTTCAACGTTTATTTCACCA CACGCTGGCTTCAAAACAAAGATATCACAATCAACAAGTTTATAATCTGC TTCTTGTTTCCACCGTTATCATTGTTGCTATGTAAACAAGCAGACGATGA AACACAAATCGATGAGCCAAAAGCTCCTTATTTATTGTCCATGTACGAAG CGCCGTTTCGAGCAAAAGAGAGTAAAGAGGATAAAAGAATTTTGCTCTGG GACGGTGTTATTGCATTTCGCCGCTTCCTAATAGCTGGAGTATGTGTCTG TACATGATTATATATTCCGTATGGTTACAGTCTCTCCCATAATGCTCATT CTTTTGTATCCATATAATTGCTCGAGTCACCTTACAAACAAAATGGAGAA CCATCTTGTGGACCTGTATCttttttttACTCTCA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+

>XLOC_022545 ID=XLOC_022545|Name=XLOC_022545|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6798bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:74957..79491+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTTGGTTGTAATTTGCTTTGCCATTTTCTTGATACCTAACATTGG
CTGTACGACAACTTGTTCAGATGTTTTTGGTTGTAATTTGCTTTGCCATT
TTCTTGATACCTAACATTGGCTGTACGACAACTTGTTCAGATCTGTCCAA
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ACACTTTCACTTTTGATATTCGCTGCAAAATATTTCTTGCTCGAATCGTT
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GTTTATAATCTGCTTCTTGTTTCCACCGTTATCATTGTTGCTATGTAAAC
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AATTTTGCTCTGGGACGGTGTTATTGCATTTCGCCGCTTCCTAATAGCTG
GAGTATGTGTCTGTACATGATTATATATTCCGTATGGTTACAGTCTCTCC
CATAATGCTCATTCTTTTGTATCCATATAATTGCTCGAGTCACCTTACAA
ACAAAATGGAGAACCATCTTGTGGACCTGTATCttttttttACTCTCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_022545XLOC_022545-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000228_pilongenomesc0000228_pilon:74957..79491 +
Properties
Property NameValue
Aaloc3316-3399:4452
Aaloc3265-3315:4400
Aaloc520-3261:1657
Aaloc73-519:1209
Aaloc1-69:1