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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000053_pilon:1634111..1639828+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038153 ID=XLOC_038153|Name=XLOC_038153|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5718bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000053_pilon:1634111..1639828+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGGCGTGAATTGGAGTTGGATGTGATTATCAAACAGCTTCTTGATGT
CCAAAAAACTCAACGACAGGTGAACACGTTTTCATTACTTTTCTATTTAC
ATTGAAGGCTCACTTCAAGAGTGCTCTAACAAATGGGGGACATAACATAA
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TTTTGTGAGTTTGGGAACTAacaatttgacaattttttttaactcgaaag
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ATGACGAGTGCAAGCGTAGATACAACATCAAGCTATGGAAGACGTTTACT
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TCACTTATGGTTATTTCTACGGGGGTAGGGATTAGACAGCAgcttttata
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TTACTCCGATgcttccttaactcgaacaagttagTTGTTTTAATTAACAA
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ATTTGCATTTCCCGTGGGTGTTAGACTCCACCGTATTTTTAATTAATCAT
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TTTCACAATTGTGCATAACTCtcaaattgtctttttaataGCCGGCGTTG
TCGAAAACACTATATTTTGTGTCCACGGAGGACTTTCACCTGACTTCCAG
CATCTCGACCAggtattttgatttgtttttattacaCAAGGATTTCTCGT
AGCTAAAGGCTAAAACaggattacacgtttttttttataaaaacaaaata
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TCTgcttttccttgaaaaattttGCAGTAGCTCCGTTTGACGTTAGGCAA
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CATTTGATCAAGTCAGCTTAGAGttgagagaaaaaaagtttgatttgcTT
GCATAGTTGGTGTTAcgcactggcggatttaagacaatagagcaattACG
TTGGAAACATGCAAAGTAGTgtaacgctcgttaaaagacaatgaaattac
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TGGTTACGATCATACGATGGAGCAATGGTGATGCTTCCATTTTGACGATT
GCTTAGATCAACCATCGTGTTTTCAGATATCTTAACATAATATTCCTTTC
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ATCCCTGATTTTGGATTAATGAACGATCTACTATGGTCAGACCCTGACGA
GGTAACCTTTCCCTTTTCTtacttctttcaatttattttatAACGAGCAT
GTCCATGAAAGAATTTGTAAAGTACTGTTGCGAAGAAGGTATTTTCGAGT
TCATGCACGTGTAtttttttCTGAGACAGAGACGGTAAACTTGAATTTGT
TTAGATGGGCTGTTTCGTTAACTTTCTTGCCACTTTTTTAAGCCCTAAAG
GTTATTTGGAAATATGGTTATTATTTGGAAATAATGCCCTTGCAACAGGT
ATGAAATTCGGTTGCTAAggaaaaaatacaataacagGGTTCACaaaaaa
aCCTTACACCTCAAAAATATTAATGCTAcagctttgaaattttcagaacc
tTTAGAGCTTAAAAGAGTGGCTAGAAAGTTAACGAAACAGCCCATCTAAA
CAAATTAAAGTTTATTTGCAACAAGTCATACAACAAGTGTCTGCcacttg
gtcaggctcgtgtatgcaaGTTTTCAAAGTATCCAggcatagcttatgct
tattatatgcttatgaatcaccCCGAGCCAAGCTTTTAGTGGAATTTCAG
AAatcttgtaaaaatttgttcaaatttttggagcagtggaatgtaggaaa
tcgtggaatgtctttttttttacttgacctcaaccaaacctttttaaaca
gataaaaaatgacaccTTAAAAAATTCAGGCTGACATAATATATgattat
gttatgcttaggaattctgcaaatctgaccgttcatatgcttataagtgt
tatgcttataaaaaacatgtaccaaATAAAAGCTCTTTTTTACCGGATTT
CTGAGCGTCTCGTAAAGAAACCTAATAAGGTTGCTGAAAGATTCTGATTC
TGATTTCAGGATATCACAGGATGGGGTGAGAACGATCGTGGAGTGTCATG
GACTTTTGGTGGTGATATTGTTAATTCTTTCCTCAAGAAGAACAATTTCA
GTTTAGTCGCAAGAGCTCATCAAGTTATCGAAGATGGCTACCAATTCTTT
CAAAAACGAAAAGTATGCAATCTTTGATTGTAGATTCTCTTCCTAACTTC
ACTCTCTAGTGTTATTAATTTTCTCGGTTTAATTTTCTTGCGAAGGTCTC
ATATTGCTCTGAATAAAAACGGATTTTGCTGCGCAGAAAATCCTCTTAGG
TTCTTTCAATGATTCTTGATATTTAGCTGTGCTATATTTTGGTGACATCC
AAGCTAAAGCCATTCAATGAATTTGGATAACAGGATAATTCTATCAAAGT
TAATGATGAGTCAtttttttCGTTCACAGCTTGTCACGTTGTTTAGTGCG
CCGAATTATTGCGGTGAATTTGATAACGCTGGAGCGACAATGTTCGTGTC
AGATGAGCTAGTTTGTTCTTTCAGTATTTTAAAGGTAAGAAgtcattatg
ttttttttcagaaaatttcgcgatttttttggTTCGCGGAAATGtctcac
gaaatttaatccgattaaagtctTGCCCGATTGaattttctgttcttata
agtaATAGCAGTAGAGAATACAGCCttagttttttgaaagaaagaagttt
taGAAAATCTCCACCATGAGTTTTCGGAAAAGCAAATATTTCGTTCATTC
TGTTCaacttaaattttttgaataagtATTTGATCCCATCAAATAATCAA
GAGTCTAAGCGTATCATCACTCAAATCCTTCCTGGTAGAAAGGGGAAGCA
TGTATCCCAAATCATACTATACAGATTTATGATCTTATGTCTTTGgtagt
agcgtggtggcaggagGTTATCCCCGCCAAATGGCCAATTTCTCTTACTG
AAAGGCATTGGTATATCTAACGGGCACCTTGATTTTGCCGTCCAAGAGGT
TAAATTAAGAAATTTGTCTCTCGAGTTCACTCCGACCTTTGGACTACTTG
TCTTGGCTAGTTAAACGTAGGCTTTGGTTAAATTCAAGATTCTATTTTTT
CTTTGCAGCCTAAAAGTATGGCTGAACTGGAAGCACAActcgaaaacaaa
aacaaaaagaagaagtga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000053_pilon:1634111..1639828+ >XLOC_038153 ID=XLOC_038153|Name=XLOC_038153|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1818bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000053_pilon:1634111..1639828+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGGCGTGAATTGGAGTTGGATGTGATTATCAAACAGCTTCTTGATGT
CCAAAAAACTCAACGACAGATGGGGCGTGAATTGGAGTTGGATGTGATTA
TCAAACAGCTTCTTGATGTCCAAAAAACTCAACGACAGGCCGCTATTACT
GAAACCAACATCCGTCTGCTATGTATGAAAGCACGTGAAGTATTTCTGGA
GGAAAGCAACCTGACAGAGGTTCAAGCCGCTATTACTGAAACCAACATCC
GTCTGCTATGTATGAAAGCACGTGAAGTATTTCTGGAGGAAAGCAACCTG
ACAGAGGTTCAATTCTTGGATTTGTTGCGACATTTCGAACAAGTCGGATT
CCCTGGATCAAACGataataaatatattttcctCGGTGACTACGTAGATA
GTTCTTGGATTTGTTGCGACATTTCGAACAAGTCGGATTCCCTGGATCAA
ACGataataaatatattttcctCGGTGACTACGTAGATAGAGGACAATAC
TCATTGGAAACGATATGTTTACTGCTGTGTTACAAACTGAAATATCCAAA
ACAAATGTTCTTATTGCGAGGGAATCATGAATGTGCTAGTATCAATAGAG
GACAATACTCATTGGAAACGATATGTTTACTGCTGTGTTACAAACTGAAA
TATCCAAAACAAATGTTCTTATTGCGAGGGAATCATGAATGTGCTAGTAT
CAATAGgatttatggtttttATGACGAGTGCAAGCGTAGATACAACATCA
AGCTATGGAAGACGTTTACTGATTGCTTCAACTGTTTACCGATGGgattt
atggtttttATGACGAGTGCAAGCGTAGATACAACATCAAGCTATGGAAG
ACGTTTACTGATTGCTTCAACTGTTTACCGATGGCCGGCGTTGTCGAAAA
CACTATATTTTGTGTCCACGGAGGACTTTCACCTGACTTCCAGCATCTCG
ACCAgCCGGCGTTGTCGAAAACACTATATTTTGTGTCCACGGAGGACTTT
CACCTGACTTCCAGCATCTCGACCAgATTCGAAATTTTGAAAGGCCAAGC
GATATCCCTGATTTTGGATTAATGAACGATCTACTATGGTCAGACCCTGA
CGAGATTCGAAATTTTGAAAGGCCAAGCGATATCCCTGATTTTGGATTAA
TGAACGATCTACTATGGTCAGACCCTGACGAGGATATCACAGGATGGGGT
GAGAACGATCGTGGAGTGTCATGGACTTTTGGTGGTGATATTGTTAATTC
TTTCCTCAAGAAGAACAATTTCAGTTTAGTCGCAAGAGCTCATCAAGTTA
TCGAAGATGGCTACCAATTCTTTCAAAAACGAAAAGATATCACAGGATGG
GGTGAGAACGATCGTGGAGTGTCATGGACTTTTGGTGGTGATATTGTTAA
TTCTTTCCTCAAGAAGAACAATTTCAGTTTAGTCGCAAGAGCTCATCAAG
TTATCGAAGATGGCTACCAATTCTTTCAAAAACGAAAACTTGTCACGTTG
TTTAGTGCGCCGAATTATTGCGGTGAATTTGATAACGCTGGAGCGACAAT
GTTCGTGTCAGATGAGCTAGTTTGTTCTTTCAGTATTTTAAAGCTTGTCA
CGTTGTTTAGTGCGCCGAATTATTGCGGTGAATTTGATAACGCTGGAGCG
ACAATGTTCGTGTCAGATGAGCTAGTTTGTTCTTTCAGTATTTTAAAGCC
TAAAAGTATGGCTGAACTGGAAGCACAActcgaaaacaaaaacaaaaaga
agaagtgaCCTAAAAGTATGGCTGAACTGGAAGCACAActcgaaaacaaa
aacaaaaagaagaagtga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000053_pilon | genome | sc0000053_pilon:1634111..1639828 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 850-909:5659 |
| Aaloc | 745-849:4980 |
| Aaloc | 592-744:4560 |
| Aaloc | 514-591:3624 |
| Aaloc | 445-513:2694 |
| Aaloc | 355-441:2238 |
| Aaloc | 247-351:1375 |
| Aaloc | 157-243:464 |
| Aaloc | 70-156:341 |
| Aaloc | 1-69:1 |
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